Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02720
• Subject: NM_001172438.3
• Aligned Length: 1203
• Identities: 975
• Gaps: 228

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCGAAATAAGCGGGTTTTGAAAACAAAAAAAAGAAGGAGTGGAAGAGGGGGCCAGGATCCAGGCCTCCATCC  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CCACAGAAGTGAAGCTACAGCTGGGAGGTCTCCTCCCACCCCAACCGTCACCCTGGGTCCCGACTGCCCACCTC  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  CTCCTCCTCCCCCTCCCCCCAACAACAACAACAACAACAACTCCAAGCACACCGGCCATAAGAGTGCGTGTGTC  222

Query    1  ------ATGACCGAACGAAGAAGGGACGAGCTCTCTGAAGAGATCAACAACTTAAGAGAGAAGGTCATGAAGCA  68
                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCCAACATGACCGAACGAAGAAGGGACGAGCTCTCTGAAGAGATCAACAACTTAAGAGAGAAGGTCATGAAGCA  296

Query   69  GTCGGAGGAGAACAACAACCTGCAGAGCCAGGTGCAGAAGCTCACAGAGGAGAACACCACCCTTCGAGAGCAAG  142
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GTCGGAGGAGAACAACAACCTGCAGAGCCAGGTGCAGAAGCTCACAGAGGAGAACACCACCCTTCGAGAGCAAG  370

Query  143  TGGAACCCACCCCTGAGGATGAGGATGATGACATCGAGCTCCGCGGTGCTGCAGCAGCTGCTGCCCCACCCCCT  216
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGGAACCCACCCCTGAGGATGAGGATGATGACATCGAGCTCCGCGGTGCTGCAGCAGCTGCTGCCCCACCCCCT  444

Query  217  CCAATAGAGGAAGAGTGCCCAGAAGACCTCCCAGAGAAGTTCGATGGCAACCCAGACATGCTGGCTCCTTTCAT  290
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCAATAGAGGAAGAGTGCCCAGAAGACCTCCCAGAGAAGTTCGATGGCAACCCAGACATGCTGGCTCCTTTCAT  518

Query  291  GGCCCAGTGCCAGATCTTCATGGAAAAGAGCACCAGGGATTTCTCAGTTGATCGTGTCCGTGTCTGCTTCGTGA  364
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGCCCAGTGCCAGATCTTCATGGAAAAGAGCACCAGGGATTTCTCAGTTGATCGTGTCCGTGTCTGCTTCGTGA  592

Query  365  CAAGCATGATGACCGGCCGTGCTGCCCGTTGGGCCTCAGCAAAGCTGGAGCGCTCCCACTACCTGATGCACAAC  438
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CAAGCATGATGACCGGCCGTGCTGCCCGTTGGGCCTCAGCAAAGCTGGAGCGCTCCCACTACCTGATGCACAAC  666

Query  439  TACCCAGCTTTCATGATGGAAATGAAGCATGTCTTTGAAGACCCTCAGAGGCGAGAGGTTGCCAAACGCAAGAT  512
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TACCCAGCTTTCATGATGGAAATGAAGCATGTCTTTGAAGACCCTCAGAGGCGAGAGGTTGCCAAACGCAAGAT  740

Query  513  CAGACGCCTGCGCCAAGGCATGGGGTCTGTCATCGACTACTCCAATGCTTTCCAGATGATTGCCCAGGACCTGG  586
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CAGACGCCTGCGCCAAGGCATGGGGTCTGTCATCGACTACTCCAATGCTTTCCAGATGATTGCCCAGGACCTGG  814

Query  587  ATTGGAACGAGCCTGCGCTGATTGACCAGTACCACGAGGGCCTCAGCGACCACATTCAGGAGGAGCTCTCCCAC  660
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATTGGAACGAGCCTGCGCTGATTGACCAGTACCACGAGGGCCTCAGCGACCACATTCAGGAGGAGCTCTCCCAC  888

Query  661  CTCGAGGTCGCCAAGTCGCTGTCTGCTCTGATTGGGCAGTGCATTCACATTGAGAGAAGGCTGGCCAGGGCTGC  734
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTCGAGGTCGCCAAGTCGCTGTCTGCTCTGATTGGGCAGTGCATTCACATTGAGAGAAGGCTGGCCAGGGCTGC  962

Query  735  TGCAGCTCGCAAGCCACGCTCGCCACCCCGGGCGCTGGTGTTGCCTCACATTGCAAGCCACCACCAGGTAGATC  808
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGCAGCTCGCAAGCCACGCTCGCCACCCCGGGCGCTGGTGTTGCCTCACATTGCAAGCCACCACCAGGTAGATC  1036

Query  809  CAACCGAGCCGGTGGGAGGTGCCCGCATGCGCCTGACGCAGGAAGAAAAAGAAAGACGCAGAAAGCTGAACCTG  882
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CAACCGAGCCGGTGGGAGGTGCCCGCATGCGCCTGACGCAGGAAGAAAAAGAAAGACGCAGAAAGCTGAACCTG  1110

Query  883  TGCCTCTACTGTGGAACAGGAGGTCACTACGCTGACAATTGTCCTGCCAAGGCCTCAAAGTCTTCGCCGGCGGG  956
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TGCCTCTACTGTGGAACAGGAGGTCACTACGCTGACAATTGTCCTGCCAAGGCCTCAAAGTCTTCGCCGGCGGG  1184

Query  957  AAACTCCCCGGCCCCGCTG  975
            |||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AAACTCCCCGGCCCCGCTG  1203