Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02757
• Subject: NM_001130722.3
• Aligned Length: 1847
• Identities: 1497
• Gaps: 337

Alignment

Query    1  ATGTCGGTGCAGGTTGTGTCAGCCGCGGCTGCCGCCAAGGTGCCTGAGGTGGAGCTGAAGGACCTGAGCCCCTC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CGAGGCGGAGTCGCAACTAGGACTGAGCACGGCCGCCGTGGGCGCCATGGCCCCCCCGGCGGGCGGTGGAGACC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CTGAGGCTCCAGCTCCCGCCGCGGAGCGGCCCCCGGTCCCCGGCCCGGGCTCGGGGCCCGCCGCCGCTCTCAGC  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  CCCGCCGCCGGGAAGGTGCCTCAGGCGTCGGCCATGAAGCGGAGCGACCCACATCACCAGCACCAGCGGCACCG  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  CGACGGCGGCGAGGCCCTGGTCAGCCCCGACG-------GCACCGTCACCGAGGCGCCGCGCACAGTC------  357
                       |.|  ||||.||||    |.|       .||..||.|..|         ||| |.||      
Sbjct    1  -----------ATG--CTGGGCAGC----AAGAAGAAATACATTGTTAATG---------GCA-ACTCTGGGAT  47

Query  358  -AAGAAGCAGATCCAGTTTGCTGACCAGAAGCAAGAATTCAACAAACGTCCCACCAAAATTGGACGTCGCTCTT  430
             |||...|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   48  TAAGGCCCAGATCCAGTTTGCTGACCAGAAGCAAGAATTCAACAAACGTCCCACCAAAATTGGACGTCGCTCTT  121

Query  431  TGTCTCGTTCCATTTCTCAGTCATCTACTGACAGCTACAGCTCAGCGGCTTCATATACAGATAGCTCTGATGAT  504
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  122  TGTCTCGTTCCATTTCTCAGTCATCTACTGACAGCTACAGCTCAGCGGCTTCATATACAGATAGCTCTGATGAT  195

Query  505  GAGACATCGCCCAGGGACAAGCAGCAAAAGAACTCTAAGGGAAGCAGTGACTTCTGTGTTAAGAACATCAAACA  578
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  196  GAGACATCGCCCAGGGACAAGCAGCAAAAGAACTCTAAGGGAAGCAGTGACTTCTGTGTTAAGAACATCAAACA  269

Query  579  GGCAGAGTTTGGACGAAGAGAAATTGAAATTGCTGAACAAGAAATGCCTGCATTGATGGCTTTGAGGAAGAGAG  652
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  270  GGCAGAGTTTGGACGAAGAGAAATTGAAATTGCTGAACAAGAAATGCCTGCATTGATGGCTTTGAGGAAGAGAG  343

Query  653  CTCAAGGAGAAAAGCCTTTGGCTGGAGCCAAAATCGTGGGTTGCACACACATCACTGCTCAGACTGCTGTGCTT  726
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  344  CTCAAGGAGAAAAGCCTTTGGCTGGAGCCAAAATCGTGGGTTGCACACACATCACTGCTCAGACTGCTGTGCTT  417

Query  727  ATGGAAACTCTGGGTGCTCTGGGGGCCCAGTGCCGATGGGCTGCCTGCAACATCTATTCCACTCTCAATGAAGT  800
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  418  ATGGAAACTCTGGGTGCTCTGGGGGCCCAGTGCCGATGGGCTGCCTGCAACATCTATTCCACTCTCAATGAAGT  491

Query  801  GGCTGCTGCTCTAGCAGAAAGTGGATTTCCTGTTTTTGCCTGGAAGGGAGAGTCAGAAGATGACTTTTGGTGGT  874
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  492  GGCTGCTGCTCTAGCAGAAAGTGGATTTCCTGTTTTTGCCTGGAAGGGAGAGTCAGAAGATGACTTTTGGTGGT  565

Query  875  GTATCGATAGATGTGTGAATGTGGAGGGCTGGCAGCCAAACATGATCTTGGATGATGGAGGGGATCTTACCCAC  948
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  566  GTATCGATAGATGTGTGAATGTGGAGGGCTGGCAGCCAAACATGATCTTGGATGATGGAGGGGATCTTACCCAC  639

Query  949  TGGATTTATAAAAAGTATCCCAACATGTTTAAGAAAATCAAGGGCATAGTAGAGGAGAGTGTTACTGGAGTTCA  1022
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  640  TGGATTTATAAAAAGTATCCCAACATGTTTAAGAAAATCAAGGGCATAGTAGAGGAGAGTGTTACTGGAGTTCA  713

Query 1023  CAGGCTGTACCAACTGTCCAAAGCTGGGAAGCTGTGTGTTCCAGCCATGAATGTCAATGACTCAGTCACCAAAC  1096
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  714  CAGGCTGTACCAACTGTCCAAAGCTGGGAAGCTGTGTGTTCCAGCCATGAATGTCAATGACTCAGTCACCAAAC  787

Query 1097  AGAAATTTGACAACCTCTACTGTTGCCGTGAATCAATTCTTGATGGACTTAAAAGGACAACAGACATGATGTTT  1170
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  788  AGAAATTTGACAACCTCTACTGTTGCCGTGAATCAATTCTTGATGGACTTAAAAGGACAACAGACATGATGTTT  861

Query 1171  GGTGGAAAGCAAGTGGTAGTCTGTGGCTATGGAGAGGTGGGGAAAGGGTGCTGTGCTGCCCTGAAAGCCATGGG  1244
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  862  GGTGGAAAGCAAGTGGTAGTCTGTGGCTATGGAGAGGTGGGGAAAGGGTGCTGTGCTGCCCTGAAAGCCATGGG  935

Query 1245  CTCCATTGTGTATGTAACTGAAATTGACCCCATCTGTGCCCTGCAAGCCTGTATGGATGGATTTCGACTGGTGA  1318
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  936  CTCCATTGTGTATGTAACTGAAATTGACCCCATCTGTGCCCTGCAAGCCTGTATGGATGGATTTCGACTGGTGA  1009

Query 1319  AATTAAATGAGGTCATCCGACAAGTGGACATTGTTATTACCTGTACAGGTAACAAGAATGTGGTAACCAGAGAG  1392
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1010  AATTAAATGAGGTCATCCGACAAGTGGACATTGTTATTACCTGTACAGGTAACAAGAATGTGGTAACCAGAGAG  1083

Query 1393  CACTTGGACCGTATGAAGAATAGCTGCATCGTTTGTAACATGGGACATTCCAACACAGAGATTGACGTGGCGAG  1466
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1084  CACTTGGACCGTATGAAGAATAGCTGCATCGTTTGTAACATGGGACATTCCAACACAGAGATTGACGTGGCGAG  1157

Query 1467  TCTGCGGACACCAGAACTGACCTGGGAGCGAGTGAGATCTCAAGTTGACCATGTGATATGGCCTGATGGCAAGA  1540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1158  TCTGCGGACACCAGAACTGACCTGGGAGCGAGTGAGATCTCAAGTTGACCATGTGATATGGCCTGATGGCAAGA  1231

Query 1541  GGATAGTACTGCTGGCAGAGGGCCGCCTGCTGAACCTTAGCTGCTCCACAGTGCCTACATTTGTGCTCTCAATC  1614
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1232  GGATAGTACTGCTGGCAGAGGGCCGCCTGCTGAACCTTAGCTGCTCCACAGTGCCTACATTTGTGCTCTCAATC  1305

Query 1615  ACTGCTACTACTCAGGCTCTTGCCTTGATAGAGCTTTACAATGCTCCTGAGGGTCGCTATAAGCAGGATGTCTA  1688
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1306  ACTGCTACTACTCAGGCTCTTGCCTTGATAGAGCTTTACAATGCTCCTGAGGGTCGCTATAAGCAGGATGTCTA  1379

Query 1689  CCTGTTGCCCAAGAAGATGGATGAGTATGTGGCCAGCCTACACCTGCCTACCTTTGATGCCCACTTGACAGAGC  1762
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1380  CCTGTTGCCCAAGAAGATGGATGAGTATGTGGCCAGCCTACACCTGCCTACCTTTGATGCCCACTTGACAGAGC  1453

Query 1763  TGACAGATGAACAGGCCAAGTATCTGGGACTCAACAAGAATGGGCCCTTCAAGCCTAATTACTACAGGTAT  1833
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1454  TGACAGATGAACAGGCCAAGTATCTGGGACTCAACAAGAATGGGCCCTTCAAGCCTAATTACTACAGGTAT  1524