Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_02790
- Subject:
- NM_001286419.1
- Aligned Length:
- 1148
- Identities:
- 955
- Gaps:
- 118
Alignment
Query 1 ATGGAGAAAAAGAAAATGGTAACTCAGGGTAACCAGGAGCCGACAACAACTCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTT 74
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGAGAAAAAGAAAATGGTAACTCAGGGTAACCAGGAGCCAACAACAACTCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTT 74
Query 75 TACTACCATCCCATTTCCACCACCTCCGCAGAATGGAATTCCCACAGAGTATGGGGTGCCACACACTCAAGACT 148
||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||
Sbjct 75 TACTACCATCCCGTTCCCACCACCTCCACAAAATGGAATTCCCACAGAATATGGAGTGCCACACACTCAGGACT 148
Query 149 ATGCCGGCCAGACCGGTGAGCATAACCTGACACTCTACGGAAGTACGCAAGCC-CACGGGGAGCAGAGCAGCAA 221
||||||||||||||.||||.|||||||||||.||||||||.||||||| |||| ||.||.||.|||||.|||||
Sbjct 149 ATGCCGGCCAGACCAGTGAACATAACCTGACCCTCTACGGGAGTACGC-AGCCTCATGGAGAACAGAGTAGCAA 221
Query 222 CTCACCCAGCACACAAAATGGATCTCTTACGACAGAAGGTGGAGCACAGACAGACGGCCAGCAGTCACAGACAC 295
.||||||||||..||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct 222 TTCACCCAGCAACCAGAATGGATCTCTCACGACAGAAGGTGGAGCACAGACAGACGGACAACAGTCACAGACAC 295
Query 296 AAAGTAGTGAAAATTCAGAGAGTAAATCTACCCCGAAACGGCTGCATGTCTCTAATATTCCTTTCCGCTTCCGG 369
|||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 296 AAAGTAGTGAAAATTCAGAGAGTAAATCTACGCCCAAGCGACTACATGTCTCTAATATTCCCTTCCGCTTCCGA 369
Query 370 GACCCTGACCTCCGGCAGATGTTTGGGCAGTTTGGCAAAATCCTAGATGTAGAAATAATCTTTAATGAACGTGG 443
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||
Sbjct 370 GACCCTGACCTCCGGCAGATGTTTGGGCAGTTTGGCAAAATCCTAGATGTGGAAATAATCTTTAATGAGCGCGG 443
Query 444 CTCTAAGGGATTCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAGACAGGGCCAGGGAGAAATTACACGGCA 517
|||
Sbjct 444 CTC----------------------------------------------------------------------- 446
Query 518 CCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCTACAGCACGTGTAATGACCAATAAGAAGATGGTCACA 591
|.|||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 447 ----------------------CAAGGTGAATAATGCAACAGCACGGGTCATGACCAACAAGAAGATGGTCACG 498
Query 592 CCATATGCAAATGGTTGGAAATTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTATATGGTCCGGAGTTATATGCAGCATCCAG 665
||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 499 CCATATGCAAATGGCTGGAAGTTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTGTATGGTCCTGAGTTATATGCAGCATCCAG 572
Query 666 CTTTCAAGCAGATGTGTCCCTAGGCAATGATGCAGCAGTGCCCCTATCAGGAAGAGGGGGTATCAACACTTACA 739
|||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||.|.|||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct 573 CTTTCAAGCTGATGTGTCCCTAGGCAATGAGGCGGCTGTGCCCTTGTCAGGAAGAGGAGGCATCAACACTTACA 646
Query 740 TTCCTTTAATCAGTCTCCCTTTAGTTCCTGGCTTCCCTTACCCTACTGCAGCCACCACGGCAGCCGCTTTCAGA 813
|.|||.|||||| |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||.||
Sbjct 647 TCCCTCTAATCA------------TTCCTGGCTTCCCTTACCCAACTGCAGCCACCACGGCAGCTGCTTTCCGA 708
Query 814 GGAGCCCATTTGAGGGGCAGAGGGCGGACAGTATATGGTGCAGTCCGAGCGGTACCTCCAACAGCCATCCCCGC 887
|||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 709 GGAGCCCATCTGAGGGGCAGAGGGCGGACAGTGTATGGTGCAGTCCGAGCGGTACCTCCAACAGCCATCCCCGC 782
Query 888 CTATCCAGGTGTGGT-TTACCAGGACGGATT--TTACGGTGCT----GACCTCTATGGTGGATATGCAGCCTAC 954
|||||||||..|.|| ||| |||||...|.| ||| |.||| .||||| |.||||||||||||||||||
Sbjct 783 CTATCCAGGAATAGTGTTA-CAGGAACCAATCATTA--GCGCTAAAATACCTC-AGGGTGGATATGCAGCCTAC 852
Query 955 AGATATGCACAGCCTGCTACTGCAACCGCAGCCACCGCTGCTGCAGCCGCTGCAGCCGCTTACAGTGACGGTTA 1028
|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 853 AGATATGCACAGCCTGCTACTGCAACCGCAGCCACAGCTGCTGCAGCCGCTGCAGCCGCTTACAGCGACGGTTA 926
Query 1029 TGGCAGGGTGTACACAGCCGACCCCTACCATGCCCTTGCCCCTGCCGCTAGCTATGGAGTTGGCGCTGTGGCGA 1102
.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 927 CGGCAGGGTGTACACAGCTGACCCCTACCATGCCCTCGCCCCTGCCGCCAGCTATGGAGTTGGCGCTGTGGCGA 1000
Query 1103 GTTTATACCGAGGTGGCTACAGCCGATTTGCCCCCTAC 1140
||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1001 GTTTGTACCGAGGTGGCTACAGCCGATTTGCCCCCTAC 1038