Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02521
• Subject: NM_006620.4
• Aligned Length: 2052
• Identities: 2052
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGCCCGGCATCGGAATGTTCGAGGCTATAACTACGATGAAGATTTTGAAGATGATGATCTCTACGGCCAGTC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCCCGGCATCGGAATGTTCGAGGCTATAACTACGATGAAGATTTTGAAGATGATGATCTCTACGGCCAGTC  74

Query   75  TGTAGAGGATGATTATTGTATTTCGCCGTCAACAGCTGCTCAGTTTATTTATTCACGGCGTGACAAACCTTCCG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGTAGAGGATGATTATTGTATTTCGCCGTCAACAGCTGCTCAGTTTATTTATTCACGGCGTGACAAACCTTCCG  148

Query  149  TTGAGCCTGTGGAAGAATATGATTATGAAGATCTGAAAGAATCTTCCAATTCTGTTTCAAACCATCAGCTCAGT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TTGAGCCTGTGGAAGAATATGATTATGAAGATCTGAAAGAATCTTCCAATTCTGTTTCAAACCATCAGCTCAGT  222

Query  223  GGATTTGATCAAGCTCGTCTTTATTCATGCCTTGATCACATGAGAGAGGTACTTGGAGATGCTGTGCCAGATGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGATTTGATCAAGCTCGTCTTTATTCATGCCTTGATCACATGAGAGAGGTACTTGGAGATGCTGTGCCAGATGA  296

Query  297  AATATTAATTGAAGCAGTTCTGAAGAACAAGTTTGATGTGCAGAAGGCTTTGTCAGGGGTTCTGGAACAAGATA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AATATTAATTGAAGCAGTTCTGAAGAACAAGTTTGATGTGCAGAAGGCTTTGTCAGGGGTTCTGGAACAAGATA  370

Query  371  GAGTGCAGAGTTTGAAGGACAAGAATGAGGCAACAGTATCTACAGGAAAGATAGCAAAAGGAAAACCAGTAGAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GAGTGCAGAGTTTGAAGGACAAGAATGAGGCAACAGTATCTACAGGAAAGATAGCAAAAGGAAAACCAGTAGAT  444

Query  445  TCCCAGACATCGCGAAGTGAATCTGAAATTGTGCCAAAAGTTGCTAAAATGACTGTATCTGGAAAGAAGCAAAC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TCCCAGACATCGCGAAGTGAATCTGAAATTGTGCCAAAAGTTGCTAAAATGACTGTATCTGGAAAGAAGCAAAC  518

Query  519  TATGGGATTTGAAGTGCCTGGAGTATCTTCTGAAGAAAATGGTCATAGTTTCCACACACCTCAAAAAGGACCGC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TATGGGATTTGAAGTGCCTGGAGTATCTTCTGAAGAAAATGGTCATAGTTTCCACACACCTCAAAAAGGACCGC  592

Query  593  CCATTGAAGATGCCATTGCTTCTTCCGATGTTCTTGAGACTGCTTCTAAATCTGCTAATCCACCCCACACGATT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCATTGAAGATGCCATTGCTTCTTCCGATGTTCTTGAGACTGCTTCTAAATCTGCTAATCCACCCCACACGATT  666

Query  667  CAAGCATCAGAAGAGCAGAGTTCAACCCCAGCACCGGTGAAAAAGTCTGGCAAGCTGAGGCAGCAAATAGATGT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CAAGCATCAGAAGAGCAGAGTTCAACCCCAGCACCGGTGAAAAAGTCTGGCAAGCTGAGGCAGCAAATAGATGT  740

Query  741  GAAGGCGGAACTGGAGAAGCGGCAAGGAGGGAAGCAGCTACTCAACTTAGTGGTCATTGGTCATGTTGATGCTG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GAAGGCGGAACTGGAGAAGCGGCAAGGAGGGAAGCAGCTACTCAACTTAGTGGTCATTGGTCATGTTGATGCTG  814

Query  815  GGAAAAGTACTCTGATGGGCCATATGCTTTATCTTCTGGGTAATATAAACAAAAGAACTATGCATAAGTATGAA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GGAAAAGTACTCTGATGGGCCATATGCTTTATCTTCTGGGTAATATAAACAAAAGAACTATGCATAAGTATGAA  888

Query  889  CAGGAGTCTAAAAAGGCTGGCAAAGCTTCGTTTGCATATGCATGGGTCTTGGATGAAACTGGCGAAGAAAGGGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CAGGAGTCTAAAAAGGCTGGCAAAGCTTCGTTTGCATATGCATGGGTCTTGGATGAAACTGGCGAAGAAAGGGA  962

Query  963  AAGGGGAGTAACCATGGATGTTGGTATGACAAAGTTTGAAACCACAACCAAAGTTATTACATTAATGGATGCTC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AAGGGGAGTAACCATGGATGTTGGTATGACAAAGTTTGAAACCACAACCAAAGTTATTACATTAATGGATGCTC  1036

Query 1037  CAGGCCATAAGGACTTCATTCCAAATATGATTACAGGAGCAGCCCAGGCGGATGTAGCTGTTTTAGTTGTAGAT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CAGGCCATAAGGACTTCATTCCAAATATGATTACAGGAGCAGCCCAGGCGGATGTAGCTGTTTTAGTTGTAGAT  1110

Query 1111  GCCAGCAGGGGAGAGTTTGAAGCTGGATTTGAGACTGGAGGACAAACACGAGAGCATGGACTCTTGGTCCGTTC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCCAGCAGGGGAGAGTTTGAAGCTGGATTTGAGACTGGAGGACAAACACGAGAGCATGGACTCTTGGTCCGTTC  1184

Query 1185  TCTGGGAGTGACGCAGCTTGCAGTTGCAGTTAATAAAATGGATCAGGTTAATTGGCAACAAGAAAGGTTTCAAG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TCTGGGAGTGACGCAGCTTGCAGTTGCAGTTAATAAAATGGATCAGGTTAATTGGCAACAAGAAAGGTTTCAAG  1258

Query 1259  AGATTACTGGAAAACTTGGGCACTTTCTTAAGCAAGCAGGTTTTAAGGAGAGTGATGTAGGTTTTATTCCTACA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGATTACTGGAAAACTTGGGCACTTTCTTAAGCAAGCAGGTTTTAAGGAGAGTGATGTAGGTTTTATTCCTACA  1332

Query 1333  AGTGGTCTCAGTGGTGAAAATCTAATCACAAGATCTCAGTCAAGTGAACTCACAAAATGGTATAAAGGACTATG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AGTGGTCTCAGTGGTGAAAATCTAATCACAAGATCTCAGTCAAGTGAACTCACAAAATGGTATAAAGGACTATG  1406

Query 1407  TTTATTAGAACAAATTGATTCCTTTAAGCCTCCCCAGCGATCTATTGACAAACCTTTTAGATTATGTGTGTCCG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TTTATTAGAACAAATTGATTCCTTTAAGCCTCCCCAGCGATCTATTGACAAACCTTTTAGATTATGTGTGTCCG  1480

Query 1481  ATGTTTTCAAAGATCAAGGATCTGGATTTTGCATAACTGGTAAAATAGAAGCTGGTTATATCCAAACTGGTGAC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  ATGTTTTCAAAGATCAAGGATCTGGATTTTGCATAACTGGTAAAATAGAAGCTGGTTATATCCAAACTGGTGAC  1554

Query 1555  CGACTACTGGCAATGCCTCCTAATGAAACTTGTACCGTGAAAGGAATCACTCTGCATGATGAACCTGTCGACTG  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CGACTACTGGCAATGCCTCCTAATGAAACTTGTACCGTGAAAGGAATCACTCTGCATGATGAACCTGTCGACTG  1628

Query 1629  GGCGGCAGCAGGCGATCATGTTAGTCTTACTTTGGTTGGGATGGATATCATCAAAATCAATGTTGGCTGCATAT  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GGCGGCAGCAGGCGATCATGTTAGTCTTACTTTGGTTGGGATGGATATCATCAAAATCAATGTTGGCTGCATAT  1702

Query 1703  TTTGTGGCCCCAAAGTACCCATTAAAGCTTGCACTCGTTTCAGAGCCCGAATCCTCATCTTTAATATTGAAATT  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TTTGTGGCCCCAAAGTACCCATTAAAGCTTGCACTCGTTTCAGAGCCCGAATCCTCATCTTTAATATTGAAATT  1776

Query 1777  CCTATCACTAAAGGATTTCCTGTGCTGTTACACTACCAAACTGTCAGTGAACCCGCCGTTATTAAACGATTGAT  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CCTATCACTAAAGGATTTCCTGTGCTGTTACACTACCAAACTGTCAGTGAACCCGCCGTTATTAAACGATTGAT  1850

Query 1851  TAGTGTCTTAAACAAAAGCACGGGTGAAGTCACAAAGAAAAAGCCTAAGTTTTTGACTAAAGGCCAGAATGCAT  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  TAGTGTCTTAAACAAAAGCACGGGTGAAGTCACAAAGAAAAAGCCTAAGTTTTTGACTAAAGGCCAGAATGCAT  1924

Query 1925  TGGTAGAGCTACAGACACAAAGACCAATAGCTCTTGAGCTATATAAAGACTTTAAAGAGCTGGGGAGGTTCATG  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  TGGTAGAGCTACAGACACAAAGACCAATAGCTCTTGAGCTATATAAAGACTTTAAAGAGCTGGGGAGGTTCATG  1998

Query 1999  CTACGTTACGGTGGTTCTACAATAGCTGCTGGTGTTGTCACTGAGATAAAAGAA  2052
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CTACGTTACGGTGGTTCTACAATAGCTGCTGGTGTTGTCACTGAGATAAAAGAA  2052