Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02658
• Subject: NM_001349974.1
• Aligned Length: 1464
• Identities: 1212
• Gaps: 252

Alignment

Query    1  ATGTCTGTCACATATGATGATTCCGTTGGAGTAGAAGTGTCCAGCGACAGCTTCTGGGAGGTCGGGAACTACAA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GCGGACTGTGAAGCGGATCGACGATGGCCACCGCCTGTGCAGCGACCTCATGAACTGCCTGCATGAGCGGGCGC  148
                                                             |||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -------------------------------------------------ATGAACTGCCTGCATGAGCGGGCGC  25

Query  149  GCATCGAGAAGGCGTATGCGCAGCAGCTCACTGAGTGGGCCCGGCGCTGGAGGCAGCTCGTGGAGAAAGGGCCC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   26  GCATCGAGAAGGCGTATGCGCAGCAGCTCACTGAGTGGGCCCGGCGCTGGAGGCAGCTCGTGGAGAAAGGGCCC  99

Query  223  CAGTACGGGACCGTGGAGAAGGCCTGGATGGCCTTCATGTCCGAGGCAGAGAGGGTGAGCGAGCTGCACCTCGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  100  CAGTACGGGACCGTGGAGAAGGCCTGGATGGCCTTCATGTCCGAGGCAGAGAGGGTGAGCGAGCTGCACCTCGA  173

Query  297  GGTGAAGGCCTCACTGATGAACGATGACTTCGAGAAGATCAAGAACTGGCAGAAGGAAGCCTTTCACAAGCAGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  174  GGTGAAGGCCTCACTGATGAACGATGACTTCGAGAAGATCAAGAACTGGCAGAAGGAAGCCTTTCACAAGCAGA  247

Query  371  TGATGGGCGGCTTCAAGGAGACCAAGGAAGCTGAGGACGGCTTTCGGAAGGCACAGAAGCCCTGGGCCAAGAAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  248  TGATGGGCGGCTTCAAGGAGACCAAGGAAGCTGAGGACGGCTTTCGGAAGGCACAGAAGCCCTGGGCCAAGAAG  321

Query  445  CTGAAAGAGGTAGAAGCAGCAAAGAAAGCCCACCATGCAGCGTGCAAAGAGGAGAAGCTGGCTATCTCACGAGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  322  CTGAAAGAGGTAGAAGCAGCAAAGAAAGCCCACCATGCAGCGTGCAAAGAGGAGAAGCTGGCTATCTCACGAGA  395

Query  519  AGCCAACAGCAAGGCAGACCCATCCCTCAACCCTGAACAGCTCAAGAAATTGCAAGACAAAATAGAAAAGTGCA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  396  AGCCAACAGCAAGGCAGACCCATCCCTCAACCCTGAACAGCTCAAGAAATTGCAAGACAAAATAGAAAAGTGCA  469

Query  593  AGCAAGATGTTCTTAAGACCAAAGAGAAGTATGAGAAGTCCCTGAAGGAACTCGACCAGGGCACACCCCAGTAC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  470  AGCAAGATGTTCTTAAGACCAAAGAGAAGTATGAGAAGTCCCTGAAGGAACTCGACCAGGGCACACCCCAGTAC  543

Query  667  ATGGAGAACATGGAGCAGGTGTTTGAGCAGTGCCAGCAGTTCGAGGAGAAACGCCTTCGCTTCTTCCGGGAGGT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  544  ATGGAGAACATGGAGCAGGTGTTTGAGCAGTGCCAGCAGTTCGAGGAGAAACGCCTTCGCTTCTTCCGGGAGGT  617

Query  741  TCTGCTGGAGGTTCAGAAGCACCTAGACCTGTCCAATGTGGCTGGCTACAAAGCCATTTACCATGACCTGGAGC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  618  TCTGCTGGAGGTTCAGAAGCACCTAGACCTGTCCAATGTGGCTGGCTACAAAGCCATTTACCATGACCTGGAGC  691

Query  815  AGAGCATCAGAGCAGCTGATGCAGTGGAGGACCTGAGGTGGTTCCGAGCCAATCACGGGCCGGGCATGGCCATG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  692  AGAGCATCAGAGCAGCTGATGCAGTGGAGGACCTGAGGTGGTTCCGAGCCAATCACGGGCCGGGCATGGCCATG  765

Query  889  AACTGGCCGCAGTTTGAG------GAGTGGTCCGCAGACCTGAATCGAACCCTCAGCCGGAGAGAGAAGAAGAA  956
            ||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  766  AACTGGCCGCAGTTTGAGGATGAAGAGTGGTCCGCAGACCTGAATCGAACCCTCAGCCGGAGAGAGAAGAAGAA  839

Query  957  GGCCACTGACGGCGTCACCCTGACGGGCATCAACCAGACAGGCGACCAGTCTCTGCCGAGTAAGCCCAGCAGCA  1030
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  
Sbjct  840  GGCCACTGACGGCGTCACCCTGACGGGCATCAACCAGACAGGCGACCAGTCTCTGCCGAGTAAGCCCAGCAG--  911

Query 1031  CCCTTAATGTCCCGAGCAACCCCGCCCAGTCTGCGCAGTCACAGTCCAGCTACAACCCCTTCGAGGATGAGGAC  1104
                                                                                      
Sbjct  912  --------------------------------------------------------------------------  911

Query 1105  GACACGGGCAGCACCGTCAGTGAGAAGGACGACACTAAGGCCAAAAATGTGAGCAGCTACGAGAAGACCCAGAG  1178
                                                           |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  912  -----------------------------------------------TGTGAGCAGCTACGAGAAGACCCAGAG  938

Query 1179  CTATCCCACCGACTGGTCAGACGATGAGTCTAACAACCCCTTCTCCTCCACGGATGCCAATGGGGACTCGAATC  1252
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  939  CTATCCCACCGACTGGTCAGACGATGAGTCTAACAACCCCTTCTCCTCCACGGATGCCAATGGGGACTCGAATC  1012

Query 1253  CATTCGACGACGACGCCACCTCGGGGACGGAAGTGCGAGTCCGGGCCCTGTATGACTATGAGGGGCAGGAGCAT  1326
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1013  CATTCGACGACGACGCCACCTCGGGGACGGAAGTGCGAGTCCGGGCCCTGTATGACTATGAGGGGCAGGAGCAT  1086

Query 1327  GATGAGCTGAGCTTCAAGGCTGGGGATGAGCTGACCAAGATGGAGGACGAGGATGAGCAGGGCTGGTGCAAGGG  1400
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1087  GATGAGCTGAGCTTCAAGGCTGGGGATGAGCTGACCAAGATGGAGGACGAGGATGAGCAGGGCTGGTGCAAGGG  1160

Query 1401  ACGCTTGGACAACGGGCAAGTTGGCCTATACCCGGCAAATTATGTGGAGGCGATCCAG  1458
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1161  ACGCTTGGACAACGGGCAAGTTGGCCTATACCCGGCAAATTATGTGGAGGCGATCCAG  1218