Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_02758
- Subject:
- XM_006513761.1
- Aligned Length:
- 1896
- Identities:
- 1035
- Gaps:
- 756
Alignment
Query 1 ATGCAGCGGGAGGAGGGATTTAACACCAAGATGGCGGACGGCCCGGATGAGTACGATACCGAAGCGGGCTGTGT 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GCCCCTTCTCCACCCAGAGGAAATCAAACCCCAAAGCCATTATAACCATGGATATGGTGAACCTCTTGGACGGA 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 AAACTCATATTGATGATTACAGCACATGGGACATAGTCAAGGCTACACAATATGGAATATATGAACGCTGTCGA 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 GAATTGGTGGAAGCAGGTTATGATGTACGGCAACCGGACAAAGAAAATGTTACCCTCCTCCATTGGGCTGCCAT 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 CAATAACAGAATAGATTTAGTCAAATACTATATTTCGAAAGGTGCTATTGTGGATCAACTTGGAGGGGACCTGA 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 ATTCAACTCCATTGCACTGGGCCACAAGACAAGGCCATCTATCCATGGTTGTGCAACTAATGAAATATGGTGCA 444
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 445 GATCCTTCATTAATTGATGGAGAAGGATGTAGCTGTATTCATCTGGCTGCTCAGTTCGGACATACCTCAATTGT 518
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 519 TGCTTATCTCATAGCAAAAGGACAGGATGTAGATATGATGGATCAGAATGGAATGACGCCTTTAATGTGGGCAG 592
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 593 CATATAGAACACATAGTGTGGATCCAACTAGATTGCTTTTAACATTCAATGTTTCAGTTAACCTTGGTGACAAG 666
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 667 TATCACAAAAACACTGCTCTGCATTGGGCAGTGCTAGCAGGGAATACCACAGTCATTAGCCTTCTTCTGGAAGC 740
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 741 TGGAGCTAATGTTGATGCCCAGAATATCAAGGGCGAATCAGCGCTTGATTTGGCAAAACAGAGAAAAAATGTGT 814
|||.| .|.|||..||||.||.|||||.||||||||||||||.||.||||||||.||||
Sbjct 1 --------------ATGGC--TATTATTCAGGGTGAGTCAGCACTTGATTTGGCAAAGCAAAGAAAAAACGTGT 58
Query 815 GGATGATCAACCACTTACAAGAGGCAAGGCAAGCAAAAGGATATGACAATCCGTCCTTCCTTAGAAAGCTGAAA 888
|||||||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||.
Sbjct 59 GGATGATCAACCATTTGCAGGAGGCAAGGCAAGCGAAAGGGTATGACAACCCATCCTTCCTCAGAAAGCTGAAG 132
Query 889 GCTGATAAGGAATTTCGGCAGAAAGTAATGTTAGGAACTCCTTTCCTAGTTATTTGGCTGGTTGGGTTTATAGC 962
|||||.||||||||||||||||||||||||.|.|||||.||.|||||.||.||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 133 GCTGACAAGGAATTTCGGCAGAAAGTAATGCTGGGAACCCCATTCCTGGTGATCTGGCTGGTCGGGTTTATAGC 206
Query 963 AGACCTAAATATTGATTCTTGGCTCATTAAAGGGCTAATGTATGGTGGTGTTTGGGCTACAGTACAGTTTCTTT 1036
|||||||.|.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 207 AGACCTAGACATTGATTCTTGGCTCATTAAAGGGTTAATGTATGGTGGCGTTTGGGCTACAGTGCAATTTCTTT 280
Query 1037 CAAAATCCTTTTTCGATCATTCAATGCATAGTGCATTGCCCCTTGGGATATATTTGGCAACCAAATTCTGGATG 1110
|.||.|||||.||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 281 CCAAGTCCTTCTTTGACCATTCAATGCACAGCGCATTGCCCCTTGGGATATATTTGGCAACCAAATTCTGGATG 354
Query 1111 TATGTGACGTGGTTCTTCTGGTTTTGGAATGATCTCAACTTTTTATTTATCCATCTTCCATTCCTTGCCAATAG 1184
||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||..|.||.|||||.||.||.|||||||||||.||
Sbjct 355 TATGTGACATGGTTCTTCTGGTTCTGGAATGATCTCAACTTCCTGTTCATCCACCTCCCCTTCCTTGCCAACAG 428
Query 1185 TGTTGCACTTTTCTACAATTTTGGAAAATCTTGGAAATCAGATCCAGGGATTATTAAAGCAACAGAAGAGCAAA 1258
.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||
Sbjct 429 CGTTGCTCTTTTCTACAATTTTGGAAAGTCTTGGAAATCAGATCCAGGGATTATTAAAGCTACAGAAGAACAAA 502
Query 1259 AGAAAAAGACAATAGTTGAACTTGCAGAGACAGGAAGTCTGGACCTCAGTATATTCTGCAGTACCTGTTTGATA 1332
||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.
Sbjct 503 AGAAAAAGACGATAGTTGAACTTGCAGAGACTGGAAGTCTGGACCTCAGTATATTCTGCAGTACCTGCTTGATT 576
Query 1333 CGAAAACCGGTGAGGTCCAAACATTGTGGTGTGTGCAACCGCTGTATAGCAAAATTTGATCATCATTGCCCATG 1406
||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 577 CGGAAGCCAGTGAGGTCCAAACACTGTGGTGTGTGCAACCGCTGTATAGCGAAATTTGATCACCATTGCCCATG 650
Query 1407 GGTGGGTAACTGTGTAGGTGCAGGCAACCATAGATATTTTATGGGCTACCTATTCTTCTTGCTTTTTATGATCT 1480
|||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct 651 GGTGGGTAACTGTGTAGGTGCAGGCAACCATAGGTACTTTATGGGGTACCTGTTCTTCTTGCTTTTCATGATCT 724
Query 1481 GCTGGATGATTTATGGTTGTATATCTTACTGGGGACTCCACTGTGAGACCACTTACACCAAGGATGGATTTTGG 1554
||||||||||.|||||||||.|.|||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||
Sbjct 725 GCTGGATGATCTATGGTTGTGTCTCTTACTGGGGCCTTCACTGTGAGACCACGTACACCAAGGATGGGTTTTGG 798
Query 1555 ACATACATTACTCAGATTGCCACGTGTTCACCTTGGATGTTTTGGATGTTCCTGAACAGTGTTTTCCACTTCAT 1628
||||||||.||||||||.|||||.||.||.||.||||||||.||||||||.||.||||||||.||.||||||.|
Sbjct 799 ACATACATAACTCAGATCGCCACATGCTCCCCGTGGATGTTCTGGATGTTTCTCAACAGTGTGTTTCACTTCCT 872
Query 1629 GTGGGTGGCTGTATTACTCATGTGTCAGATGTACCAGATATCATGTTTAGGTATTACTACAAATGAAAGAATGA 1702
|||||||||.||..|.||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 873 GTGGGTGGCCGTGCTGCTCATGTGTCAGCTGTACCAGATAACATGTTTAGGTATTACTACAAATGAAAGAATGA 946
Query 1703 ATGCCAGGAGATACAAGCACTTTAAAGTCACAACAACGTCTATTGAAAGCCCATTCAACCATGGATGTGTAAGA 1776
|.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 947 ACGCCAGGAGATACAAGCACTTTAAAGTTACGACAACATCTATTGAAAGCCCATTCAACCATGGATGTGTAAGG 1020
Query 1777 AATATTATAGACTTCTTTGAATTTCGATGCTGTGGCCTCTTTCGTCCTGTTATCGTGGACTGGACCAGGCAGTA 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1021 AATATTATAGACTTCTTTGAATTTCGATGCTGTGGCCTCTTTCGTCCTGTTATCGTGGACTGGACCAGGCAGTA 1094
Query 1851 TACAATAGAATATGACCAAATATCAGGATCTGGGTACCAGCTGGTG 1896
.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1095 CACTATAGAATATGACCAAATATCAGGATCTGGGTACCAGCTTGTG 1140
