Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_02531
Subject:
NM_001286503.1
Aligned Length:
858
Identities:
814
Gaps:
44

Alignment

Query   1  MSVVGLDVGSQSCYIAVARAGGIETIANEFSDRCTPSVISFGSKNRTIGVAAKNQQITHANNTVSNFKRFHGRA  74
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Sbjct   1  MSVVGLDVGSQSCYIAVARAGGIETIANEFSDRCTPSVISFGSKNRTIGVAAKNQQITHANNTVSNFKRFHGRA  74

Query  75  FNDPFIQKEKENLSYDLVPLKNGGVGIKVMYMGEEHLFSVEQITAMLLTKLKETAENSLKKPVTDCVISVPSFF  148
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Sbjct  75  FNDPFIQKEKENLSYDLVPLKNGGVGIKVMYMGEEHLFSVEQITAMLLTKLKETAENSLKKPVTDCVISVPSFF  148

Query 149  TDAERRSVLDAAQIVGLNCLRLMNDMTAVALNYGIYKQDLPSLDEKPRIVVFVDMGHSAFQVSACAFNKGKLKV  222
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Sbjct 149  TDAERRSVLDAAQIVGLNCLRLMNDMTAVALNYGIYKQDLPSLDEKPRIVVFVDMGHSAFQVSACAFNKGKLKV  222

Query 223  LGTAFDPFLGGKNFDEKLVEHFCAEFKTKYKLDAKSKIRALLRLYQECEKLKKLMSSNSTDLPLNIECFMNDKD  296
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Sbjct 223  LGTAFDPFLGGKNFDEKLVEHFCAEFKTKYKLDAKSKIRALLRLYQECEKLKKLMSSNSTDLPLNIECFMNDKD  296

Query 297  VSGKMNRSQFEELCAELLQKIEVPLYSLLEQTHLKVEDVSAVEIVGGATRIPAVKERIAKFFGKDISTTLNADE  370
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Sbjct 297  VSGKMNRSQFEELCAELLQKIEVPLYSLLEQTHLKVEDVSAVEIVGGATRIPAVKERIAKFFGKDISTTLNADE  370

Query 371  AVARGCALQCAILSPAFKVREFSVTDAVPFPISLIWNHDSEDTEGVHEVFSRNHAAPFSKVLTFLRRGPFELEA  444
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Sbjct 371  AVARGCALQCAILSPAFKVREFSVTDAVPFPISLIWNHDSEDTEGVHEVFSRNHAAPFSKVLTFLRRGPFELEA  444

Query 445  FYSDPQGVPYPEAKIGRFVVQNVSAQKDGEKSRVKVKVRVNTHGIFTISTASMVEKVPTEENEMSSEADMECLN  518
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Sbjct 445  FYSDPQGVPYPEAKIGRFVVQNVSAQKDGEKSRVKVKVRVNTHGIFTISTASMVEKVPTEENEMSSEADMECLN  518

Query 519  QRPPENPDTDKNVQQDNSEAGTQPQVQTDAQQTSQSPPSPELTSEENKIPDADKANEKKVDQPPEAKKPKIKVV  592
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Sbjct 519  QRPPENPDTD--------------------------------------------ANEKKVDQPPEAKKPKIKVV  548

Query 593  NVELPIEANLVWQLGKDLLNMYIETEGKMIMQDKLEKERNDAKNAVEEYVYEFRDKLCGPYEKFICEQDHQNFL  666
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Sbjct 549  NVELPIEANLVWQLGKDLLNMYIETEGKMIMQDKLEKERNDAKNAVEEYVYEFRDKLCGPYEKFICEQDHQNFL  622

Query 667  RLLTETEDWLYEEGEDQAKQAYVDKLEELMKIGTPVKVRFQEAEERPKMFEELGQRLQHYAKIAADFRNKDEKY  740
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Sbjct 623  RLLTETEDWLYEEGEDQAKQAYVDKLEELMKIGTPVKVRFQEAEERPKMFEELGQRLQHYAKIAADFRNKDEKY  696

Query 741  NHIDESEMKKVEKSVNEVMEWMNNVMNAQAKKSLDQDPVVRAQEIKTKIKELNNTCEPVVTQPKPKIESPKLER  814
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Sbjct 697  NHIDESEMKKVEKSVNEVMEWMNNVMNAQAKKSLDQDPVVRAQEIKTKIKELNNTCEPVVTQPKPKIESPKLER  770

Query 815  TPNGPNIDKKEEDLEDKNNFGAEPPHQNGECYPNEKNSVNMDLD  858
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Sbjct 771  TPNGPNIDKKEEDLEDKNNFGAEPPHQNGECYPNEKNSVNMDLD  814