Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02663
• Subject: NM_001257172.2
• Aligned Length: 1467
• Identities: 1322
• Gaps: 138

Alignment

Query    1  ATGGCCACTGACTCATGGGC--CCTGGCGGTGGACGAGCAGGA-----AGCTGCGGC-----------------  50
            ||||   |||      ||||  ||.||||     ||..||.||     ..|||||||                 
Sbjct    1  ATGG---CTG------GGGCTGCCGGGCG-----CGTCCAAGATCGCGCCCTGCGGCGGTTTCCCATCACCCTG  60

Query   51  ----TGAGTCG--TTGAGCAACTTGCATCTTAAGGAAGAGAAAATCAAACCAGATACCAATGGTGCTGTTGTCA  118
                || |.||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   61  CCTGTG-GGCGACTTGAGCAACTTGCATCTTAAGGAAGAGAAAATCAAACCAGATACCAATGGTGCTGTTGTCA  133

Query  119  AGACCAATGCCAATGCAGAGAAGACAGATGAAGAAGAGAAAGAGGACAGAGCTGCCCAGTCCTTACTCAACAAG  192
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  134  AGACCAATGCCAATGCAGAGAAGACAGATGAAGAAGAGAAAGAGGACAGAGCTGCCCAGTCCTTACTCAACAAG  207

Query  193  CTGATCAGAAGCAACCTTGTTGATAACACAAACCAAGTGGAAGTCCTGCAGCGGGATCCAAACTCCCCTCTGTA  266
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  208  CTGATCAGAAGCAACCTTGTTGATAACACAAACCAAGTGGAAGTCCTGCAGCGGGATCCAAACTCCCCTCTGTA  281

Query  267  CTCGGTGAAGTCTTTTGAAGAGCTTCGGCTGAAACCACAGCTTCTCCAAGGAGTCTATGCCATGGGTTTCAATC  340
            ||||||||||||||||||||||||||||||                                            
Sbjct  282  CTCGGTGAAGTCTTTTGAAGAGCTTCGGCT--------------------------------------------  311

Query  341  GTCCATCCAAGATACAAGAGAACGCATTGCCACTGATGCTTGCTGAGCCCCCACAGAACTTAATTGCCCAATCT  414
                                                             |||||||||||||||||||||||||
Sbjct  312  -------------------------------------------------CCCACAGAACTTAATTGCCCAATCT  336

Query  415  CAGTCTGGTACTGGTAAAACAGCTGCCTTCGTGCTGGCCATGCTTAGCCAAGTAGAACCTGCAAACAAATACCC  488
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  337  CAGTCTGGTACTGGTAAAACAGCTGCCTTCGTGCTGGCCATGCTTAGCCAAGTAGAACCTGCAAACAAATACCC  410

Query  489  CCAGTGTCTATGTCTCTCCCCAACGTATGAGCTCGCCCTCCAAACAGGAAAAGTGATTGAACAAATGGGCAAAT  562
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  411  CCAGTGTCTATGTCTCTCCCCAACGTATGAGCTCGCCCTCCAAACAGGAAAAGTGATTGAACAAATGGGCAAAT  484

Query  563  TTTACCCTGAACTGAAGCTAGCTTATGCTGTTCGAGGCAATAAATTGGAAAGAGGCCAGAAGATCAGTGAGCAG  636
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  485  TTTACCCTGAACTGAAGCTAGCTTATGCTGTTCGAGGCAATAAATTGGAAAGAGGCCAGAAGATCAGTGAGCAG  558

Query  637  ATTGTCATTGGCACCCCTGGGACTGTGCTGGACTGGTGCTCCAAGCTCAAGTTCATTGATCCCAAGAAAATCAA  710
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  559  ATTGTCATTGGCACCCCTGGGACTGTGCTGGACTGGTGCTCCAAGCTCAAGTTCATTGATCCCAAGAAAATCAA  632

Query  711  GGTGTTTGTTCTGGATGAGGCTGATGTCATGATAGCCACTCAGGGCCACCAAGATCAGAGCATCCGCATCCAGA  784
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  633  GGTGTTTGTTCTGGATGAGGCTGATGTCATGATAGCCACTCAGGGCCACCAAGATCAGAGCATCCGCATCCAGA  706

Query  785  GGATGCTGCCCAGGAACTGCCAGATGCTGCTTTTCTCCGCCACCTTTGAAGACTCTGTGTGGAAGTTTGCCCAG  858
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  707  GGATGCTGCCCAGGAACTGCCAGATGCTGCTTTTCTCCGCCACCTTTGAAGACTCTGTGTGGAAGTTTGCCCAG  780

Query  859  AAAGTGGTCCCAGACCCAAACGTTATCAAACTGAAGCGTGAGGAAGAGACCCTGGACACCATCAAGCAGTACTA  932
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  781  AAAGTGGTCCCAGACCCAAACGTTATCAAACTGAAGCGTGAGGAAGAGACCCTGGACACCATCAAGCAGTACTA  854

Query  933  TGTCCTGTGCAGCAGCAGAGACGAGAAGTTCCAGGCCTTGTGTAACCTCTACGGGGCCATCACCATTGCTCAAG  1006
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  855  TGTCCTGTGCAGCAGCAGAGACGAGAAGTTCCAGGCCTTGTGTAACCTCTACGGGGCCATCACCATTGCTCAAG  928

Query 1007  CCATGATCTTCTGCCATACTCGCAAAACAGCTAGTTGGCTGGCAGCAGAGCTCTCAAAAGAAGGCCACCAGGTG  1080
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  929  CCATGATCTTCTGCCATACTCGCAAAACAGCTAGTTGGCTGGCAGCAGAGCTCTCAAAAGAAGGCCACCAGGTG  1002

Query 1081  GCTCTGCTGAGTGGGGAGATGATGGTGGAACAGAGGGCTGCAGTGATTGAGCGCTTCCGAGAGGGCAAAGAGAA  1154
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1003  GCTCTGCTGAGTGGGGAGATGATGGTGGAACAGAGGGCTGCAGTGATTGAGCGCTTCCGAGAGGGCAAAGAGAA  1076

Query 1155  GGTTTTGGTGACCACCAACGTGTGTGCCCGCGGCATTGATGTTGAACAAGTGTCTGTCGTCATCAACTTTGATC  1228
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1077  GGTTTTGGTGACCACCAACGTGTGTGCCCGCGGCATTGATGTTGAACAAGTGTCTGTCGTCATCAACTTTGATC  1150

Query 1229  TTCCCGTGGACAAGGACGGGAATCCTGACAATGAGACCTACCTGCACCGGATCGGGCGCACGGGCCGCTTTGGC  1302
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1151  TTCCCGTGGACAAGGACGGGAATCCTGACAATGAGACCTACCTGCACCGGATCGGGCGCACGGGCCGCTTTGGC  1224

Query 1303  AAGAGGGGCCTGGCAGTGAACATGGTGGACAGCAAGCACAGCATGAACATCCTGAACAGAATCCAGGAGCATTT  1376
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1225  AAGAGGGGCCTGGCAGTGAACATGGTGGACAGCAAGCACAGCATGAACATCCTGAACAGAATCCAGGAGCATTT  1298

Query 1377  TAATAAGAAGATAGAAAGATTGGACACAGATGATTTGGACGAGATTGAGAAAATAGCCAAC  1437
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1299  TAATAAGAAGATAGAAAGATTGGACACAGATGATTTGGACGAGATTGAGAAAATAGCCAAC  1359