Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02658
• Subject: NM_001184971.1
• Aligned Length: 1458
• Identities: 1335
• Gaps: 123

Alignment

Query    1  ATGTCTGTCACATATGATGATTCCGTTGGAGTAGAAGTGTCCAGCGACAGCTTCTGGGAGGTCGGGAACTACAA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCTGTCACATATGATGATTCCGTTGGAGTAGAAGTGTCCAGCGACAGCTTCTGGGAGGTCGGGAACTACAA  74

Query   75  GCGGACTGTGAAGCGGATCGACGATGGCCACCGCCTGTGCAGCGACCTCATGAACTGCCTGCATGAGCGGGCGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCGGACTGTGAAGCGGATCGACGATGGCCACCGCCTGTGCAGCGACCTCATGAACTGCCTGCATGAGCGGGCGC  148

Query  149  GCATCGAGAAGGCGTATGCGCAGCAGCTCACTGAGTGGGCCCGGCGCTGGAGGCAGCTCGTGGAGAAAGGGCCC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCATCGAGAAGGCGTATGCGCAGCAGCTCACTGAGTGGGCCCGGCGCTGGAGGCAGCTCGTGGAGAAAGGGCCC  222

Query  223  CAGTACGGGACCGTGGAGAAGGCCTGGATGGCCTTCATGTCCGAGGCAGAGAGGGTGAGCGAGCTGCACCTCGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CAGTACGGGACCGTGGAGAAGGCCTGGATGGCCTTCATGTCCGAGGCAGAGAGGGTGAGCGAGCTGCACCTCGA  296

Query  297  GGTGAAGGCCTCACTGATGAACGATGACTTCGAGAAGATCAAGAACTGGCAGAAGGAAGCCTTTCACAAGCAGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGTGAAGGCCTCACTGATGAACGATGACTTCGAGAAGATCAAGAACTGGCAGAAGGAAGCCTTTCACAAGCAGA  370

Query  371  TGATGGGCGGCTTCAAGGAGACCAAGGAAGCTGAGGACGGCTTTCGGAAGGCACAGAAGCCCTGGGCCAAGAAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGATGGGCGGCTTCAAGGAGACCAAGGAAGCTGAGGACGGCTTTCGGAAGGCACAGAAGCCCTGGGCCAAGAAG  444

Query  445  CTGAAAGAGGTAGAAGCAGCAAAGAAAGCCCACCATGCAGCGTGCAAAGAGGAGAAGCTGGCTATCTCACGAGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTGAAAGAGGTAGAAGCAGCAAAGAAAGCCCACCATGCAGCGTGCAAAGAGGAGAAGCTGGCTATCTCACGAGA  518

Query  519  AGCCAACAGCAAGGCAGACCCATCCCTCAACCCTGAACAGCTCAAGAAATTGCAAGACAAAATAGAAAAGTGCA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGCCAACAGCAAGGCAGACCCATCCCTCAACCCTGAACAGCTCAAGAAATTGCAAGACAAAATAGAAAAGTGCA  592

Query  593  AGCAAGATGTTCTTAAGACCAAAGAGAAGTATGAGAAGTCCCTGAAGGAACTCGACCAGGGCACACCCCAGTAC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGCAAGATGTTCTTAAGACCAAAGAGAAGTATGAGAAGTCCCTGAAGGAACTCGACCAGGGCACACCCCAGTAC  666

Query  667  ATGGAGAACATGGAGCAGGTGTTTGAGCAGTGCCAGCAGTTCGAGGAGAAACGCCTTCGCTTCTTCCGGGAGGT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATGGAGAACATGGAGCAGGTGTTTGAGCAGTGCCAGCAGTTCGAGGAGAAACGCCTTCGCTTCTTCCGGGAGGT  740

Query  741  TCTGCTGGAGGTTCAGAAGCACCTAGACCTGTCCAATGTGGCTGGCTACAAAGCCATTTACCATGACCTGGAGC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TCTGCTGGAGGTTCAGAAGCACCTAGACCTGTCCAATGTGGCTGGCTACAAAGCCATTTACCATGACCTGGAGC  814

Query  815  AGAGCATCAGAGCAGCTGATGCAGTGGAGGACCTGAGGTGGTTCCGAGCCAATCACGGGCCGGGCATGGCCATG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGAGCATCAGAGCAGCTGATGCAGTGGAGGACCTGAGGTGGTTCCGAGCCAATCACGGGCCGGGCATGGCCATG  888

Query  889  AACTGGCCGCAGTTTGAGGAGTGGTCCGCAGACCTGAATCGAACCCTCAGCCGGAGAGAGAAGAAGAAGGCCAC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AACTGGCCGCAGTTTGAGGAGTGGTCCGCAGACCTGAATCGAACCCTCAGCCGGAGAGAGAAGAAGAAGGCCAC  962

Query  963  TGACGGCGTCACCCTGACGGGCATCAACCAGACAGGCGACCAGTCTCTGCCGAGTAAGCCCAGCAGCACCCTTA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
Sbjct  963  TGACGGCGTCACCCTGACGGGCATCAACCAGACAGGCGACCAGTCTCTGCCGAGTAAGCCCAGCAG--------  1028

Query 1037  ATGTCCCGAGCAACCCCGCCCAGTCTGCGCAGTCACAGTCCAGCTACAACCCCTTCGAGGATGAGGACGACACG  1110
                                                                                      
Sbjct 1029  --------------------------------------------------------------------------  1028

Query 1111  GGCAGCACCGTCAGTGAGAAGGACGACACTAAGGCCAAAAATGTGAGCAGCTACGAGAAGACCCAGAGCTATCC  1184
                                                     |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1029  -----------------------------------------TGTGAGCAGCTACGAGAAGACCCAGAGCTATCC  1061

Query 1185  CACCGACTGGTCAGACGATGAGTCTAACAACCCCTTCTCCTCCACGGATGCCAATGGGGACTCGAATCCATTCG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1062  CACCGACTGGTCAGACGATGAGTCTAACAACCCCTTCTCCTCCACGGATGCCAATGGGGACTCGAATCCATTCG  1135

Query 1259  ACGACGACGCCACCTCGGGGACGGAAGTGCGAGTCCGGGCCCTGTATGACTATGAGGGGCAGGAGCATGATGAG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1136  ACGACGACGCCACCTCGGGGACGGAAGTGCGAGTCCGGGCCCTGTATGACTATGAGGGGCAGGAGCATGATGAG  1209

Query 1333  CTGAGCTTCAAGGCTGGGGATGAGCTGACCAAGATGGAGGACGAGGATGAGCAGGGCTGGTGCAAGGGACGCTT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1210  CTGAGCTTCAAGGCTGGGGATGAGCTGACCAAGATGGAGGACGAGGATGAGCAGGGCTGGTGCAAGGGACGCTT  1283

Query 1407  GGACAACGGGCAAGTTGGCCTATACCCGGCAAATTATGTGGAGGCGATCCAG  1458
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1284  GGACAACGGGCAAGTTGGCCTATACCCGGCAAATTATGTGGAGGCGATCCAG  1335