Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02720
• Subject: NM_001184962.2
• Aligned Length: 1077
• Identities: 975
• Gaps: 102

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  CTGGGTCCCGACTGCCCACCTCCTCCTCCTCCCCCTCCCCCCAACAACAACAACAACAACAACTCCAAGCACAC  74

Query    1  ----------------------------ATGACCGAACGAAGAAGGGACGAGCTCTCTGAAGAGATCAACAACT  46
                                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CGGCCATAAGAGTGCGTGTGTCCCCAACATGACCGAACGAAGAAGGGACGAGCTCTCTGAAGAGATCAACAACT  148

Query   47  TAAGAGAGAAGGTCATGAAGCAGTCGGAGGAGAACAACAACCTGCAGAGCCAGGTGCAGAAGCTCACAGAGGAG  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TAAGAGAGAAGGTCATGAAGCAGTCGGAGGAGAACAACAACCTGCAGAGCCAGGTGCAGAAGCTCACAGAGGAG  222

Query  121  AACACCACCCTTCGAGAGCAAGTGGAACCCACCCCTGAGGATGAGGATGATGACATCGAGCTCCGCGGTGCTGC  194
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AACACCACCCTTCGAGAGCAAGTGGAACCCACCCCTGAGGATGAGGATGATGACATCGAGCTCCGCGGTGCTGC  296

Query  195  AGCAGCTGCTGCCCCACCCCCTCCAATAGAGGAAGAGTGCCCAGAAGACCTCCCAGAGAAGTTCGATGGCAACC  268
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGCAGCTGCTGCCCCACCCCCTCCAATAGAGGAAGAGTGCCCAGAAGACCTCCCAGAGAAGTTCGATGGCAACC  370

Query  269  CAGACATGCTGGCTCCTTTCATGGCCCAGTGCCAGATCTTCATGGAAAAGAGCACCAGGGATTTCTCAGTTGAT  342
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CAGACATGCTGGCTCCTTTCATGGCCCAGTGCCAGATCTTCATGGAAAAGAGCACCAGGGATTTCTCAGTTGAT  444

Query  343  CGTGTCCGTGTCTGCTTCGTGACAAGCATGATGACCGGCCGTGCTGCCCGTTGGGCCTCAGCAAAGCTGGAGCG  416
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CGTGTCCGTGTCTGCTTCGTGACAAGCATGATGACCGGCCGTGCTGCCCGTTGGGCCTCAGCAAAGCTGGAGCG  518

Query  417  CTCCCACTACCTGATGCACAACTACCCAGCTTTCATGATGGAAATGAAGCATGTCTTTGAAGACCCTCAGAGGC  490
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTCCCACTACCTGATGCACAACTACCCAGCTTTCATGATGGAAATGAAGCATGTCTTTGAAGACCCTCAGAGGC  592

Query  491  GAGAGGTTGCCAAACGCAAGATCAGACGCCTGCGCCAAGGCATGGGGTCTGTCATCGACTACTCCAATGCTTTC  564
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GAGAGGTTGCCAAACGCAAGATCAGACGCCTGCGCCAAGGCATGGGGTCTGTCATCGACTACTCCAATGCTTTC  666

Query  565  CAGATGATTGCCCAGGACCTGGATTGGAACGAGCCTGCGCTGATTGACCAGTACCACGAGGGCCTCAGCGACCA  638
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CAGATGATTGCCCAGGACCTGGATTGGAACGAGCCTGCGCTGATTGACCAGTACCACGAGGGCCTCAGCGACCA  740

Query  639  CATTCAGGAGGAGCTCTCCCACCTCGAGGTCGCCAAGTCGCTGTCTGCTCTGATTGGGCAGTGCATTCACATTG  712
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CATTCAGGAGGAGCTCTCCCACCTCGAGGTCGCCAAGTCGCTGTCTGCTCTGATTGGGCAGTGCATTCACATTG  814

Query  713  AGAGAAGGCTGGCCAGGGCTGCTGCAGCTCGCAAGCCACGCTCGCCACCCCGGGCGCTGGTGTTGCCTCACATT  786
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGAGAAGGCTGGCCAGGGCTGCTGCAGCTCGCAAGCCACGCTCGCCACCCCGGGCGCTGGTGTTGCCTCACATT  888

Query  787  GCAAGCCACCACCAGGTAGATCCAACCGAGCCGGTGGGAGGTGCCCGCATGCGCCTGACGCAGGAAGAAAAAGA  860
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GCAAGCCACCACCAGGTAGATCCAACCGAGCCGGTGGGAGGTGCCCGCATGCGCCTGACGCAGGAAGAAAAAGA  962

Query  861  AAGACGCAGAAAGCTGAACCTGTGCCTCTACTGTGGAACAGGAGGTCACTACGCTGACAATTGTCCTGCCAAGG  934
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AAGACGCAGAAAGCTGAACCTGTGCCTCTACTGTGGAACAGGAGGTCACTACGCTGACAATTGTCCTGCCAAGG  1036

Query  935  CCTCAAAGTCTTCGCCGGCGGGAAACTCCCCGGCCCCGCTG  975
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CCTCAAAGTCTTCGCCGGCGGGAAACTCCCCGGCCCCGCTG  1077