Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02752
• Subject: XM_011240299.2
• Aligned Length: 2295
• Identities: 2030
• Gaps: 63

Alignment

Query    1  ---------------------------------------------------ATGGCCAGTGAAGGCACCAACAT  23
                                                               |||||||||||.|||.|||.|||
Sbjct    1  ATGCAGCGTGCAGGGTCGAGGACAGCCGGCCCCCCATGTCAGTGGTCTAGGATGGCCAGTGAGGGCGCCAGCAT  74

Query   24  CCCAAGTCCTGTGGTGCGCCAGATTGACAAGCAGTTTCTGATTTGCAGTATATGCCTGGAACGGTACAAGAATC  97
            |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct   75  CCCAAGTCCCGTGGTGCGCCAGATTGACAAGCAGTTTCTGATCTGCAGTATATGCCTGGAACGGTACAAGAACC  148

Query   98  CCAAGGTTCTCCCCTGTCTGCACACTTTCTGCGAGAGGTGCCTGCAGAACTACATTCCTGCCCACAGTTTAACC  171
            |||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct  149  CCAAGGTCCTGCCCTGTCTGCACACTTTCTGCGAGAGGTGCCTGCAGAACTACATCCCAGCCCACAGTTTAACC  222

Query  172  CTCTCCTGCCCAGTGTGCCGCCAGACCTCCATCCTGCCCGAGAAAGGGGTGGCCGCGCTCCAGAACAATTTCTT  245
            |||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||
Sbjct  223  CTCTCCTGCCCGGTGTGTCGCCAGACATCCATCCTGCCCGAGAAAGGGGTGGCCGCACTTCAGAACAACTTCTT  296

Query  246  CATCACAAACCTGATGGACGTGCTGCAGCGAACTCCAGGCAGCAACGCTGAGGAGTCTTCCATCCTGGAGACAG  319
            .|||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||||..|||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct  297  TATCACGAACCTCATGGATGTGCTGCAGCGGACGCCAGGCAGCAACGGCGAGGACTCTTCCATCCTGGAGACGG  370

Query  320  TCACTGCTGTGGCTGCGGGAAAGCCTCTCTCTTGCCCAAACCACGATGGGAATGTGATGGAATTTTACTGCCAG  393
            ||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCACCGCTGTGGCTGCAGGAAAGCCTCTTTCGTGCCCAAACCATGATGGAAATGTGATGGAATTTTACTGCCAG  444

Query  394  TCCTGTGAGACTGCCATGTGTCGGGAGTGCACGGAGGGGGAGCACGCAGAGCACCCCACAGTTCCACTCAAGGA  467
            |||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||
Sbjct  445  TCCTGTGAGACCGCCATGTGTCGGGAGTGCACGGAGGGGGAGCACGCGGAGCACCCCACAGTCCCGCTGAAGGA  518

Query  468  TGTGGTGGAACAGCACAAGGCCTCGCTCCAGGTCCAGCTGGATGCTGTCAACAAAAGGCTCCCAGAAATAGATT  541
            |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  519  TGTGGTGGAGCAGCACAAGGCCTCGCTCCAGGTCCAGCTGGACGCAGTCAACAAAAGACTCCCAGAAATAGATT  592

Query  542  CTGCTCTTCAGTTCATCTCTGAAATCATTCATCAGTTAACCAACCAAAAGGCCAGCATCGTGGATGACATTCAT  615
            |||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.
Sbjct  593  CTGCTCTTCAGTTCATCTCAGAAATCATCCATCAGTTAACCAACCAAAAGGCCAGCATTGTGGATGACATCCAC  666

Query  616  TCCACCTTTGATGAGCTCCAGAAGACTTTAAATGTGCGCAAGAGTGTGCTGCTTATGGAATTGGAGGTCAACTA  689
            |||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct  667  TCCACCTTTGATGAGCTGCAGAAGACTTTAAATGTTCGCAAGAGCGTGCTGCTCATGGAGTTGGAGGTCAACTA  740

Query  690  TGGCCTCAAACACAAAGTCCTCCAGTCGCAGCTGGATACTCTGCTCCAGGGGCAGGAGAGCATTAAGAGCTGCA  763
            |||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct  741  TGGTCTCAAACACAAAGTGCTGCAGTCGCAGCTGGATACCCTGCTCCAAGGCCAGGAAAGCATTAAGAGCTGCA  814

Query  764  GCAACTTCACAGCGCAGGCCCTCAACCATGGCACGGAGACCGAGGTCCTACTGGTGAAGAAGCAGATGAGCGAG  837
            ||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GCAACTTCACGGCTCAGGCCCTCAACCATGGCACGGAGACGGAGGTGCTGCTGGTGAAGAAGCAGATGAGCGAG  888

Query  838  AAGCTGAACGAGCTGGCCGACCAGGACTTCCCCTTGCACCCGCGGGAGAACGACCAGCTGGATTTCATCGTGGA  911
            |||||||||||.|||||.||||||||||||||..||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  889  AAGCTGAACGAACTGGCGGACCAGGACTTCCCACTGCACCCGCGCGAGAACGACCAGCTGGATTTTATCGTGGA  962

Query  912  AACCGAGGGGCTGAAGAAGTCCATCCACAACCTCGGGACGATCTTAACCACCAACGCCGTTGCCTCAGAGACAG  985
            |||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.|||.|.|||||.|||||.||.|||||.|||||.|
Sbjct  963  AACGGAGGGACTGAAGAAGTCTATCCACAACCTGGGGACCATCCTCACCACTAACGCGGTCGCCTCTGAGACGG  1036

Query  986  TGGCCACGGGCGAGGGGCTGCGGCAGACCATCATCGGGCAGCCCATGTCCGTCACCATCACCACCAAGGACAAA  1059
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||
Sbjct 1037  TGGCCACGGGGGAGGGGCTGCGGCAGACCATCATCGGGCAGCCCATGTCCGTTACTATAACCACCAAGGACAAA  1110

Query 1060  GACGGTGAGCTGTGCAAAACCGGCAACGCCTACCTCACCGCCGAACTGAGCACCCCCGACGGGAGCGTGGCAGA  1133
            |||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||.|||||.||||||||.||
Sbjct 1111  GACGGAGAGCTGTGCAAGACAGGCAACGCATACCTCACCGCTGAGCTCAGCACCCCGGACGGCAGCGTGGCCGA  1184

Query 1134  CGGGGAGATCCTGGACAACAAGAACGGCACCTATGAGTTTTTGTACACTGTCCAGAAGGAAGGGGACTTTACCC  1207
            |||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||.||||
Sbjct 1185  CGGAGAGATCCTGGACAACAAGAACGGCACCTACGAGTTCTTGTATACTGTGCAGAAGGAGGGGGACTTCACCC  1258

Query 1208  TGTCTCTGAGACTCTATGACCAGCACATCCGAGGCAGCCCGTTTAAGCTGAAAGTGATCCGATCCGCTGATGTG  1281
            ||||.||.||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||.||.||.|||
Sbjct 1259  TGTCCCTCAGGCTCTACGACCAGCATATCCGAGGCAGCCCGTTTAAGCTCAAGGTCATCCGCTCTGCCGACGTG  1332

Query 1282  TCTCCCACCACAGAAGGCGTGAAGAGGCGCGTTAAGTCCCCGGGGAGCGGCCACGTCAAGCAGAAAGCTGTGAA  1355
            ||.||||||||.||.|||||||||.|.||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1333  TCCCCCACCACCGAGGGCGTGAAGCGACGAGTCAAGTCCCCGGGGAGCGGGCACGTCAAGCAGAAGGCTGTGAA  1406

Query 1356  AAGACCCGCAAGCATGTACAGCACTGGAAAACGAAAAGAGAATCCCATCGAAGACGATTTGATCTTTCGAGTGG  1429
            .|||||.||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||.|||||..|||||||.|||||.|
Sbjct 1407  GAGACCTGCCAGCATGTACAGCACCGGCAAGCGAAAAGAGAACCCCATCGAGGACGACCTGATCTTCCGAGTCG  1480

Query 1430  GTACCAAAGGAAGAAATAAAGGAGAGTTTACAAATCTTCAGGGGGTAGCTGCATCTACAAATGGAAAGATATTA  1503
            ||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||.||.|||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1481  GTACCAAAGGAAGAAACAAAGGAGAATTTACAAACCTGCAGGGTGTGGCTGCATCTACAAGTGGAAAGATATTA  1554

Query 1504  ATTGCAGACAGTAACAACCAATGTGTGCAGATATTTTCCAATGATGGCCAGTTCAAAAGTCGTTTTGGCATACG  1577
            ||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct 1555  ATTGCAGATAGTAACAACCAGTGTGTGCAGATCTTTTCCAATGATGGACAGTTCAAAAGTCGTTTCGGCATCCG  1628

Query 1578  GGGACGCTCTCCGGGGCAGCTGCAGCGGCCCACAGGAGTGGCTGTACATCCCAGTGGGGACATAATCATTGCCG  1651
            .|||||.||.||.||.|||||.|||||||||||.||.||.||.||.||.||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct 1629  AGGACGATCACCCGGACAGCTCCAGCGGCCCACGGGGGTAGCGGTGCACCCCAGTGGGGACATCATCATTGCAG  1702

Query 1652  ATTATGATAATAAATGGGTCAGCATTTTCTCCTCCGATGGGAAATTTAAGACAAAAATTGGATCAGGAAAGCTG  1725
            |||||||.||.||.|||||.||||||||||||...||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1703  ATTATGACAACAAGTGGGTTAGCATTTTCTCCAATGATGGGAAGTTTAAGACAAAAATTGGATCAGGAAAACTG  1776

Query 1726  ATGGGACCCAAAGGAGTTTCTGTGGACCGCAATGGGCACATTATTGTTGTGGACAACAAGGCGTGCTGCGTGTT  1799
            |||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1777  ATGGGGCCCAAAGGAGTTTCTGTGGACCGCAATGGGCACATTATTGTGGTGGACAACAAGGCGTGCTGTGTGTT  1850

Query 1800  TATCTTCCAGCCAAACGGGAAAATAGTCACCAGGTTTGGTAGCCGAGGAAATGGGGACAGGCAGTTTGCA----  1869
            ||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||    
Sbjct 1851  TATCTTCCAGCCCAACGGGAAAATAGTCACCAGGTTTGGTAGCCGAGGAAACGGGGACAGGCAGTTTGCAGGTA  1924

Query 1870  --------GGTCCCCATTTTGCAGCTGTAAATAGCAATAATGAGATTATTATTACAGATTTCCATAATCATTCT  1935
                    ||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1925  CACTCGATGGTCCCCACTTTGCAGCTGTGAATAGCAATAATGAGATCATCATTACAGATTTCCATAATCACTCT  1998

Query 1936  GTCAAGGTGTTTAATCAGGAAGGAGAATTCATGTTGAAGTTTGGCTCAAATGGAGAAGGAAATGGGCAGTTTAA  2009
            ||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GTCAAGGTATTTAATCAGGAAGGAGAATTCATGTTGAAGTTTGGCTCCAATGGAGAAGGAAATGGGCAGTTTAA  2072

Query 2010  TGCTCCAACAGGTGTAGCAGTGGATTCAAATGGAAACATCATTGTGGCCGACTGGGGAAACAGCAGGATCCAGG  2083
            |||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 2073  TGCACCAACAGGTGTGGCCGTGGACTCAAATGGGAACATCATTGTGGCTGACTGGGGGAACAGCAGGATCCAGG  2146

Query 2084  TTTTTGATGGGAGTGGATCATTTTTGTCCTACATTAACACATCTGCTGACCCACTCTATGGCCCCCAAGGCCTG  2157
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||
Sbjct 2147  TTTTTGATGGGAGTGGATCATTTTTGTCCTATATCAACACATCTGCTGACCCGCTCTATGGCCCCCAGGGCCTG  2220

Query 2158  GCCCTAACTTCAGATGGTCATGTTGTGGTTGCAGACTCTGGAAATCACTGTTTCAAAGTCTATCGATACTTACA  2231
            ||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||||||||
Sbjct 2221  GCTCTCACTTCAGATGGCCATGTTGTGGTTGCAGACTCCGGAAACCACTGTTTCAAGGTCTACCGGTACTTACA  2294

Query 2232  G  2232
            |
Sbjct 2295  G  2295