Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02255
• Subject: XM_017010098.2
• Aligned Length: 2470
• Identities: 2295
• Gaps: 170

Alignment

Query    1  ATGTCCAAGAAAGGGCGAAATAAGGGCGAGAAGCCCGAGGCACTCATTGTTGCCCTTCAAGCTGCCAATGAAGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCCAAGAAAGGGCGAAATAAGGGCGAGAAGCCCGAGGCACTCATTGTTGCCCTTCAAGCTGCCAATGAAGA  74

Query   75  CCTCAGGACCAAGCTCACAGACATTCAGATAGAGCTGCATCAAGAGAAGTCCAAGGTATCAAAGCTTGAAAGAG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCTCAGGACCAAGCTCACAGACATTCAGATAGAGCTGCATCAAGAGAAGTCCAAGGTATCAAAGCTTGAAAGAG  148

Query  149  AGAAGACTCAAGAAGCGAAGAGGATTCGTGAGCTGGAGCAGCGCAAGCACACGGTGCTGGTGACAGAACTCAAA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGAAGACTCAAGAAGCGAAGAGGATTCGTGAGCTGGAGCAGCGCAAGCACACGGTGCTGGTGACAGAACTCAAA  222

Query  223  GCCAAGCTCCATGAGGAGAAGATGAAGGAGCTGCAGGCTGTGAGGGAGAACCTTATCAAGCAGCACGAGCAGGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCCAAGCTCCATGAGGAGAAGATGAAGGAGCTGCAGGCTGTGAGGGAGAACCTTATCAAGCAGCACGAGCAGGA  296

Query  297  AATGTCAAGGACGGTGAAGGTACGTGATGGAGAGATCCAGAGGCTCAAGTCTGCTCTCTGTGCTCTCCGCGACG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AATGTCAAGGACGGTGAAGGTACGTGATGGAGAGATCCAGAGGCTCAAGTCTGCTCTCTGTGCTCTCCGCGACG  370

Query  371  GCAGCAGTGACAAAGTAAGGACAGCGCTCACCATTGAGGCCCGGGAGGAGGCCCGGAAACTGTTTGACACAGAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCAGCAGTGACAAAGTAAGGACAGCGCTCACCATTGAGGCCCGGGAGGAGGCCCGGAAACTGTTTGACACAGAG  444

Query  445  CGCCTTAAGCTCTTACAGGAAATTGCGGACCTGAAAACGGCCAAGAAGCAGGTGGACGAGGCTCTGAGCAATAT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CGCCTTAAGCTCTTACAGGAAATTGCGGACCTGAAAACGGCCAAGAAGCAGGTGGACGAGGCTCTGAGCAATAT  518

Query  519  GATCCAAGCAGATAAAATCAAGGCTGGGGACCTTCGGAGTGAGCATCAGTCCCACCAAGAAGCCATCTCGAAGA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GATCCAAGCAGATAAAATCAAGGCTGGGGACCTTCGGAGTGAGCATCAGTCCCACCAAGAAGCCATCTCGAAGA  592

Query  593  TCAAGTGGGAGTCGGAGCGGGATATTCGGAGGCTGATGGATGAAATCAAAGCCAAGGACAGGATCATCTTTTCC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCAAGTGGGAGTCGGAGCGGGATATTCGGAGGCTGATGGATGAAATCAAAGCCAAGGACAGGATCATCTTTTCC  666

Query  667  CTGGAAAAGGAACTGGAGACCCAGACAGGCTATGTACAGAAACTCCAACTTCAGAAGGAGGCTTTGGACGAACA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CTGGAAAAGGAACTGGAGACCCAGACAGGCTATGTACAGAAACTCCAACTTCAGAAGGAGGCTTTGGACGAACA  740

Query  741  ACTCTTTCTGGTCAAGGAGGCTGAGTGCAACATGAGCAGCCCAAAACGAGAAATTCCAGGAAGGGCAGGTGATG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ACTCTTTCTGGTCAAGGAGGCTGAGTGCAACATGAGCAGCCCAAAACGAGAAATTCCAGGAAGGGCAGGTGATG  814

Query  815  GTTCCGAACACTGCAGCAGTCCTGATTTGCGAAGAAATCAAAAGAGAATAGCTGAATTGAATGCCACTATAAGA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GTTCCGAACACTGCAGCAGTCCTGATTTGCGAAGAAATCAAAAGAGAATAGCTGAATTGAATGCCACTATAAGA  888

Query  889  AAATTAGAAGACAGGAATACCTTGCTTGGAGATGAACGAAATGAACTGTTAAAACGTGTGCGGGAAACCGAAAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAATTAGAAGACAGGAATACCTTGCTTGGAGATGAACGAAATGAACTGTTAAAACGTGTGCGGGAAACCGAAAA  962

Query  963  GCAATGTAAACCTCTCCTGGAAAGGAACAAGTGCCTCGCCAAGAGAAACGATGAACTGATGGTGTCCTTGCAGC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GCAATGTAAACCTCTCCTGGAAAGGAACAAGTGCCTCGCCAAGAGAAACGATGAACTGATGGTGTCCTTGCAGC  1036

Query 1037  GCATGGAAGAAAAACTAAAAGCCGTTACCAAGGAAAATTCAGAAATGAGAGAAAAAATAACATCCCATCCACCC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GCATGGAAGAAAAACTAAAAGCCGTTACCAAGGAAAATTCAGAAATGAGAGAAAAAATAACATCCCATCCACCC  1110

Query 1111  CTGAAGAAATTAAAATCTCTGAATGACCTCGACCAAGCTAATGAAGAACAAGAAACAGAGTTTCTAAAACTTCA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CTGAAGAAATTAAAATCTCTGAATGACCTCGACCAAGCTAATGAAGAACAAGAAACAGAGTTTCTAAAACTTCA  1184

Query 1185  GGTCATTGAGCAACAGAACATTATTGATGAGCTCACAAGGGACCGAGAAAAGCTCATCCGTAGAAGAAAGCATA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGTCATTGAGCAACAGAACATTATTGATGAGCTCACAAGGGACCGAGAAAAGCTCATCCGTAGAAGAAAGCATA  1258

Query 1259  GAAGAAGTTCCAAGCCAATTAAGAGGCCTGTTTTGGACCCGTTTATTGGCTATGATGAGGACTCTATGGATTCA  1332
            |||||||||||||||||||||||                                                   
Sbjct 1259  GAAGAAGTTCCAAGCCAATTAAG---------------------------------------------------  1281

Query 1333  GAGACATCATCCATGGCCTCATTTAGAACAGACAGAACACCAGCTACTCCTGATGATGACTTGGATGAAAGTTT  1406
                                                                                 |||||
Sbjct 1282  ---------------------------------------------------------------------AGTTT  1286

Query 1407  AGCAGCTGAAGAATCTGAACTAAGATTTCGACAATTAACAAAAGAATATCAGGCCCTCCAAAGAGCATATGCCC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1287  AGCAGCTGAAGAATCTGAACTAAGATTTCGACAATTAACAAAAGAATATCAGGCCCTCCAAAGAGCATATGCCC  1360

Query 1481  TCCTACAGGAGCAGACGGGAGGCATCATCGACGCTGAACGAGAAGCCAAGGCTCAAGAACAGCTCCAAGCAGAG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1361  TCCTACAGGAGCAGACGGGAGGCATCATCGACGCTGAACGAGAAGCCAAGGCTCAAGAACAGCTCCAAGCAGAG  1434

Query 1555  GTGCTAAGGTATAAAGCCAAAATTGAAGACCTGGAAGCGACTCTGGCTCAGAAAGGGCAGGATTCACACTGGGT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1435  GTGCTAAGGTATAAAGCCAAAATTGAAGACCTGGAAGCGACTCTGGCTCAGAAAGGGCAGGATTCACACTGGGT  1508

Query 1629  AGAAGATAAACAACTTTTCATTAAGAGAAACCAGGAGCTTTTAGAAAAGATAGAAAAACAGGAGGCAGAAAATC  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1509  AGAAGATAAACAACTTTTCATTAAGAGAAACCAGGAGCTTTTAGAAAAGATAGAAAAACAGGAGGCAGAAAATC  1582

Query 1703  ACCGGTTACAACAAGAACTACAGGACGCCAGAGACCAGAATGAGCTGCTGGAGTTTCGAAACCTAGAGCTAGAA  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1583  ACCGGTTACAACAAGAACTACAGGACGCCAGAGACCAGAATGAGCTGCTGGAGTTTCGAAACCTAGAGCTAGAA  1656

Query 1777  GAGAGAGAGAGACGATCCCCTCCATTTAATCTCCAAATTCACCCATTCTCAGATGGTGTGAGTGCTCTACAGAT  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1657  GAGAGAGAGAGACGATCCCCTCCATTTAATCTCCAAATTCACCCATTCTCAGATGGTGTGAGTGCTCTACAGAT  1730

Query 1851  CTACTGTATGAAAGAAGGTGTTAAGGATGTGAACATCCCTGATCTCATAAAGCAGCTTGATATCTTGGGTGATA  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1731  CTACTGTATGAAAGAAGGTGTTAAGGATGTGAACATCCCTGATCTCATAAAGCAGCTTGATATCTTGGGTGATA  1804

Query 1925  ATGGGAATTTAAGAAATGAAGAACAAGTGGCCATAATTCAGGCCAGCACTGTGCTGTCCCTGGCAGAGAAGTGG  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1805  ATGGGAATTTAAGAAATGAAGAACAAGTGGCCATAATTCAGGCCAGCACTGTGCTGTCCCTGGCAGAGAAGTGG  1878

Query 1999  ATCCAGCAGATTGAAGGAGCTGAGGCTGCCCTACACCAGAAAATGATGGAATTGGAAAGTGACATGGAACAGTT  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1879  ATCCAGCAGATTGAAGGAGCTGAGGCTGCCCTACACCAGAAAATGATGGAATTGGAAAGTGACATGGAACAGTT  1952

Query 2073  CTGCAAAATAAAAGGCTATCTGGAGGAAGAACTAGACTACAGAAAACAAGCTCTTGACCAAGCATATATGAGAA  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1953  CTGCAAAATAAAAGGCTATCTGGAGGAAGAACTAGACTACAGAAAACAAGCTCTTGACCAAGCATATATGAGAA  2026

Query 2147  TCCAGGAACTAGAAGCTACTTTGTACAATGCTCTACAGCAAGAAACTGTTATCAAGTTTGGTGAATTATTAAGT  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2027  TCCAGGAACTAGAAGCTACTTTGTACAATGCTCTACAGCAAGAAACTGTTATCAAGTTTGGTGAATTATTAAGT  2100

Query 2221  GAAAAACAGCAAGAGGAGCTGAGGACGGCAGTAGAAAAGTTACGGCGGCAAATGCTGAGGAAGAGCAGAGAGTA  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2101  GAAAAACAGCAAGAGGAGCTGAGGACGGCAGTAGAAAAGTTACGGCGGCAAATGCTGAGGAAGAGCAGAGAGTA  2174

Query 2295  TGACTGTCAGATTCTTCAGGAGAGAATGGAGCTCTTACAGCAAGCCCATCAGAGAATTCGTGACTTAGAAGATA  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2175  TGACTGTCAGATTCTTCAGGAGAGAATGGAGCTCTTACAGCAAGCCCATCAGAGAATTCGTGACTTAGAAGATA  2248

Query 2369  AAACAGACATCCAGAAAAGACAAATAAAAGACTTAGAAGAAAAGAGTAACCGAAAACATGGA------------  2430
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|          .||..            
Sbjct 2249  AAACAGACATCCAGAAAAGACAAATAAAAGACTTAGAAGAAAAGTTT----------CTGTTTCTATTCTTGTT  2312

Query 2431  ----------------------------  2430
                                        
Sbjct 2313  CTTCTCTCTTGCCTTTATTCTATGGCCT  2340