Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_02688
- Subject:
- XM_030254196.1
- Aligned Length:
- 1615
- Identities:
- 998
- Gaps:
- 560
Alignment
Query 1 ATGAGAGACTCTACAGGGGCAGGTAATTCACTGGTCCACAAGCGGTCTCCTTTACGTCGAAACCAAAAGACCCC 74
|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1 ATGAGAGACTCTACAGGAGCAGGTAATTCACTGGTCCACAAGCGGTCTCCTTTACGTCGAAACCAAAAGACCTC 74
Query 75 AACATCCTTGACCAAGCTGTCTTTACAGGATGGACATAAAGCCAAAAAGCCAGCATGTAAATTTGAAGAGGGTC 148
|.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AGCATCCTTGAACAAGCTGTCTTTACAGGATGGACATAAAGCCAAAAAACCAGCATGTAAATTTGAAGAGGGTC 148
Query 149 AGGATGTCCTAGCTAGATGGTCAGATGGCTTGTTTTATCTTGGCACTATCAAAAAGATAAACATATTGAAACAG 222
|.||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AAGATGTCTTAGCTAGATGGTCAGATGGCTTGTTTTATCTTGGAACTATCAAAAAGATAAACATATTGAAACAG 222
Query 223 AGCTGCTTCATCATATTTGAAGACAGTTCTAAATCCTGGGTTCTCTGGAAGGACATTCAAACAGGAGCCACTGG 296
||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 223 AGCTGCTTCATCATATTTGAGGACAGTTCCAAATCCTGGGTTCTCTGGAAGGACATCCAAACAGGAGCCACTGG 296
Query 297 AAGTGGGGAAATGGTCTGTACAATATGTCAAGAAGAGTATTCAGAAGCTCCCAATGAAATGGTTATATGTGACA 370
.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 297 GAGTGGGGAAATGGTCTGTACAATATGTCAAGAAGAGTATTCAGAAGCTCCCAATGAAATGGTTATATGTGATA 370
Query 371 AGTGTGGCCAAGGATATCATCAGTTGTGTCACACACCTCATATTGATTCCAGTGTGATTGATTCAGATGAAAAA 444
|||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.
Sbjct 371 AGTGTGGTCAAGGATATCATCAGCTGTGTCACACACCTCATATTGACTCGAGTGTGATTGATTCAGATGAAAAG 444
Query 445 TGGCTCTGTCGGCAGTGTGTTTTTGCAACAACAACAAAGAGGGGTGGTGCACTTAAGAAAGGACCAAATGCCAA 518
|||||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TGGCTTTGTCGACAGTGCGTTTTTGCAACAACTACAAAGAGGGGTGGTGCGCTTAAGAAAGGACCAAATGCCAA 518
Query 519 AGCATTGCAAGTCATGAAGCAGACATTACCCTATAGTGTGGCAGACCTTGAATGGGATGCAGGTCATAAAACCA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 519 AGCATTGCAAGTCATGAAGCAGACATTACCCTATAGTGTGGCTGACCTTGAATGGGATGCAGGCCATAAAACCA 592
Query 593 ATGTCCAGCAGTGTTACTGCTATTGTGGAGGCCCTGGAGACTGGTATTTGAAGATGCTACAGTGCTGCAAATGT 666
|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 593 ATGTCCAGCAGTGCTACTGCTATTGTGGAGGCCCTGGAGACTGGTATTTAAAGATGCTGCAGTGCTGCAAATGT 666
Query 667 AAGCAGTGGTTTCATGAGGCTTGTGTGCAATGCCTTCAAAAGCCAATGCTATTTGGAGACAGATTTTATACGTT 740
|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||.||
Sbjct 667 AAGCAGTGGTTTCATGAAGCTTGTGTCCAATGCCTTCAGAAGCCAATGCTGTTTGGAGATAGGTTTTATACATT 740
Query 741 TATATGCTCTGTCTGCAGTTCTGGACCAGAATACCTCAAACGTCTACCATTACAGTGGGTAGATATAGCACACC 814
|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TATTTGCTCTGTCTGCAGTTCTGGACCAGAATACCTCAAACGTCTACCGTTACAGTGGGTAGATATAGCACACC 814
Query 815 TATGCCTTTACAACCTAAGTGTTATTCATAAGAAGAAATACTTTGATTCTGAACTTGAGCTTATGACATACATT 888
||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TATGCCTTTACAACCTAAGTGTTATTCACAAGAAGAAATACTTTGATTCTGAACTTGAGCTTATGACATACATT 888
Query 889 AATGAAAACTGGGATAGATTGCACCCTGGAGAGCTGGCAGACACACCAAAATCTGAAAGATATGAGCATGTTCT 962
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AATGAAAACTGGGATAGATTGCACCCTGGAGAGCTGGCAGACACACCCAAATCTGAAAGATATGAGCATGTTCT 962
Query 963 GGAGGCATTAAATGATTACAAGACCATGGAAGTAAGCAATGGCATAGAAAAAAAAGGAAAGAAAAAATCTGTAG 1036
||||||||||||||||||||||||||| |.||.|..|.| .||.||.
Sbjct 963 GGAGGCATTAAATGATTACAAGACCAT-------ACCACTCTCCT----------------------CCTTTAA 1007
Query 1037 GTC------GTCCACCTGGCCCATATACAAGAAAA-ATGATTCAAAAAACTGCTGAGCCACTTTTGGATAAGGA 1103
||| |||.||.| |.|..||||| || .||||||| .||.|||||
Sbjct 1008 GTCCAGCATGTCTACAT--------TTCTTGAAAATAT-TTTCAAAA------------------TGACAAGGA 1054
Query 1104 ATCAATTTCAGAGAATCCTACTTTGGATTTACCTTGTTCTATAGGGAGAACTGAGGGAACTGCACATTCATCCA 1177
| |.||.||
Sbjct 1055 A------------ATTCTTA------------------------------------------------------ 1062
Query 1178 ATACCTCAGATGTGGATTTCACGGGTGCTTCCAGTGCAAAAGAAACTACCTCGTCTAGCATTTCCAGGCATTAT 1251
Sbjct 1063 -------------------------------------------------------------------------- 1062
Query 1252 GGATTATCTGACTCCAGAAAAAGAACGCGTACAGGAAGATCTTGGCCTGCTGCAATACCACATTTGCGGAGAAG 1325
Sbjct 1063 -------------------------------------------------------------------------- 1062
Query 1326 AAGAGGTCGTCTTCCAAGAAGAGCACTCCAGACTCAGAACTCAGAAATTGTAAAAGATGATGAAGGCAAAGAAG 1399
Sbjct 1063 -------------------------------------------------------------------------- 1062
Query 1400 ATTATCAGTTTGATGAACTCAACACAGAGATTCTGAATAACTTAGCAGATCAGGAGTTACAACTCAATCATCTA 1473
Sbjct 1063 -------------------------------------------------------------------------- 1062
Query 1474 AAGAACTCCATTACCAGTTATTTTGGTGCTGCAGGTAGAATAGCATGTGGCGAAAAATACCGAGTTTTGGCACG 1547
Sbjct 1063 -------------------------------------------------------------------------- 1062
Query 1548 TCGGGTGACACTTGATGGAAAGGTGCAGTATCTTGTGGAATGGGAAGGAGCAACTGCATCC 1608
Sbjct 1063 ------------------------------------------------------------- 1062
