Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02516
• Subject: XM_017029232.1
• Aligned Length: 3693
• Identities: 3693
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGATAGCAGCTCCAGAAATACCAACTGATTTTAATCTACTACAGGAGTCAGAAACACATTTTTCTTCTGACAC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGATAGCAGCTCCAGAAATACCAACTGATTTTAATCTACTACAGGAGTCAGAAACACATTTTTCTTCTGACAC  74

Query   75  AGATTTTGAAGATATCGAAGGAAAAAACCAAAAGCAAGGCAAAGGCAAAACTTGTAAAAAAGGCAAAAAGGGCC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGATTTTGAAGATATCGAAGGAAAAAACCAAAAGCAAGGCAAAGGCAAAACTTGTAAAAAAGGCAAAAAGGGCC  148

Query  149  CAGCAGAAAAGGGCAAAGGTGGAAATGGAGGAGGAAAACCTCCTTCTGGTCCAAACCGAATGAATGGTCATCAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CAGCAGAAAAGGGCAAAGGTGGAAATGGAGGAGGAAAACCTCCTTCTGGTCCAAACCGAATGAATGGTCATCAC  222

Query  223  CAACAGAATGGAGTGGAAAACATGATGTTGTTTGAAGTTGTTAAAATGGGCAAGAGTGCTATGCAGTCGGTGGT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CAACAGAATGGAGTGGAAAACATGATGTTGTTTGAAGTTGTTAAAATGGGCAAGAGTGCTATGCAGTCGGTGGT  296

Query  297  AGATGATTGGATAGAATCATACAAGCATGACCGAGATATAGCACTTCTTGACCTTATCAACTTTTTTATTCAGT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGATGATTGGATAGAATCATACAAGCATGACCGAGATATAGCACTTCTTGACCTTATCAACTTTTTTATTCAGT  370

Query  371  GTTCAGGCTGTAAAGGAGTTGTCACAGCAGAAATGTTTAGACATATGCAGAACTCTGAGATAATTCGAAAAATG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GTTCAGGCTGTAAAGGAGTTGTCACAGCAGAAATGTTTAGACATATGCAGAACTCTGAGATAATTCGAAAAATG  444

Query  445  ACTGAAGAATTCGATGAGGATAGTGGAGATTATCCACTTACCATGGCTGGTCCTCAGTGGAAGAAGTTCAAATC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ACTGAAGAATTCGATGAGGATAGTGGAGATTATCCACTTACCATGGCTGGTCCTCAGTGGAAGAAGTTCAAATC  518

Query  519  CAGTTTTTGTGAATTCATTGGCGTGTTAGTACGGCAATGTCAATATAGTATCATATATGATGAGTATATGATGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CAGTTTTTGTGAATTCATTGGCGTGTTAGTACGGCAATGTCAATATAGTATCATATATGATGAGTATATGATGG  592

Query  593  ATACAGTCATTTCACTTCTTACAGGATTGTCTGACTCACAAGTCAGAGCATTTCGACATACAAGCACCCTGGCA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATACAGTCATTTCACTTCTTACAGGATTGTCTGACTCACAAGTCAGAGCATTTCGACATACAAGCACCCTGGCA  666

Query  667  GCTATGAAGTTGATGACAGCTTTGGTGAATGTGGCACTAAATCTTAGCATTAATATGGATAATACACAAAGACA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GCTATGAAGTTGATGACAGCTTTGGTGAATGTGGCACTAAATCTTAGCATTAATATGGATAATACACAAAGACA  740

Query  741  ATATGAAGCAGAACGGAATAAAATGATTGGAAAACGAGCCAATGAGAGGCTAGAACTCCTGCTACAAAAGCGGA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ATATGAAGCAGAACGGAATAAAATGATTGGAAAACGAGCCAATGAGAGGCTAGAACTCCTGCTACAAAAGCGGA  814

Query  815  AAGAGCTTCAGGAAAATCAAGATGAAATAGAAAATATGATGAATGCAATATTTAAAGGAGTGTTTGTACATAGA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AAGAGCTTCAGGAAAATCAAGATGAAATAGAAAATATGATGAATGCAATATTTAAAGGAGTGTTTGTACATAGA  888

Query  889  TACCGTGATGCGATAGCTGAAATTCGAGCTATTTGCATTGAAGAGATTGGCATTTGGATGAAGATGTATAGTGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TACCGTGATGCGATAGCTGAAATTCGAGCTATTTGCATTGAAGAGATTGGCATTTGGATGAAGATGTATAGTGA  962

Query  963  TGCCTTTCTTAATGACAGTTATTTAAAATATGTTGGTTGGACTATGCATGATAAGCAAGGTGAAGTAAGACTCA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGCCTTTCTTAATGACAGTTATTTAAAATATGTTGGTTGGACTATGCATGATAAGCAAGGTGAAGTAAGACTCA  1036

Query 1037  AATGTCTTACTGCTCTACAAGGGCTTTATTATAACAAAGAGCTTAATTCCAAACTGGAACTTTTTACCAGTCGG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AATGTCTTACTGCTCTACAAGGGCTTTATTATAACAAAGAGCTTAATTCCAAACTGGAACTTTTTACCAGTCGG  1110

Query 1111  TTCAAGGATAGAATTGTGTCTATGACCCTTGACAAAGAATATGATGTTGCAGTACAAGCAATAAAATTACTCAC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TTCAAGGATAGAATTGTGTCTATGACCCTTGACAAAGAATATGATGTTGCAGTACAAGCAATAAAATTACTCAC  1184

Query 1185  TCTTGTTTTACAGAGTAGTGAAGAAGTTCTCACTGCAGAAGATTGTGAAAATGTCTATCATCTGGTTTATTCAG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TCTTGTTTTACAGAGTAGTGAAGAAGTTCTCACTGCAGAAGATTGTGAAAATGTCTATCATCTGGTTTATTCAG  1258

Query 1259  CTCACCGGCCAGTAGCAGTAGCAGCTGGAGAATTTCTCTACAAAAAGCTCTTCAGTCGTAGAGATCCAGAGGAG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CTCACCGGCCAGTAGCAGTAGCAGCTGGAGAATTTCTCTACAAAAAGCTCTTCAGTCGTAGAGATCCAGAGGAG  1332

Query 1333  GATGGAATGATGAAAAGAAGAGGAAGACAAGGTCCAAATGCCAACCTTGTTAAGACATTGGTTTTTTTCTTTCT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GATGGAATGATGAAAAGAAGAGGAAGACAAGGTCCAAATGCCAACCTTGTTAAGACATTGGTTTTTTTCTTTCT  1406

Query 1407  AGAAAGTGAGTTACATGAGCATGCAGCATACCTTGTGGATAGCATGTGGGACTGTGCTACTGAGCTGCTGAAAG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AGAAAGTGAGTTACATGAGCATGCAGCATACCTTGTGGATAGCATGTGGGACTGTGCTACTGAGCTGCTGAAAG  1480

Query 1481  ACTGGGAATGTATGAATAGCTTGTTACTGGAAGAGCCACTTAGTGGAGAGGAAGCACTAACAGATAGGCAAGAG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  ACTGGGAATGTATGAATAGCTTGTTACTGGAAGAGCCACTTAGTGGAGAGGAAGCACTAACAGATAGGCAAGAG  1554

Query 1555  AGTGCTCTGATTGAAATAATGCTTTGTACCATTAGACAAGCGGCTGAATGTCATCCTCCCGTGGGAAGAGGGAC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  AGTGCTCTGATTGAAATAATGCTTTGTACCATTAGACAAGCGGCTGAATGTCATCCTCCCGTGGGAAGAGGGAC  1628

Query 1629  AGGAAAAAGGGTGCTTACAGCAAAGGAGAAGAAGACACAGTTGGATGATAGGACAAAAATCACTGAGCTTTTTG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  AGGAAAAAGGGTGCTTACAGCAAAGGAGAAGAAGACACAGTTGGATGATAGGACAAAAATCACTGAGCTTTTTG  1702

Query 1703  CCGTGGCCCTTCCTCAGTTATTAGCAAAATACTCTGTAGATGCAGAAAAGGTGACTAACTTGTTGCAGTTGCCT  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CCGTGGCCCTTCCTCAGTTATTAGCAAAATACTCTGTAGATGCAGAAAAGGTGACTAACTTGTTGCAGTTGCCT  1776

Query 1777  CAGTACTTTGATTTGGAAATATATACCACTGGACGATTAGAAAAGCATTTGGATGCCTTATTGCGACAGATCCG  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CAGTACTTTGATTTGGAAATATATACCACTGGACGATTAGAAAAGCATTTGGATGCCTTATTGCGACAGATCCG  1850

Query 1851  GAATATTGTAGAGAAGCACACAGATACAGATGTTTTGGAAGCATGTTCTAAAACTTACCATGCACTCTGTAATG  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GAATATTGTAGAGAAGCACACAGATACAGATGTTTTGGAAGCATGTTCTAAAACTTACCATGCACTCTGTAATG  1924

Query 1925  AAGAGTTCACAATCTTCAACAGAGTAGATATTTCAAGAAGTCAACTGATAGATGAATTGGCAGATAAATTTAAC  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  AAGAGTTCACAATCTTCAACAGAGTAGATATTTCAAGAAGTCAACTGATAGATGAATTGGCAGATAAATTTAAC  1998

Query 1999  CGGCTTCTTGAAGATTTTCTGCAAGAGGGTGAAGAACCTGATGAAGATGATGCATATCAGGTATTGTCAACATT  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CGGCTTCTTGAAGATTTTCTGCAAGAGGGTGAAGAACCTGATGAAGATGATGCATATCAGGTATTGTCAACATT  2072

Query 2073  GAAGAGGATCACTGCTTTTCATAATGCCCATGACCTTTCAAAGTGGGATTTATTTGCTTGTAATTACAAACTCT  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  GAAGAGGATCACTGCTTTTCATAATGCCCATGACCTTTCAAAGTGGGATTTATTTGCTTGTAATTACAAACTCT  2146

Query 2147  TGAAAACTGGAATCGAAAATGGAGACATGCCTGAGCAGATTGTTATTCACGCACTGCAGTGTACTCACTATGTA  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  TGAAAACTGGAATCGAAAATGGAGACATGCCTGAGCAGATTGTTATTCACGCACTGCAGTGTACTCACTATGTA  2220

Query 2221  ATCCTTTGGCAACTTGCTAAGATAACTGAAAGCAGCTCTACAAAGGAGGACTTGCTGCGTTTAAAGAAACAAAT  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  ATCCTTTGGCAACTTGCTAAGATAACTGAAAGCAGCTCTACAAAGGAGGACTTGCTGCGTTTAAAGAAACAAAT  2294

Query 2295  GAGAGTATTTTGTCAGATATGTCAACATTACCTGACCAACGTGAATACTACTGTTAAGGAACAGGCCTTCACTA  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  GAGAGTATTTTGTCAGATATGTCAACATTACCTGACCAACGTGAATACTACTGTTAAGGAACAGGCCTTCACTA  2368

Query 2369  TTCTGTGTGATATTTTGATGATCTTCAGCCATCAGATTATGTCAGGAGGGCGTGACATGTTAGAGCCATTAGTG  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  TTCTGTGTGATATTTTGATGATCTTCAGCCATCAGATTATGTCAGGAGGGCGTGACATGTTAGAGCCATTAGTG  2442

Query 2443  TATACCCCTGATTCTTCATTGCAGTCTGAGTTGCTCAGCTTTATTTTGGATCATGTCTTCATTGAACAGGATGA  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  TATACCCCTGATTCTTCATTGCAGTCTGAGTTGCTCAGCTTTATTTTGGATCATGTCTTCATTGAACAGGATGA  2516

Query 2517  TGATAATAATAGTGCAGATGGTCAGCAAGAGGATGAAGCCAGTAAAATTGAAGCTCTGCACAAGAGAAGAAATT  2590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  TGATAATAATAGTGCAGATGGTCAGCAAGAGGATGAAGCCAGTAAAATTGAAGCTCTGCACAAGAGAAGAAATT  2590

Query 2591  TACTTGCAGCATTTTGTAAGCTAATTGTATATACTGTGGTGGAGATGAATACAGCTGCAGATATCTTCAAACAG  2664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  TACTTGCAGCATTTTGTAAGCTAATTGTATATACTGTGGTGGAGATGAATACAGCTGCAGATATCTTCAAACAG  2664

Query 2665  TATATGAAGTATTATAATGACTATGGAGATATCATCAAAGAAACAATGAGTAAAACAAGGCAGATAGACAAAAT  2738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  TATATGAAGTATTATAATGACTATGGAGATATCATCAAAGAAACAATGAGTAAAACAAGGCAGATAGACAAAAT  2738

Query 2739  TCAGTGTGCTAAGACCCTTATTCTCAGTCTGCAACAGCTTTTTAATGAAATGATACAAGAAAATGGCTATAATT  2812
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  TCAGTGTGCTAAGACCCTTATTCTCAGTCTGCAACAGCTTTTTAATGAAATGATACAAGAAAATGGCTATAATT  2812

Query 2813  TTGATAGATCATCCTCTACATTTAGTGGCATAAAAGAACTTGCTCGACGTTTTGCTTTAACTTTTGGACTTGAT  2886
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813  TTGATAGATCATCCTCTACATTTAGTGGCATAAAAGAACTTGCTCGACGTTTTGCTTTAACTTTTGGACTTGAT  2886

Query 2887  CAGTTGAAAACAAGAGAAGCCATTGCCATGCTACACAAAGATGGCATAGAATTTGCTTTTAAAGAGCCTAATCC  2960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887  CAGTTGAAAACAAGAGAAGCCATTGCCATGCTACACAAAGATGGCATAGAATTTGCTTTTAAAGAGCCTAATCC  2960

Query 2961  GCAAGGGGAGAGCCATCCACCTTTAAATTTGGCATTTCTTGATATTCTGAGTGAATTTTCTTCTAAACTACTTC  3034
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961  GCAAGGGGAGAGCCATCCACCTTTAAATTTGGCATTTCTTGATATTCTGAGTGAATTTTCTTCTAAACTACTTC  3034

Query 3035  GACAAGACAAAAGAACAGTGTATGTTTACTTGGAAAAGTTCATGACCTTTCAGATGTCACTCCGAAGAGAGGAT  3108
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035  GACAAGACAAAAGAACAGTGTATGTTTACTTGGAAAAGTTCATGACCTTTCAGATGTCACTCCGAAGAGAGGAT  3108

Query 3109  GTGTGGCTTCCACTGATGTCTTACCGAAATTCTTTGCTAGCTGGTGGTGATGATGACACCATGTCAGTCATTAG  3182
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109  GTGTGGCTTCCACTGATGTCTTACCGAAATTCTTTGCTAGCTGGTGGTGATGATGACACCATGTCAGTCATTAG  3182

Query 3183  TGGAATCAGCAGCCGGGGGTCAACAGTACGGAGTAAAAAATCAAAACCATCTACAGGAAAACGGAAAGTGGTTG  3256
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183  TGGAATCAGCAGCCGGGGGTCAACAGTACGGAGTAAAAAATCAAAACCATCTACAGGAAAACGGAAAGTGGTTG  3256

Query 3257  AGGGCATGCAGCTTTCACTCACTGAAGAAAGTAGTAGTAGTGACAGTATGTGGTTAAGCAGAGAACAAACACTG  3330
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3257  AGGGCATGCAGCTTTCACTCACTGAAGAAAGTAGTAGTAGTGACAGTATGTGGTTAAGCAGAGAACAAACACTG  3330

Query 3331  CACACCCCTGTTATGATGCAGACACCACAACTCACCTCCACTATTATGAGAGAGCCCAAAAGATTACGGCCTGA  3404
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3331  CACACCCCTGTTATGATGCAGACACCACAACTCACCTCCACTATTATGAGAGAGCCCAAAAGATTACGGCCTGA  3404

Query 3405  GGATAGCTTCATGAGTGTTTATCCAATGCAGACTGAACATCATCAAACACCTCTTGATTATAATCGGCGTGGCA  3478
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3405  GGATAGCTTCATGAGTGTTTATCCAATGCAGACTGAACATCATCAAACACCTCTTGATTATAATCGGCGTGGCA  3478

Query 3479  CAAGCCTAATGGAAGATGATGAAGAGCCAATTGTGGAAGATGTTATGATGTCCTCAGAAGGGAGGATTGAGGAT  3552
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3479  CAAGCCTAATGGAAGATGATGAAGAGCCAATTGTGGAAGATGTTATGATGTCCTCAGAAGGGAGGATTGAGGAT  3552

Query 3553  CTTAATGAGGGAATGGATTTTGACACCATGGATATAGATTTGCCACCATCAAAGAACAGACGAGAGAGAACAGA  3626
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3553  CTTAATGAGGGAATGGATTTTGACACCATGGATATAGATTTGCCACCATCAAAGAACAGACGAGAGAGAACAGA  3626

Query 3627  ACTGAAGCCTGATTTCTTTGATCCAGCTTCAATTATGGATGAATCAGTTCTTGGAGTGTCAATGTTT  3693
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3627  ACTGAAGCCTGATTTCTTTGATCCAGCTTCAATTATGGATGAATCAGTTCTTGGAGTGTCAATGTTT  3693