Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_02704
Subject:
XM_017314904.1
Aligned Length:
1176
Identities:
1056
Gaps:
0

Alignment

Query    1  ATGTCTACGCGGGAGTCCTTTAACCCGGAAAGTTACGAATTGGACAAAAGCTTCCGGCTAACCAGATTCACTGA  74
            ||||||||.||.|||||||||||||||||.|.|||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct    1  ATGTCTACTCGAGAGTCCTTTAACCCGGAGACTTATGAATTGGACAAGAGCTTCCGGCTAACCAGGTTTACTGA  74

Query   75  ACTGAAGGGCACAGGCTGCAAAGTGCCCCAAGATGTCCTGCAAAAATTGCTGGAATCTTTACAGGAGAACCACT  148
            ||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||.||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct   75  ACTGAAAGGCACAGGCTGCAAAGTGCCCCAAGATGTCCTACAGAAACTGCTGGAATCTTTACAAGAGAACCACT  148

Query  149  TCCAAGAAGATGAGCAGTTTCTGGGAGCCGTTATGCCAAGGCTTGGCATTGGAATGGATACTTGTGTCATTCCT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct  149  TCCAAGAAGATGAGCAGTTTCTGGGAGCTGTTATGCCACGACTTGGCATTGGGATGGATACTTGCGTCATTCCT  222

Query  223  TTGAGGCACGGTGGGCTTTCCTTGGTTCAAACCACAGATTACATTTACCCGATCGTAGACGACCCTTACATGAT  296
            ||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||.|||||
Sbjct  223  TTGAGGCATGGTGGTCTTTCCTTGGTTCAGACCACAGATTACATTTATCCTATCGTCGACGACCCGTATATGAT  296

Query  297  GGGCAGGATAGCGTGTGCCAATGTCCTCAGTGACCTCTATGCAATGGGGGTCACGGAATGTGACAATATGCTGA  370
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  297  GGGCAGGATAGCATGTGCCAATGTCCTCAGTGACCTTTATGCAATGGGTGTCACGGAGTGTGACAATATGCTGA  370

Query  371  TGCTCCTTGGAGTCAGTAATAAAATGACCGACAGGGAAAGGGATAAAGTGATGCCTCTGATTATCCAAGGTTTT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||.||||||||||||||.||.||.|||||.||.||||||
Sbjct  371  TGCTCCTTGGAGTCAGTAATAAAATGACTGACCGGGAGAGGGATAAAGTGATACCGCTAATTATACAGGGTTTT  444

Query  445  AAAGACGCAGCTGAGGAAGCAGGAACATCTGTAACAGGCGGCCAAACAGTACTAAACCCCTGGATTGTCCTGGG  518
            |||||.||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||.|||||
Sbjct  445  AAAGATGCGGCAGAGGAAGCGGGAACCTCTGTAACAGGCGGCCAAACGGTATTAAACCCCTGGATTGTTCTGGG  518

Query  519  AGGAGTGGCTACCACTGTCTGCCAACCCAATGAATTTATCATGCCAGACAATGCAGTGCCAGGGGACGTGCTGG  592
            ||||||.||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||
Sbjct  519  AGGAGTCGCCACAACGGTCTGCCAGCCCAATGAATTTATCATGCCAGATAATGCAGTACCTGGGGATGTGCTGG  592

Query  593  TGCTGACAAAACCCCTGGGGACACAGGTGGCAGTGGCTGTGCACCAGTGGCTGGATATCCCTGAGAAATGGAAT  666
            |..|||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||
Sbjct  593  TATTGACAAAGCCCCTGGGGACACAGGTTGCAGTTGCTGTGCACCAGTGGCTGGATATTCCCGAAAAATGGAAT  666

Query  667  AAGATTAAACTAGTGGTCACCCAAGAAGATGTAGAGCTGGCCTACCAGGAGGCGATGATGAACATGGCGAGGCT  740
            ||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||.||||.|||||.|||||.||||||||||||||..||||
Sbjct  667  AAAATTAAGCTAGTGGTCACCCAAGAAGACGTAGAGTTGGCATACCAAGAGGCAATGATGAACATGGCCCGGCT  740

Query  741  CAACAGGACAGCTGCAGGACTCATGCACACGTTCAATGCCCACGCCGCCACTGACATCACGGGCTTCGGGATTT  814
            ||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||.
Sbjct  741  CAACAGGACAGCTGCAGGCCTCATGCACACGTTCAATGCTCATGCAGCCACTGACATCACCGGCTTCGGGATTC  814

Query  815  TGGGCCATGCGCAGAACCTGGCCAAGCAGCAGAGGAACGAGGTGTCGTTTGTAATTCACAACCTCCCGGTGCTG  888
            |||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.||.||||||
Sbjct  815  TGGGCCACGCGCAGAACCTGGCCAAGCAACAGAGGAACGAAGTGTCCTTCGTGATTCACAACCTTCCTGTGCTG  888

Query  889  GCCAAGATGGCTGCGGTGAGCAAGGCCTGCGGAAACATGTTCGGCCTCATGCACGGGACCTGCCCGGAGACTTC  962
            ||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||
Sbjct  889  GCGAAGATGGCCGCTGTGAGCAAAGCCTGCGGAAACATGTTCGGCCTAATGCATGGGACCTGCCCAGAGACGTC  962

Query  963  AGGCGGCCTTCTGATCTGTTTACCACGTGAGCAAGCAGCTCGGTTCTGTGCAGAGATAAAGTCCCCCAAATATG  1036
            |||.|||||.||.||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct  963  AGGAGGCCTGCTAATCTGTCTACCCCGTGAGCAAGCAGCTCGGTTCTGTGCAGAGATCAAGTCCCCCAAATACG  1036

Query 1037  GTGAAGGCCACCAAGCATGGATTATTGGGATTGTAGAGAAGGGCAACCGCACAGCCAGAATCATAGACAAACCC  1110
            |.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.
Sbjct 1037  GCGAAGGGCACCAAGCATGGATTATTGGGATAGTGGAGAAGGGCAACCGCACAGCCAGGATCATCGACAAGCCT  1110

Query 1111  CGGATCATCGAGGTCGCACCACAAGTGGCCACTCAAAATGTGAATCCCACACCCGGGGCCACCTCT  1176
            |||||.||.||.||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.||||||||.||.||||||||.
Sbjct 1111  CGGATTATTGAAGTCGCACCTCAAGTAGCCACACAAAACGTGAACCCCACACCTGGTGCCACCTCC  1176