Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_02688
- Subject:
- NM_001359088.1
- Aligned Length:
- 1812
- Identities:
- 1531
- Gaps:
- 204
Alignment
Query 1 ---------------ATGA------------------GAGACTCTACAGGGGCAGGTAATTCACTGGTCCACAA 41
|||| .||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCCTCCCCCTTCCATGATGGACTGTACTCTGAAACTAGACTCTACAGGAGCAGGTAATTCACTGGTCCACAA 74
Query 42 GCGGTCTCCTTTACGTCGAAACCAAAAGACCCCAACATCCTTGACCAAGCTGTCTTTACAGGATGGACATAAAG 115
|||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GCGGTCTCCTTTACGTCGAAACCAAAAGACCTCAGCATCCTTGAACAAGCTGTCTTTACAGGATGGACATAAAG 148
Query 116 CCAAAAAGCCAGCATGTAAATTTGAAGAGGGTCAGGATGTCCTAGCTAGATGGTCAGATGGCTTGTTTTATCTT 189
|||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CCAAAAAACCAGCATGTAAATTTGAAGAGGGTCAAGATGTCTTAGCTAGATGGTCAGATGGCTTGTTTTATCTT 222
Query 190 GGCACTATCAAAAAGATAAACATATTGAAACAGAGCTGCTTCATCATATTTGAAGACAGTTCTAAATCCTGGGT 263
||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 223 GGAACTATCAAAAAGATAAACATATTGAAACAGAGCTGCTTCATCATATTTGAGGACAGTTCCAAATCCTGGGT 296
Query 264 TCTCTGGAAGGACATTCAAACAGGAGCCACTGGAAGTGGGGAAATGGTCTGTACAATATGTCAAGAAGAGTATT 337
|||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TCTCTGGAAGGACATCCAAACAGGAGCCACTGGGAGTGGGGAAATGGTCTGTACAATATGTCAAGAAGAGTATT 370
Query 338 CAGAAGCTCCCAATGAAATGGTTATATGTGACAAGTGTGGCCAAGGATATCATCAGTTGTGTCACACACCTCAT 411
|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 371 CAGAAGCTCCCAATGAAATGGTTATATGTGATAAGTGTGGTCAAGGATATCATCAGCTGTGTCACACACCTCAT 444
Query 412 ATTGATTCCAGTGTGATTGATTCAGATGAAAAATGGCTCTGTCGGCAGTGTGTTTTTGCAACAACAACAAAGAG 485
|||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct 445 ATTGACTCGAGTGTGATTGATTCAGATGAAAAGTGGCTTTGTCGACAGTGCGTTTTTGCAACAACTACAAAGAG 518
Query 486 GGGTGGTGCACTTAAGAAAGGACCAAATGCCAAAGCATTGCAAGTCATGAAGCAGACATTACCCTATAGTGTGG 559
|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GGGTGGTGCGCTTAAGAAAGGACCAAATGCCAAAGCATTGCAAGTCATGAAGCAGACATTACCCTATAGTGTGG 592
Query 560 CAGACCTTGAATGGGATGCAGGTCATAAAACCAATGTCCAGCAGTGTTACTGCTATTGTGGAGGCCCTGGAGAC 633
|.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CTGACCTTGAATGGGATGCAGGCCATAAAACCAATGTCCAGCAGTGCTACTGCTATTGTGGAGGCCCTGGAGAC 666
Query 634 TGGTATTTGAAGATGCTACAGTGCTGCAAATGTAAGCAGTGGTTTCATGAGGCTTGTGTGCAATGCCTTCAAAA 707
||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 667 TGGTATTTAAAGATGCTGCAGTGCTGCAAATGTAAGCAGTGGTTTCATGAAGCTTGTGTCCAATGCCTTCAGAA 740
Query 708 GCCAATGCTATTTGGAGACAGATTTTATACGTTTATATGCTCTGTCTGCAGTTCTGGACCAGAATACCTCAAAC 781
|||||||||.||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GCCAATGCTGTTTGGAGATAGGTTTTATACATTTATTTGCTCTGTCTGCAGTTCTGGACCAGAATACCTCAAAC 814
Query 782 GTCTACCATTACAGTGGGTAGATATAGCACACCTATGCCTTTACAACCTAAGTGTTATTCATAAGAAGAAATAC 855
|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 815 GTCTACCGTTACAGTGGGTAGATATAGCACACCTATGCCTTTACAACCTAAGTGTTATTCACAAGAAGAAATAC 888
Query 856 TTTGATTCTGAACTTGAGCTTATGACATACATTAATGAAAACTGGGATAGATTGCACCCTGGAGAGCTGGCAGA 929
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TTTGATTCTGAACTTGAGCTTATGACATACATTAATGAAAACTGGGATAGATTGCACCCTGGAGAGCTGGCAGA 962
Query 930 CACACCAAAATCTGAAAGATATGAGCATGTTCTGGAGGCATTAAATGATTACAAGACCAT-------------- 989
||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CACACCCAAATCTGAAAGATATGAGCATGTTCTGGAGGCATTAAATGATTACAAGACCATGTTTATGTCTGGGA 1036
Query 990 -------------------------------------------------------------------------- 989
Sbjct 1037 AAGAAATAAAGAAGAAGAAGCATTTGTTTGGGTTGCGAATTCGTGTTCCTCCTGTGCCACCAAATGTGGCTTTC 1110
Query 990 -------------------------------------------------------------------------- 989
Sbjct 1111 AAAGCAGAGAAAGAACCAGAAGGAACATCCCATGAATTTAAAATTAAAGGCAGAAAGGCATCCAAACCTACATC 1184
Query 990 ---------GGAAGTAAGCAATGGCATAGAAAAAAAAGGAAAGAAAAAATCTGTAGGTCGTCCACCTGGCCCAT 1054
|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1185 TGACTCAAGGGAAGTAAGCAATGGGATAGAAAAAAAAGGAAAGAAAAAATCTGTAGGTCGTCCTCCTGGCCCAT 1258
Query 1055 ATACAAGAAAAATGATTCAAAAAACTGCTGAGCCACTTTTGGATAAGGAATCAATTTCAGAGAATCCTACTTTG 1128
|||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||
Sbjct 1259 ATACAAGAAAAATGATTCAAAAAACTGCTGAGCTACCTTTGGATAAGGAATCAGTTTCAGAGAATCCTACGTTG 1332
Query 1129 GATTTACCTTGTTCTATAGGGAGAACTGAGGGAACTGCACATTCATCCAATACCTCAGATGTGGATTTCACGGG 1202
||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||
Sbjct 1333 GATTTACCTTGTTCTATAGGGAGAACTGAGGGAATTGCACATTCATCCAATACCTCAGATGTGGACCTCACGGG 1406
Query 1203 TGCTTCCAGTGCAAAAGAAACTACCTCGTCTAGCATTTCCAGGCATTATGGATTATCTGACTCCAGAAAAAGAA 1276
|||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct 1407 TGCTTCCAGTGCAAACGAAACTACCTCGGCTAGCATTTCCAGGCATTGTGGATTATCAGACTCTAGAAAAAGAA 1480
Query 1277 CGCGTACAGGAAGATCTTGGCCTGCTGCAATACCACATTTGCGGAGAAGAAGAGGTCGTCTTCCAAGAAGAGCA 1350
|.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||
Sbjct 1481 CTCGCACAGGAAGATCATGGCCTGCTGCAATACCACATTTGCGGAGAAGAAGAGGTCGCCTTCCACGAAGAGCA 1554
Query 1351 CTCCAGACTCAGAACTCAGAAATTGTAAAAGATGATGAAGGCAAAGAAGATTATCAGTTTGATGAACTCAACAC 1424
|||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1555 CTCCAGACTCAGAACTCAGAAGTTGTGAAAGATGATGAAGGCAAAGAAGATTATCAGTTTGAAGAACTTAACAC 1628
Query 1425 AGAGATTCTGAATAACTTAGCAGATCAGGAGTTACAACTCAATCATCTAAAGAACTCCATTACCAGTTATTTTG 1498
|||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||.||||||||.||.||||||||||
Sbjct 1629 AGAAATTCTGAATAACTTAGCAGATCAGGAGTTGCAGCTCAATCACCTGAAAAACTCCATCACTAGTTATTTTG 1702
Query 1499 GTGCTGCAGGTAGAATAGCATGTGGCGAAAAATACCGAGTTTTGGCACGTCGGGTGACACTTGATGGAAAGGTG 1572
||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||
Sbjct 1703 GTGCCGCAGGTAGAATAGCATGTGGCGAAAAATACAGAGTTTTGGCTCGTCGGGTGACGCTTGATGGGAAGGTG 1776
Query 1573 CAGTATCTTGTGGAATGGGAAGGAGCAACTGCATCC 1608
||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1777 CAGTATCTTGTGGAATGGGAAGGAGCGACTGCATCC 1812