Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_02688
- Subject:
- XM_011249417.3
- Aligned Length:
- 1648
- Identities:
- 997
- Gaps:
- 593
Alignment
Query 1 ---------------ATGA------------------GAGACTCTACAGGGGCAGGTAATTCACTGGTCCACAA 41
|||| .||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCCTCCCCCTTCCATGATGGACTGTACTCTGAAACTAGACTCTACAGGAGCAGGTAATTCACTGGTCCACAA 74
Query 42 GCGGTCTCCTTTACGTCGAAACCAAAAGACCCCAACATCCTTGACCAAGCTGTCTTTACAGGATGGACATAAAG 115
|||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GCGGTCTCCTTTACGTCGAAACCAAAAGACCTCAGCATCCTTGAACAAGCTGTCTTTACAGGATGGACATAAAG 148
Query 116 CCAAAAAGCCAGCATGTAAATTTGAAGAGGGTCAGGATGTCCTAGCTAGATGGTCAGATGGCTTGTTTTATCTT 189
|||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CCAAAAAACCAGCATGTAAATTTGAAGAGGGTCAAGATGTCTTAGCTAGATGGTCAGATGGCTTGTTTTATCTT 222
Query 190 GGCACTATCAAAAAGATAAACATATTGAAACAGAGCTGCTTCATCATATTTGAAGACAGTTCTAAATCCTGGGT 263
||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 223 GGAACTATCAAAAAGATAAACATATTGAAACAGAGCTGCTTCATCATATTTGAGGACAGTTCCAAATCCTGGGT 296
Query 264 TCTCTGGAAGGACATTCAAACAGGAGCCACTGGAAGTGGGGAAATGGTCTGTACAATATGTCAAGAAGAGTATT 337
|||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TCTCTGGAAGGACATCCAAACAGGAGCCACTGGGAGTGGGGAAATGGTCTGTACAATATGTCAAGAAGAGTATT 370
Query 338 CAGAAGCTCCCAATGAAATGGTTATATGTGACAAGTGTGGCCAAGGATATCATCAGTTGTGTCACACACCTCAT 411
|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 371 CAGAAGCTCCCAATGAAATGGTTATATGTGATAAGTGTGGTCAAGGATATCATCAGCTGTGTCACACACCTCAT 444
Query 412 ATTGATTCCAGTGTGATTGATTCAGATGAAAAATGGCTCTGTCGGCAGTGTGTTTTTGCAACAACAACAAAGAG 485
|||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct 445 ATTGACTCGAGTGTGATTGATTCAGATGAAAAGTGGCTTTGTCGACAGTGCGTTTTTGCAACAACTACAAAGAG 518
Query 486 GGGTGGTGCACTTAAGAAAGGACCAAATGCCAAAGCATTGCAAGTCATGAAGCAGACATTACCCTATAGTGTGG 559
|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GGGTGGTGCGCTTAAGAAAGGACCAAATGCCAAAGCATTGCAAGTCATGAAGCAGACATTACCCTATAGTGTGG 592
Query 560 CAGACCTTGAATGGGATGCAGGTCATAAAACCAATGTCCAGCAGTGTTACTGCTATTGTGGAGGCCCTGGAGAC 633
|.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CTGACCTTGAATGGGATGCAGGCCATAAAACCAATGTCCAGCAGTGCTACTGCTATTGTGGAGGCCCTGGAGAC 666
Query 634 TGGTATTTGAAGATGCTACAGTGCTGCAAATGTAAGCAGTGGTTTCATGAGGCTTGTGTGCAATGCCTTCAAAA 707
||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 667 TGGTATTTAAAGATGCTGCAGTGCTGCAAATGTAAGCAGTGGTTTCATGAAGCTTGTGTCCAATGCCTTCAGAA 740
Query 708 GCCAATGCTATTTGGAGACAGATTTTATACGTTTATATGCTCTGTCTGCAGTTCTGGACCAGAATACCTCAAAC 781
|||||||||.||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GCCAATGCTGTTTGGAGATAGGTTTTATACATTTATTTGCTCTGTCTGCAGTTCTGGACCAGAATACCTCAAAC 814
Query 782 GTCTACCATTACAGTGGGTAGATATAGCACACCTATGCCTTTACAACCTAAGTGTTATTCATAAGAAGAAATAC 855
|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 815 GTCTACCGTTACAGTGGGTAGATATAGCACACCTATGCCTTTACAACCTAAGTGTTATTCACAAGAAGAAATAC 888
Query 856 TTTGATTCTGAACTTGAGCTTATGACATACATTAATGAAAACTGGGATAGATTGCACCCTGGAGAGCTGGCAGA 929
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TTTGATTCTGAACTTGAGCTTATGACATACATTAATGAAAACTGGGATAGATTGCACCCTGGAGAGCTGGCAGA 962
Query 930 CACACCAAAATCTGAAAGATATGAGCATGTTCTGGAGGCATTAAATGATTACAAGACCATGGAAGTAAGCAATG 1003
||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |.||.|.
Sbjct 963 CACACCCAAATCTGAAAGATATGAGCATGTTCTGGAGGCATTAAATGATTACAAGACCAT-------ACCACTC 1029
Query 1004 GCATAGAAAAAAAAGGAAAGAAAAAATCTGTAGGTC------GTCCACCTGGCCCATATACAAGAAAA-ATGAT 1070
.|.| .||.||.||| |||.||.| |.|..||||| || .|
Sbjct 1030 TCCT----------------------CCTTTAAGTCCAGCATGTCTACAT--------TTCTTGAAAATAT-TT 1072
Query 1071 TCAAAAAACTGCTGAGCCACTTTTGGATAAGGAATCAATTTCAGAGAATCCTACTTTGGATTTACCTTGTTCTA 1144
|||||| .||.|||||| |.||.||
Sbjct 1073 TCAAAA------------------TGACAAGGAA------------ATTCTTA--------------------- 1095
Query 1145 TAGGGAGAACTGAGGGAACTGCACATTCATCCAATACCTCAGATGTGGATTTCACGGGTGCTTCCAGTGCAAAA 1218
Sbjct 1096 -------------------------------------------------------------------------- 1095
Query 1219 GAAACTACCTCGTCTAGCATTTCCAGGCATTATGGATTATCTGACTCCAGAAAAAGAACGCGTACAGGAAGATC 1292
Sbjct 1096 -------------------------------------------------------------------------- 1095
Query 1293 TTGGCCTGCTGCAATACCACATTTGCGGAGAAGAAGAGGTCGTCTTCCAAGAAGAGCACTCCAGACTCAGAACT 1366
Sbjct 1096 -------------------------------------------------------------------------- 1095
Query 1367 CAGAAATTGTAAAAGATGATGAAGGCAAAGAAGATTATCAGTTTGATGAACTCAACACAGAGATTCTGAATAAC 1440
Sbjct 1096 -------------------------------------------------------------------------- 1095
Query 1441 TTAGCAGATCAGGAGTTACAACTCAATCATCTAAAGAACTCCATTACCAGTTATTTTGGTGCTGCAGGTAGAAT 1514
Sbjct 1096 -------------------------------------------------------------------------- 1095
Query 1515 AGCATGTGGCGAAAAATACCGAGTTTTGGCACGTCGGGTGACACTTGATGGAAAGGTGCAGTATCTTGTGGAAT 1588
Sbjct 1096 -------------------------------------------------------------------------- 1095
Query 1589 GGGAAGGAGCAACTGCATCC 1608
Sbjct 1096 -------------------- 1095
