Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02658
• Subject: XM_017316605.1
• Aligned Length: 1464
• Identities: 1185
• Gaps: 129

Alignment

Query    1  ATGTCTGTCACATATGATGATTCCGTTGGAGTAGAAGTGTCCAGCGACAGCTTCTGGGAGGTCGGGAACTACAA  74
            |||||||||||.||.|||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct    1  ATGTCTGTCACCTACGATGACTCTGTGGGAGTGGAAGTGTCCAGCGACAGCTTCTGGGAGGTTGGGAACTACAA  74

Query   75  GCGGACTGTGAAGCGGATCGACGATGGCCACCGCCTGTGCAGCGACCTCATGAACTGCCTGCATGAGCGGGCGC  148
            .|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||..|.||||||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct   75  ACGGACTGTGAAGCGGATTGACGATGGCCACCGCCTGTGTGGTGACCTCATGAACTGTCTGCATGAGCGGGCAC  148

Query  149  GCATCGAGAAGGCGTATGCGCAGCAGCTCACTGAGTGGGCCCGGCGCTGGAGGCAGCTCGTGGAGAAAGGGCCC  222
            |||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||.||.
Sbjct  149  GCATCGAGAAGGCGTATGCACAGCAGCTCACTGAGTGGGCCCGACGCTGGAGGCAGCTGGTAGAGAAGGGACCA  222

Query  223  CAGTACGGGACCGTGGAGAAGGCCTGGATGGCCTTCATGTCCGAGGCAGAGAGGGTGAGCGAGCTGCACCTCGA  296
            |||||.|||||||||||||||||||||||.||..|||||||.||.||||||||||||||.||.||||||||.||
Sbjct  223  CAGTATGGGACCGTGGAGAAGGCCTGGATAGCTGTCATGTCTGAAGCAGAGAGGGTGAGTGAACTGCACCTGGA  296

Query  297  GGTGAAGGCCTCACTGATGAACGATGACTTCGAGAAGATCAAGAACTGGCAGAAGGAAGCCTTTCACAAGCAGA  370
            .||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGTGAAGGCATCACTGATGAATGAAGACTTTGAGAAGATCAAGAACTGGCAGAAGGAAGCCTTTCACAAGCAGA  370

Query  371  TGATGGGCGGCTTCAAGGAGACCAAGGAAGCTGAGGACGGCTTTCGGAAGGCACAGAAGCCCTGGGCCAAGAAG  444
            |||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGATGGGAGGCTTCAAGGAGACCAAAGAAGCAGAGGATGGCTTTCGGAAGGCCCAGAAGCCCTGGGCCAAGAAG  444

Query  445  CTGAAAGAGGTAGAAGCAGCAAAGAAAGCCCACCATGCAGCGTGCAAAGAGGAGAAGCTGGCTATCTCACGAGA  518
            |||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||..|||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||
Sbjct  445  CTGAAAGAGGTGGAAGCGGCAAAGAAGGCGCACCACACAGCGTGCAAAGAGGAGAAGCTGGCCATCTCCCGGGA  518

Query  519  AGCCAACAGCAAGGCAGACCCATCCCTCAACCCTGAACAGCTCAAGAAATTGCAAGACAAAATAGAAAAGTGCA  592
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||.||||||||||.||||||||.||||
Sbjct  519  AGCCAACAGCAAGGCAGATCCATCCCTCAACCCTGAGCAGCTGAAGAAACTGCAAGACAAGATAGAAAAATGCA  592

Query  593  AGCAAGATGTTCTTAAGACCAAAGAGAAGTATGAGAAGTCCCTGAAGGAACTCGACCAGGGCACACCCCAGTAC  666
            |.||.||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||..|||||||||||||
Sbjct  593  AACAGGACGTTCTAAAGACCAAGGACAAGTATGAGAAGTCCCTGAAGGAGCTTGATCAGACCACACCCCAGTAC  666

Query  667  ATGGAGAACATGGAGCAGGTGTTTGAGCAGTGCCAGCAGTTCGAGGAGAAACGCCTTCGCTTCTTCCGGGAGGT  740
            |||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct  667  ATGGAGAACATGGAGCAGGTGTTCGAGCAGTGCCAGCAGTTTGAAGAGAAGCGCCTGCGCTTCTTCCGGGAGGT  740

Query  741  TCTGCTGGAGGTTCAGAAGCACCTAGACCTGTCCAATGTGGCTGGCTACAAAGCCATTTACCATGACCTGGAGC  814
            ||||||||||||||||||||||.|.||.|||||||||||||||.||||.|||.|||||||||..||.|||||||
Sbjct  741  TCTGCTGGAGGTTCAGAAGCACTTGGATCTGTCCAATGTGGCTAGCTATAAAACCATTTACCGGGAGCTGGAGC  814

Query  815  AGAGCATCAGAGCAGCTGATGCAGTGGAGGACCTGAGGTGGTTCCGAGCCAATCACGGGCCGGGCATGGCCATG  888
            |||||||||.||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||.||||||||.|||
Sbjct  815  AGAGCATCAAAGCAGCAGATGCGGTAGAGGACCTGAGGTGGTTCCGGGCTAACCATGGGCCAGGCATGGCTATG  888

Query  889  AACTGGCCGCAGTTTGAG------GAGTGGTCCGCAGACCTGAATCGAACCCTCAGCCGGAGAGAGAAGAAGAA  956
            ||||||||.|||||||||      ||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AACTGGCCACAGTTTGAGGATGAAGAGTGGTCTGCAGATCTGAATCGAACTCTCAGCCGGAGAGAGAAGAAGAA  962

Query  957  GGCCACTGACGGCGTCACCCTGACGGGCATCAACCAGACAGGCGACCAGTCTCTGCCGAGTAAGCCCAGCAGCA  1030
            |||...||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||...|.||..|||||..||||  
Sbjct  963  GGCTGTTGACGGTGTCACCCTAACAGGGATCAACCAGACAGGTGACCAGTCTGGACAGAACAAGCCTGGCAG--  1034

Query 1031  CCCTTAATGTCCCGAGCAACCCCGCCCAGTCTGCGCAGTCACAGTCCAGCTACAACCCCTTCGAGGATGAGGAC  1104
                                                                                      
Sbjct 1035  --------------------------------------------------------------------------  1034

Query 1105  GACACGGGCAGCACCGTCAGTGAGAAGGACGACACTAAGGCCAAAAATGTGAGCAGCTACGAGAAGACCCAGAG  1178
                                                           |||.||||||||.||||||||.||||.
Sbjct 1035  -----------------------------------------------TGTCAGCAGCTATGAGAAGACTCAGAC  1061

Query 1179  CTATCCCACCGACTGGTCAGACGATGAGTCTAACAACCCCTTCTCCTCCACGGATGCCAATGGGGACTCGAATC  1252
            .||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|
Sbjct 1062  TTACCCCACTGACTGGTCTGATGATGAGTCTAACAACCCTTTCTCCTCCACGGATGCCAACGGGGATTCGAACC  1135

Query 1253  CATTCGACGACGACGCCACCTCGGGGACGGAAGTGCGAGTCCGGGCCCTGTATGACTATGAGGGGCAGGAGCAT  1326
            ||||.||.||.|||.|.|||||.||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1136  CATTTGATGAGGACACGACCTCAGGAACAGAAGTGCGAGTTCGGGCCCTCTATGACTATGAGGGGCAGGAACAT  1209

Query 1327  GATGAGCTGAGCTTCAAGGCTGGGGATGAGCTGACCAAGATGGAGGACGAGGATGAGCAGGGCTGGTGCAAGGG  1400
            |||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 1210  GATGAGCTGAGCTTCAAGGCTGGGGATGAACTGACCAAGATAGAGGATGAAGATGAACAGGGTTGGTGCAAGGG  1283

Query 1401  ACGCTTGGACAACGGGCAAGTTGGCCTATACCCGGCAAATTATGTGGAGGCGATCCAG  1458
            |||.||.||||.|||.||.||||||||||||||.||.||.|||||.|||||.||||||
Sbjct 1284  ACGTTTAGACAGCGGCCAGGTTGGCCTATACCCAGCCAACTATGTCGAGGCTATCCAG  1341