Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_02752
- Subject:
- XM_011240298.2
- Aligned Length:
- 2298
- Identities:
- 2030
- Gaps:
- 66
Alignment
Query 1 ------------------------------------------------------ATGGCCAGTGAAGGCACCAA 20
|||||||||||.|||.|||.
Sbjct 1 ATGCAGCAGCGTGCAGGGTCGAGGACAGCCGGCCCCCCATGTCAGTGGTCTAGGATGGCCAGTGAGGGCGCCAG 74
Query 21 CATCCCAAGTCCTGTGGTGCGCCAGATTGACAAGCAGTTTCTGATTTGCAGTATATGCCTGGAACGGTACAAGA 94
||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CATCCCAAGTCCCGTGGTGCGCCAGATTGACAAGCAGTTTCTGATCTGCAGTATATGCCTGGAACGGTACAAGA 148
Query 95 ATCCCAAGGTTCTCCCCTGTCTGCACACTTTCTGCGAGAGGTGCCTGCAGAACTACATTCCTGCCCACAGTTTA 168
|.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 149 ACCCCAAGGTCCTGCCCTGTCTGCACACTTTCTGCGAGAGGTGCCTGCAGAACTACATCCCAGCCCACAGTTTA 222
Query 169 ACCCTCTCCTGCCCAGTGTGCCGCCAGACCTCCATCCTGCCCGAGAAAGGGGTGGCCGCGCTCCAGAACAATTT 242
||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||
Sbjct 223 ACCCTCTCCTGCCCGGTGTGTCGCCAGACATCCATCCTGCCCGAGAAAGGGGTGGCCGCACTTCAGAACAACTT 296
Query 243 CTTCATCACAAACCTGATGGACGTGCTGCAGCGAACTCCAGGCAGCAACGCTGAGGAGTCTTCCATCCTGGAGA 316
|||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||||..|||||.||||||||||||||||
Sbjct 297 CTTTATCACGAACCTCATGGATGTGCTGCAGCGGACGCCAGGCAGCAACGGCGAGGACTCTTCCATCCTGGAGA 370
Query 317 CAGTCACTGCTGTGGCTGCGGGAAAGCCTCTCTCTTGCCCAAACCACGATGGGAATGTGATGGAATTTTACTGC 390
|.|||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CGGTCACCGCTGTGGCTGCAGGAAAGCCTCTTTCGTGCCCAAACCATGATGGAAATGTGATGGAATTTTACTGC 444
Query 391 CAGTCCTGTGAGACTGCCATGTGTCGGGAGTGCACGGAGGGGGAGCACGCAGAGCACCCCACAGTTCCACTCAA 464
||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.||
Sbjct 445 CAGTCCTGTGAGACCGCCATGTGTCGGGAGTGCACGGAGGGGGAGCACGCGGAGCACCCCACAGTCCCGCTGAA 518
Query 465 GGATGTGGTGGAACAGCACAAGGCCTCGCTCCAGGTCCAGCTGGATGCTGTCAACAAAAGGCTCCCAGAAATAG 538
||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 519 GGATGTGGTGGAGCAGCACAAGGCCTCGCTCCAGGTCCAGCTGGACGCAGTCAACAAAAGACTCCCAGAAATAG 592
Query 539 ATTCTGCTCTTCAGTTCATCTCTGAAATCATTCATCAGTTAACCAACCAAAAGGCCAGCATCGTGGATGACATT 612
||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 593 ATTCTGCTCTTCAGTTCATCTCAGAAATCATCCATCAGTTAACCAACCAAAAGGCCAGCATTGTGGATGACATC 666
Query 613 CATTCCACCTTTGATGAGCTCCAGAAGACTTTAAATGTGCGCAAGAGTGTGCTGCTTATGGAATTGGAGGTCAA 686
||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 667 CACTCCACCTTTGATGAGCTGCAGAAGACTTTAAATGTTCGCAAGAGCGTGCTGCTCATGGAGTTGGAGGTCAA 740
Query 687 CTATGGCCTCAAACACAAAGTCCTCCAGTCGCAGCTGGATACTCTGCTCCAGGGGCAGGAGAGCATTAAGAGCT 760
||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 741 CTATGGTCTCAAACACAAAGTGCTGCAGTCGCAGCTGGATACCCTGCTCCAAGGCCAGGAAAGCATTAAGAGCT 814
Query 761 GCAGCAACTTCACAGCGCAGGCCCTCAACCATGGCACGGAGACCGAGGTCCTACTGGTGAAGAAGCAGATGAGC 834
|||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GCAGCAACTTCACGGCTCAGGCCCTCAACCATGGCACGGAGACGGAGGTGCTGCTGGTGAAGAAGCAGATGAGC 888
Query 835 GAGAAGCTGAACGAGCTGGCCGACCAGGACTTCCCCTTGCACCCGCGGGAGAACGACCAGCTGGATTTCATCGT 908
||||||||||||||.|||||.||||||||||||||..||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 889 GAGAAGCTGAACGAACTGGCGGACCAGGACTTCCCACTGCACCCGCGCGAGAACGACCAGCTGGATTTTATCGT 962
Query 909 GGAAACCGAGGGGCTGAAGAAGTCCATCCACAACCTCGGGACGATCTTAACCACCAACGCCGTTGCCTCAGAGA 982
||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.|||.|.|||||.|||||.||.|||||.||||
Sbjct 963 GGAAACGGAGGGACTGAAGAAGTCTATCCACAACCTGGGGACCATCCTCACCACTAACGCGGTCGCCTCTGAGA 1036
Query 983 CAGTGGCCACGGGCGAGGGGCTGCGGCAGACCATCATCGGGCAGCCCATGTCCGTCACCATCACCACCAAGGAC 1056
|.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||
Sbjct 1037 CGGTGGCCACGGGGGAGGGGCTGCGGCAGACCATCATCGGGCAGCCCATGTCCGTTACTATAACCACCAAGGAC 1110
Query 1057 AAAGACGGTGAGCTGTGCAAAACCGGCAACGCCTACCTCACCGCCGAACTGAGCACCCCCGACGGGAGCGTGGC 1130
||||||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 1111 AAAGACGGAGAGCTGTGCAAGACAGGCAACGCATACCTCACCGCTGAGCTCAGCACCCCGGACGGCAGCGTGGC 1184
Query 1131 AGACGGGGAGATCCTGGACAACAAGAACGGCACCTATGAGTTTTTGTACACTGTCCAGAAGGAAGGGGACTTTA 1204
.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||.|
Sbjct 1185 CGACGGAGAGATCCTGGACAACAAGAACGGCACCTACGAGTTCTTGTATACTGTGCAGAAGGAGGGGGACTTCA 1258
Query 1205 CCCTGTCTCTGAGACTCTATGACCAGCACATCCGAGGCAGCCCGTTTAAGCTGAAAGTGATCCGATCCGCTGAT 1278
|||||||.||.||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||.||.||.
Sbjct 1259 CCCTGTCCCTCAGGCTCTACGACCAGCATATCCGAGGCAGCCCGTTTAAGCTCAAGGTCATCCGCTCTGCCGAC 1332
Query 1279 GTGTCTCCCACCACAGAAGGCGTGAAGAGGCGCGTTAAGTCCCCGGGGAGCGGCCACGTCAAGCAGAAAGCTGT 1352
|||||.||||||||.||.|||||||||.|.||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||
Sbjct 1333 GTGTCCCCCACCACCGAGGGCGTGAAGCGACGAGTCAAGTCCCCGGGGAGCGGGCACGTCAAGCAGAAGGCTGT 1406
Query 1353 GAAAAGACCCGCAAGCATGTACAGCACTGGAAAACGAAAAGAGAATCCCATCGAAGACGATTTGATCTTTCGAG 1426
|||.|||||.||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||.|||||..|||||||.||||
Sbjct 1407 GAAGAGACCTGCCAGCATGTACAGCACCGGCAAGCGAAAAGAGAACCCCATCGAGGACGACCTGATCTTCCGAG 1480
Query 1427 TGGGTACCAAAGGAAGAAATAAAGGAGAGTTTACAAATCTTCAGGGGGTAGCTGCATCTACAAATGGAAAGATA 1500
|.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||.||.|||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1481 TCGGTACCAAAGGAAGAAACAAAGGAGAATTTACAAACCTGCAGGGTGTGGCTGCATCTACAAGTGGAAAGATA 1554
Query 1501 TTAATTGCAGACAGTAACAACCAATGTGTGCAGATATTTTCCAATGATGGCCAGTTCAAAAGTCGTTTTGGCAT 1574
|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1555 TTAATTGCAGATAGTAACAACCAGTGTGTGCAGATCTTTTCCAATGATGGACAGTTCAAAAGTCGTTTCGGCAT 1628
Query 1575 ACGGGGACGCTCTCCGGGGCAGCTGCAGCGGCCCACAGGAGTGGCTGTACATCCCAGTGGGGACATAATCATTG 1648
.||.|||||.||.||.||.|||||.|||||||||||.||.||.||.||.||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1629 CCGAGGACGATCACCCGGACAGCTCCAGCGGCCCACGGGGGTAGCGGTGCACCCCAGTGGGGACATCATCATTG 1702
Query 1649 CCGATTATGATAATAAATGGGTCAGCATTTTCTCCTCCGATGGGAAATTTAAGACAAAAATTGGATCAGGAAAG 1722
|.||||||||.||.||.|||||.||||||||||||...||||||||.||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1703 CAGATTATGACAACAAGTGGGTTAGCATTTTCTCCAATGATGGGAAGTTTAAGACAAAAATTGGATCAGGAAAA 1776
Query 1723 CTGATGGGACCCAAAGGAGTTTCTGTGGACCGCAATGGGCACATTATTGTTGTGGACAACAAGGCGTGCTGCGT 1796
||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1777 CTGATGGGGCCCAAAGGAGTTTCTGTGGACCGCAATGGGCACATTATTGTGGTGGACAACAAGGCGTGCTGTGT 1850
Query 1797 GTTTATCTTCCAGCCAAACGGGAAAATAGTCACCAGGTTTGGTAGCCGAGGAAATGGGGACAGGCAGTTTGCA- 1869
|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1851 GTTTATCTTCCAGCCCAACGGGAAAATAGTCACCAGGTTTGGTAGCCGAGGAAACGGGGACAGGCAGTTTGCAG 1924
Query 1870 -----------GGTCCCCATTTTGCAGCTGTAAATAGCAATAATGAGATTATTATTACAGATTTCCATAATCAT 1932
||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 1925 GTACACTCGATGGTCCCCACTTTGCAGCTGTGAATAGCAATAATGAGATCATCATTACAGATTTCCATAATCAC 1998
Query 1933 TCTGTCAAGGTGTTTAATCAGGAAGGAGAATTCATGTTGAAGTTTGGCTCAAATGGAGAAGGAAATGGGCAGTT 2006
|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 TCTGTCAAGGTATTTAATCAGGAAGGAGAATTCATGTTGAAGTTTGGCTCCAATGGAGAAGGAAATGGGCAGTT 2072
Query 2007 TAATGCTCCAACAGGTGTAGCAGTGGATTCAAATGGAAACATCATTGTGGCCGACTGGGGAAACAGCAGGATCC 2080
||||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct 2073 TAATGCACCAACAGGTGTGGCCGTGGACTCAAATGGGAACATCATTGTGGCTGACTGGGGGAACAGCAGGATCC 2146
Query 2081 AGGTTTTTGATGGGAGTGGATCATTTTTGTCCTACATTAACACATCTGCTGACCCACTCTATGGCCCCCAAGGC 2154
||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||
Sbjct 2147 AGGTTTTTGATGGGAGTGGATCATTTTTGTCCTATATCAACACATCTGCTGACCCGCTCTATGGCCCCCAGGGC 2220
Query 2155 CTGGCCCTAACTTCAGATGGTCATGTTGTGGTTGCAGACTCTGGAAATCACTGTTTCAAAGTCTATCGATACTT 2228
|||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.|||||
Sbjct 2221 CTGGCTCTCACTTCAGATGGCCATGTTGTGGTTGCAGACTCCGGAAACCACTGTTTCAAGGTCTACCGGTACTT 2294
Query 2229 ACAG 2232
||||
Sbjct 2295 ACAG 2298