Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02688
• Subject: XM_030254190.1
• Aligned Length: 1808
• Identities: 1478
• Gaps: 253

Alignment

Query    1  ATG----------------AGAGACTCTACAGGGGCAGGTAATTCACTGGTCCACAAGCGGTCTCCTTTACGTC  58
            |||                |||||      ||.||..||.|||    |||      |||||             
Sbjct    1  ATGGCTGATTGCTGTTACCAGAGA------AGAGGAGGGAAAT----TGG------AGCGG-------------  45

Query   59  GAAACCAAAA------GACCCCAACATCCTTGACCAAGCTGTCTT--TAC-----AGGATGGACATAAAGCCAA  119
                 ||.||      ||            |||  |||     ||  |||     |||||||||||||||||||
Sbjct   46  -----CACAATAGAGGGA------------TGA--AAG-----TTCCTACTAGGGAGGATGGACATAAAGCCAA  95

Query  120  AAAGCCAGCATGTAAATTTGAAGAGGGTCAGGATGTCCTAGCTAGATGGTCAGATGGCTTGTTTTATCTTGGCA  193
            |||.||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct   96  AAAACCAGCATGTAAATTTGAAGAGGGTCAAGATGTCTTAGCTAGATGGTCAGATGGCTTGTTTTATCTTGGAA  169

Query  194  CTATCAAAAAGATAAACATATTGAAACAGAGCTGCTTCATCATATTTGAAGACAGTTCTAAATCCTGGGTTCTC  267
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  170  CTATCAAAAAGATAAACATATTGAAACAGAGCTGCTTCATCATATTTGAGGACAGTTCCAAATCCTGGGTTCTC  243

Query  268  TGGAAGGACATTCAAACAGGAGCCACTGGAAGTGGGGAAATGGTCTGTACAATATGTCAAGAAGAGTATTCAGA  341
            |||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  244  TGGAAGGACATCCAAACAGGAGCCACTGGGAGTGGGGAAATGGTCTGTACAATATGTCAAGAAGAGTATTCAGA  317

Query  342  AGCTCCCAATGAAATGGTTATATGTGACAAGTGTGGCCAAGGATATCATCAGTTGTGTCACACACCTCATATTG  415
            |||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  318  AGCTCCCAATGAAATGGTTATATGTGATAAGTGTGGTCAAGGATATCATCAGCTGTGTCACACACCTCATATTG  391

Query  416  ATTCCAGTGTGATTGATTCAGATGAAAAATGGCTCTGTCGGCAGTGTGTTTTTGCAACAACAACAAAGAGGGGT  489
            |.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  392  ACTCGAGTGTGATTGATTCAGATGAAAAGTGGCTTTGTCGACAGTGCGTTTTTGCAACAACTACAAAGAGGGGT  465

Query  490  GGTGCACTTAAGAAAGGACCAAATGCCAAAGCATTGCAAGTCATGAAGCAGACATTACCCTATAGTGTGGCAGA  563
            |||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  466  GGTGCGCTTAAGAAAGGACCAAATGCCAAAGCATTGCAAGTCATGAAGCAGACATTACCCTATAGTGTGGCTGA  539

Query  564  CCTTGAATGGGATGCAGGTCATAAAACCAATGTCCAGCAGTGTTACTGCTATTGTGGAGGCCCTGGAGACTGGT  637
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  540  CCTTGAATGGGATGCAGGCCATAAAACCAATGTCCAGCAGTGCTACTGCTATTGTGGAGGCCCTGGAGACTGGT  613

Query  638  ATTTGAAGATGCTACAGTGCTGCAAATGTAAGCAGTGGTTTCATGAGGCTTGTGTGCAATGCCTTCAAAAGCCA  711
            ||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct  614  ATTTAAAGATGCTGCAGTGCTGCAAATGTAAGCAGTGGTTTCATGAAGCTTGTGTCCAATGCCTTCAGAAGCCA  687

Query  712  ATGCTATTTGGAGACAGATTTTATACGTTTATATGCTCTGTCTGCAGTTCTGGACCAGAATACCTCAAACGTCT  785
            |||||.||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  688  ATGCTGTTTGGAGATAGGTTTTATACATTTATTTGCTCTGTCTGCAGTTCTGGACCAGAATACCTCAAACGTCT  761

Query  786  ACCATTACAGTGGGTAGATATAGCACACCTATGCCTTTACAACCTAAGTGTTATTCATAAGAAGAAATACTTTG  859
            |||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  762  ACCGTTACAGTGGGTAGATATAGCACACCTATGCCTTTACAACCTAAGTGTTATTCACAAGAAGAAATACTTTG  835

Query  860  ATTCTGAACTTGAGCTTATGACATACATTAATGAAAACTGGGATAGATTGCACCCTGGAGAGCTGGCAGACACA  933
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  836  ATTCTGAACTTGAGCTTATGACATACATTAATGAAAACTGGGATAGATTGCACCCTGGAGAGCTGGCAGACACA  909

Query  934  CCAAAATCTGAAAGATATGAGCATGTTCTGGAGGCATTAAATGATTACAAGACCAT------------------  989
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  
Sbjct  910  CCCAAATCTGAAAGATATGAGCATGTTCTGGAGGCATTAAATGATTACAAGACCATGTTTATGTCTGGGAAAGA  983

Query  990  --------------------------------------------------------------------------  989
                                                                                      
Sbjct  984  AATAAAGAAGAAGAAGCATTTGTTTGGGTTGCGAATTCGTGTTCCTCCTGTGCCACCAAATGTGGCTTTCAAAG  1057

Query  990  --------------------------------------------------------------------------  989
                                                                                      
Sbjct 1058  CAGAGAAAGAACCAGAAGGAACATCCCATGAATTTAAAATTAAAGGCAGAAAGGCATCCAAACCTACATCTGAC  1131

Query  990  -----GGAAGTAAGCAATGGCATAGAAAAAAAAGGAAAGAAAAAATCTGTAGGTCGTCCACCTGGCCCATATAC  1058
                 |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1132  TCAAGGGAAGTAAGCAATGGGATAGAAAAAAAAGGAAAGAAAAAATCTGTAGGTCGTCCTCCTGGCCCATATAC  1205

Query 1059  AAGAAAAATGATTCAAAAAACTGCTGAGCCACTTTTGGATAAGGAATCAATTTCAGAGAATCCTACTTTGGATT  1132
            |||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1206  AAGAAAAATGATTCAAAAAACTGCTGAGCTACCTTTGGATAAGGAATCAGTTTCAGAGAATCCTACGTTGGATT  1279

Query 1133  TACCTTGTTCTATAGGGAGAACTGAGGGAACTGCACATTCATCCAATACCTCAGATGTGGATTTCACGGGTGCT  1206
            ||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||
Sbjct 1280  TACCTTGTTCTATAGGGAGAACTGAGGGAATTGCACATTCATCCAATACCTCAGATGTGGACCTCACGGGTGCT  1353

Query 1207  TCCAGTGCAAAAGAAACTACCTCGTCTAGCATTTCCAGGCATTATGGATTATCTGACTCCAGAAAAAGAACGCG  1280
            |||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||.|||||.|||||||||||.||
Sbjct 1354  TCCAGTGCAAACGAAACTACCTCGGCTAGCATTTCCAGGCATTGTGGATTATCAGACTCTAGAAAAAGAACTCG  1427

Query 1281  TACAGGAAGATCTTGGCCTGCTGCAATACCACATTTGCGGAGAAGAAGAGGTCGTCTTCCAAGAAGAGCACTCC  1354
            .|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||
Sbjct 1428  CACAGGAAGATCATGGCCTGCTGCAATACCACATTTGCGGAGAAGAAGAGGTCGCCTTCCACGAAGAGCACTCC  1501

Query 1355  AGACTCAGAACTCAGAAATTGTAAAAGATGATGAAGGCAAAGAAGATTATCAGTTTGATGAACTCAACACAGAG  1428
            |||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.
Sbjct 1502  AGACTCAGAACTCAGAAGTTGTGAAAGATGATGAAGGCAAAGAAGATTATCAGTTTGAAGAACTTAACACAGAA  1575

Query 1429  ATTCTGAATAACTTAGCAGATCAGGAGTTACAACTCAATCATCTAAAGAACTCCATTACCAGTTATTTTGGTGC  1502
            |||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||.||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 1576  ATTCTGAATAACTTAGCAGATCAGGAGTTGCAGCTCAATCACCTGAAAAACTCCATCACTAGTTATTTTGGTGC  1649

Query 1503  TGCAGGTAGAATAGCATGTGGCGAAAAATACCGAGTTTTGGCACGTCGGGTGACACTTGATGGAAAGGTGCAGT  1576
            .||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct 1650  CGCAGGTAGAATAGCATGTGGCGAAAAATACAGAGTTTTGGCTCGTCGGGTGACGCTTGATGGGAAGGTGCAGT  1723

Query 1577  ATCTTGTGGAATGGGAAGGAGCAACTGCATCC  1608
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1724  ATCTTGTGGAATGGGAAGGAGCGACTGCATCC  1755