Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02752
• Subject: NM_001271725.1
• Aligned Length: 2310
• Identities: 2030
• Gaps: 78

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCCCAGGAGTGGCCGTTATGGAACCCAGCAGCGTGCAGGGTCGAGGACAGCCGGCCCCCCATGTCAGTGGTC  74

Query    1  ----ATGGCCAGTGAAGGCACCAACATCCCAAGTCCTGTGGTGCGCCAGATTGACAAGCAGTTTCTGATTTGCA  70
                |||||||||||.|||.|||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct   75  TAGGATGGCCAGTGAGGGCGCCAGCATCCCAAGTCCCGTGGTGCGCCAGATTGACAAGCAGTTTCTGATCTGCA  148

Query   71  GTATATGCCTGGAACGGTACAAGAATCCCAAGGTTCTCCCCTGTCTGCACACTTTCTGCGAGAGGTGCCTGCAG  144
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GTATATGCCTGGAACGGTACAAGAACCCCAAGGTCCTGCCCTGTCTGCACACTTTCTGCGAGAGGTGCCTGCAG  222

Query  145  AACTACATTCCTGCCCACAGTTTAACCCTCTCCTGCCCAGTGTGCCGCCAGACCTCCATCCTGCCCGAGAAAGG  218
            ||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AACTACATCCCAGCCCACAGTTTAACCCTCTCCTGCCCGGTGTGTCGCCAGACATCCATCCTGCCCGAGAAAGG  296

Query  219  GGTGGCCGCGCTCCAGAACAATTTCTTCATCACAAACCTGATGGACGTGCTGCAGCGAACTCCAGGCAGCAACG  292
            |||||||||.||.||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct  297  GGTGGCCGCACTTCAGAACAACTTCTTTATCACGAACCTCATGGATGTGCTGCAGCGGACGCCAGGCAGCAACG  370

Query  293  CTGAGGAGTCTTCCATCCTGGAGACAGTCACTGCTGTGGCTGCGGGAAAGCCTCTCTCTTGCCCAAACCACGAT  366
            ..|||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||
Sbjct  371  GCGAGGACTCTTCCATCCTGGAGACGGTCACCGCTGTGGCTGCAGGAAAGCCTCTTTCGTGCCCAAACCATGAT  444

Query  367  GGGAATGTGATGGAATTTTACTGCCAGTCCTGTGAGACTGCCATGTGTCGGGAGTGCACGGAGGGGGAGCACGC  440
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGAAATGTGATGGAATTTTACTGCCAGTCCTGTGAGACCGCCATGTGTCGGGAGTGCACGGAGGGGGAGCACGC  518

Query  441  AGAGCACCCCACAGTTCCACTCAAGGATGTGGTGGAACAGCACAAGGCCTCGCTCCAGGTCCAGCTGGATGCTG  514
            .||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct  519  GGAGCACCCCACAGTCCCGCTGAAGGATGTGGTGGAGCAGCACAAGGCCTCGCTCCAGGTCCAGCTGGACGCAG  592

Query  515  TCAACAAAAGGCTCCCAGAAATAGATTCTGCTCTTCAGTTCATCTCTGAAATCATTCATCAGTTAACCAACCAA  588
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCAACAAAAGACTCCCAGAAATAGATTCTGCTCTTCAGTTCATCTCAGAAATCATCCATCAGTTAACCAACCAA  666

Query  589  AAGGCCAGCATCGTGGATGACATTCATTCCACCTTTGATGAGCTCCAGAAGACTTTAAATGTGCGCAAGAGTGT  662
            |||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct  667  AAGGCCAGCATTGTGGATGACATCCACTCCACCTTTGATGAGCTGCAGAAGACTTTAAATGTTCGCAAGAGCGT  740

Query  663  GCTGCTTATGGAATTGGAGGTCAACTATGGCCTCAAACACAAAGTCCTCCAGTCGCAGCTGGATACTCTGCTCC  736
            ||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  741  GCTGCTCATGGAGTTGGAGGTCAACTATGGTCTCAAACACAAAGTGCTGCAGTCGCAGCTGGATACCCTGCTCC  814

Query  737  AGGGGCAGGAGAGCATTAAGAGCTGCAGCAACTTCACAGCGCAGGCCCTCAACCATGGCACGGAGACCGAGGTC  810
            |.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.
Sbjct  815  AAGGCCAGGAAAGCATTAAGAGCTGCAGCAACTTCACGGCTCAGGCCCTCAACCATGGCACGGAGACGGAGGTG  888

Query  811  CTACTGGTGAAGAAGCAGATGAGCGAGAAGCTGAACGAGCTGGCCGACCAGGACTTCCCCTTGCACCCGCGGGA  884
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||..||||||||||.||
Sbjct  889  CTGCTGGTGAAGAAGCAGATGAGCGAGAAGCTGAACGAACTGGCGGACCAGGACTTCCCACTGCACCCGCGCGA  962

Query  885  GAACGACCAGCTGGATTTCATCGTGGAAACCGAGGGGCTGAAGAAGTCCATCCACAACCTCGGGACGATCTTAA  958
            ||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.|||.|.|
Sbjct  963  GAACGACCAGCTGGATTTTATCGTGGAAACGGAGGGACTGAAGAAGTCTATCCACAACCTGGGGACCATCCTCA  1036

Query  959  CCACCAACGCCGTTGCCTCAGAGACAGTGGCCACGGGCGAGGGGCTGCGGCAGACCATCATCGGGCAGCCCATG  1032
            ||||.|||||.||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CCACTAACGCGGTCGCCTCTGAGACGGTGGCCACGGGGGAGGGGCTGCGGCAGACCATCATCGGGCAGCCCATG  1110

Query 1033  TCCGTCACCATCACCACCAAGGACAAAGACGGTGAGCTGTGCAAAACCGGCAACGCCTACCTCACCGCCGAACT  1106
            |||||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.||
Sbjct 1111  TCCGTTACTATAACCACCAAGGACAAAGACGGAGAGCTGTGCAAGACAGGCAACGCATACCTCACCGCTGAGCT  1184

Query 1107  GAGCACCCCCGACGGGAGCGTGGCAGACGGGGAGATCCTGGACAACAAGAACGGCACCTATGAGTTTTTGTACA  1180
            .||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|
Sbjct 1185  CAGCACCCCGGACGGCAGCGTGGCCGACGGAGAGATCCTGGACAACAAGAACGGCACCTACGAGTTCTTGTATA  1258

Query 1181  CTGTCCAGAAGGAAGGGGACTTTACCCTGTCTCTGAGACTCTATGACCAGCACATCCGAGGCAGCCCGTTTAAG  1254
            ||||.||||||||.||||||||.||||||||.||.||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CTGTGCAGAAGGAGGGGGACTTCACCCTGTCCCTCAGGCTCTACGACCAGCATATCCGAGGCAGCCCGTTTAAG  1332

Query 1255  CTGAAAGTGATCCGATCCGCTGATGTGTCTCCCACCACAGAAGGCGTGAAGAGGCGCGTTAAGTCCCCGGGGAG  1328
            ||.||.||.|||||.||.||.||.|||||.||||||||.||.|||||||||.|.||.||.||||||||||||||
Sbjct 1333  CTCAAGGTCATCCGCTCTGCCGACGTGTCCCCCACCACCGAGGGCGTGAAGCGACGAGTCAAGTCCCCGGGGAG  1406

Query 1329  CGGCCACGTCAAGCAGAAAGCTGTGAAAAGACCCGCAAGCATGTACAGCACTGGAAAACGAAAAGAGAATCCCA  1402
            |||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||
Sbjct 1407  CGGGCACGTCAAGCAGAAGGCTGTGAAGAGACCTGCCAGCATGTACAGCACCGGCAAGCGAAAAGAGAACCCCA  1480

Query 1403  TCGAAGACGATTTGATCTTTCGAGTGGGTACCAAAGGAAGAAATAAAGGAGAGTTTACAAATCTTCAGGGGGTA  1476
            ||||.|||||..|||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||.||.
Sbjct 1481  TCGAGGACGACCTGATCTTCCGAGTCGGTACCAAAGGAAGAAACAAAGGAGAATTTACAAACCTGCAGGGTGTG  1554

Query 1477  GCTGCATCTACAAATGGAAAGATATTAATTGCAGACAGTAACAACCAATGTGTGCAGATATTTTCCAATGATGG  1550
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1555  GCTGCATCTACAAGTGGAAAGATATTAATTGCAGATAGTAACAACCAGTGTGTGCAGATCTTTTCCAATGATGG  1628

Query 1551  CCAGTTCAAAAGTCGTTTTGGCATACGGGGACGCTCTCCGGGGCAGCTGCAGCGGCCCACAGGAGTGGCTGTAC  1624
            .|||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||.||.||.|||||.|||||||||||.||.||.||.||.|
Sbjct 1629  ACAGTTCAAAAGTCGTTTCGGCATCCGAGGACGATCACCCGGACAGCTCCAGCGGCCCACGGGGGTAGCGGTGC  1702

Query 1625  ATCCCAGTGGGGACATAATCATTGCCGATTATGATAATAAATGGGTCAGCATTTTCTCCTCCGATGGGAAATTT  1698
            |.||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.||.|||||.||||||||||||...||||||||.|||
Sbjct 1703  ACCCCAGTGGGGACATCATCATTGCAGATTATGACAACAAGTGGGTTAGCATTTTCTCCAATGATGGGAAGTTT  1776

Query 1699  AAGACAAAAATTGGATCAGGAAAGCTGATGGGACCCAAAGGAGTTTCTGTGGACCGCAATGGGCACATTATTGT  1772
            |||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  AAGACAAAAATTGGATCAGGAAAACTGATGGGGCCCAAAGGAGTTTCTGTGGACCGCAATGGGCACATTATTGT  1850

Query 1773  TGTGGACAACAAGGCGTGCTGCGTGTTTATCTTCCAGCCAAACGGGAAAATAGTCACCAGGTTTGGTAGCCGAG  1846
            .||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GGTGGACAACAAGGCGTGCTGTGTGTTTATCTTCCAGCCCAACGGGAAAATAGTCACCAGGTTTGGTAGCCGAG  1924

Query 1847  GAAATGGGGACAGGCAGTTTGCAGGTCCCCATTTTGCAGCTGTAAATAGCAATAATGAGATTATTATTACAGAT  1920
            ||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 1925  GAAACGGGGACAGGCAGTTTGCAGGTCCCCACTTTGCAGCTGTGAATAGCAATAATGAGATCATCATTACAGAT  1998

Query 1921  TTCCATAATCATTCTGTCAAGGTGTTTAATCAGGAAGGAGAATTCATGTTGAAGTTTGGCTCAAATGGAGAAGG  1994
            |||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1999  TTCCATAATCACTCTGTCAAGGTATTTAATCAGGAAGGAGAATTCATGTTGAAGTTTGGCTCCAATGGAGAAGG  2072

Query 1995  AAATGGGCAGTTTAATGCTCCAACAGGTGTAGCAGTGGATTCAAATGGAAACATCATTGTGGCCGACTGGGGAA  2068
            ||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct 2073  AAATGGGCAGTTTAATGCACCAACAGGTGTGGCCGTGGACTCAAATGGGAACATCATTGTGGCTGACTGGGGGA  2146

Query 2069  ACAGCAGGATCCAGGTTTTTGATGGGAGTGGATCATTTTTGTCCTACATTAACACATCTGCTGACCCACTCTAT  2142
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct 2147  ACAGCAGGATCCAGGTTTTTGATGGGAGTGGATCATTTTTGTCCTATATCAACACATCTGCTGACCCGCTCTAT  2220

Query 2143  GGCCCCCAAGGCCTGGCCCTAACTTCAGATGGTCATGTTGTGGTTGCAGACTCTGGAAATCACTGTTTCAAAGT  2216
            ||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||
Sbjct 2221  GGCCCCCAGGGCCTGGCTCTCACTTCAGATGGCCATGTTGTGGTTGCAGACTCCGGAAACCACTGTTTCAAGGT  2294

Query 2217  CTATCGATACTTACAG  2232
            |||.||.|||||||||
Sbjct 2295  CTACCGGTACTTACAG  2310