Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_02521
- Subject:
- XM_006512805.3
- Aligned Length:
- 2073
- Identities:
- 1351
- Gaps:
- 519
Alignment
Query 1 ATGGCCCGGCATCGGAATGTTCGAGGCTATAACTACGATGAAGATTTTGAAGATGATGATCTCTACGGCCAGTC 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 TGTAGAGGATGATTATTGTATTTCGCCGTCAACAGCTGCTCAGTTTATTTATTCACGGCGTGACAAACCTTCCG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 TTGAGCCTGTGGAAGAATATGATTATGAAGATCTGAAAGAATCTTCCAATTCTGTTTCAAACCATCAGCTCAGT 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 GGATTTGATCAAGCTCGTCTTTATTCATGCCTTGATCACATGAGAGAGGTACTTGGAGATGCTGTGCCAGATGA 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 AATATTAATTGAAGCAGTTCTGAAGAACAAGTTTGATGTGCAGAAGGCTTTGTCAGGGGTTCTGGAACAAGATA 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 GAGTGCAGAGTTTGAAGGACAAGAATGAGGCAACAGTATCTACAGGAAAGATAGCAAAAGGAAAACCAGTAGAT 444
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 445 TCCCAGACATCGCGAAGTGAATCTGAAATTGTGCCAAAAGTTGCTAAAATGACTGTATCTGGAAAGAAGCAAAC 518
|||||||||||.||.||||||||.||
Sbjct 1 ------------------------------------------------ATGACTGTATCCGGGAAGAAGCAGAC 26
Query 519 TATGGGATTTGAAGTGCCTGGAGTATCTTCTGAAGAAAATGGTCATAGTTTCCACACACCTCAAAAAGGACCGC 592
.||||||||||||||||||||..||.|||||||.||||||||.|..|||.|.|.|.|.|||||.|||||.||.|
Sbjct 27 CATGGGATTTGAAGTGCCTGGCTTAACTTCTGAGGAAAATGGACTCAGTGTGCGCGCTCCTCACAAAGGGCCTC 100
Query 593 CCATTGAAGATG---CCATTGCTTCTTCCGATGTTCTTGAGACTG---CTTCTAAATCTGCTAATCCACCCCAC 660
|...|||.|||| .|.|.||||||.|..|..|||.||||||.| ||.|.||||||||....|||||.|..
Sbjct 101 CTGGTGATGATGTGAGCGTAGCTTCTCCTAACATTCCTGAGACCGGCACTCCAAAATCTGCCCTCCCACCTCCT 174
Query 661 ACGATTCAAGCATCAGAAGAGCAGAGTTCAACCCCAGCACCGGTGAAAAAGTCTGGCAAGCTGAGGCAGCAAAT 734
.|..|||||.||||||||||||.|.|.||.||.||..||||.||||.||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 175 TCCCTTCAAACATCAGAAGAGCTGGGCTCCACTCCGACACCAGTGAGAAAGTCTGGCAAGCTGAGGCAGCAGAT 248
Query 735 AGATGTGAAGGCGGAACTGGAGAAGCGGCAAGGAGGGAAGCAGCTACTCAACTTAGTGGTCATTGGTCATGTTG 808
|||.|||||.||||||.||||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 249 AGACGTGAAAGCGGAATTGGAAAAGCGGCAGGGCGGGAAGCAGCTCCTCAACTTAGTGGTCATTGGTCATGTTG 322
Query 809 ATGCTGGGAAAAGTACTCTGATGGGCCATATGCTTTATCTTCTGGGTAATATAAACAAAAGAACTATGCATAAG 882
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 323 ATGCTGGGAAAAGTACTCTGATGGGCCATATGCTTTATCTTCTGGGTAATGTAAACAAAAGAACTATGCATAAG 396
Query 883 TATGAACAGGAGTCTAAAAAGGCTGGCAAAGCTTCGTTTGCATATGCATGGGTCTTGGATGAAACTGGCGAAGA 956
|||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 397 TATGAGCAAGAATCTAAAAAGGCTGGCAAGGCTTCATTTGCATATGCGTGGGTCTTGGATGAAACTGGAGAAGA 470
Query 957 AAGGGAAAGGGGAGTAACCATGGATGTTGGTATGACAAAGTTTGAAACCACAACCAAAGTTATTACATTAATGG 1030
||||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 471 AAGGGAAAGGGGAGTAACAATGGACGTCGGAATGACGAAGTTTGAAACCACAACCAAAGTTATTACCTTAATGG 544
Query 1031 ATGCTCCAGGCCATAAGGACTTCATTCCAAATATGATTACAGGAGCAGCCCAGGCGGATGTAGCTGTTTTAGTT 1104
|||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||..|.||.
Sbjct 545 ATGCTCCAGGCCATAAGGATTTCATTCCAAACATGATCACAGGAGCAGCCCAGGCCGATGTCGCTGTCCTGGTC 618
Query 1105 GTAGATGCCAGCAGGGGAGAGTTTGAAGCTGGATTTGAGACTGGAGGACAAACACGAGAGCATGGACTCTTGGT 1178
||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||.|||||
Sbjct 619 GTTGATGCCAGCAGAGGAGAGTTTGAAGCTGGATTTGAGACGGGAGGACAGACCCGAGAGCATGGCCTTTTGGT 692
Query 1179 CCGTTCTCTGGGAGTGACGCAGCTTGCAGTTGCAGTTAATAAAATGGATCAGGTTAATTGGCAACAAGAAAGGT 1252
|||.|||||.||||||||.||||||||.||.||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 693 CCGATCTCTTGGAGTGACACAGCTTGCTGTGGCTGTCAATAAGATGGATCAGGTAAATTGGCAACAAGAAAGAT 766
Query 1253 TTCAAGAGATTACTGGAAAACTTGGGCACTTTCTTAAGCAAGCAGGTTTTAAGGAGAGTGATGTAGGTTTTATT 1326
||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.
Sbjct 767 TTCAAGAGATTACTGGAAAACTCGGGCACTTTCTTAAGCAAGCAGGTTTTAAGGAGAGTGATGTAGCTTTTATC 840
Query 1327 CCTACAAGTGGTCTCAGTGGTGAAAATCTAATCACAAGATCTCAGTCAAGTGAACTCACAAAATGGTATAAAGG 1400
||.||.||.|||||.||||||||.|||.|||.|.||||.||.|||||.|||||.|||||.|..|||||.|||||
Sbjct 841 CCGACGAGCGGTCTGAGTGGTGAGAATTTAACCGCAAGGTCACAGTCCAGTGACCTCACGACGTGGTACAAAGG 914
Query 1401 ACTATGTTTATTAGAACAAATTGATTCCTTTAAGCCTCCCCAGCGATCTATTGACAAACCTTTTAGATTATGTG 1474
..|.||.|||||.||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 915 GATGTGCTTATTGGAGCAGATTGATTCCTTCAAGCCCCCTCAGCGCTCGATTGACAAACCTTTTAGATTATGTG 988
Query 1475 TGTCCGATGTTTTCAAAGATCAAGGATCTGGATTTTGCATAACTGGTAAAATAGAAGCTGGTTATATCCAAACT 1548
||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||..|.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct 989 TGTCTGATGTCTTCAAAGATCAAGGATCTGGCTTTTGTGTGACTGGTAAAATTGAAGCTGGTTATATCCAGACT 1062
Query 1549 GGTGACCGACTACTGGCAATGCCTCCTAATGAAACTTGTACCGTGAAAGGAATCACTCTGCATGATGAACCTGT 1622
|||||||||||..|.||.|||||.||.||||||||.|||||.|..|||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1063 GGTGACCGACTGTTAGCCATGCCACCCAATGAAACCTGTACTGCTAAAGGAATCACTCTGCACGATGAGCCTGT 1136
Query 1623 CGACTGGGCGGCAGCAGGCGATCATGTTAGTCTTACTTTGGTTGGGATGGATATCATCAAAATCAATGTTGGCT 1696
|||.|||||.||||||||||||||.||.|.||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 1137 CGATTGGGCAGCAGCAGGCGATCACGTAAATCTTACCTTGGTTGGGATGGACATCATCAAAATCAATGTCGGCT 1210
Query 1697 GCATATTTTGTGGCCCCAAAGTACCCATTAAAGCTTGCACTCGTTTCAGAGCCCGAATCCTCATCTTTAATATT 1770
|||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||.||||.||||||
Sbjct 1211 GCATATTTTGTGGCCCCAAAGAACCCATTAAGGCTTGCACCCGCTTCAGAGCCCGAATCCTCGTCTTCAATATT 1284
Query 1771 GAAATTCCTATCACTAAAGGATTTCCTGTGCTGTTACACTACCAAACTGTCAGTGAACCCGCCGTTATTAAACG 1844
|||.||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||||||||.||
Sbjct 1285 GAAGTTCCGATCACTAAAGGGTTTCCTGTGCTGTTACACTACCAAACCGTCAGTGAGCCTGCTGTTATTAAGCG 1358
Query 1845 ATTGATTAGTGTCTTAAACAAAAGCACGGGTGAAGTCACAAAGAAAAAGCCTAAGTTTTTGACTAAAGGCCAGA 1918
|||||||||||||.||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||..||||.||.|||||||
Sbjct 1359 ATTGATTAGTGTCCTAAACAAAAGTACTGGTGAAGTCACAAAGAAGAAGCCCAAGTTGCTGACCAAGGGCCAGA 1432
Query 1919 ATGCATTGGTAGAGCTACAGACACAAAGACCAATAGCTCTTGAGCTATATAAAGACTTTAAAGAGCTGGGGAGG 1992
|.||.|||||||||||.|||||||||||||||.|.|||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||.||
Sbjct 1433 ACGCCTTGGTAGAGCTGCAGACACAAAGACCAGTGGCTCTTGAGCTCTACAAAGACTTCAAGGAGCTGGGGCGG 1506
Query 1993 TTCATGCTACGTTACGGTGGTTCTACAATAGCTGCTGGTGTTGTCACTGAGATAAAAGAA-------------- 2052
||.|||||.|||||.|||||.||.|||.|||||||.||||||||||||||| |.|
Sbjct 1507 TTTATGCTGCGTTATGGTGGCTCCACAGTAGCTGCCGGTGTTGTCACTGAG------GTATCTGCTGTGTCCTC 1574
Query 2053 - 2052
Sbjct 1575 T 1575