Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_02728
- Subject:
- XM_006529267.4
- Aligned Length:
- 2409
- Identities:
- 1584
- Gaps:
- 636
Alignment
Query 1 ATGGAGGTGAAACCTGTGGGAGAACCTACTCAAGAGGTGTCTAAATTCAAACTTTCCACCAAGGTAGAAAGCAC 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GGGACACTGGCTGGTGGAAGATCATGTTCGAATATGGGAAGTTTTAAAGACAGAGGAGAGCTCGATTCAGGACT 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 GGGGTGAAGAGGTAGAGGAAGGAGCTGTTTACCATGTCACCCTCAAAAGAGTCCAGATTCAACAGGCTGCCAAT 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 AAAGGAGCAAGATGGCTAGGGGTTGAAGGGGACCAGCTGCCTCCAGGACACACAGTCAGTCAATATGAAACCTG 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 TAAGATCAGGACCATAAAAGCTGGCACCTTGGAGAAGCTTGTGGAGAACCTGCTGACAGCTTTTGGGGACAATG 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 ACTTTACCTATATCAGCATCTTTCTTTCAACGTACAGAGGCTTTGCCTCCACTAAAGAAGTGCTGGAACTACTG 444
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 445 CTGGACAGGTATGGAAACCTGACAAGCCCAAACTGTGAAGAAGATGGAAGCCAAAGTTCATCAGAGTCCAAAAT 518
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 519 GGTGATCAGGAATGCAATCGCTTCCATACTAAGGGCCTGGCTTGACCAGTGTGCAGAAGACTTCCGAGAGCCCC 592
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 593 CTCACTTCCCTTGCTTACAGAAACTGCTGGATTATCTCACACGGATGATGCCGGGCTCTGACCCAGAAAGAAGA 666
||||||||.||||||||||||||.||.|||
Sbjct 1 --------------------------------------------ATGATGCCTGGCTCTGACCCAGAGAGGAGA 30
Query 667 GCACAAAATCTTCTTGAGCAGTTTCAGAAGCAAGAAGTGGAAACTGACAATGGGCTTCCCAACACGATCTCCTT 740
|||||.||.||||||||.||||||||.|||||.||.|||||..|.||||||||.||||.||||||.|.||||||
Sbjct 31 GCACAGAACCTTCTTGAACAGTTTCAAAAGCAGGACGTGGATTCCGACAATGGACTTCTCAACACCAGCTCCTT 104
Query 741 CAGCCTGGAAGAGGAAGAGGAACTGGAGGGTGGAGAGTCAGCAGAATTCACGTGCTTCTCAGAAGATCTCGTGG 814
||||||||||||||||||||||||||||.|.||||.||||||||||||||||..||||||||||||||||||||
Sbjct 105 CAGCCTGGAAGAGGAAGAGGAACTGGAGAGCGGAGGGTCAGCAGAATTCACGAACTTCTCAGAAGATCTCGTGG 178
Query 815 CAGAGCAGCTGACCTACATGGATGCACAACTCTTCAAGAAAGTAGTGCCTCACCACTGCCTGGGCTGCATTTGG 888
||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 179 CAGAACAGCTGACCTACATGGACGCACAACTATTCAAGAAGGTAGTGCCTCACCATTGCCTGGGCTGTATTTGG 252
Query 889 TCTCGAAGGGATAAGAAGGAAAACAAACATTTGGCTCCTACGATCCGTGCCACCATCTCTCAGTTTAATACCCT 962
||||...|||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 253 TCTCAGCGGGATAAAAAGGAAAACAAGCATTTGGCTCCTACGATCCGTGCCACCATCTCTCAGTTTAATACGCT 326
Query 963 CACCAAATGTGTTGTCAGCACCATCCTGGGGGGCAAAGAACTCAAAACTCAGCAGAGAGCCAAAATCATTGAGA 1036
||||||.|||||||||||||||.||||||||.||||.||||||||||||||||||.||||||.|.||||.||||
Sbjct 327 CACCAAGTGTGTTGTCAGCACCGTCCTGGGGAGCAAGGAACTCAAAACTCAGCAGCGAGCCAGAGTCATCGAGA 400
Query 1037 AGTGGATCAACATCGCTCATGAATGTAGACTCCTGAAGAATTTTTCCTCCTTGAGGGCCATCGTTTCGGCACTG 1110
|||||||||||||.|||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 401 AGTGGATCAACATTGCTCACGAATGTAGAATCCTGAAGAATTTTTCCTCCTTGAGGGCCATCGTTTCCGCACTG 474
Query 1111 CAGTCTAATTCCATCTATCGGTTAAAAAAGACTTGGGCTGCCGTCCCAAGGGACCGAATGCTGATGTTTGAAGA 1184
|||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||.|||||.|.||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 475 CAGTCTAATTCCATCTATCGGTTGAAAAAGGCTTGGGCTGCTGTCCCGAAGGACAGAATGCTGATGTTTGAAGA 548
Query 1185 ACTTTCAGATATCTTCTCAGACCATAATAACCATTTGACCAGCCGAGAACTACTGATGAAGGAAGGAACCTCAA 1258
||||||||||||||||||.||.||.|||||||||.|.|||||.||.||.|||||.||||||||||||||.||||
Sbjct 549 ACTTTCAGATATCTTCTCTGATCACAATAACCATCTAACCAGTCGGGAGCTACTAATGAAGGAAGGAACTTCAA 622
Query 1259 AATTTGCAAACCTGGACAGCAGTGTGAAAGAAAACCAGAAGCGTACCCAGAGGCGGCTGCAGCTCCAGAAGGAC 1332
||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.
Sbjct 623 AATTTGCAAACCTGGACAGCAGCGTGAAAGAAAACCAGAAGCGGACCCAGAGGCGCCTGCAACTGCAGAAGGAT 696
Query 1333 ATGGGTGTGATGCAGGGAACTGTGCCCTACCTGGGCACCTTCCTGACTGACCTGACCATGCTTGACACTGCCCT 1406
|||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 697 ATGGGTGTGATGCAGGGTACCGTGCCTTACCTGGGCACCTTCCTGACTGACCTGACCATGCTGGACACTGCCCT 770
Query 1407 TCAGGACTACATCGAGGGTGGACTGATAAACTTTGAGAAAAGGAGAAGGGAATTTGAAGTGATTGCCCAGATAA 1480
.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 771 GCAGGACTACATTGAGGGTGGACTGATCAACTTCGAGAAAAGAAGAAGGGAATTTGAAGTCATTGCCCAGATAA 844
Query 1481 AGCTCTTACAGTCTGCCTGCAACAGCTATTGCATGACCCCAGACCAAAAGTTCATCCAGTGGTTCCAGAGGCAG 1554
|||||.||||||||||.|||||||||||.||||||..|||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 845 AGCTCCTACAGTCTGCTTGCAACAGCTACTGCATGGGCCCAGACCAGAAGTTTATCCAGTGGTTCCAGAGGCAG 918
Query 1555 CAGCTCCTGACAGAGGAGGAGAGCTATGCCCTGTCATGTGAGATTGAAGCAGCTGCTGACGCCAGCACCACCTC 1628
|||||.||..||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||||.||||||.||
Sbjct 919 CAGCTTCTATCAGAGGAGGAAAGCTACGCCCTCTCGTGTGAGATTGAAGCCGCTGCCGACGCCAACACCACTTC 992
Query 1629 GCCCAAGCCTCGGAAGAGCATGGTGAAGAGACTCAGCCTACTGTTTCTAGGGTCTGACATGATCACCAGTCCCA 1702
.||.|||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||.|||||.|||||||||||.|||.||.|...||
Sbjct 993 CCCTAAGCCTCGGAAAAGCATGGTGAAGAGGCTGAGCCTGCTATTTCTGGGGTCTGACATCATCCCCGGGAGCA 1066
Query 1703 CTCCCACCAAAGAGCAGCCCAAGTCCACTGCCAGCGGGAGCTCTGGTGAAAGCATGGACTCTGTCAGCGTGTCA 1776
||||||||||||||||||||||||||.|.|||||.|||||||||||.||.||.||||||||.|||||.|||||.
Sbjct 1067 CTCCCACCAAAGAGCAGCCCAAGTCCGCAGCCAGTGGGAGCTCTGGGGAGAGTATGGACTCAGTCAGTGTGTCG 1140
Query 1777 TCCTGCGAGTCGAACCACTCAGAGGCTGAGGAGGGCTCCATTACTCCCATGGACACCCCTGATGAGCCTCAAAA 1850
|||||.||.||.||||||||.|||||||||||||||.||.|.||.|||||||||||.||.||||||||.|||||
Sbjct 1141 TCCTGTGAATCAAACCACTCCGAGGCTGAGGAGGGCCCCGTCACACCCATGGACACACCAGATGAGCCCCAAAA 1214
Query 1851 AAAGCTCTCTGAGTCCTCCTCATCCTGTTCTTCTATCCATTCCATGGACACAAATTCCTCAGGGATGTCTTCCT 1924
.|||||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||.
Sbjct 1215 GAAGCTCTCTGAATCCTCCTCTTCCTGTTCCTCCATCCATTCCATGGACACGAATTCCTCAGGGATGTCGTCCC 1288
Query 1925 TAATCAACCCCCTCTCCTCCCCTCCGTCCTGCAACAACAACCCCAAAATCCACAAGCGCTCTGTCTCGGTGACG 1998
|||||||||||||.|||||||||||..|.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.
Sbjct 1289 TAATCAACCCCCTGTCCTCCCCTCCAACGTGCAACAACAATCCTAAAATCCACAAGCGCTCCGTCTCCGTGACA 1362
Query 1999 TCCATTACCTCGACTGTGCTGCCTCCTGTTTACAACCAACAGAATGAAGACACCTGCATAATCCGCATCAGTGT 2072
|||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1363 TCCATTACCTCCACAGTACTGCCTCCTGTTTACAATCAGCAGAACGAAGACACCTGCATCATCCGCATCAGTGT 1436
Query 2073 GGAAGACAATAACGGCAACATGTACAAGAGCATCATGTTGACGAGCCAGGATAAAACCCCCGCTGTGATCCAGA 2146
.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1437 AGAAGACAACAATGGCAACATGTACAAGAGCATCATGCTGACAAGCCAGGATAAGACCCCCGCTGTGATCCAGA 1510
Query 2147 GAGCCATGCTGAAGCACAATCTGGACTCAGACCCCGCCGAGGAGTACGAGCTGGTGCAGGTCATCTCGGAGGAC 2220
||||.|||..|||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1511 GAGCGATGTCGAAGCACAACCTGGAGTCGGACCCCGCCGAGGAGTATGAGCTGGTGCAGGTCATCTCGGAGGAC 1584
Query 2221 AAAGAACTTGTGATTCCAGACTCAGCAAATGTCTTTTATGCCATGAACAGCCAAGTGAACTTTGACTTCATTTT 2294
||||||||.|||||.||.|||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1585 AAAGAACTAGTGATCCCGGACTCTGCAAACGTCTTTTACGCCATGAATAGCCAAGTGAACTTTGATTTCATTTT 1658
Query 2295 GCGCAAAAAGAACTCCATGGAAGAACAAGTGAAACTGCGTAGCCGGACCAGCTTGACGTTGCCCAGGACAGCTA 2368
.||||||||||||||..||||.||.||.|||||..||||.||.|||||||||.||||.||||||||||||||||
Sbjct 1659 ACGCAAAAAGAACTCGGTGGAGGAGCAGGTGAAGTTGCGCAGTCGGACCAGCCTGACTTTGCCCAGGACAGCTA 1732
Query 2369 AACGGGGCTGCTGGAGTAACAGACACAGCAAAATCACCCTC 2409
|.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 1733 AGCGGGGCTGCTGGAGTAACAGGCACAGCAAGATCACCCTC 1773
