Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02599
• Subject: NM_001290270.1
• Aligned Length: 1490
• Identities: 1226
• Gaps: 151

Alignment

Query    1  ATGACCCCCATCGTCACAGTCCTGATCTGTCTCAGGCTGAGTCTGGGCCCCCGGACCCACGTGCAGGCAGGGAC  74
            ||||||||||||.||||.|||||||||||||||                                    |||..
Sbjct    1  ATGACCCCCATCCTCACGGTCCTGATCTGTCTC------------------------------------GGGCA  38

Query   75  CCTCCCCAAGCCCACACTCTGGGCTGAGCCAGGCTCTGTGATCACCCAGGGGAGTCCCGTGACCCTCTGGTGTC  148
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||.|||||||||.||||||
Sbjct   39  CCTCCCCAAGCCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGGCTCTGTGATCATCCAGGGAAGTCCTGTGACCCTCAGGTGTC  112

Query  149  AGGGGATCCTGGAGACCCAGGAGTACCGTCTGTATAGAGAAAAGAAAACAGCACCCTGGATTACACGGATCCCA  222
            ||||||.|||..||.|..|||||||||.|||.|||||.|||||.|||.|||||.|||||.|||.||||||   |
Sbjct  113  AGGGGAGCCTTCAGGCTGAGGAGTACCATCTATATAGGGAAAACAAATCAGCATCCTGGGTTAGACGGAT---A  183

Query  223  CAGGAGATTGTGAAGAAGGGCCAGTTCCCCATCCCATCCATCACCTGGGAACACACAGGGCGGTATCGCTGT--  294
            ||.|||..||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||  
Sbjct  184  CAAGAGCCTGGGAAGAATGGCCAGTTCCCCATCCCATCCATCACCTGGGAACACGCAGGGCGGTATCACTGTCA  257

Query  295  -TTCTACGGTAGCCACACTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGTGACAGGAGCCTACA  367
             |.||||   |||||||.| ||  ||..||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  258  GTACTAC---AGCCACAAT-CA--CTCATCAGAGTACAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGTGACAGGAGCCTACA  325

Query  368  TCAAACCCACCCTCTCAGCTCTACCCAGCCCTGTGGTGACCTCAGGAGGGAACGTGACCCTCCATTGTGTCTCA  441
            .|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  326  GCAAACCCACCCTCTCAGCTCTGCCCAGCCCTGTGGTGACCTCAGGAGGGAACGTGACCCTCCAGTGTGTCTCA  399

Query  442  CAGGTGGCATTTGGCAGCTTCATTCTGTGTAAGGAAGGAGAAGATGAACACCCACAATGCCTGAACTCACAGCC  515
            |||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.||..|
Sbjct  400  CAGGTGGCATTTGACGGCTTCATTCTGTGTAAGGAAGGAGAAGATGAACACCCACAACGCCTGAACTCCCATTC  473

Query  516  CCGTACCCATGGGTGGTCCCGGGCCATCTTCTCTGTGGGCCCCGTGAGCCCGAGTCGCAGGTGGTCGTACAGGT  589
            ||.|.|||.||||||||||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  474  CCATGCCCGTGGGTGGTCCTGGGCCATCTTCTCCGTGGGCCCCGTGAGCCCGAGTCGCAGGTGGTCGTACAGGT  547

Query  590  GCTATGCTTATGACTCGAACTCTCCCCATGTGTGGTCTCTACCCAGTGATCTCCTGGAGCTCCTGGTCCTAGGT  663
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  548  GCTATGCTTATGACTCGAACTCTCCCTATGTGTGGTCTCTACCCAGTGATCTCCTGGAGCTCCTGGTCCCAGGT  621

Query  664  GTTTCTAAGAAGCCATCACTCTCAGTGCAGCCAGGTCCTATAGTGGCCCCTGGGGAGAGCCTGACCCTCCAGTG  737
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  622  GTTTCTAAGAAGCCATCACTCTCAGTGCAGCCAGGTCCTATGGTGGCCCCTGGGGAGAGCCTGACCCTCCAGTG  695

Query  738  TGTTTCTGATGTCAGCTACGACAGATTTGTTCTGTATAAGGAGGGAGAACGTGACTTCCTCCAGCTCCCTGGCC  811
            |||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||..
Sbjct  696  TGTCTCTGATGTCGGCTACGACAGATTTGTTCTGTATAAGGAGGGAGAACGTGACTTCCTCCAGCGCCCTGGTT  769

Query  812  CACAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCTACGGGGGCCAGTAC  885
            ..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||
Sbjct  770  GGCAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCCCTCCCACGGGGGCCAGTAC  843

Query  886  AGATGCTCCGGTGCATACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGGACATCCTGATCGCAGG  959
            |||||||.|.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  844  AGATGCTACAGTGCACACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGTGACCCCCTGGACATCCTGATCACAGG  917

Query  960  ACAGTTCCGTGGCAGACCCT-TCATCTCGGTGCATCCGGGCCCCACGGTGGCCTCAGGAGAGAACGTGACCCTG  1032
            |||||||..||.|||||||| || ||||||||||.||||.||||||.||.|||.|||||.||||||||||||||
Sbjct  918  ACAGTTCTATGACAGACCCTCTC-TCTCGGTGCAGCCGGTCCCCACAGTAGCCCCAGGAAAGAACGTGACCCTG  990

Query 1033  CTGTGTCAGTCATGGGGGCCGTTCCACACTTTCCTTCTGACCAAGGCGGGAGCAGCTGATGCCCCCCTCCGTCT  1106
            ||||||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||.||||...||.||||.||.|.|||
Sbjct  991  CTGTGTCAGTCACGGGGGCAGTTCCACACTTTCCTTCTGACCAAGGAGGGGGCAGGCCATCCCCCACTGCATCT  1064

Query 1107  CAGATCAATACACGAATATCCTAAGTACCAGGCTGAATTCCCTATGAGTCCTGTGACCTCAGCCCACTCGGGGA  1180
            .||||||...|||.||..||...||.|||||||||||||||..|||.||||||||||||||||||||..|||||
Sbjct 1065  GAGATCAGAGCACCAAGCTCAGCAGAACCAGGCTGAATTCCGCATGGGTCCTGTGACCTCAGCCCACGTGGGGA  1138

Query 1181  CCTACAGGTGCTACGGCTCACTCAGCTCCAACCCCTACCTGCTGTCTCACCCCAGTGACTCCCTGGAGCTCATG  1254
            |||||||.||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 1139  CCTACAGATGCTACAGCTCACTCAGCTCCAACCCCTACCTGCTGTCTCTCCCCAGTGACCCCCTGGAGCTCGTG  1212

Query 1255  GTCTCAGGAGCAGCTGAGACCCTCAGCCCACCACAAAACAAGTCCGATTCCAAGGCTGGAGCAGCTAACA-CCC  1327
            |||||||                                                             || |||
Sbjct 1213  GTCTCAG-------------------------------------------------------------CATCCC  1225

Query 1328  TCAGCCCATCACAAAACAAGACTGCCTCACACCCCCAGGATTACACAGTGGAGAATCTCATCCGCATGGGCATA  1401
            | ||.|||                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|.
Sbjct 1226  T-AGGCCA--------------------ACACCCCCAGGATTACACAGTGGAGAATCTCATCCGCATGGGTGTG  1278

Query 1402  GCTGGCTTGGTCCTGGTGGTCCTCGGGATTCTGCTATTTGAGGCTCAGCACAGCCAGAGAAGCCTC--------  1467
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.        
Sbjct 1279  GCTGGCTTGGTCCTGGTGGTCCTCGGGATTCTGCTATTTGAGGCTCAGCACAGCCAGAGAAGCCTACAAGATGC  1352

Query 1468  ----------  1467
                      
Sbjct 1353  AGCCGGGAGG  1362