Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02521
• Subject: NM_019702.2
• Aligned Length: 2059
• Identities: 1757
• Gaps: 20

Alignment

Query    1  ATGGCCCGGCATCGGAATGTTCGAGGCTATAACTACGATGAAGATTTTGAAGATGATGATCTCTACGGCCAGTC  74
            |||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||
Sbjct    1  ATGGCCCGGCATCGGAACGTCCGGGGATATAACTACGATGAAGATTTTGAAGATGATGATCTGTATGGGCAGTC  74

Query   75  TGTAGAGGATGATTATTGTATTTCGCCGTCAACAGCTGCTCAGTTTATTTATTCACGGCGTGACAAACCTTCCG  148
            |||.||||||||.||.|||||.||.||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||||         
Sbjct   75  TGTGGAGGATGACTACTGTATCTCACCATCAACAGCCGCTCAGTTCATTTACTCACGCCGTGACA---------  139

Query  149  TTGAGCCTGTGGAAGAATATGATTATGAAGATCTGAAAGAATCTTCCAATTCTGTTTCAAACCATCAGCTCAGT  222
               |.||||..||||||||||..|||||||||||||.|||.|||||.||||||.|||..||.||.||..|.|||
Sbjct  140  ---ACCCTGAAGAAGAATATGGCTATGAAGATCTGAGAGAGTCTTCTAATTCTCTTTTGAATCACCAATTAAGT  210

Query  223  GGATTTGATCAAGCTCGTCTTTATTCATGCCTTGATCACATGAGAGAGGTACTTGGAGATGCTGTGCCAGATGA  296
            |.|.||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||
Sbjct  211  GAAATTGACCAAGCTCGCCTGTATTCATGCCTTGATCACATGAGAGAGGTACTGGGGGACGCTGTGCCTGATGA  284

Query  297  AATATTAATTGAAGCAGTTCTGAAGAACAAGTTTGATGTGCAGAAGGCTTTGTCAGGGGTTCTGGAACAAGATA  370
            .|||.|.|.|||.|||.|||||||..||||.|||||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||.
Sbjct  285  CATACTGACTGAGGCAATTCTGAAACACAAATTTGATGTGCAGAAGGCTTTGTCCGTGGTTCTGGAACAAGATG  358

Query  371  GAGTGCAGAGTTTGAAGGACAAGAATGAGGCAACAGTATCTACAGGAAAGATAGCAAAAGGAAAACCAGTAGAT  444
            |.||||||..||.||||||.||||.||||..|.||||.|.|.|||||.||....|||||||||||.|||| .||
Sbjct  359  GTGTGCAGCCTTGGAAGGAGAAGAGTGAGCGAGCAGTGTGTGCAGGACAGCCTTCAAAAGGAAAATCAGT-TAT  431

Query  445  -TCCCAGACATCGCGAAGTGAATCTGAAATTGTGCCAAAAGTTGCTAAAATGACTGTATCTGGAAAGAAGCAAA  517
             ||.|.|.||||.|..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|
Sbjct  432  ATCTCGGTCATCCCAGAGTGAATCTGAAATTGTGCCAAAAGTTGCTAAAATGACTGTATCCGGGAAGAAGCAGA  505

Query  518  CTATGGGATTTGAAGTGCCTGGAGTATCTTCTGAAGAAAATGGTCATAGTTTCCACACACCTCAAAAAGGACCG  591
            |.||||||||||||||||||||..||.|||||||.||||||||.|..|||.|.|.|.|.|||||.|||||.||.
Sbjct  506  CCATGGGATTTGAAGTGCCTGGCTTAACTTCTGAGGAAAATGGACTCAGTGTGCGCGCTCCTCACAAAGGGCCT  579

Query  592  CCCATTGAAGATG---CCATTGCTTCTTCCGATGTTCTTGAGACTG---CTTCTAAATCTGCTAATCCACCCCA  659
            ||...|||.||||   .|.|.||||||.|..|..|||.||||||.|   ||.|.||||||||....|||||.|.
Sbjct  580  CCTGGTGATGATGTGAGCGTAGCTTCTCCTAACATTCCTGAGACCGGCACTCCAAAATCTGCCCTCCCACCTCC  653

Query  660  CACGATTCAAGCATCAGAAGAGCAGAGTTCAACCCCAGCACCGGTGAAAAAGTCTGGCAAGCTGAGGCAGCAAA  733
            ..|..|||||.||||||||||||.|.|.||.||.||..||||.||||.||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  654  TTCCCTTCAAACATCAGAAGAGCTGGGCTCCACTCCGACACCAGTGAGAAAGTCTGGCAAGCTGAGGCAGCAGA  727

Query  734  TAGATGTGAAGGCGGAACTGGAGAAGCGGCAAGGAGGGAAGCAGCTACTCAACTTAGTGGTCATTGGTCATGTT  807
            ||||.|||||.||||||.||||.||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  728  TAGACGTGAAAGCGGAATTGGAAAAGCGGCAGGGCGGGAAGCAGCTCCTCAACTTAGTGGTCATTGGTCATGTT  801

Query  808  GATGCTGGGAAAAGTACTCTGATGGGCCATATGCTTTATCTTCTGGGTAATATAAACAAAAGAACTATGCATAA  881
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  802  GATGCTGGGAAAAGTACTCTGATGGGCCATATGCTTTATCTTCTGGGTAATGTAAACAAAAGAACTATGCATAA  875

Query  882  GTATGAACAGGAGTCTAAAAAGGCTGGCAAAGCTTCGTTTGCATATGCATGGGTCTTGGATGAAACTGGCGAAG  955
            ||||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  876  GTATGAGCAAGAATCTAAAAAGGCTGGCAAGGCTTCATTTGCATATGCGTGGGTCTTGGATGAAACTGGAGAAG  949

Query  956  AAAGGGAAAGGGGAGTAACCATGGATGTTGGTATGACAAAGTTTGAAACCACAACCAAAGTTATTACATTAATG  1029
            |||||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  950  AAAGGGAAAGGGGAGTAACAATGGACGTCGGAATGACGAAGTTTGAAACCACAACCAAAGTTATTACCTTAATG  1023

Query 1030  GATGCTCCAGGCCATAAGGACTTCATTCCAAATATGATTACAGGAGCAGCCCAGGCGGATGTAGCTGTTTTAGT  1103
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||..|.||
Sbjct 1024  GATGCTCCAGGCCATAAGGATTTCATTCCAAACATGATCACAGGAGCAGCCCAGGCCGATGTCGCTGTCCTGGT  1097

Query 1104  TGTAGATGCCAGCAGGGGAGAGTTTGAAGCTGGATTTGAGACTGGAGGACAAACACGAGAGCATGGACTCTTGG  1177
            .||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||.||||
Sbjct 1098  CGTTGATGCCAGCAGAGGAGAGTTTGAAGCTGGATTTGAGACGGGAGGACAGACCCGAGAGCATGGCCTTTTGG  1171

Query 1178  TCCGTTCTCTGGGAGTGACGCAGCTTGCAGTTGCAGTTAATAAAATGGATCAGGTTAATTGGCAACAAGAAAGG  1251
            ||||.|||||.||||||||.||||||||.||.||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 1172  TCCGATCTCTTGGAGTGACACAGCTTGCTGTGGCTGTCAATAAGATGGATCAGGTAAATTGGCAACAAGAAAGA  1245

Query 1252  TTTCAAGAGATTACTGGAAAACTTGGGCACTTTCTTAAGCAAGCAGGTTTTAAGGAGAGTGATGTAGGTTTTAT  1325
            |||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1246  TTTCAAGAGATTACTGGAAAACTCGGGCACTTTCTTAAGCAAGCAGGTTTTAAGGAGAGTGATGTAGCTTTTAT  1319

Query 1326  TCCTACAAGTGGTCTCAGTGGTGAAAATCTAATCACAAGATCTCAGTCAAGTGAACTCACAAAATGGTATAAAG  1399
            .||.||.||.|||||.||||||||.|||.|||.|.||||.||.|||||.|||||.|||||.|..|||||.||||
Sbjct 1320  CCCGACGAGCGGTCTGAGTGGTGAGAATTTAACCGCAAGGTCACAGTCCAGTGACCTCACGACGTGGTACAAAG  1393

Query 1400  GACTATGTTTATTAGAACAAATTGATTCCTTTAAGCCTCCCCAGCGATCTATTGACAAACCTTTTAGATTATGT  1473
            |..|.||.|||||.||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1394  GGATGTGCTTATTGGAGCAGATTGATTCCTTCAAGCCCCCTCAGCGCTCGATTGACAAACCTTTTAGATTATGT  1467

Query 1474  GTGTCCGATGTTTTCAAAGATCAAGGATCTGGATTTTGCATAACTGGTAAAATAGAAGCTGGTTATATCCAAAC  1547
            |||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||..|.|||||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 1468  GTGTCTGATGTCTTCAAAGATCAAGGATCTGGCTTTTGTGTGACTGGTAAAATTGAAGCTGGTTATATCCAGAC  1541

Query 1548  TGGTGACCGACTACTGGCAATGCCTCCTAATGAAACTTGTACCGTGAAAGGAATCACTCTGCATGATGAACCTG  1621
            ||||||||||||..|.||.|||||.||.||||||||.|||||.|..|||||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct 1542  TGGTGACCGACTGTTAGCCATGCCACCCAATGAAACCTGTACTGCTAAAGGAATCACTCTGCACGATGAGCCTG  1615

Query 1622  TCGACTGGGCGGCAGCAGGCGATCATGTTAGTCTTACTTTGGTTGGGATGGATATCATCAAAATCAATGTTGGC  1695
            ||||.|||||.||||||||||||||.||.|.||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct 1616  TCGATTGGGCAGCAGCAGGCGATCACGTAAATCTTACCTTGGTTGGGATGGACATCATCAAAATCAATGTCGGC  1689

Query 1696  TGCATATTTTGTGGCCCCAAAGTACCCATTAAAGCTTGCACTCGTTTCAGAGCCCGAATCCTCATCTTTAATAT  1769
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||.||||.|||||
Sbjct 1690  TGCATATTTTGTGGCCCCAAAGAACCCATTAAGGCTTGCACCCGCTTCAGAGCCCGAATCCTCGTCTTCAATAT  1763

Query 1770  TGAAATTCCTATCACTAAAGGATTTCCTGTGCTGTTACACTACCAAACTGTCAGTGAACCCGCCGTTATTAAAC  1843
            ||||.||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||||||||.|
Sbjct 1764  TGAAGTTCCGATCACTAAAGGGTTTCCTGTGCTGTTACACTACCAAACCGTCAGTGAGCCTGCTGTTATTAAGC  1837

Query 1844  GATTGATTAGTGTCTTAAACAAAAGCACGGGTGAAGTCACAAAGAAAAAGCCTAAGTTTTTGACTAAAGGCCAG  1917
            ||||||||||||||.||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||..||||.||.||||||
Sbjct 1838  GATTGATTAGTGTCCTAAACAAAAGTACTGGTGAAGTCACAAAGAAGAAGCCCAAGTTGCTGACCAAGGGCCAG  1911

Query 1918  AATGCATTGGTAGAGCTACAGACACAAAGACCAATAGCTCTTGAGCTATATAAAGACTTTAAAGAGCTGGGGAG  1991
            ||.||.|||||||||||.|||||||||||||||.|.|||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||.|
Sbjct 1912  AACGCCTTGGTAGAGCTGCAGACACAAAGACCAGTGGCTCTTGAGCTCTACAAAGACTTCAAGGAGCTGGGGCG  1985

Query 1992  GTTCATGCTACGTTACGGTGGTTCTACAATAGCTGCTGGTGTTGTCACTGAGATAAAAGAA  2052
            |||.|||||.|||||.|||||.||.|||.|||||||.|||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1986  GTTTATGCTGCGTTATGGTGGCTCCACAGTAGCTGCCGGTGTTGTCACTGAGATAAAAGAG  2046