Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_02426
- Subject:
- NM_001349216.2
- Aligned Length:
- 1555
- Identities:
- 1247
- Gaps:
- 299
Alignment
Query 1 ATGTCAGTGGACATGAATAGCCAGGGGTCTGACAGCAATGAAGAGGACTATGACCCAAATTGTGAGGAAGAGGA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 AGAAGAAGAAGAAGACGACCCTGGGGACATAGAGGACTATTACGTGGGAGTAGCCAGCGATGTGGAGCAGCAGG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 GGGCTGATGCCTTTGATCCCGAGGAGTACCAGTTCACTTGCTTGACCTACAAGGAATCTGAGGGTGCCCTCAAT 222
||
Sbjct 1 ------------------------------------------------------------------------AT 2
Query 223 GAGCACATG--ACCAGCTTAGCTTCTGTCCT-----AAAGGTATCTCATTCAGTTGCTAAACTTATATTAGTTA 289
|..||| || |.||||| ||.||...||| |..|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3 GCTCAC-TGCCATCAGCT--GCATCCTCCCTATGGCACTGGTATCTCATTCAGTTGCTAAACTTATATTAGTTA 73
Query 290 ATTTCCACTGGCAAGTTTCAGAGATATTGGACAGATACAAGTCCAATTCTGCTCAACTGCTTGTTGAGGCTCGA 363
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 74 ATTTCCACTGGCAAGTTTCAGAGATATTGGACAGATACAAGTCCAATTCTGCTCAACTGCTTGTTGAGGCTCGA 147
Query 364 GTTCAGCCTAATCCATCAAAACATGTTCCCACATCCCATCCCCCTCACCACTGTGCAGTGTGTATGCAGTTTGT 437
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 148 GTTCAGCCTAATCCATCAAAACATGTTCCCACATCCCATCCCCCTCACCACTGTGCAGTGTGTATGCAGTTTGT 221
Query 438 GCGAAAGGAAAACCTACTCTCTCTGGCCTGTCAGCACCAGTTTTGCCGCAGCTGCTGGGAGCAGCACTGCTCAG 511
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 222 GCGAAAGGAAAACCTACTCTCTCTGGCCTGTCAGCACCAGTTTTGCCGCAGCTGCTGGGAGCAGCACTGCTCAG 295
Query 512 TTCTCGTCAAGGACGGCGTGGGCGTGGGAGTCTCTTGCATGGCTCAGGACTGTCCACTCCGTACACCAGAGGAC 585
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 296 TTCTCGTCAAGGACGGCGTGGGCGTGGGAGTCTCTTGCATGGCTCAGGACTGTCCACTCCGTACACCAGAGGAC 369
Query 586 TTTGTGTTTCCATTGCTTCCCAATGAAGAATTGAGAGAGAAATACAGGCGCTACCTCTTCAGGGACTATGTGGA 659
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 370 TTTGTGTTTCCATTGCTTCCCAATGAAGAATTGAGAGAGAAATACAGGCGCTACCTCTTCAGGGACTATGTGGA 443
Query 660 GAGTCATTACCAGCTCCAGCTGTGCCCTGGTGCAGACTGCCCCATGGTTATTCGGGTACAGGAGCCTAGAGCTC 733
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 444 GAGTCATTACCAGCTCCAGCTGTGCCCTGGTGCAGACTGCCCCATGGTTATTCGGGTACAGGAGCCTAGAGCTC 517
Query 734 GCCGAGTACAGTGCAATCGGTGCAACGAGGTCTTCTGTTTCAAGTGTCGTCAGATGTATCACGCACCCACAGAC 807
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 518 GCCGAGTACAGTGCAATCGGTGCAACGAGGTCTTCTGTTTCAAGTGTCGTCAGATGTATCACGCACCCACAGAC 591
Query 808 TGTGCCACAATCCGGAAATGGCTCACGAAGTGTGCAGACGACTCTGAAACAGCCAACTACATTAGTGCTCACAC 881
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 592 TGTGCCACAATCCGGAAATGGCTCACGAAGTGTGCAGACGACTCTGAAACAGCCAACTACATTAGTGCTCACAC 665
Query 882 TAAAGACTGTCCCAAGTGCAACATCTGCATTGAGAAGAATGGAGGCTGCAATCACATGCAATGCTCCAAATGTA 955
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 666 TAAAGACTGTCCCAAGTGCAACATCTGCATTGAGAAGAATGGAGGCTGCAATCACATGCAATGCTCCAAATGTA 739
Query 956 AACACG-------------------------------------------------------------------- 961
||||||
Sbjct 740 AACACGGTGAGTTCCAAGCTTGGTGTGTAAGGCCCAGTGGCACTTTCTTGTGGTTGGGTCTCCGTTACTATTTA 813
Query 962 -ACTTCTGCTGGATGTGTCTAGGAGATTGGAAGACTCATGGCAGTGAATACTATGAGTGCAGTCGTTACAAGGA 1034
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 814 AACTTCTGCTGGATGTGTCTAGGAGATTGGAAGACTCATGGCAGTGAATACTATGAGTGCAGTCGTTACAAGGA 887
Query 1035 GAATCCTGACATCGTGAACCAGAGCCAACAAGCCCAGGCGAGGGAAGCCCTCAAGAAGTACTTATTCTACTTTG 1108
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 888 GAATCCTGACATCGTGAACCAGAGCCAACAAGCCCAGGCGAGGGAAGCCCTCAAGAAGTACTTATTCTACTTTG 961
Query 1109 AGAGGTGGGAAAACCACAATAAAAGCTTGCAGCTAGAGGCACAGACATACCAGCGGATTCACGAGAAGATTCAG 1182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 962 AGAGGTGGGAAAACCACAATAAAAGCTTGCAGCTAGAGGCACAGACATACCAGCGGATTCACGAGAAGATTCAG 1035
Query 1183 GAGAGGGTCATGAACAATCTGGGGACATGGATCGACTGGCAGTACCTACAGAATGCTGCCAAGCTCTTGGCCAA 1256
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036 GAGAGGGTCATGAACAATCTGGGGACATGGATCGACTGGCAGTACCTACAGAATGCTGCCAAGCTCTTGGCCAA 1109
Query 1257 GTGTCGATACACCCTGCAATACACCTACCCATATGCATATTACATGGAGTCCGGACCCAGGAAGAAGCTGTTTG 1330
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1110 GTGTCGATACACCCTGCAATACACCTACCCATATGCATATTACATGGAGTCCGGACCCAGGAAGAAGCTGTTTG 1183
Query 1331 AATACCAGCAGGCTCAGCTGGAGGCTGAGATCGAAAACCTCTCATGGAAAGTGGAGCGTGCAGACAGCTATGAC 1404
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1184 AATACCAGCAGGCTCAGCTGGAGGCTGAGATCGAAAACCTCTCATGGAAAGTGGAGCGTGCAGACAGCTATGAC 1257
Query 1405 AGAGGGGACTTGGAGAACCAGATGCATATAGCGGAGCAGCGGAGGAGAACCCTGCTGAAAGATTTCCATGACAC 1478
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1258 AGAGGGGACTTGGAGAACCAGATGCATATAGCGGAGCAGCGGAGGAGAACCCTGCTGAAAGATTTCCATGACAC 1331
Query 1479 C 1479
|
Sbjct 1332 C 1332