Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02337
• Subject: NM_014251.3
• Aligned Length: 2025
• Identities: 2025
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGCGGCCGCCAAGGTGGCTTTAACCAAGAGAGCAGATCCAGCTGAGCTTAGAACAATATTTTTGAAGTATGC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGGCCGCCAAGGTGGCTTTAACCAAGAGAGCAGATCCAGCTGAGCTTAGAACAATATTTTTGAAGTATGC  74

Query   75  AAGCATTGAGAAAAACGGTGAATTTTTCATGTCCCCCAATGACTTTGTCACTCGATACTTGAACATTTTTGGAG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AAGCATTGAGAAAAACGGTGAATTTTTCATGTCCCCCAATGACTTTGTCACTCGATACTTGAACATTTTTGGAG  148

Query  149  AAAGCCAGCCTAATCCAAAGACTGTGGAACTTTTAAGTGGAGTGGTGGATCAGACCAAAGATGGATTAATATCT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AAAGCCAGCCTAATCCAAAGACTGTGGAACTTTTAAGTGGAGTGGTGGATCAGACCAAAGATGGATTAATATCT  222

Query  223  TTTCAAGAATTTGTTGCCTTTGAATCTGTCCTGTGTGCCCCTGATGCTTTGTTTATGGTAGCCTTTCAGCTGTT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTTCAAGAATTTGTTGCCTTTGAATCTGTCCTGTGTGCCCCTGATGCTTTGTTTATGGTAGCCTTTCAGCTGTT  296

Query  297  TGACAAAGCTGGCAAAGGAGAAGTAACTTTTGAGGATGTTAAGCAAGTTTTTGGACAGACCACAATTCATCAAC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGACAAAGCTGGCAAAGGAGAAGTAACTTTTGAGGATGTTAAGCAAGTTTTTGGACAGACCACAATTCATCAAC  370

Query  371  ATATTCCATTTAACTGGGATTCAGAATTTGTGCAACTACATTTTGGAAAAGAAAGAAAAAGACACCTGACATAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATATTCCATTTAACTGGGATTCAGAATTTGTGCAACTACATTTTGGAAAAGAAAGAAAAAGACACCTGACATAT  444

Query  445  GCGGAATTTACTCAGTTTTTATTGGAAATACAACTGGAGCACGCAAAGCAAGCCTTTGTGCAACGGGACAATGC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCGGAATTTACTCAGTTTTTATTGGAAATACAACTGGAGCACGCAAAGCAAGCCTTTGTGCAACGGGACAATGC  518

Query  519  TAGGACTGGGAGAGTCACAGCCATCGACTTCCGAGACATCATGGTCACCATCCGCCCCCATGTCTTGACTCCTT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TAGGACTGGGAGAGTCACAGCCATCGACTTCCGAGACATCATGGTCACCATCCGCCCCCATGTCTTGACTCCTT  592

Query  593  TTGTAGAAGAATGTCTAGTAGCTGCTGCTGGAGGTACCACATCCCATCAAGTTAGTTTCTCCTATTTTAATGGA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TTGTAGAAGAATGTCTAGTAGCTGCTGCTGGAGGTACCACATCCCATCAAGTTAGTTTCTCCTATTTTAATGGA  666

Query  667  TTTAATTCGCTCCTTAACAACATGGAACTCATTAGAAAGATCTATAGCACTCTGGCTGGCACCAGGAAAGATGT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TTTAATTCGCTCCTTAACAACATGGAACTCATTAGAAAGATCTATAGCACTCTGGCTGGCACCAGGAAAGATGT  740

Query  741  TGAAGTGACTAAGGAGGAGTTTGTTCTGGCAGCTCAGAAATTTGGTCAGGTTACACCCATGGAAGTTGACATCT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGAAGTGACTAAGGAGGAGTTTGTTCTGGCAGCTCAGAAATTTGGTCAGGTTACACCCATGGAAGTTGACATCT  814

Query  815  TGTTTCAGTTAGCAGATTTATATGAGCCAAGGGGACGTATGACCTTAGCAGACATTGAACGGATTGCTCCTCTG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGTTTCAGTTAGCAGATTTATATGAGCCAAGGGGACGTATGACCTTAGCAGACATTGAACGGATTGCTCCTCTG  888

Query  889  GAAGAGGGAACTCTGCCCTTTAACTTGGCTGAGGCCCAGAGGCAGAAGGCCTCAGGTGATTCAGCTCGACCAGT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GAAGAGGGAACTCTGCCCTTTAACTTGGCTGAGGCCCAGAGGCAGAAGGCCTCAGGTGATTCAGCTCGACCAGT  962

Query  963  TCTTCTACAAGTTGCAGAGTCGGCCTACAGGTTTGGTCTGGGTTCTGTTGCTGGAGCTGTTGGAGCCACTGCTG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TCTTCTACAAGTTGCAGAGTCGGCCTACAGGTTTGGTCTGGGTTCTGTTGCTGGAGCTGTTGGAGCCACTGCTG  1036

Query 1037  TGTATCCTATCGATCTTGTAAAAACTCGAATGCAGAACCAACGATCAACTGGCTCTTTTGTGGGAGAACTCATG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TGTATCCTATCGATCTTGTAAAAACTCGAATGCAGAACCAACGATCAACTGGCTCTTTTGTGGGAGAACTCATG  1110

Query 1111  TATAAAAACAGCTTTGACTGTTTTAAGAAAGTGCTACGCTATGAAGGCTTCTTTGGACTGTATAGAGGTCTGTT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TATAAAAACAGCTTTGACTGTTTTAAGAAAGTGCTACGCTATGAAGGCTTCTTTGGACTGTATAGAGGTCTGTT  1184

Query 1185  GCCACAGTTATTGGGAGTTGCCCCAGAGAAGGCCATAAAACTTACAGTGAACGATTTTGTGAGGGATAAATTTA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GCCACAGTTATTGGGAGTTGCCCCAGAGAAGGCCATAAAACTTACAGTGAACGATTTTGTGAGGGATAAATTTA  1258

Query 1259  TGCACAAAGATGGTTCGGTCCCACTTGCAGCAGAAATTCTTGCTGGAGGCTGCGCTGGAGGCTCCCAGGTGATT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGCACAAAGATGGTTCGGTCCCACTTGCAGCAGAAATTCTTGCTGGAGGCTGCGCTGGAGGCTCCCAGGTGATT  1332

Query 1333  TTCACAAATCCTTTAGAAATCGTCAAGATCCGTTTGCAAGTGGCAGGAGAAATCACCACTGGTCCTCGAGTCAG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TTCACAAATCCTTTAGAAATCGTCAAGATCCGTTTGCAAGTGGCAGGAGAAATCACCACTGGTCCTCGAGTCAG  1406

Query 1407  TGCTCTGTCTGTCGTGCGGGACCTGGGGTTTTTTGGGATCTACAAGGGTGCCAAAGCATGCTTTCTGCGGGACA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TGCTCTGTCTGTCGTGCGGGACCTGGGGTTTTTTGGGATCTACAAGGGTGCCAAAGCATGCTTTCTGCGGGACA  1480

Query 1481  TTCCTTTCTCGGCCATCTACTTTCCGTGCTATGCTCATGTGAAGGCTTCCTTTGCAAATGAAGATGGGCAGGTT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TTCCTTTCTCGGCCATCTACTTTCCGTGCTATGCTCATGTGAAGGCTTCCTTTGCAAATGAAGATGGGCAGGTT  1554

Query 1555  AGCCCAGGAAGCCTGCTCTTAGCTGGTGCCATAGCTGGTATGCCTGCAGCATCTTTAGTGACCCCTGCTGATGT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  AGCCCAGGAAGCCTGCTCTTAGCTGGTGCCATAGCTGGTATGCCTGCAGCATCTTTAGTGACCCCTGCTGATGT  1628

Query 1629  TATCAAGACGAGATTACAGGTGGCTGCCCGGGCTGGCCAAACCACTTACAGCGGAGTGATAGACTGCTTTAGAA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TATCAAGACGAGATTACAGGTGGCTGCCCGGGCTGGCCAAACCACTTACAGCGGAGTGATAGACTGCTTTAGAA  1702

Query 1703  AGATACTGCGTGAAGAAGGACCAAAAGCTCTGTGGAAGGGAGCTGGTGCTCGTGTATTTCGATCCTCACCCCAG  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  AGATACTGCGTGAAGAAGGACCAAAAGCTCTGTGGAAGGGAGCTGGTGCTCGTGTATTTCGATCCTCACCCCAG  1776

Query 1777  TTTGGTGTAACTTTGCTGACTTACGAATTGCTACAGCGATGGTTCTACATTGATTTTGGAGGAGTAAAACCCAT  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  TTTGGTGTAACTTTGCTGACTTACGAATTGCTACAGCGATGGTTCTACATTGATTTTGGAGGAGTAAAACCCAT  1850

Query 1851  GGGATCAGAGCCAGTTCCTAAATCCAGGATCAACCTGCCTGCCCCGAATCCTGATCACGTTGGGGGCTACAAAC  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GGGATCAGAGCCAGTTCCTAAATCCAGGATCAACCTGCCTGCCCCGAATCCTGATCACGTTGGGGGCTACAAAC  1924

Query 1925  TGGCAGTTGCTACATTTGCAGGGATTGAAAACAAATTTGGACTTTACCTACCTCTCTTCAAGCCATCAGTATCT  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  TGGCAGTTGCTACATTTGCAGGGATTGAAAACAAATTTGGACTTTACCTACCTCTCTTCAAGCCATCAGTATCT  1998

Query 1999  ACCTCAAAGGCTATTGGTGGAGGCCCA  2025
            |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  ACCTCAAAGGCTATTGGTGGAGGCCCA  2025