Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_02658
Subject:
NM_001184970.3
Aligned Length:
1458
Identities:
1458
Gaps:
0

Alignment

Query    1  ATGTCTGTCACATATGATGATTCCGTTGGAGTAGAAGTGTCCAGCGACAGCTTCTGGGAGGTCGGGAACTACAA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCTGTCACATATGATGATTCCGTTGGAGTAGAAGTGTCCAGCGACAGCTTCTGGGAGGTCGGGAACTACAA  74

Query   75  GCGGACTGTGAAGCGGATCGACGATGGCCACCGCCTGTGCAGCGACCTCATGAACTGCCTGCATGAGCGGGCGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCGGACTGTGAAGCGGATCGACGATGGCCACCGCCTGTGCAGCGACCTCATGAACTGCCTGCATGAGCGGGCGC  148

Query  149  GCATCGAGAAGGCGTATGCGCAGCAGCTCACTGAGTGGGCCCGGCGCTGGAGGCAGCTCGTGGAGAAAGGGCCC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCATCGAGAAGGCGTATGCGCAGCAGCTCACTGAGTGGGCCCGGCGCTGGAGGCAGCTCGTGGAGAAAGGGCCC  222

Query  223  CAGTACGGGACCGTGGAGAAGGCCTGGATGGCCTTCATGTCCGAGGCAGAGAGGGTGAGCGAGCTGCACCTCGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CAGTACGGGACCGTGGAGAAGGCCTGGATGGCCTTCATGTCCGAGGCAGAGAGGGTGAGCGAGCTGCACCTCGA  296

Query  297  GGTGAAGGCCTCACTGATGAACGATGACTTCGAGAAGATCAAGAACTGGCAGAAGGAAGCCTTTCACAAGCAGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGTGAAGGCCTCACTGATGAACGATGACTTCGAGAAGATCAAGAACTGGCAGAAGGAAGCCTTTCACAAGCAGA  370

Query  371  TGATGGGCGGCTTCAAGGAGACCAAGGAAGCTGAGGACGGCTTTCGGAAGGCACAGAAGCCCTGGGCCAAGAAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGATGGGCGGCTTCAAGGAGACCAAGGAAGCTGAGGACGGCTTTCGGAAGGCACAGAAGCCCTGGGCCAAGAAG  444

Query  445  CTGAAAGAGGTAGAAGCAGCAAAGAAAGCCCACCATGCAGCGTGCAAAGAGGAGAAGCTGGCTATCTCACGAGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTGAAAGAGGTAGAAGCAGCAAAGAAAGCCCACCATGCAGCGTGCAAAGAGGAGAAGCTGGCTATCTCACGAGA  518

Query  519  AGCCAACAGCAAGGCAGACCCATCCCTCAACCCTGAACAGCTCAAGAAATTGCAAGACAAAATAGAAAAGTGCA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGCCAACAGCAAGGCAGACCCATCCCTCAACCCTGAACAGCTCAAGAAATTGCAAGACAAAATAGAAAAGTGCA  592

Query  593  AGCAAGATGTTCTTAAGACCAAAGAGAAGTATGAGAAGTCCCTGAAGGAACTCGACCAGGGCACACCCCAGTAC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGCAAGATGTTCTTAAGACCAAAGAGAAGTATGAGAAGTCCCTGAAGGAACTCGACCAGGGCACACCCCAGTAC  666

Query  667  ATGGAGAACATGGAGCAGGTGTTTGAGCAGTGCCAGCAGTTCGAGGAGAAACGCCTTCGCTTCTTCCGGGAGGT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATGGAGAACATGGAGCAGGTGTTTGAGCAGTGCCAGCAGTTCGAGGAGAAACGCCTTCGCTTCTTCCGGGAGGT  740

Query  741  TCTGCTGGAGGTTCAGAAGCACCTAGACCTGTCCAATGTGGCTGGCTACAAAGCCATTTACCATGACCTGGAGC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TCTGCTGGAGGTTCAGAAGCACCTAGACCTGTCCAATGTGGCTGGCTACAAAGCCATTTACCATGACCTGGAGC  814

Query  815  AGAGCATCAGAGCAGCTGATGCAGTGGAGGACCTGAGGTGGTTCCGAGCCAATCACGGGCCGGGCATGGCCATG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGAGCATCAGAGCAGCTGATGCAGTGGAGGACCTGAGGTGGTTCCGAGCCAATCACGGGCCGGGCATGGCCATG  888

Query  889  AACTGGCCGCAGTTTGAGGAGTGGTCCGCAGACCTGAATCGAACCCTCAGCCGGAGAGAGAAGAAGAAGGCCAC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AACTGGCCGCAGTTTGAGGAGTGGTCCGCAGACCTGAATCGAACCCTCAGCCGGAGAGAGAAGAAGAAGGCCAC  962

Query  963  TGACGGCGTCACCCTGACGGGCATCAACCAGACAGGCGACCAGTCTCTGCCGAGTAAGCCCAGCAGCACCCTTA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGACGGCGTCACCCTGACGGGCATCAACCAGACAGGCGACCAGTCTCTGCCGAGTAAGCCCAGCAGCACCCTTA  1036

Query 1037  ATGTCCCGAGCAACCCCGCCCAGTCTGCGCAGTCACAGTCCAGCTACAACCCCTTCGAGGATGAGGACGACACG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ATGTCCCGAGCAACCCCGCCCAGTCTGCGCAGTCACAGTCCAGCTACAACCCCTTCGAGGATGAGGACGACACG  1110

Query 1111  GGCAGCACCGTCAGTGAGAAGGACGACACTAAGGCCAAAAATGTGAGCAGCTACGAGAAGACCCAGAGCTATCC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GGCAGCACCGTCAGTGAGAAGGACGACACTAAGGCCAAAAATGTGAGCAGCTACGAGAAGACCCAGAGCTATCC  1184

Query 1185  CACCGACTGGTCAGACGATGAGTCTAACAACCCCTTCTCCTCCACGGATGCCAATGGGGACTCGAATCCATTCG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CACCGACTGGTCAGACGATGAGTCTAACAACCCCTTCTCCTCCACGGATGCCAATGGGGACTCGAATCCATTCG  1258

Query 1259  ACGACGACGCCACCTCGGGGACGGAAGTGCGAGTCCGGGCCCTGTATGACTATGAGGGGCAGGAGCATGATGAG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ACGACGACGCCACCTCGGGGACGGAAGTGCGAGTCCGGGCCCTGTATGACTATGAGGGGCAGGAGCATGATGAG  1332

Query 1333  CTGAGCTTCAAGGCTGGGGATGAGCTGACCAAGATGGAGGACGAGGATGAGCAGGGCTGGTGCAAGGGACGCTT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CTGAGCTTCAAGGCTGGGGATGAGCTGACCAAGATGGAGGACGAGGATGAGCAGGGCTGGTGCAAGGGACGCTT  1406

Query 1407  GGACAACGGGCAAGTTGGCCTATACCCGGCAAATTATGTGGAGGCGATCCAG  1458
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GGACAACGGGCAAGTTGGCCTATACCCGGCAAATTATGTGGAGGCGATCCAG  1458