Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_02688
Subject:
NM_001164391.1
Aligned Length:
593
Identities:
434
Gaps:
159

Alignment

Query   1  MRDSTGAGNSLVHKRSPLRRNQKTPTSLTKLSLQDGHKAKKPACKFEEGQDVLARWSDGLFYLGTIKKINILKQ  74
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  75  SCFIIFEDSSKSWVLWKDIQTGATGSGEMVCTICQEEYSEAPNEMVICDKCGQGYHQLCHTPHIDSSVIDSDEK  148
                                       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ----------------------------MVCTICQEEYSEAPNEMVICDKCGQGYHQLCHTPHIDSSVIDSDEK  46

Query 149  WLCRQCVFATTTKRGGALKKGPNAKALQVMKQTLPYSVADLEWDAGHKTNVQQCYCYCGGPGDWYLKMLQCCKC  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  47  WLCRQCVFATTTKRGGALKKGPNAKALQVMKQTLPYSVADLEWDAGHKTNVQQCYCYCGGPGDWYLKMLQCCKC  120

Query 223  KQWFHEACVQCLQKPMLFGDRFYTFICSVCSSGPEYLKRLPLQWVDIAHLCLYNLSVIHKKKYFDSELELMTYI  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121  KQWFHEACVQCLQKPMLFGDRFYTFICSVCSSGPEYLKRLPLQWVDIAHLCLYNLSVIHKKKYFDSELELMTYI  194

Query 297  NENWDRLHPGELADTPKSERYEHVLEALNDYKTM----------------------------------------  330
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||                                        
Sbjct 195  NENWDRLHPGELADTPKSERYEHVLEALNDYKTMFMSGKEIKKKKHLFGLRIRVPPVPPNVAFKAEKEPEGTSH  268

Query 331  -----------------EVSNGIEKKGKKKSVGRPPGPYTRKMIQKTAEPLLDKESISENPTLDLPCSIGRTEG  387
                            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 269  EFKIKGRKASKPISDSREVSNGIEKKGKKKSVGRPPGPYTRKMIQKTAEPLLDKESISENPTLDLPCSIGRTEG  342

Query 388  TAHSSNTSDVDFTGASSAKETTSSSISRHYGLSDSRKRTRTGRSWPAAIPHLRRRRGRLPRRALQTQNSEIVKD  461
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 343  TAHSSNTSDVDFTGASSAKETTSSSISRHYGLSDSRKRTRTGRSWPAAIPHLRRRRGRLPRRALQTQNSEIVKD  416

Query 462  DEGKEDYQFDELNTEILNNLADQELQLNHLKNSITSYFGAAGRIACGEKYRVLARRVTLDGKVQYLVEWEGATA  535
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 417  DEGKEDYQFDELNTEILNNLADQELQLNHLKNSITSYFGAAGRIACGEKYRVLARRVTLDGKVQYLVEWEGATA  490

Query 536  S  536
           |
Sbjct 491  S  491