Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02324
• Subject: NM_026508.2
• Aligned Length: 2128
• Identities: 1791
• Gaps: 26

Alignment

Query    1  ATGGCGCGCGAGCTGCGGGCGCTGCTGCTGTGGGGCCGCCGCCTGCGGCCTTTGCTGCGGGCGCCGGCGCTGGC  74
            ||||||.||||||||||.||..||.||||||||||||||.|.||||.|.||.|.||||||||.||.||||||||
Sbjct    1  ATGGCGTGCGAGCTGCGAGCTGTGTTGCTGTGGGGCCGCGGGCTGCAGACTGTACTGCGGGCCCCCGCGCTGGC  74

Query   75  GGCCGTGCCGGGAGGAAAACCAATTCTGTGTCCTCGGAGGACCACAGCCCAGTT---GGGCCCCAGGCGAAACC  145
            .|..||.|.|.|||||||.|||.|||||...|.||.||.|||.||||.||||||   |||||||     |.||.
Sbjct   75  TGGAGTTCGGCGAGGAAAGCCAGTTCTGCACCTTCAGAAGACTACAGTCCAGTTTAGGGGCCCC-----ACACA  143

Query  146  CAGCCTGGAGCTTGCAG--------GCAGGACGACTGTTCAGCACGCAGACCGCCGAGGACAAGGAGGA----A  207
            .||.|||  |||| |||        |||||||...|.|.||||||.|||.|.|||||||||||||||||    |
Sbjct  144  AAGTCTG--GCTT-CAGGGATCTCTGCAGGACAGTTATACAGCACACAGGCAGCCGAGGACAAGGAGGAGGAGA  214

Query  208  CCCCTGCACTCGATTATCAGCAGCACAGAGAGC-GTGCAGGGTTCCACTTCCAAACATGAGTTCCAGGCCGAGA  280
             .|||||||||.||.|||||||.|||.||| || ||||.||||||....||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  215  -GCCTGCACTCCATCATCAGCAACACTGAG-GCAGTGCGGGGTTCTGTCTCCAAACATGAGTTCCAGGCAGAGA  286

Query  281  CAAAGAAGCTTTTGGACATTGTTGCCCGGTCCCTGTACTCAGAAAAAGAGGTGTTTATACGGGAGCTGATCTCC  354
            |||||||.|||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||
Sbjct  287  CAAAGAAACTTTTGGACATCGTAGCCCGTTCTCTGTACTCAGAAAAAGAGGTGTTCATACGAGAGCTCATCTCC  360

Query  355  AATGCCAGCGATGCCTTGGAAAAACTGCGTCACAAACTGGTGTCTGACGGCCAAGCACTGCCAGAAATGGAGAT  428
            ||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||||.|||.|||||.|..|||||||||||||||||
Sbjct  361  AATGCCAGTGATGCCTTGGAGAAACTGCGGCACAAGCTGGTGTGTGAAGGCCAGGTGCTGCCAGAAATGGAGAT  434

Query  429  TCACTTGCAGACCAATGCCGAGAAAGGCACCATCACCATCCAGGATACTGGTATCGGGATGACACAGGAAGAGC  502
            ||||.|.|||||..|||||.||||.|||||.||.|||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.||||
Sbjct  435  TCACCTTCAGACGGATGCCAAGAAGGGCACTATTACCATTCAGGACACTGGCATTGGGATGACACAGGAGGAGC  508

Query  503  TGGTGTCCAACCTGGGGACGATTGCCAGATCGGGGTCAAAGGCCTTCCTGGATGCTCTGCAGAACCAGGCTGAG  576
            |||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||
Sbjct  509  TGGTGTCCAACCTTGGCACAATTGCCAGATCGGGGTCAAAGGCCTTCCTGGAAGCACTGCAGAACCAGGCAGAG  582

Query  577  GCCAGCAGCAAGATCATCGGCCAGTTTGGAGTGGGTTTCTACTCAGCTTTCATGGTGGCTGACAGAGTGGAGGT  650
            .||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||..||.||.||
Sbjct  583  ACCAGCAGCAAGATCATTGGTCAGTTTGGAGTGGGTTTCTATTCAGCCTTCATGGTAGCTGACAAGGTTGAAGT  656

Query  651  CTATTCCCGCTCGGCAGCCCCGGGGAGCCTGGGTTACCAGTGGCTTTCAGATGGTTCTGGAGTGTTTGAAATCG  724
            ||||||.||.||.|||||.||.|.|||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  657  CTATTCTCGATCAGCAGCTCCAGAGAGCCCAGGTTACCAGTGGCTTTCAGATGGTTCTGGAGTGTTTGAAATTG  730

Query  725  CCGAAGCTTCGGGAGTTAGAACCGGGACAAAAATCATCATCCACCTGAAATCCGACTGCAAGGAGTTTTCCAGC  798
            ||||||||||.|||||||||.|.|||||.|||||.|||||||||||.||.||.|||||.||.||.|||.|||||
Sbjct  731  CCGAAGCTTCAGGAGTTAGACCTGGGACCAAAATAATCATCCACCTCAAGTCAGACTGTAAAGATTTTGCCAGC  804

Query  799  GAGGCCCGGGTGCGAGATGTGGTAACGAAGTACAGCAACTTCGTCAGCTTCCCCTTGTACTTGAATGGAAGGCG  872
            |||.|||||||.|.||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||.|.|||||||.|||
Sbjct  805  GAGTCCCGGGTACAAGATGTGGTAACAAAGTACAGTAACTTTGTCAGCTTCCCCTTGTACCTTAATGGAAAGCG  878

Query  873  GATGAACACCTTGCAGGCCATCTGGATGATGGACCCCAAGGATGTCCGTGAGTGGCAACATGAGGAGTTCTACC  946
            |||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||..||.||||.|..||.||||||||.|||||||
Sbjct  879  GATTAACACTTTGCAGGCCATCTGGATGATGGACCCAAAGGACATCAGTGAATTTCAGCATGAGGAATTCTACC  952

Query  947  GCTACGTCGCGCAGGCTCACGACAAGCCCCGCTACACCCTGCACTATAAGACGGACGCACCGCTCAACATCCGC  1020
            |.||..|.||.||||||.|.||.||||||||||.|||..|||||||.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  953  GTTATATTGCTCAGGCTTATGATAAGCCCCGCTTCACTTTGCACTACAAGACGGACGCACCACTCAACATCCGC  1026

Query 1021  AGCATCTTCTACGTGCCCGACATGAAACCGTCCATGTTTGATGTGAGCCGGGAGCTGGGCTCCAGCGTTGCACT  1094
            |||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1027  AGCATCTTCTATGTGCCAGAGATGAAACCATCCATGTTTGATGTGAGCAGGGAGCTGGGCTCCAGCGTGGCACT  1100

Query 1095  GTACAGCCGCAAAGTCCTCATCCAGACCAAGGCCACGGACATCCTGCCCAAGTGGCTGCGCTTCATCCGAGGTG  1168
            |||.||||||||.||||||||||||||||||||..|.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1101  GTATAGCCGCAAGGTCCTCATCCAGACCAAGGCTGCAGACATCCTGCCCAAGTGGCTGCGCTTCATTCGAGGTG  1174

Query 1169  TGGTGGACAGTGAGGACATTCCCCTGAACCTCAGCCGGGAGCTGCTGCAGGAGAGCGCACTCATCAGGAAACTC  1242
            |||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|.|||||.|||||||||||.||.||||||.||||||||
Sbjct 1175  TGGTGGATAGTGAGGACATTCCCCTGAACCTCAGCAGAGAGCTCCTGCAGGAGAGTGCGCTCATCCGGAAACTC  1248

Query 1243  CGGGACGTTTTACAGCAGAGGCTGATCAAATTCTTCATTGACCAGAGTAAAAAAGATGCTGAGAAGTATGCAAA  1316
            |||||.|||.||||.|||||..|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||
Sbjct 1249  CGGGATGTTCTACAACAGAGATTGATCAAGTTCTTCATTGACCAGAGTAAAAAAGATGCTGAAAAATACGCAAA  1322

Query 1317  GTTTTTTGAAGATTACGGCCTGTTCATGCGGGAGGGCATTGTGACCGCCACCGAGCAGGAGGTCAAGGAGGACA  1390
            |||||||||||||||.|||.||||||||.|||||||||||||||||.|..|.|||||.||..||||||||||.|
Sbjct 1323  GTTTTTTGAAGATTATGGCTTGTTCATGAGGGAGGGCATTGTGACCACTGCAGAGCAAGACATCAAGGAGGATA  1396

Query 1391  TAGCAAAGCTGCTGCGCTACGAGTCCTCGGCGCTGCCCTCCGGGCAGCTAACCAGCCTCTCAGAATACGCCAGC  1464
            |.|||||.|||||.||.||.||||||||.||.|||||..|.||||||||.||||||.|..||||.||.||||||
Sbjct 1397  TTGCAAAACTGCTACGGTATGAGTCCTCAGCCCTGCCTGCTGGGCAGCTGACCAGCTTACCAGACTATGCCAGC  1470

Query 1465  CGCATGCGGGCCGGCACCCGCAACATCTACTACCTGTGCGCCCCCAACCGTCACCTGGCAGAGCACTCACCCTA  1538
            ||.||||.|||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||.||||||||
Sbjct 1471  CGAATGCAGGCTGGCACCCGCAACATCTATTACCTGTGTGCCCCTAACCGTCACCTGGCTGAACATTCACCCTA  1544

Query 1539  CTATGAGGCCATGAAGAAGAAAGACACAGAGGTTCTCTTCTGCTTTGAGCAGTTTGATGAGCTCACCCTGCTGC  1612
            .||.||.|||||||||.|||||.|.||.|||||.||||||||||.|||||||||.||||||||.||.|||||||
Sbjct 1545  TTACGAAGCCATGAAGCAGAAACATACTGAGGTGCTCTTCTGCTATGAGCAGTTCGATGAGCTTACTCTGCTGC  1618

Query 1613  ACCTTCGTGAGTTTGACAAGAAGAAGCTGATCTCTGTGGAGACGGACATAGTCGTGGATCACTACAAGGAGGAG  1686
            ||||..|.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 1619  ACCTGAGGGAGTTTGACAAGAAGAAGCTCATCTCTGTGGAAACAGACATCGTCGTTGATCACTACAAGGAGGAA  1692

Query 1687  AAGTTTGAGGACAGGTCCCCAGCCGCCGAGTGCCTATCAGAGAAGGAGACGGAGGAGCTCATGGCCTGGATGAG  1760
            |||||||||||||..||.|||||.|..|||.||||.||.||||||||.||.||.||.||.|||||.||||||||
Sbjct 1693  AAGTTTGAGGACACATCTCCAGCTGATGAGCGCCTCTCGGAGAAGGAAACAGAAGATCTAATGGCGTGGATGAG  1766

Query 1761  AAATGTGCTGGGGTCGCGTGTCACCAACGTGAAGGTGACCCTCCGACTGGACACCCACCCTGCCATGGTCACCG  1834
            |||||..||.|||||.|||||||||||.|||||||||||..||||.||.||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1767  AAATGCACTAGGGTCCCGTGTCACCAATGTGAAGGTGACTTTCCGCCTAGACACCCACCCTGCCATGGTGACCG  1840

Query 1835  TGCTGGAGATGGGGGCTGCCCGCCACTTCCTGCGCATGCAGCAGCTGGCCAAGACCCAGGAGGAGCGCGCACAG  1908
            |||||||||||||||||||.||.||.|||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.
Sbjct 1841  TGCTGGAGATGGGGGCTGCTCGGCATTTCTTGCGTATGCAGCAGCTGGCCAAGACCCAGGAGGAACGTGCCCAA  1914

Query 1909  CTCCTGCAGCCCACGCTGGAGATCAACCCCAGGCACGCGCTCATCAAGAAGCTGAATCAGCTGCGCGCAAGCGA  1982
            ||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||.|.||.||.||||||||....||||||.|.|..|||||
Sbjct 1915  CTGCTACAGCCCACACTGGAGATCAACCCCAGGCACACACTGATAAAGAAGCTCTGCCAGCTGAGGGAGAGCGA  1988

Query 1983  GCCTGGCCTGGCTCAGCTGCTGGTGGATCAGATATACGAGAACGCCATGATTGCTGCTGGACTTGTTGACGACC  2056
            |||.|..|||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.||.||.|||||.|||||.||||
Sbjct 1989  GCCGGAGCTGGCCCAGCTGCTCGTGGATCAGATCTATGAGAATGCCATGATAGCAGCAGGACTCGTTGATGACC  2062

Query 2057  CTAGGGCCATGGTGGGCCGCTTGAATGAGCTGCTTGTCAAGGCCCTGGAGCGACAC  2112
            |..||||||||||.||||||.||||.||.||..|.|||||||.|||||||..||||
Sbjct 2063  CCCGGGCCATGGTCGGCCGCCTGAACGACCTTTTGGTCAAGGTCCTGGAGAAACAC  2118