Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_02717
- Subject:
- NM_146157.4
- Aligned Length:
- 2991
- Identities:
- 2632
- Gaps:
- 12
Alignment
Query 1 ATGGCGGCTGAGTGGGCTTCTCGTTTCTGGCTTTGGGCTAC---GCTGCTGATTCCTGCGGCCGCGGTCTACGA 71
|||||||..|.|..|||.|||.|.||||||.|.||||||.| ||||||..|.||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGGTCGCGGTGGCGTCTGGGTTCTGGATCTGGGCTGCTGTGCTGCTCGTCCCTGCGGCCGCGGTCTACGA 74
Query 72 AGACCAAGTGGGCAAGTTTGATTGGAGACAGCAATATGTTGGGAAGGTCAAGTTTGCCTCCTTGGAATTTTCCC 145
|||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 75 AGACCAAGTGGGCAAGTTTGACTGGAGACAGCAGTATGTTGGGAAGATCAAGTTTGCCTCCTTGGAGTTTTCCC 148
Query 146 CTGGATCCAAGAAGTTGGTTGTAGCCACAGAGAAGAATGTGATTGCAGCATTAAATTCCCGAACTGGGGAGATC 219
||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||.||||||
Sbjct 149 CTGGATCCAAGAAGTTGGTTGTGGCCACAGAGAAGAATGTGATTGCGGCGTTAAATTCTCGGACTGGAGAGATC 222
Query 220 TTGTGGCGCCATGTTGACAAGGGCACGGCAGAAGGGGCTGTGGATGCCATGCTGCTGCACGGACAGGATGTGAT 293
||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||.|.||.|||||.||||..||
Sbjct 223 TTGTGGCGCCATGTTGACAAAGGCACAGCAGAAGGAGCTGTGGATGCCATGCTGGTCCATGGACAAGATGCAAT 296
Query 294 CACTGTGTCCAATGGAGGCCGAATCATGCGTTCCTGGGAGACTAACATCGGGGGCCTGAACTGGGAGATAACCC 367
||||||.|||||.|||||.||..|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 297 CACTGTATCCAACGGAGGGCGCCTCATGCGTTCCTGGGAGACCAACATCGGGGGCCTGAACTGGGAGATAACTC 370
Query 368 TGGACAGTGGCAGTTTCCAGGCACTTGGGCTGGTTGGCCTGCAGGAGTCTGTAAGGTACATCGCAGTCCTGAAG 441
||||||.||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||.||||||||.|||||.||||||
Sbjct 371 TGGACACTGGCAGTTTCCAGGCACTTGGGCTAGTGGGCCTTCAGGAGTCAGTGAGGTACATTGCAGTTCTGAAG 444
Query 442 AAGACTACACTTGCCCTCCATCACCTCTCCAGTGGGCACCTCAAGTGGGTGGAACATCTCCCAGAAAGTGACAG 515
|||||.||.||..|||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct 445 AAGACGACCCTCACCCTCCACCACCTCTCCAGTGGGCACCTGAAGTGGGTGGAGCATCTGCCAGAAAGTGACAG 518
Query 516 CATCCACTACCAGATGGTGTATTCTTACGGCTCTGGGGTGGTGTGGGCCCTCGGAGTTGTTCCCTTCAGCCATG 589
|||||.||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||..|.||||||||||||||.|
Sbjct 519 CATCCTCTACCAGATGGTGTATTCCTACGGCTCCGGGGTGGTGTGGGCCCTTGGCATCGTTCCCTTCAGCCACG 592
Query 590 TGAACATTGTCAAGTTTAATGTGGAAGATGGAGAGATTGTTCAGCAGGTTAGGGTTTCAACTCCGTGGCTGCAG 663
|||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||..|||||.|||||||||
Sbjct 593 TGAACATCGTCAAGTTTAACGTGGAGGATGGAGAGATTGTTCAGCAGGTCAGGGTTTGGACTCCATGGCTGCAG 666
Query 664 CACCTGTCTGGAGCCTGTGGTGTGGTGGATGAGGCTGTCCTGGTGTGTCCTGACCCGAGCTCACGTTCCCTCCA 737
|||||..||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||||..||.|||||
Sbjct 667 CACCTCACTGGGGCCTGTGGTGTGGTAGATGAGGCTGTCCTGGTATGCCCCGACCCCAGCTCACACTCACTCCA 740
Query 738 AACTTTGGCTCTGGAGACGGAATGGGAGTTGAGACAGATCCCACTGCAGTCTCTCGACTTAGAATTTGGAAGTG 811
.||||||||.|||||||||||.|||||..||.||||||||||.||||||||||..|||||||||||||||||||
Sbjct 741 CACTTTGGCCCTGGAGACGGAGTGGGAACTGCGACAGATCCCCCTGCAGTCTCCTGACTTAGAATTTGGAAGTG 814
Query 812 GATTCCAACCCCGGGTCCTGCCTACCCAGCCCAACCCAGTGGACGCTTCCCGGGCCCAGTTCTTCCTGCACTTG 885
|||||||.||||..||.|||||.||.||.||||.||||||||...||||.||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct 815 GATTCCAGCCCCAAGTGCTGCCCACACAACCCAGCCCAGTGGCTCCTTCTCGAGCCCAGTTCTTCCTGCAGTTG 888
Query 886 TCCCCAAGCCACTATGCTCTGCTGCAGTACCATTATGGAACGCTGAGTTTGCTTAAAAACTTCCCACAGACTGC 959
||||||||||||||.|||||.|||||.|||||..||||..|..|||.|.|||||||.||||||||.|||.|..|
Sbjct 889 TCCCCAAGCCACTACGCTCTACTGCACTACCACCATGGTGCCGTGACTCTGCTTAAGAACTTCCCCCAGGCCAC 962
Query 960 CCTAGTGAGCTTTGCCACCACTGGGGAGAAGACGGTGGCTGCAGTCATGGCCTGTCGGAATGAAGTGCAGAAAA 1033
.||.||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||.|||||||.|.|||||||||.|||.
Sbjct 963 GCTCGTCAGCTTCGCCACCACAGGGGAGAAGACAGTGGCTGCAGTCATGACCTGTCGCACTGAAGTGCAAAAAC 1036
Query 1034 GTAGCAGTTCTGAAGATGGGTCAATGGGGAGCTTTTCGGAGAAGTCTAGTTCAAAGGACTCTCTGGCTTGCTTC 1107
.|..||||.|||.|||||||||..|||..||||||.|.||||..|||.||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CTGTCAGTGCTGGAGATGGGTCTGTGGCAAGCTTTCCTGAGACATCTGGTGCACAGGACTCTCTGGCTTGCTTC 1110
Query 1108 AATCAGACCTACACCATTAACCTATACCTCGTGGAGACAGGTCGGCGGCTGCTGGACACCACGATAACATTTAG 1181
||.||||||||||||||||||||.|||.|.||||||||||||||||||||.||.|||||..|.||..|.||.||
Sbjct 1111 AACCAGACCTACACCATTAACCTGTACTTAGTGGAGACAGGTCGGCGGCTCCTAGACACTTCCATTTCCTTCAG 1184
Query 1182 CCTGGAACAGAGCGGCACTCGGCCTGAGCGGCTGTATATCCAGGTGTTCTTGAAGAAGGATGACTCAGTGGGCT 1255
||||||.||||..|||||.||.|||||||.||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 1185 CCTGGAGCAGAAGGGCACGCGACCTGAGCAGCTGTACATCCAGGTGTTCTTGAAGAAGGACGACTCGGTGGGCT 1258
Query 1256 ACCGGGCTTTGGTGCAGACAGAGGATCATCTGCTACTTTTCCTGCAGCAGTTGGCAGGGAAGGTGGTGCTGTGG 1329
|||||||.||||||||||||.||||.|||||||..||.||||||||||||.|.||.||||||||||||.|||||
Sbjct 1259 ACCGGGCCTTGGTGCAGACACAGGACCATCTGCAGCTGTTCCTGCAGCAGCTTGCTGGGAAGGTGGTGTTGTGG 1332
Query 1330 AGCCGTGAGGAGTCCCTGGCAGAAGTGGTGTGCCTAGAGATGGTGGACCTCCCCCTGACTGGGGCACAGGCCGA 1403
|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||
Sbjct 1333 AGCCGAGAGGAGTCCCTGGCAGAAGTCGTGTGCCTGGAGATGGTGGATCTCCCCCTGACTGGAGCGCAGGCTGA 1406
Query 1404 GCTGGAAGGAGAATTTGGCAAAAAGGC---------AGATGGCTTGCTGGGGATGTTCCTGAAACGCCTCTCGT 1468
|.|||||||||||||||||||.||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1407 GTTGGAAGGAGAATTTGGCAAGAAGGCAGCGATTCAAGATGGCTTGCTGGGGATGTTCCTGAAACGCCTGTCGT 1480
Query 1469 CTCAGCTTATCCTGCTGCAAGCATGGACTTCCCACCTCTGGAAAATGTTTTATGATGCTCGGAAGCCCCGGAGT 1542
|.|||||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.
Sbjct 1481 CCCAGCTCATCCTGCTCCAGGCCTGGACTTCCCACCTCTGGAAAATGTTCTACGATGCTCGGAAGCCCCGAAGC 1554
Query 1543 CAGATTAAGAATGAGATCAACATTGACACCCTGGCCAGAGATGAATTCAACCTCCAGAAGATGATGGTGATGGT 1616
|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||||.|||
Sbjct 1555 CAGATTAAGAATGAGATCAACATCGACACACTGGCTAGAGATGAGTTCAACCTGCAGAAAATGATGGTGACGGT 1628
Query 1617 AACAGCCTCAGGCAAGCTTTTTGGCATTGAGAGCAGCTCTGGCACCATCCTGTGGAAACAGTATCTACCCAATG 1690
||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct 1629 AACAGCCTCAGGCAAGCTCTTTGGCATCGAGAGCAGCTCTGGAACCATTCTGTGGAAGCAGTATCTGCCCAATG 1702
Query 1691 TCAAGCCAGACTCCTCCTTTAAACTGATGGTCCAGAGAACTACTGCTCATTTCCCCCATCCCCCACAGTGCACC 1764
|.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.
Sbjct 1703 TTAAGCCAGACTCCTCCTTTAAGCTGATGGTGCAGAGGACTACTGCCCATTTCCCCCATCCACCCCAGTGCACG 1776
Query 1765 CTGCTGGTGAAGGACAAGGAGTCGGGAATGAGTTCTCTGTATGTCTTCAATCCCATTTTTGGGAAGTGGAGTCA 1838
|||||||||||||||||||||.|.||||||||.|||||||.|||||||||.|||||||||||.||||||||.||
Sbjct 1777 CTGCTGGTGAAGGACAAGGAGACAGGAATGAGCTCTCTGTTTGTCTTCAACCCCATTTTTGGCAAGTGGAGCCA 1850
Query 1839 GGTAGCTCCCCCAGTGCTGAAGCGCCCCATCTTGCAGTCCTTGCTTCTCCCAGTCATGGATCAAGACTACGCCA 1912
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1851 GGTAGCTCCCCCAGTGCTGAAGCGCCCCATCTTGCAGTCACTGCTTCTCCCAGTCATGGATCAAGACTATGCCA 1924
Query 1913 AGGTGTTGCTGTTGATAGATGATGAATACAAGGTCACAGCTTTTCCAGCCACTCGGAATGTCTTGCGACAGCTA 1986
||||||||||||||.|.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||.
Sbjct 1925 AGGTGTTGCTGTTGGTGGATGACGAATACAAGGTCACAGCTTTCCCAGCTACGCGGAATGTCTTGCGGCAGCTG 1998
Query 1987 CATGAGCTTGCCCCTTCCATCTTCTTCTATTTGGTGGATGCAGAGCAGGGACGGCTGTGTGGATATCGGCTTCG 2060
|||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||..||||.||||.||||||
Sbjct 1999 CATGAACTTGCCCCCTCCATCTTCTTCTACTTGGTGGATGCAGAGCAGGGGCGGCTCAGTGGGTATCAGCTTCG 2072
Query 2061 AAAGGATCTCACCACTGAGCTGAGTTGGGAGCTGACCATTCCCCCAGAAGTACAGCGGATCGTCAAGGTGAAGG 2134
||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||..||||||||||.||||
Sbjct 2073 AAAGGATCTCACTACAGAACTGAGTTGGGAGCTGACCATCCCCCCAGAAGTGCAGCGCGTCGTCAAGGTCAAGG 2146
Query 2135 GGAAACGCAGCAGTGAGCACGTTCATTCCCAGGGCCGTGTGATGGGGGACCGCAGTGTGCTCTACAAGAGCCTG 2208
||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct 2147 GGAAGCGCAGCAGCGAGCACGTACACTCCCAGGGCCGGGTGATGGGGGATCGAAGTGTGCTCTACAAGAGTCTG 2220
Query 2209 AACCCCAACCTGCTGGCCGTGGTGACAGAGAGCACAGACGCGCACCATGAGCGCACCTTTATTGGCATCTTCCT 2282
|||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||.|..|||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 AACCCCAACTTGCTGGCCGTGGTGACAGAGAGCACGGATGTCCACCACGAGCGCACCTTTATTGGCATCTTCCT 2294
Query 2283 CATTGATGGCGTCACTGGGCGTATCATTCACTCCTCTGTGCAGAAGAAAGCCAAAGGCCCTGTCCATATCGTGC 2356
|||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||..|||||||||||..|.||||
Sbjct 2295 CATTGATGGTGTCACTGGCCGCATCATCCACTCCTCCGTGCAGAAGAAGGCCAGGGGCCCTGTCCACCTTGTGC 2368
Query 2357 ATTCAGAGAACTGGGTGGTGTACCAGTACTGGAACACCAAGGCTCGGCGCAACGAGTTTACCGTACTGGAGCTC 2430
||||||||||||||||||||||||||||||||||..|.||||||||||||||.|||.|.||.|..|||||||||
Sbjct 2369 ATTCAGAGAACTGGGTGGTGTACCAGTACTGGAATTCTAAGGCTCGGCGCAATGAGCTGACGGCCCTGGAGCTC 2442
Query 2431 TATGAGGGCACTGAGCAATACAACGCCACCGCCTTCAGCTCCCTGGACCGCCCCCAGCTGCCCCAGGTCCTCCA 2504
||.|||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 TACGAGGGCACTGAACAGTACAATGCCACTGCCTTCAGCTCTCTAGACCGACCCCAGCTGCCCCAGGTCCTCCA 2516
Query 2505 GCAGTCCTATATCTTCCCGTCCTCCATCAGTGCCATGGAGGCCACCATCACCGAACGGGGCATCACCAGCCGAC 2578
|||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||..||||||||||||||||.|
Sbjct 2517 GCAGTCCTACATCTTCCCCTCCTCCATCAGTGCCATGGAAGCTACCATCACCGAGAGGGGCATCACCAGCCGGC 2590
Query 2579 ACCTGCTGATTGGACTACCTTCTGGAGCAATTCTTTCCCTTCCTAAGGCTTTGCTGGATCCCCGCCGCCCCGAG 2652
||.||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 2591 ACTTGCTCATTGGGCTGCCTTCTGGAGCAATCCTTTCCCTCCCCAAGGCCTTGCTGGATCCCCGGCGCCCAGAG 2664
Query 2653 ATCCCAACAGAACAAAGCAGAGAGGAGAACTTAATCCCGTATTCTCCAGATGTACAGATACACGCAGAGCGATT 2726
|||||||||||.|||||||||||.||||||.|.|||||.||||||||||||||.|||.|.||.|||||||||||
Sbjct 2665 ATCCCAACAGAGCAAAGCAGAGAAGAGAACCTGATCCCATATTCTCCAGATGTTCAGGTCCATGCAGAGCGATT 2738
Query 2727 CATCAACTATAACCAGACAGTTTCTCGAATGCGAGGTATCTACACAGCTCCCTCGGGTCTGGAGTCCACTTGTT 2800
|||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||||
Sbjct 2739 CATCAACTATAACCAGACAGTCTCTCGAATGCGAGGCATCTATACAGCGCCCTCAGGCCTGGAGTCCACTTGTT 2812
Query 2801 TGGTTGTGGCCTATGGTTTGGACATTTACCAAACTCGAGTCTACCCATCCAAGCAGTTTGACGTTCTGAAGGAT 2874
|||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||.|||
Sbjct 2813 TGGTTGTGGCCTACGGTTTGGATATTTACCAAACTCGAGTTTACCCGTCCAAGCAGTTTGATGTCCTGAAAGAT 2886
Query 2875 GACTATGACTACGTGTTAATCAGCAGCGTCCTCTTTGGCCTGGTTTTTGCCACCATGATCACTAAGAGACTGGC 2948
|||||.|||||.|||.|.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 2887 GACTACGACTATGTGCTCATCAGCAGTGTCCTTTTTGGCCTGGTTTTTGCCACCATGATCACAAAGAGGCTGGC 2960
Query 2949 ACAGGTGAAGCTCCTGAATCGGGCCTGGCGA 2979
|||||||||.|||||.|||||.||||||||.
Sbjct 2961 ACAGGTGAAACTCCTCAATCGAGCCTGGCGG 2991