Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_02688
- Subject:
- NM_007358.4
- Aligned Length:
- 1779
- Identities:
- 1608
- Gaps:
- 171
Alignment
Query 1 ATGAGAGACTCTACAGGGGCAGGTAATTCACTGGTCCACAAGCGGTCTCCTTTACGTCGAAACCAAAAGACCCC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAGAGACTCTACAGGGGCAGGTAATTCACTGGTCCACAAGCGGTCTCCTTTACGTCGAAACCAAAAGACCCC 74
Query 75 AACATCCTTGACCAAGCTGTCTTTACAGGATGGACATAAAGCCAAAAAGCCAGCATGTAAATTTGAAGAGGGTC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AACATCCTTGACCAAGCTGTCTTTACAGGATGGACATAAAGCCAAAAAGCCAGCATGTAAATTTGAAGAGGGTC 148
Query 149 AGGATGTCCTAGCTAGATGGTCAGATGGCTTGTTTTATCTTGGCACTATCAAAAAGATAAACATATTGAAACAG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AGGATGTCCTAGCTAGATGGTCAGATGGCTTGTTTTATCTTGGCACTATCAAAAAGATAAACATATTGAAACAG 222
Query 223 AGCTGCTTCATCATATTTGAAGACAGTTCTAAATCCTGGGTTCTCTGGAAGGACATTCAAACAGGAGCCACTGG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AGCTGCTTCATCATATTTGAAGACAGTTCTAAATCCTGGGTTCTCTGGAAGGACATTCAAACAGGAGCCACTGG 296
Query 297 AAGTGGGGAAATGGTCTGTACAATATGTCAAGAAGAGTATTCAGAAGCTCCCAATGAAATGGTTATATGTGACA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AAGTGGGGAAATGGTCTGTACAATATGTCAAGAAGAGTATTCAGAAGCTCCCAATGAAATGGTTATATGTGACA 370
Query 371 AGTGTGGCCAAGGATATCATCAGTTGTGTCACACACCTCATATTGATTCCAGTGTGATTGATTCAGATGAAAAA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AGTGTGGCCAAGGATATCATCAGTTGTGTCACACACCTCATATTGATTCCAGTGTGATTGATTCAGATGAAAAA 444
Query 445 TGGCTCTGTCGGCAGTGTGTTTTTGCAACAACAACAAAGAGGGGTGGTGCACTTAAGAAAGGACCAAATGCCAA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TGGCTCTGTCGGCAGTGTGTTTTTGCAACAACAACAAAGAGGGGTGGTGCACTTAAGAAAGGACCAAATGCCAA 518
Query 519 AGCATTGCAAGTCATGAAGCAGACATTACCCTATAGTGTGGCAGACCTTGAATGGGATGCAGGTCATAAAACCA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AGCATTGCAAGTCATGAAGCAGACATTACCCTATAGTGTGGCAGACCTTGAATGGGATGCAGGTCATAAAACCA 592
Query 593 ATGTCCAGCAGTGTTACTGCTATTGTGGAGGCCCTGGAGACTGGTATTTGAAGATGCTACAGTGCTGCAAATGT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ATGTCCAGCAGTGTTACTGCTATTGTGGAGGCCCTGGAGACTGGTATTTGAAGATGCTACAGTGCTGCAAATGT 666
Query 667 AAGCAGTGGTTTCATGAGGCTTGTGTGCAATGCCTTCAAAAGCCAATGCTATTTGGAGACAGATTTTATACGTT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AAGCAGTGGTTTCATGAGGCTTGTGTGCAATGCCTTCAAAAGCCAATGCTATTTGGAGACAGATTTTATACGTT 740
Query 741 TATATGCTCTGTCTGCAGTTCTGGACCAGAATACCTCAAACGTCTACCATTACAGTGGGTAGATATAGCACACC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TATATGCTCTGTCTGCAGTTCTGGACCAGAATACCTCAAACGTCTACCATTACAGTGGGTAGATATAGCACACC 814
Query 815 TATGCCTTTACAACCTAAGTGTTATTCATAAGAAGAAATACTTTGATTCTGAACTTGAGCTTATGACATACATT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TATGCCTTTACAACCTAAGTGTTATTCATAAGAAGAAATACTTTGATTCTGAACTTGAGCTTATGACATACATT 888
Query 889 AATGAAAACTGGGATAGATTGCACCCTGGAGAGCTGGCAGACACACCAAAATCTGAAAGATATGAGCATGTTCT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AATGAAAACTGGGATAGATTGCACCCTGGAGAGCTGGCAGACACACCAAAATCTGAAAGATATGAGCATGTTCT 962
Query 963 GGAGGCATTAAATGATTACAAGACCAT----------------------------------------------- 989
|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GGAGGCATTAAATGATTACAAGACCATGTTTATGTCTGGGAAAGAAATAAAGAAGAAGAAGCATTTGTTTGGGT 1036
Query 990 -------------------------------------------------------------------------- 989
Sbjct 1037 TGCGAATTCGTGTTCCTCCTGTGCCACCAAATGTGGCTTTCAAAGCAGAGAAAGAACCTGAAGGAACATCTCAT 1110
Query 990 --------------------------------------------------GGAAGTAAGCAATGGCATAGAAAA 1013
||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GAATTTAAAATTAAAGGCAGAAAGGCATCCAAACCTATATCTGATTCAAGGGAAGTAAGCAATGGCATAGAAAA 1184
Query 1014 AAAAGGAAAGAAAAAATCTGTAGGTCGTCCACCTGGCCCATATACAAGAAAAATGATTCAAAAAACTGCTGAGC 1087
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 AAAAGGAAAGAAAAAATCTGTAGGTCGTCCACCTGGCCCATATACAAGAAAAATGATTCAAAAAACTGCTGAGC 1258
Query 1088 CACTTTTGGATAAGGAATCAATTTCAGAGAATCCTACTTTGGATTTACCTTGTTCTATAGGGAGAACTGAGGGA 1161
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CACTTTTGGATAAGGAATCAATTTCAGAGAATCCTACTTTGGATTTACCTTGTTCTATAGGGAGAACTGAGGGA 1332
Query 1162 ACTGCACATTCATCCAATACCTCAGATGTGGATTTCACGGGTGCTTCCAGTGCAAAAGAAACTACCTCGTCTAG 1235
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 ACTGCACATTCATCCAATACCTCAGATGTGGATTTCACGGGTGCTTCCAGTGCAAAAGAAACTACCTCGTCTAG 1406
Query 1236 CATTTCCAGGCATTATGGATTATCTGACTCCAGAAAAAGAACGCGTACAGGAAGATCTTGGCCTGCTGCAATAC 1309
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 CATTTCCAGGCATTATGGATTATCTGACTCCAGAAAAAGAACGCGTACAGGAAGATCTTGGCCTGCTGCAATAC 1480
Query 1310 CACATTTGCGGAGAAGAAGAGGTCGTCTTCCAAGAAGAGCACTCCAGACTCAGAACTCAGAAATTGTAAAAGAT 1383
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CACATTTGCGGAGAAGAAGAGGTCGTCTTCCAAGAAGAGCACTCCAGACTCAGAACTCAGAAATTGTAAAAGAT 1554
Query 1384 GATGAAGGCAAAGAAGATTATCAGTTTGATGAACTCAACACAGAGATTCTGAATAACTTAGCAGATCAGGAGTT 1457
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 GATGAAGGCAAAGAAGATTATCAGTTTGATGAACTCAACACAGAGATTCTGAATAACTTAGCAGATCAGGAGTT 1628
Query 1458 ACAACTCAATCATCTAAAGAACTCCATTACCAGTTATTTTGGTGCTGCAGGTAGAATAGCATGTGGCGAAAAAT 1531
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 ACAACTCAATCATCTAAAGAACTCCATTACCAGTTATTTTGGTGCTGCAGGTAGAATAGCATGTGGCGAAAAAT 1702
Query 1532 ACCGAGTTTTGGCACGTCGGGTGACACTTGATGGAAAGGTGCAGTATCTTGTGGAATGGGAAGGAGCAACTGCA 1605
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 ACCGAGTTTTGGCACGTCGGGTGACACTTGATGGAAAGGTGCAGTATCTTGTGGAATGGGAAGGAGCAACTGCA 1776
Query 1606 TCC 1608
|||
Sbjct 1777 TCC 1779