Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02746
• Subject: XM_006514435.2
• Aligned Length: 1592
• Identities: 1390
• Gaps: 67

Alignment

Query    1  ATGGAGCCCGACTCGGTGATTGAGGACAAGACCATCGAGCTCA-TGAACACTTCAGTTATG---GAAGATCAAA  70
                                             || |.||.|| ||        |||  ||   |.|||.||  
Sbjct    1  ---------------------------------AT-GTGCGCACTG--------AGT--TGCCTGCAGAGCA--  28

Query   71  ATGAAGATGAGTCCCCAAAGAAAAAT-ACTCTTTGGCAGATAAGTAATGGAACATCATCTGTGATCGTCTCCAG  143
                       |.||||..|..|.|| .|||     |||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct   29  -----------TGCCCAGTGTCAGATGTCTC-----CAGATCAGTAATGGAACGTCATCTGTGATTGTCTCCAG  86

Query  144  AAAGAGGCCATCAGAAGGAAACTATCAAAAAGAAAAAGACTTGTGTATTAAATATTTTGACCAGTGGTCTGAAT  217
            |||||||||.|||||.||.|||||.||.||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct   87  AAAGAGGCCGTCAGAGGGGAACTACCAGAAAGAAAAGGACTTGTGCATTAAGTACTTTGACCAGTGGTCTGAAT  160

Query  218  CAGATCAAGTGGAATTTGTGGAACATCTTATTTCACGAATGTGTCATTATCAGCATGGACATATTAACTCTTAC  291
            |||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  161  CAGATCAGGTGGAATTTGTGGAGCATCTTATCTCACGGATGTGTCATTATCAGCATGGACATATTAACTCTTAC  234

Query  292  CTGAAGCCCATGTTGCAGCGGGACTTTATTACCGCTTTACCAGAGCAAGGCTTAGATCACATAGCAGAAAACAT  365
            |||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  235  CTGAAGCCCATGTTGCAGCGGGACTTTATCACTGCTTTACCAGAGCAAGGCTTAGATCACATAGCAGAAAACAT  308

Query  366  TCTTTCGTACCTGGATGCCAGGTCTCTGTGTGCAGCAGAGCTGGTATGTAAAGAATGGCAGCGAGTGATCTCAG  439
            |||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  309  TCTCTCCTACCTGGATGCCAGGTCTCTGTGTGCAGCAGAGCTGGTGTGTAAAGAATGGCAGCGAGTGATCTCAG  382

Query  440  AAGGAATGCTTTGGAAGAAGCTGATTGAACGAATGGTACGCACTGATCCCCTATGGAAAGGACTTTCAGAAAGA  513
            ||||.|||||||||||||||||||||||..|.|||||.|||||.||.||.||.|||||.|||||.|||||||||
Sbjct  383  AAGGGATGCTTTGGAAGAAGCTGATTGAGAGGATGGTGCGCACCGACCCTCTCTGGAAGGGACTCTCAGAAAGA  456

Query  514  AGAGGGTGGGATCAGTACCTGTTTAAAAACAGACCCACAGATGGCCCTCCAAATTCATTTTATAGGTCATTATA  587
            |||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||
Sbjct  457  AGAGGCTGGGATCAGTACCTGTTTAAAAACAGACCTACAGATGGCCCTCCCAACTCATTTTATAGATCATTATA  530

Query  588  CCCAAAGATTATCCAGGATATAGAGACTATAGAATCTAACTGGCGGTGTGGACGACACAACTTGCAGAGGATTC  661
            ||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  531  CCCAAAGATTATCCAGGACATAGAGACCATAGAATCCAACTGGCGGTGTGGACGACACAACTTGCAGAGGATCC  604

Query  662  AGTGCCGCTCTGAAAATAGTAAAGGTGTCTACTGTTTACAGTACGATGATGAAAAAATTATCAGTGGCCTACGA  735
            ||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||.
Sbjct  605  AGTGCCGCTCTGAAAATAGTAAGGGTGTCTACTGTTTGCAATATGATGATGACAAAATTATCAGTGGCCTCCGG  678

Query  736  GATAATTCTATTAAGATATGGGATAAAACCAGCCTGGAATGTTTGAAAGTGTTAACAGGACACACAGGCTCTGT  809
            ||.||.|||||.|||||.||||||||||.||||.|||||||||||||||||.||||.||.||||||||||||||
Sbjct  679  GACAACTCTATCAAGATCTGGGATAAAAGCAGCTTGGAATGTTTGAAAGTGCTAACGGGCCACACAGGCTCTGT  752

Query  810  CCTCTGTCTGCAGTATGATGAGCGTGTCATTGTAACTGGCTCTTCAGATTCTACGGTGAGAGTGTGGGATGTGA  883
            ||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct  753  CCTCTGCCTCCAGTATGATGAGCGAGTCATTGTAACTGGTTCTTCAGACTCCACGGTGAGAGTCTGGGATGTGA  826

Query  884  ACACGGGTGAAGTTCTTAACACATTGATCCACCACAATGAGGCTGTATTGCACTTACGCTTCAGCAATGGACTG  957
            ||||.|||||.||.||.||||||.|.||||||||||||||.||.|||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  827  ACACTGGTGAGGTGCTCAACACACTCATCCACCACAATGAAGCCGTACTGCACTTACGCTTCAGCAATGGACTG  900

Query  958  ATGGTGACCTGTTCCAAGGACCGCTCCATTGCTGTGTGGGACATGGCTTCTGCGACCGACATCACTTTACGCCG  1031
            ||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct  901  ATGGTGACTTGTTCCAAGGACCGTTCCATTGCCGTGTGGGACATGGCTTCTGCCACCGATATCACTTTACGCCG  974

Query 1032  TGTCCTGGTTGGCCACCGGGCTGCCGTCAATGTAGTAGACTTTGACGACAAGTACATCGTGTCTGCCTCTGGTG  1105
            |||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.||.||.|
Sbjct  975  TGTTCTGGTTGGCCACCGTGCTGCTGTCAATGTAGTAGACTTTGATGATAAATACATCGTGTCTGCTTCAGGAG  1048

Query 1106  ACAGGACCATCAAAGTCTGGAGCACGAGCACCTGTGAATTTGTTCGTACTCTCAATGGGCACAAGCGGGGCATT  1179
            ||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||.|||||.
Sbjct 1049  ACAGGACCATTAAAGTGTGGAGCACGAGCACATGTGAGTTTGTCCGCACTCTGAATGGGCACAAGCGAGGCATC  1122

Query 1180  GCCTGTCTCCAGTACAGGGATCGCCTGGTTGTTAGTGGATCATCAGATAATACCATTAGGCTCTGGGATATTGA  1253
            ||||||||.||||||.|.||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||..||.|.|||||||||||
Sbjct 1123  GCCTGTCTGCAGTACCGCGACCGGCTTGTTGTTAGTGGATCATCAGATAATACCATCCGGTTATGGGATATTGA  1196

Query 1254  ATGTGGTGCCTGTTTAAGAGTCCTAGAGGGACATGAAGAATTGGTCCGATGCATCCGGTTTGATAACAAGAGGA  1327
            ||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1197  ATGTGGTGCCTGTTTAAGAGTCCTAGAGGGGCACGAAGAATTGGTCCGGTGCATCCGTTTTGATAACAAGAGGA  1270

Query 1328  TTGTCAGTGGGGCCTATGATGGGAAAATTAAAGTTTGGGACTTGCAAGCTGCTCTTGACCCTCGAGCCCCAGCA  1401
            ||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1271  TTGTCAGTGGCGCCTATGATGGGAAGATTAAAGTCTGGGACTTGCAGGCTGCTCTTGACCCTCGGGCCCCAGCA  1344

Query 1402  AGCACATTGTGTTTGCGCACATTGGTGGAACATTCTGGACGTGTGTTTCGGCTCCAGTTTGATGAGTTTCAGAT  1475
            ||||||||||||.|||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1345  AGCACATTGTGTCTGCGCACCTTGGTGGAACACTCTGGACGTGTGTTTCGGCTGCAGTTTGATGAGTTTCAGAT  1418

Query 1476  CATCAGCAGCTCCCATGATGACACTATTTTGATTTGGGATTTCTTAAATGTGCCTCCCAGTGCCCAGAATGAGA  1549
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1419  CATCAGCAGCTCCCATGATGACACTATTTTGATTTGGGATTTCTTAAATGTGCCTCCCAGTGCCCAGAATGAGA  1492

Query 1550  CCCGTTCTCCCTCCAGAACATACACTTACATCTCTAGA  1587
            ||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||
Sbjct 1493  CCCGCTCTCCCTCCAGAACCTACACCTATATCTCCAGA  1530