Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02569
• Subject: NM_009770.3
• Aligned Length: 888
• Identities: 692
• Gaps: 132

Alignment

Query   1  ATGAAGAATGAAATTGCTGCCGTTGTCTTCTTTTTCACAAGGCTAGTTCGAAAACATGATAAGTTGAAAAAAGA  74
           ||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct   1  ATGAAGAACGAAATTGCGGCTGTTGTCTTCTTTTTCACAAGGCTAGTTCGAAAGCATGACAAGTTGAAAAAAGA  74

Query  75  GGCAGTTGAGAGGTTTGCTGAGAAATTGACCCTAATACTTCAAGAAAAATATAAAAATCACTGGTATCCAGAAA  148
           .||||||||||||||||||||||||||.||.|.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  AGCAGTTGAGAGGTTTGCTGAGAAATTAACTCAAATACTTCAAGAGAAATATAAAAATCACTGGTATCCAGAAA  148

Query 149  AACCATCGAAAGGACAGGCCTACAGATGTATTCGTGTCAATAAATTTCAGAGAGTTGATCCTGATGTCCTGAAA  222
           |||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 149  AACCATCCAAAGGTCAGGCCTACAGATGCATTCGTGTCAATAAGTTTCAGAGAGTTGATCCCGATGTCCTGAAA  222

Query 223  GCCTGTGAAAACAGCTGCATCTTGTATAGTGACCTGGGCTTGCCAAAGGAGCTCACTCTCTGGGTGGACCCATG  296
           ||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||.||
Sbjct 223  GCCTGTGAGAACAGCTGCATCTTGTACAGCGACCTGGGCTTGCCTAAGGAGCTTACACTCTGGGTGGATCCGTG  296

Query 297  TGAGGTGTGCTGTCGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGACTGCTCTCAAACTCCTGACCTCGTGATCC  370
           ||||||||||||.||                                                           
Sbjct 297  TGAGGTGTGCTGCCG-----------------------------------------------------------  311

Query 371  GCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGCGCTGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCTCCTCCTTTTTGATTATG  444
                                                                                    |
Sbjct 312  -------------------------------------------------------------------------G  312

Query 445  TATGGAGAGAAAAACAATGCATTCATTGTTGCCAGCTTTGAAAATAAAGATGAGAACAAGGATGAGATCTCCAG  518
           ||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|.||.||||||||||||||.|||||||.
Sbjct 313  TATGGAGAGAAAAACAATGCGTTCATTGTTGCCAGCTTTGAAAATGAGGACGAGAACAAGGATGAAATCTCCAA  386

Query 519  GAAAGTTACCAGGGCCCTTGATAAGGTTACCTCTGATTATCATTCAGGATCCTCTTCTTCAGATGAAGAAACAA  592
           ||||||||.||||||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct 387  GAAAGTTAGCAGGGCTCTGGATAAGGTGACCTCTGATTATCACTCAGGGTCCTCTTCCTCAGATGAAGACACAA  460

Query 593  GTAAGGAAATGGAAGTGAAACCCAGTTCGGTGACTGCAGCCGCAAGTCCTGTGTACCAGATTTCAGAACTTATA  666
           |.||||||.||||.|||||||||||.||.|||.|.|||.|..||||.||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 461  GCAAGGAAGTGGACGTGAAACCCAGCTCAGTGGCGGCAACACCAAGCCCCGTGTACCAGATTTCAGAACTGATA  534

Query 667  TTTCCACCTCTTCCAATGTGGCACCCTTTGCCCAGAAAAAAGCCAGGAATGTATCGAGGGAATGGCCATCAGAA  740
           ||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||.
Sbjct 535  TTCCCACCTCTTCCAATGTGGCACCCTTTGCCCAGAAAAAAGCCAGGAATGTATCGAGGGAGCGGCCATCAGAC  608

Query 741  TCACTATCCTCCTCCTGTTCCATTTGGTTATCCAAATCAGGGAAGAAAAAATAAACCATATCGCCCAATTCCAG  814
           ||||||.|||||||||||||||||||.|||||||||||..|||||.||.||||||||||..|||||||||||||
Sbjct 609  TCACTACCCTCCTCCTGTTCCATTTGCTTATCCAAATCCAGGAAGGAAGAATAAACCATTCCGCCCAATTCCAG  682

Query 815  TGACATGGGTACCTCCTCCTGGAATGCATTGTGACCGGAATCACTGGATTAATCCTCACATGTTAGCACCTCAC  888
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 683  TGACATGGGTACCTCCTCCTGGAATGCATTGTGACCGAAATCACTGGATTAATCCTCACATGTTAGCACCTCAC  756