Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02295
• Subject: XM_006501612.3
• Aligned Length: 1185
• Identities: 787
• Gaps: 252

Alignment

Query    1  ATGGCCGTCACCGACAGCCTCAGCCGGGCTGCGACTGTCTTGGCAACTGTGTTGCTCTTGTCCTTCGGCAGCGT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GGCCGCTAGTCATATCGAGGATCAAGCAGAACAATTCTTTAGAAGTGGCCATACAAACAACTGGGCTGTTCTGG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TGTGTACATCCCGATTCTGGTTTAATTATCGACATGTTGCAAATACCCTTTCTGTTTATAGAAGTGTCAAGAGG  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  CTAGGTATTCCTGACAGTCACATTGTCCTAATGCTTGCAGATGATATGGCCTGTAATCCTAGAAATCCCAAACC  296
                                          ||||||||.|||||.|||||.||.|||.||.|.||.|||||.||
Sbjct    1  ------------------------------ATGCTTGCTGATGACATGGCGTGCAATGCTCGGAACCCCAAGCC  44

Query  297  AGCTACAGTGTTTAGTCACAAGAATATGGAACTAAATGTGTATGGAGATGATGTGGAAGTGGATTATAGAAGTT  370
            |||.||||||||.||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.|
Sbjct   45  AGCCACAGTGTTCAGCCACAAGAACATGGAGCTCAATGTGTATGGAGACGATGTGGAAGTGGACTACAGAAGCT  118

Query  371  ATGAGGTAACTGTGGAGAATTTTTTACGGGTATTAACTGGGAGGATCCCACCTAGTACTCCTCGGTCAAAACGT  444
            |||||||||||||||||||.||||||.|||||||.||.||||||.|.|||||.|||||.|||||.|||||.|||
Sbjct  119  ATGAGGTAACTGTGGAGAACTTTTTAAGGGTATTGACCGGGAGGGTTCCACCCAGTACCCCTCGCTCAAAGCGT  192

Query  445  CTTCTTTCTGATGACAGAAGCAATATTCTAATTTATATGACAGGGCATGGTGGAAATGGTTTCTTAAAATTTCA  518
            ||||||||.||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.|||||.||
Sbjct  193  CTTCTTTCCGACGACAGAAGCAATATCCTCATTTATATGACAGGTCATGGAGGGAATGGTTTCTTGAAATTCCA  266

Query  519  AGATTCTGAAGAAATTACCAACATAGAACTCGCGGATGCTTTTGAACAAATGTGGCAGAAAAGACGCTACAATG  592
            |||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  267  AGATTCTGAAGAAATCACCAACATAGAACTTGCAGATGCGTTTGAACAGATGTGGCAGAAGAGACGCTACAATG  340

Query  593  AGCTACTGTTTATTATTGATACTTGCCAAGGAGCATCCATGTATGAACGATTTTATTCTCCTAACATAATGGCT  666
            ||||.|||||.||||||||.||||||||.||.||.||||||||.||.||.||.||.|||||||||||.|||||.
Sbjct  341  AGCTGCTGTTCATTATTGACACTTGCCAGGGCGCGTCCATGTACGAGCGGTTCTACTCTCCTAACATCATGGCC  414

Query  667  CTAGCTAGTAGTCAAGTGGGAGAAGATTCACTCTCGCATCAACCTGATCCTGCAATTGGAGTCCATCTTATGGA  740
            .|.||||||||.||.||||||||.|||||.||.|||||.||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct  415  TTGGCTAGTAGCCAGGTGGGAGAGGATTCGCTGTCGCACCAGCCTGACCCTGCGATTGGAGTTCATCTTATGGA  488

Query  741  TAGATACACATTTTATGTCTTGGAATTTTTGGAAGAAATTAACCCAGCTAGCCAAACTAATATGAATGACCTTT  814
            |||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct  489  TAGGTACACGTTTTATGTCTTGGAATTTTTGGAAGAAATTAATCCAGCTAGCCAAACTAACATGAACGACCTTT  562

Query  815  TTCAGGTATGTCCCAAAAGTCTGTGTGTGTCTACTCCTGGACATCGCACTGATCTTTTTCAGAGGGATCCTAAA  888
            ||||.||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||.|.|||||.|||
Sbjct  563  TTCAAGTGTGTCCCAAAAGTCTCTGTGTGTCGACCCCTGGACATCGCACTGACCTTTTCCAGCGAGATCCAAAA  636

Query  889  AATGTACTGATAACTGATTTCTTTGGAAGTGTACGGAAAGTGGAAATTACAACAGAGACTATTAAATTGCAACA  962
            |||||.|||||.||.||||||||.||||||||.||.||.||||||||.||||||||||..||.|..|||||...
Sbjct  637  AATGTCCTGATCACCGATTTCTTCGGAAGTGTGCGCAAGGTGGAAATCACAACAGAGAAGATCAGTTTGCAGTG  710

Query  963  GGATTCAGAAATCATGGAAAGCAGCTATAAGGAAGACCAGATGGATGAGAAACTAATGGAACCTCTGAAATATG  1036
            |||||||.||.||.||||.|||||.|.|||.||||||...|.||..|||.|.|..||||.||||||.||.||||
Sbjct  711  GGATTCACAAGTCGTGGACAGCAGTTCTAAAGAAGACGGCACGGCCGAGGAGCGCATGGGACCTCTCAAGTATG  784

Query 1037  CTGAACAACTTCCTGTAGCTCAGATAATACACCAGAAACCGAAGCTGAAAGACTGGCATCCTCCTGGGGGCTTT  1110
            ||||.||.||.||.||.||||||||||||||||||||.||.||||.||.|||||||||.|||||.||.|||||.
Sbjct  785  CTGAGCAGCTCCCGGTGGCTCAGATAATACACCAGAAGCCAAAGCCGAGAGACTGGCACCCTCCCGGAGGCTTC  858

Query 1111  ATTCTGGGATTATGGGCACTTATTATCATGGTTTTCTTCAAAACTTATGGAATTAAGCATATGAAGTTCATTTT  1184
            ||.|||||..|.|||||.||.||.||||||||.||||||||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct  859  ATCCTGGGGCTGTGGGCGCTCATCATCATGGTCTTCTTCAAGACCTATGGGATCAAGCATATGAAGTTCATTTT  932

Query 1185  T  1185
            .
Sbjct  933  C  933