Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02746
• Subject: XM_006514433.2
• Aligned Length: 1601
• Identities: 1445
• Gaps: 22

Alignment

Query    1  ATG-GAGCCCGACTCGGTGA-TTG-----AGGACAAGACCA---TCGAG----CTCATGAACACTTCAGTTATG  60
            ||| |.||.|       ||| |||     ||..||.|.|||   || ||    |||..||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTGCGCAC-------TGAGTTGCCTGCAGAGCATGCCCAGTGTC-AGATGTCTCCAGAACACTTCAGTTATG  66

Query   61  GAAGATCAAAATGAAGATGAGTCCCCAAAGAAAAATACTCTTTGGCAGATAAGTAATGGAACATCATCTGTGAT  134
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct   67  GAAGATCAAAATGAAGATGAGTCCCCAAAGAAAAGTGCTCTTTGGCAGATCAGTAATGGAACGTCATCTGTGAT  140

Query  135  CGTCTCCAGAAAGAGGCCATCAGAAGGAAACTATCAAAAAGAAAAAGACTTGTGTATTAAATATTTTGACCAGT  208
            .|||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||.||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||||
Sbjct  141  TGTCTCCAGAAAGAGGCCGTCAGAGGGGAACTACCAGAAAGAAAAGGACTTGTGCATTAAGTACTTTGACCAGT  214

Query  209  GGTCTGAATCAGATCAAGTGGAATTTGTGGAACATCTTATTTCACGAATGTGTCATTATCAGCATGGACATATT  282
            ||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  215  GGTCTGAATCAGATCAGGTGGAATTTGTGGAGCATCTTATCTCACGGATGTGTCATTATCAGCATGGACATATT  288

Query  283  AACTCTTACCTGAAGCCCATGTTGCAGCGGGACTTTATTACCGCTTTACCAGAGCAAGGCTTAGATCACATAGC  356
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  289  AACTCTTACCTGAAGCCCATGTTGCAGCGGGACTTTATCACTGCTTTACCAGAGCAAGGCTTAGATCACATAGC  362

Query  357  AGAAAACATTCTTTCGTACCTGGATGCCAGGTCTCTGTGTGCAGCAGAGCTGGTATGTAAAGAATGGCAGCGAG  430
            ||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  363  AGAAAACATTCTCTCCTACCTGGATGCCAGGTCTCTGTGTGCAGCAGAGCTGGTGTGTAAAGAATGGCAGCGAG  436

Query  431  TGATCTCAGAAGGAATGCTTTGGAAGAAGCTGATTGAACGAATGGTACGCACTGATCCCCTATGGAAAGGACTT  504
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||..|.|||||.|||||.||.||.||.|||||.|||||.
Sbjct  437  TGATCTCAGAAGGGATGCTTTGGAAGAAGCTGATTGAGAGGATGGTGCGCACCGACCCTCTCTGGAAGGGACTC  510

Query  505  TCAGAAAGAAGAGGGTGGGATCAGTACCTGTTTAAAAACAGACCCACAGATGGCCCTCCAAATTCATTTTATAG  578
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||
Sbjct  511  TCAGAAAGAAGAGGCTGGGATCAGTACCTGTTTAAAAACAGACCTACAGATGGCCCTCCCAACTCATTTTATAG  584

Query  579  GTCATTATACCCAAAGATTATCCAGGATATAGAGACTATAGAATCTAACTGGCGGTGTGGACGACACAACTTGC  652
            .||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  585  ATCATTATACCCAAAGATTATCCAGGACATAGAGACCATAGAATCCAACTGGCGGTGTGGACGACACAACTTGC  658

Query  653  AGAGGATTCAGTGCCGCTCTGAAAATAGTAAAGGTGTCTACTGTTTACAGTACGATGATGAAAAAATTATCAGT  726
            |||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||||||||
Sbjct  659  AGAGGATCCAGTGCCGCTCTGAAAATAGTAAGGGTGTCTACTGTTTGCAATATGATGATGACAAAATTATCAGT  732

Query  727  GGCCTACGAGATAATTCTATTAAGATATGGGATAAAACCAGCCTGGAATGTTTGAAAGTGTTAACAGGACACAC  800
            |||||.||.||.||.|||||.|||||.||||||||||.||||.|||||||||||||||||.||||.||.|||||
Sbjct  733  GGCCTCCGGGACAACTCTATCAAGATCTGGGATAAAAGCAGCTTGGAATGTTTGAAAGTGCTAACGGGCCACAC  806

Query  801  AGGCTCTGTCCTCTGTCTGCAGTATGATGAGCGTGTCATTGTAACTGGCTCTTCAGATTCTACGGTGAGAGTGT  874
            |||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.|
Sbjct  807  AGGCTCTGTCCTCTGCCTCCAGTATGATGAGCGAGTCATTGTAACTGGTTCTTCAGACTCCACGGTGAGAGTCT  880

Query  875  GGGATGTGAACACGGGTGAAGTTCTTAACACATTGATCCACCACAATGAGGCTGTATTGCACTTACGCTTCAGC  948
            |||||||||||||.|||||.||.||.||||||.|.||||||||||||||.||.|||.|||||||||||||||||
Sbjct  881  GGGATGTGAACACTGGTGAGGTGCTCAACACACTCATCCACCACAATGAAGCCGTACTGCACTTACGCTTCAGC  954

Query  949  AATGGACTGATGGTGACCTGTTCCAAGGACCGCTCCATTGCTGTGTGGGACATGGCTTCTGCGACCGACATCAC  1022
            |||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct  955  AATGGACTGATGGTGACTTGTTCCAAGGACCGTTCCATTGCCGTGTGGGACATGGCTTCTGCCACCGATATCAC  1028

Query 1023  TTTACGCCGTGTCCTGGTTGGCCACCGGGCTGCCGTCAATGTAGTAGACTTTGACGACAAGTACATCGTGTCTG  1096
            ||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||
Sbjct 1029  TTTACGCCGTGTTCTGGTTGGCCACCGTGCTGCTGTCAATGTAGTAGACTTTGATGATAAATACATCGTGTCTG  1102

Query 1097  CCTCTGGTGACAGGACCATCAAAGTCTGGAGCACGAGCACCTGTGAATTTGTTCGTACTCTCAATGGGCACAAG  1170
            |.||.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.||||||||||||
Sbjct 1103  CTTCAGGAGACAGGACCATTAAAGTGTGGAGCACGAGCACATGTGAGTTTGTCCGCACTCTGAATGGGCACAAG  1176

Query 1171  CGGGGCATTGCCTGTCTCCAGTACAGGGATCGCCTGGTTGTTAGTGGATCATCAGATAATACCATTAGGCTCTG  1244
            ||.|||||.||||||||.||||||.|.||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||..||.|.||
Sbjct 1177  CGAGGCATCGCCTGTCTGCAGTACCGCGACCGGCTTGTTGTTAGTGGATCATCAGATAATACCATCCGGTTATG  1250

Query 1245  GGATATTGAATGTGGTGCCTGTTTAAGAGTCCTAGAGGGACATGAAGAATTGGTCCGATGCATCCGGTTTGATA  1318
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct 1251  GGATATTGAATGTGGTGCCTGTTTAAGAGTCCTAGAGGGGCACGAAGAATTGGTCCGGTGCATCCGTTTTGATA  1324

Query 1319  ACAAGAGGATTGTCAGTGGGGCCTATGATGGGAAAATTAAAGTTTGGGACTTGCAAGCTGCTCTTGACCCTCGA  1392
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 1325  ACAAGAGGATTGTCAGTGGCGCCTATGATGGGAAGATTAAAGTCTGGGACTTGCAGGCTGCTCTTGACCCTCGG  1398

Query 1393  GCCCCAGCAAGCACATTGTGTTTGCGCACATTGGTGGAACATTCTGGACGTGTGTTTCGGCTCCAGTTTGATGA  1466
            |||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1399  GCCCCAGCAAGCACATTGTGTCTGCGCACCTTGGTGGAACACTCTGGACGTGTGTTTCGGCTGCAGTTTGATGA  1472

Query 1467  GTTTCAGATCATCAGCAGCTCCCATGATGACACTATTTTGATTTGGGATTTCTTAAATGTGCCTCCCAGTGCCC  1540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1473  GTTTCAGATCATCAGCAGCTCCCATGATGACACTATTTTGATTTGGGATTTCTTAAATGTGCCTCCCAGTGCCC  1546

Query 1541  AGAATGAGACCCGTTCTCCCTCCAGAACATACACTTACATCTCTAGA  1587
            |||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||
Sbjct 1547  AGAATGAGACCCGCTCTCCCTCCAGAACCTACACCTATATCTCCAGA  1593