Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_02519
- Subject:
- XM_006532320.3
- Aligned Length:
- 3311
- Identities:
- 2922
- Gaps:
- 13
Alignment
Query 1 ATGGCTGGTGCCTCGGTGAAAGTGGCAGTGAGGGTTCGGCCCTTTAACGCCCGTGAGACCAGCCAGGATGCCAA 74
||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCTGGAGCCTCCGTGAAAGTTGCAGTGAGGGTTCGGCCCTTTAATGCCCGTGAGACCAGCCAGGATGCCAA 74
Query 75 GTGTGTGGTCAGCATGCAGGGCAACACCACCTCCATCATCAATCCTAAACAGAGCAAGGATGCCCCCAAAAGCT 148
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GTGTGTGGTCAGCATGCAGGGCAACACCACCTCCATCATTAATCCCAAACAGAGCAAGGATGCCCCCAAAAGCT 148
Query 149 TCACCTTTGACTACTCCTACTGGTCACACACTTCGACGGAGGACCCCCAGTTTGCATCTCAGCAGCAAGTGTAT 222
|||||||.|||||.||.||||||||.||.||||||..||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.
Sbjct 149 TCACCTTCGACTATTCTTACTGGTCGCATACTTCGGTGGAGGATCCGCAGTTTGCATCTCAGCAGCAGGTGTAC 222
Query 223 CGGGACATTGGAGAAGAGATGCTGCTCCACGCCTTTGAAGGCTACAACGTGTGCATCTTTGCCTATGGGCAGAC 296
||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 223 CGAGACATAGGAGAAGAGATGCTACTCCATGCCTTTGAAGGCTACAATGTGTGCATCTTTGCCTACGGGCAGAC 296
Query 297 CGGGGCTGGGAAATCCTATACCATGATGGGGCGACAGGAGCCAGGGCAGCAGGGCATCGTGCCCCAGCTCTGTG 370
.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct 297 GGGGGCTGGGAAGTCCTACACCATGATGGGGCGGCAGGAGCCGGGGCAGCAGGGCATTGTGCCTCAGCTCTGTG 370
Query 371 AGGACCTCTTCTCTCGCGTTAGTGAGAACCAGAGTGCTCAGCTATCCTACTCTGTGGAGGTGAGCTATATGGAG 444
||||||||||||||||.||.|.||.||||||||||||.|||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.
Sbjct 371 AGGACCTCTTCTCTCGAGTCAATGTGAACCAGAGTGCCCAGCTTTCCTATTCAGTAGAGGTGAGCTATATGGAA 444
Query 445 ATCTACTGTGAGCGGGTACGAGACCTCTTGAACCCCAAGAGTCGGGGTTCTCTGCGGGTCCGGGAGCACCCCAT 518
|||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 ATCTATTGCGAGCGAGTACGAGACCTCTTGAACCCCAAGAGTCGGGGCTCTCTGCGGGTCCGGGAGCACCCCAT 518
Query 519 CCTGGGCCCGTACGTGCAGGACCTGTCCAAATTGGCTGTGACCTCCTACGCAGACATTGCTGACCTCATGGACT 592
|||.||||||||||||||.||||||||.|||.||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 519 CCTAGGCCCGTACGTGCAAGACCTGTCTAAACTGGCTGTGACTTCCTATGCAGACATTGCCGACCTCATGGACT 592
Query 593 GTGGAAATAAAGCACGGACTGTGGCTGCCACCAACATGAATGAGACCAGCAGCCGTTCCCATGCCGTCTTTACC 666
||||||||||.|||.|.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 593 GTGGAAATAAGGCAAGAACCGTGGCTGCCACCAACATGAACGAGACCAGCAGCCGCTCCCATGCCGTCTTTACT 666
Query 667 ATCGTCTTCACACAGCGCTGCCATGACCAGCTCACGGGGCTGGACTCGGAGAAGGTCAGTAAGATCAGTTTGGT 740
||.|||||.||.|||||.|.||||||||||||.||.||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 667 ATTGTCTTTACCCAGCGATCCCATGACCAGCTTACTGGCCTGGATTCAGAAAAGGTCAGTAAGATCAGCTTGGT 740
Query 741 GGACCTTGCTGGGAGTGAGCGAGCCGACTCCTCAGGGGCCCGGGGCATGCGCCTGAAGGAAGGAGCCAACATCA 814
||||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||||
Sbjct 741 GGACCTCGCCGGGAGTGAGCGGGCTGACTCCTCAGGGGCCCGGGGGATGCGTCTAAAGGAAGGCGCCAACATCA 814
Query 815 ATAAGTCCCTGACTACACTAGGGAAAGTGATCTCGGCCCTTGCAGATATGCAATCAAAGAAGCGAAAGTCGGAT 888
||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.||||||.||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 815 ATAAGTCCCTGACTACGCTTGGGAAGGTGATCTCAGCCCTGGCAGATTTGCAATCAAAGAAGCGGAAGTCGGAT 888
Query 889 TTTATCCCCTACAGGGACTCTGTGCTCACCTGGCTGCTCAAGGAAAATTTGGGGGGGAACTCACGCACAGCCAT 962
||.||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.||
Sbjct 889 TTCATCCCCTATAGAGACTCAGTGCTTACCTGGCTGCTCAAGGAGAATTTGGGTGGGAACTCTCGCACAGCAAT 962
Query 963 GATTGCAGCCCTGAGCCCTGCTGACATCAATTACGAGGAGACTCTCAGCACCCTCAGGTATGCTGACCGCACCA 1036
|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct 963 GATTGCAGCCCTGAGTCCTGCTGACATCAATTACGAGGAGACACTCAGCACTCTCAGGTATGCAGACCGCACCA 1036
Query 1037 AGCAAATCCGCTGCAATGCCATCATCAACGAGGACCCTAATGCCCGGCTGATTAGAGAGCTGCAGGAGGAAGTA 1110
||||.|||||.||||||||..||||||||||||||||.|||||||||||.||..|.||||||||||||||.||.
Sbjct 1037 AGCAGATCCGATGCAATGCTGTCATCAACGAGGACCCCAATGCCCGGCTTATCCGGGAGCTGCAGGAGGAGGTG 1110
Query 1111 GCCCGGCTGCGGGAACTGCTGATGGCTCAGGGACTGTCAGCCTCTGCTCTGGAAGGCCTGAAGACGGAAGAAGG 1184
||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|.|||.||.|||..||||||.||
Sbjct 1111 GCCCGGCTGCGGGACCTGCTGATGGCTCAGGGGCTGTCAGCCTCTGCTCTAGGAGGTCTAAAGGTGGAAGAGGG 1184
Query 1185 GAGTGTCAGAGGCGCCCTGCCAGCTGTGTCATCTCCCCCAGCTCCAGTTTCACCCTCATCACCCACCACACATA 1258
||||....||||.|..|||||..|||..|||||||||||.||.||||.||||||||||||.||..||.||||||
Sbjct 1185 GAGTCCTGGAGGTGTTCTGCCCCCTGCATCATCTCCCCCCGCCCCAGCTTCACCCTCATCTCCTCCCCCACATA 1258
Query 1259 ATGGGGAGCTGGAGCCGTCATTCTCCCCCAACACGGAGTCCCAGATTGGGCCTGAGGAAGCCATGGAGAGGCTG 1332
||||||||||||||||.||||||||.||||...|.|||.|||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1259 ATGGGGAGCTGGAGCCCTCATTCTCACCCAGTGCCGAGCCCCAGATTGGGCCTGAGGAGGCCATGGAGAGGCTG 1332
Query 1333 CAGGAGACAGAGAAGATTATAGCTGAGCTGAACGAGACATGGGAGGAGAAGCTACGCAAGACAGAAGCCCTGAG 1406
|||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||
Sbjct 1333 CAGGAAACAGAGAAGATCATAGCTGAGCTGAATGAGACTTGGGAGGAGAAGCTTCGGAAGACAGAGGCTCTGAG 1406
Query 1407 GATGGAGAGAGAAGCATTGCTGGCTGAGATGGGGGTGGCCGTCCGGGAGGATGGGGGAACTGTGGGCGTCTTCT 1480
.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||||
Sbjct 1407 AATGGAGAGAGAAGCATTGCTGGCTGAGATGGGCGTGGCTGTCCGGGAGGATGGCGGTACTGTGGGTGTCTTCT 1480
Query 1481 CTCCAAAGAAGACTCCCCACCTGGTGAACCTGAACGAAGACCCTCTGATGTCTGAGTGTCTGCTCTACCACATC 1554
|||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||..||||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 1481 CTCCAAAAAAGACTCCCCACCTGGTAAATCTGAATGAGGACCCCTTGATGTCTGAATGTCTTCTCTACCACATC 1554
Query 1555 AAAGATGGCGTCACCAGGGTCGGCCAAGTAGATATGGACATCAAGCTGACCGGACAGTTCATTCGGGAGCAACA 1628
||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||||||.||||.||.||||||||.||||||||.||
Sbjct 1555 AAAGATGGCGTCACCAGGGTTGGCCAAGTAGATGTGGACATCAAGTTGACTGGCCAGTTCATCCGGGAGCAGCA 1628
Query 1629 CTGTCTGTTCCGGAGCATCCCCCAGCCAGATGGAGAAGTGGTGGTCACTCTGGAGCCTTGTGAAGGAGCTGAGA 1702
.||.||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 TTGCCTCTTCCGCAGCATCCCTCAGCCTGATGGAGAAGTGATGGTTACTCTGGAGCCTTGTGAAGGAGCTGAGA 1702
Query 1703 CATATGTGAATGGGAAGCTTGTGACGGAGCCGCTGGTGCTGAAGTCAGGGAATAGGATTGTGATGGGCAAGAAC 1776
|||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 1703 CATATGTCAATGGGAAGCTCGTGACGGAGCCGCTGGTGCTGAAGTCAGGAAACAGGATTGTAATGGGCAAGAAC 1776
Query 1777 CACGTTTTCCGCTTCAACCACCCGGAGCAGGCAAGGCTGGAACGGGAACGAGGGGTCCCCCCACCCCCAGGACC 1850
||.||||||||||||||.||||||||||||||..||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1777 CATGTTTTCCGCTTCAATCACCCGGAGCAGGCGCGGCTGGAACGAGAACGTGGGGTCCCCCCGCCCCCAGGACC 1850
Query 1851 GCCCTCTGAGCCAGTCGACTGGAACTTTGCCCAGAAGGAACTGCTGGAGCAGCAAGGCATCGACATAAAGCTGG 1924
.|||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 1851 TCCCTCGGAGCCTGTGGACTGGAACTTTGCTCAGAAGGAGCTGCTGGAGCAGCAAGGCATAGACATCAAGCTGG 1924
Query 1925 AAATGGAGAAGAGGCTGCAGGATCTGGAGAATCAGTACCGGAAAGAAAAGGAAGAAGCCGATCTTCTGCTGGAG 1998
|.||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||
Sbjct 1925 AGATGGAGAAGAGGCTGCAGGACTTGGAGAATCAGTACCGGAAAGAGAAGGAAGAGGCTGACCTTCTGCTGGAG 1998
Query 1999 CAGCAGCGACTGTATGCAGACTCGGACAGCGGGGATGACTCTGACAAGCGCTCTTGTGAAGAGAGCTGGAGGCT 2072
||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||.||||
Sbjct 1999 CAGCAGCGGCTGTATGCAGACTCTGACAGCGGGGAAGACTCTGACAAGCGTTCTTGTGAAGAAAGCTGGCGGCT 2072
Query 2073 CATCTCCTCCTTGCGGGAGCAGCTGCCGCCCACCACGGTCCAGACCATTGTCAAACGCTGTGGTCTGCCCAGCA 2146
.||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||||.|||||||||.||||||||.|||||.||.|
Sbjct 2073 GATTTCCTCCTTGCGGGAGCAGCTGCCCCCTACCACAGTACAGAACATTGTCAAGCGCTGTGGCCTGCCTAGTA 2146
Query 2147 GTGGCAAGCGCAGGGCCCCTCGCAGGGTTTATCAGATCCCCCAGCGACGCAGGCTGCAGGGCAAAGACCCCCGC 2220
||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||..||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 2147 GTGGCAAGCGCAGGGCCCCTCGAAGAGTCTATCAGATCCCTCAGCGACGGCGGCTCCAGGGCAAAGACCCCCGA 2220
Query 2221 TGGGCCACCATGGCTGACCTGAAGATGCAGGCGGTGAAGGAGATCTGCTACGAGGTGGCCCTGGCTGACTTCCG 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||
Sbjct 2221 TGGGCCACCATGGCTGACCTGAAGATGCAGGCAGTAAAGGAGATATGCTATGAGGTGGCCCTAGCCGACTTCCG 2294
Query 2295 CCACGGGCGGGCTGAGATTGAGGCCCTGGCCGCCCTCAAGATGCGGGAGCTGTGTCGCACCTATGGCAAGCCAG 2368
||||||.||.||.||.|||||.||||||||.||.|||||||||.||||||||||.||.|||||.||||||||||
Sbjct 2295 CCACGGACGAGCAGAAATTGAAGCCCTGGCTGCTCTCAAGATGAGGGAGCTGTGCCGAACCTACGGCAAGCCAG 2368
Query 2369 ACGGCCCCGGAGACGCCTGGAGGGCTGTGGCCCGGGATGTCTGGGACACTGTAGGCGAGGAGGAAGGAGGTGGA 2442
|.||.||.|||||.||||||||.||.||||||.|||||||||||||.|||||.||.||.||.||||||.|||||
Sbjct 2369 AGGGTCCTGGAGATGCCTGGAGAGCCGTGGCCAGGGATGTCTGGGATACTGTGGGTGAAGAAGAAGGATGTGGA 2442
Query 2443 GCTGGCAGTGGTGGTGGCAGTGAGGAGGGAGCCCGAGGGGCGGAGGTGGAGGACCTCCGGGCCCACATCGACAA 2516
|.|||| ||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 2443 GGTGGC---GGAGGTGGCAGTGAGGAGGGAGCCCGTGGGGCAGAGGTGGAGGACCTCCGGGCTCACATCGACAA 2513
Query 2517 GCTGACGGGGATTCTGCAGGAGGTGAAGCTGCAGAACAGCAGCAAGGACCGGGAGCTGCAGGCCCTGCGGGACC 2590
||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 2514 GCTGACAGGGATCCTGCAGGAGGTGAAGCTCCAGAACAGCAGCAAGGACCGCGAGCTGCAGGCCCTGCGGGACC 2587
Query 2591 GCATGCTCCGCATGGAGAGGGTCATCCCCCTGGCCCAGGATCATGAGGATGAGAATGAAGAAGGTGGTGAGGTC 2664
||||||||||||||||||||||||||||.|||.|.|||||||.|||||||||.|||||.||...||||..||||
Sbjct 2588 GCATGCTCCGCATGGAGAGGGTCATCCCGCTGACTCAGGATCTTGAGGATGATAATGACGAGTCTGGTTTGGTC 2661
Query 2665 CCCTGGGCCCCGCCTGAAGGATCAGAGGCAGCAGAGGAGGCAGCCCCCAGTGACCGCATGCCGTCAGCCCGGCC 2738
.||||||||||.||.|||||..||||.||||.|||||||.|||..||||..||||.|...||..|.|.||||||
Sbjct 2662 ACCTGGGCCCCACCGGAAGGGCCAGAAGCAGTAGAGGAGACAGTGCCCAACGACCACTCACCAGCTGTCCGGCC 2735
Query 2739 CCCCTCGCCACCACTGTCAAGCTGGGAGCGGGTGTCACGGCTCATGGAGGAGGACCCTGCCTTCCGTCGTGGTC 2812
|.||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||..|..|.|||||.||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 2736 CACCTCACCACCTCTGTCCAGCTGGGAGCGGGTGTCGAGATTGATGGAAGAGGACCCTGCCTTCCGTCGCGGCC 2809
Query 2813 GTCTTCGCTGGCTCAAGCAGGAGCAGCTACGGCTGCAGGGACTGCAGGGCTCTGGGGGCCGGGGCGGGGGGCTG 2886
|.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 2810 GCCTTCGCTGGCTCAAGCAGGAGCAGCTGCGGCTGCAGGGACTGCAGGGCGCTGGGGGCCGGGGTGGGGGACTG 2883
Query 2887 CGCAGGCCCCCAGCCCGCTTTGTGCCCCCTCACGACTGCAAGCTACGCTTCCCCTTCAAGAGCAACCCCCAGCA 2960
||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 2884 CGCAGGCCTCCAGCCCGCTTTGTGCCCCCGCATGATTGCAAGCTGCGCTTCCCCTTCAAAAGCAACCCTCAGCA 2957
Query 2961 CCGGGAGTCTTGGCCAGGGATGGGGAGCGGGGAGGCTCCAACTCCGCTCCAACCCCCTGAGGAGGTCAC--TCC 3032
|.|||||||.||||||||.||||||||.||.|||||.|||.|||| .||.||||||||.|||||||| |||
Sbjct 2958 CAGGGAGTCCTGGCCAGGAATGGGGAGTGGAGAGGCCCCAGCTCC---TCAGCCCCCTGAAGAGGTCACTGTCC 3028
Query 3033 CCATCCAGCCACCCCTGCCCGCCGGCCTCCGAGTCCCCGAAGGTCCCACCATCCCCGCAGGAACTCCCTGGATG 3106
|| |||||..|||||..|||..|||||||.|||||||||||..||||||.|.|.||||||||.|||||.||||
Sbjct 3029 CC--CCAGCACCCCCTAACCGTAGGCCTCCAAGTCCCCGAAGACCCCACCGTTCTCGCAGGAATTCCCTAGATG 3100
Query 3107 GAGGGGGCCGATCCCGGGGAGCGGGTTCTGCACAGCCTGAACCCCAGCACTTCCAGCCCAAAAAGCACAACTCT 3180
|||||.|||||||.|||||||.|||||||.|||||||.||||||||||||||.|.||||.|||||||||||..|
Sbjct 3101 GAGGGAGCCGATCTCGGGGAGGGGGTTCTACACAGCCAGAACCCCAGCACTTACGGCCCCAAAAGCACAACGGT 3174
Query 3181 TATCCCCAGCCACCCCAACCCTACCCAGCCCAGCGGCCCCCAGGGCCCCGCTACCCCCCATACACTACTCCCCC 3254
||||||||.|..|||||.|||..||||||||||||| |||||||||||||||||.|||||||||||.||.||
Sbjct 3175 TATCCCCAACAGCCCCAGCCCAGCCCAGCCCAGCGG---CCAGGGCCCCGCTACCCACCATACACTACCCCTCC 3245
Query 3255 ACGAATGAGACGGCAGCGTTCTGCCCCTGACCTCAAGGAGAGTGGGGCAGCTGTG 3309
.||||||.||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 3246 GCGAATGCGACGGCAGCGCTCAGCCCCTGACCTCAAAGAGAGTGGGGCAGCTGTG 3300