Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02658
• Subject: NM_001349973.1
• Aligned Length: 1464
• Identities: 1335
• Gaps: 129

Alignment

Query    1  ATGTCTGTCACATATGATGATTCCGTTGGAGTAGAAGTGTCCAGCGACAGCTTCTGGGAGGTCGGGAACTACAA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCTGTCACATATGATGATTCCGTTGGAGTAGAAGTGTCCAGCGACAGCTTCTGGGAGGTCGGGAACTACAA  74

Query   75  GCGGACTGTGAAGCGGATCGACGATGGCCACCGCCTGTGCAGCGACCTCATGAACTGCCTGCATGAGCGGGCGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCGGACTGTGAAGCGGATCGACGATGGCCACCGCCTGTGCAGCGACCTCATGAACTGCCTGCATGAGCGGGCGC  148

Query  149  GCATCGAGAAGGCGTATGCGCAGCAGCTCACTGAGTGGGCCCGGCGCTGGAGGCAGCTCGTGGAGAAAGGGCCC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCATCGAGAAGGCGTATGCGCAGCAGCTCACTGAGTGGGCCCGGCGCTGGAGGCAGCTCGTGGAGAAAGGGCCC  222

Query  223  CAGTACGGGACCGTGGAGAAGGCCTGGATGGCCTTCATGTCCGAGGCAGAGAGGGTGAGCGAGCTGCACCTCGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CAGTACGGGACCGTGGAGAAGGCCTGGATGGCCTTCATGTCCGAGGCAGAGAGGGTGAGCGAGCTGCACCTCGA  296

Query  297  GGTGAAGGCCTCACTGATGAACGATGACTTCGAGAAGATCAAGAACTGGCAGAAGGAAGCCTTTCACAAGCAGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGTGAAGGCCTCACTGATGAACGATGACTTCGAGAAGATCAAGAACTGGCAGAAGGAAGCCTTTCACAAGCAGA  370

Query  371  TGATGGGCGGCTTCAAGGAGACCAAGGAAGCTGAGGACGGCTTTCGGAAGGCACAGAAGCCCTGGGCCAAGAAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGATGGGCGGCTTCAAGGAGACCAAGGAAGCTGAGGACGGCTTTCGGAAGGCACAGAAGCCCTGGGCCAAGAAG  444

Query  445  CTGAAAGAGGTAGAAGCAGCAAAGAAAGCCCACCATGCAGCGTGCAAAGAGGAGAAGCTGGCTATCTCACGAGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTGAAAGAGGTAGAAGCAGCAAAGAAAGCCCACCATGCAGCGTGCAAAGAGGAGAAGCTGGCTATCTCACGAGA  518

Query  519  AGCCAACAGCAAGGCAGACCCATCCCTCAACCCTGAACAGCTCAAGAAATTGCAAGACAAAATAGAAAAGTGCA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGCCAACAGCAAGGCAGACCCATCCCTCAACCCTGAACAGCTCAAGAAATTGCAAGACAAAATAGAAAAGTGCA  592

Query  593  AGCAAGATGTTCTTAAGACCAAAGAGAAGTATGAGAAGTCCCTGAAGGAACTCGACCAGGGCACACCCCAGTAC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGCAAGATGTTCTTAAGACCAAAGAGAAGTATGAGAAGTCCCTGAAGGAACTCGACCAGGGCACACCCCAGTAC  666

Query  667  ATGGAGAACATGGAGCAGGTGTTTGAGCAGTGCCAGCAGTTCGAGGAGAAACGCCTTCGCTTCTTCCGGGAGGT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATGGAGAACATGGAGCAGGTGTTTGAGCAGTGCCAGCAGTTCGAGGAGAAACGCCTTCGCTTCTTCCGGGAGGT  740

Query  741  TCTGCTGGAGGTTCAGAAGCACCTAGACCTGTCCAATGTGGCTGGCTACAAAGCCATTTACCATGACCTGGAGC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TCTGCTGGAGGTTCAGAAGCACCTAGACCTGTCCAATGTGGCTGGCTACAAAGCCATTTACCATGACCTGGAGC  814

Query  815  AGAGCATCAGAGCAGCTGATGCAGTGGAGGACCTGAGGTGGTTCCGAGCCAATCACGGGCCGGGCATGGCCATG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGAGCATCAGAGCAGCTGATGCAGTGGAGGACCTGAGGTGGTTCCGAGCCAATCACGGGCCGGGCATGGCCATG  888

Query  889  AACTGGCCGCAGTTTGAG------GAGTGGTCCGCAGACCTGAATCGAACCCTCAGCCGGAGAGAGAAGAAGAA  956
            ||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AACTGGCCGCAGTTTGAGGATGAAGAGTGGTCCGCAGACCTGAATCGAACCCTCAGCCGGAGAGAGAAGAAGAA  962

Query  957  GGCCACTGACGGCGTCACCCTGACGGGCATCAACCAGACAGGCGACCAGTCTCTGCCGAGTAAGCCCAGCAGCA  1030
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  
Sbjct  963  GGCCACTGACGGCGTCACCCTGACGGGCATCAACCAGACAGGCGACCAGTCTCTGCCGAGTAAGCCCAGCAG--  1034

Query 1031  CCCTTAATGTCCCGAGCAACCCCGCCCAGTCTGCGCAGTCACAGTCCAGCTACAACCCCTTCGAGGATGAGGAC  1104
                                                                                      
Sbjct 1035  --------------------------------------------------------------------------  1034

Query 1105  GACACGGGCAGCACCGTCAGTGAGAAGGACGACACTAAGGCCAAAAATGTGAGCAGCTACGAGAAGACCCAGAG  1178
                                                           |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1035  -----------------------------------------------TGTGAGCAGCTACGAGAAGACCCAGAG  1061

Query 1179  CTATCCCACCGACTGGTCAGACGATGAGTCTAACAACCCCTTCTCCTCCACGGATGCCAATGGGGACTCGAATC  1252
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1062  CTATCCCACCGACTGGTCAGACGATGAGTCTAACAACCCCTTCTCCTCCACGGATGCCAATGGGGACTCGAATC  1135

Query 1253  CATTCGACGACGACGCCACCTCGGGGACGGAAGTGCGAGTCCGGGCCCTGTATGACTATGAGGGGCAGGAGCAT  1326
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1136  CATTCGACGACGACGCCACCTCGGGGACGGAAGTGCGAGTCCGGGCCCTGTATGACTATGAGGGGCAGGAGCAT  1209

Query 1327  GATGAGCTGAGCTTCAAGGCTGGGGATGAGCTGACCAAGATGGAGGACGAGGATGAGCAGGGCTGGTGCAAGGG  1400
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1210  GATGAGCTGAGCTTCAAGGCTGGGGATGAGCTGACCAAGATGGAGGACGAGGATGAGCAGGGCTGGTGCAAGGG  1283

Query 1401  ACGCTTGGACAACGGGCAAGTTGGCCTATACCCGGCAAATTATGTGGAGGCGATCCAG  1458
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1284  ACGCTTGGACAACGGGCAAGTTGGCCTATACCCGGCAAATTATGTGGAGGCGATCCAG  1341