Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_02688
- Subject:
- XM_030254191.1
- Aligned Length:
- 1779
- Identities:
- 1238
- Gaps:
- 477
Alignment
Query 1 ATGAGAGACTCTACAGGGGCAGGTAATTCACTGGTCCACAAGCGGTCTCCTTTACGTCGAAACCAAAAGACCCC 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 AACATCCTTGACCAAGCTGTCTTTACAGGATGGACATAAAGCCAAAAAGCCAGCATGTAAATTTGAAGAGGGTC 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 AGGATGTCCTAGCTAGATGGTCAGATGGCTTGTTTTATCTTGGCACTATCAAAAAGATAAACATATTGAAACAG 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 AGCTGCTTCATCATATTTGAAGACAGTTCTAAATCCTGGGTTCTCTGGAAGGACATTCAAACAGGAGCCACTGG 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 AAGTGGGGAAATGGTCTGTACAATATGTCAAGAAGAGTATTCAGAAGCTCCCAATGAAATGGTTATATGTGACA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1 ----------ATGGTCTGTACAATATGTCAAGAAGAGTATTCAGAAGCTCCCAATGAAATGGTTATATGTGATA 64
Query 371 AGTGTGGCCAAGGATATCATCAGTTGTGTCACACACCTCATATTGATTCCAGTGTGATTGATTCAGATGAAAAA 444
|||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.
Sbjct 65 AGTGTGGTCAAGGATATCATCAGCTGTGTCACACACCTCATATTGACTCGAGTGTGATTGATTCAGATGAAAAG 138
Query 445 TGGCTCTGTCGGCAGTGTGTTTTTGCAACAACAACAAAGAGGGGTGGTGCACTTAAGAAAGGACCAAATGCCAA 518
|||||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 139 TGGCTTTGTCGACAGTGCGTTTTTGCAACAACTACAAAGAGGGGTGGTGCGCTTAAGAAAGGACCAAATGCCAA 212
Query 519 AGCATTGCAAGTCATGAAGCAGACATTACCCTATAGTGTGGCAGACCTTGAATGGGATGCAGGTCATAAAACCA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 213 AGCATTGCAAGTCATGAAGCAGACATTACCCTATAGTGTGGCTGACCTTGAATGGGATGCAGGCCATAAAACCA 286
Query 593 ATGTCCAGCAGTGTTACTGCTATTGTGGAGGCCCTGGAGACTGGTATTTGAAGATGCTACAGTGCTGCAAATGT 666
|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 287 ATGTCCAGCAGTGCTACTGCTATTGTGGAGGCCCTGGAGACTGGTATTTAAAGATGCTGCAGTGCTGCAAATGT 360
Query 667 AAGCAGTGGTTTCATGAGGCTTGTGTGCAATGCCTTCAAAAGCCAATGCTATTTGGAGACAGATTTTATACGTT 740
|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||.||
Sbjct 361 AAGCAGTGGTTTCATGAAGCTTGTGTCCAATGCCTTCAGAAGCCAATGCTGTTTGGAGATAGGTTTTATACATT 434
Query 741 TATATGCTCTGTCTGCAGTTCTGGACCAGAATACCTCAAACGTCTACCATTACAGTGGGTAGATATAGCACACC 814
|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 435 TATTTGCTCTGTCTGCAGTTCTGGACCAGAATACCTCAAACGTCTACCGTTACAGTGGGTAGATATAGCACACC 508
Query 815 TATGCCTTTACAACCTAAGTGTTATTCATAAGAAGAAATACTTTGATTCTGAACTTGAGCTTATGACATACATT 888
||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 509 TATGCCTTTACAACCTAAGTGTTATTCACAAGAAGAAATACTTTGATTCTGAACTTGAGCTTATGACATACATT 582
Query 889 AATGAAAACTGGGATAGATTGCACCCTGGAGAGCTGGCAGACACACCAAAATCTGAAAGATATGAGCATGTTCT 962
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 583 AATGAAAACTGGGATAGATTGCACCCTGGAGAGCTGGCAGACACACCCAAATCTGAAAGATATGAGCATGTTCT 656
Query 963 GGAGGCATTAAATGATTACAAGACCAT----------------------------------------------- 989
|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 657 GGAGGCATTAAATGATTACAAGACCATGTTTATGTCTGGGAAAGAAATAAAGAAGAAGAAGCATTTGTTTGGGT 730
Query 990 -------------------------------------------------------------------------- 989
Sbjct 731 TGCGAATTCGTGTTCCTCCTGTGCCACCAAATGTGGCTTTCAAAGCAGAGAAAGAACCAGAAGGAACATCCCAT 804
Query 990 --------------------------------------------------GGAAGTAAGCAATGGCATAGAAAA 1013
|||||||||||||||.||||||||
Sbjct 805 GAATTTAAAATTAAAGGCAGAAAGGCATCCAAACCTACATCTGACTCAAGGGAAGTAAGCAATGGGATAGAAAA 878
Query 1014 AAAAGGAAAGAAAAAATCTGTAGGTCGTCCACCTGGCCCATATACAAGAAAAATGATTCAAAAAACTGCTGAGC 1087
||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 879 AAAAGGAAAGAAAAAATCTGTAGGTCGTCCTCCTGGCCCATATACAAGAAAAATGATTCAAAAAACTGCTGAGC 952
Query 1088 CACTTTTGGATAAGGAATCAATTTCAGAGAATCCTACTTTGGATTTACCTTGTTCTATAGGGAGAACTGAGGGA 1161
.||.||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 953 TACCTTTGGATAAGGAATCAGTTTCAGAGAATCCTACGTTGGATTTACCTTGTTCTATAGGGAGAACTGAGGGA 1026
Query 1162 ACTGCACATTCATCCAATACCTCAGATGTGGATTTCACGGGTGCTTCCAGTGCAAAAGAAACTACCTCGTCTAG 1235
|.||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||
Sbjct 1027 ATTGCACATTCATCCAATACCTCAGATGTGGACCTCACGGGTGCTTCCAGTGCAAACGAAACTACCTCGGCTAG 1100
Query 1236 CATTTCCAGGCATTATGGATTATCTGACTCCAGAAAAAGAACGCGTACAGGAAGATCTTGGCCTGCTGCAATAC 1309
||||||||||||||.|||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1101 CATTTCCAGGCATTGTGGATTATCAGACTCTAGAAAAAGAACTCGCACAGGAAGATCATGGCCTGCTGCAATAC 1174
Query 1310 CACATTTGCGGAGAAGAAGAGGTCGTCTTCCAAGAAGAGCACTCCAGACTCAGAACTCAGAAATTGTAAAAGAT 1383
|||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||
Sbjct 1175 CACATTTGCGGAGAAGAAGAGGTCGCCTTCCACGAAGAGCACTCCAGACTCAGAACTCAGAAGTTGTGAAAGAT 1248
Query 1384 GATGAAGGCAAAGAAGATTATCAGTTTGATGAACTCAACACAGAGATTCTGAATAACTTAGCAGATCAGGAGTT 1457
|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1249 GATGAAGGCAAAGAAGATTATCAGTTTGAAGAACTTAACACAGAAATTCTGAATAACTTAGCAGATCAGGAGTT 1322
Query 1458 ACAACTCAATCATCTAAAGAACTCCATTACCAGTTATTTTGGTGCTGCAGGTAGAATAGCATGTGGCGAAAAAT 1531
.||.||||||||.||.||.||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1323 GCAGCTCAATCACCTGAAAAACTCCATCACTAGTTATTTTGGTGCCGCAGGTAGAATAGCATGTGGCGAAAAAT 1396
Query 1532 ACCGAGTTTTGGCACGTCGGGTGACACTTGATGGAAAGGTGCAGTATCTTGTGGAATGGGAAGGAGCAACTGCA 1605
||.||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1397 ACAGAGTTTTGGCTCGTCGGGTGACGCTTGATGGGAAGGTGCAGTATCTTGTGGAATGGGAAGGAGCGACTGCA 1470
Query 1606 TCC 1608
|||
Sbjct 1471 TCC 1473
