Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_02790
Subject:
XM_006521576.2
Aligned Length:
1359
Identities:
1036
Gaps:
240

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGCGGAAGGCGGCCAGGCGCAGCAGCAGCCGCCTCAGCTCGGGCCCGGCGCTGCCGCCCGGGGCATGAAGCG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GGAGTCGGAGGTGGAGTTGCCGGTGCCCGGAGCGGGGGCAGACGGACCCGAGCCCGGCCTGAGCAAGCGGCCAC  148

Query    1  ---------------------------------------------------------ATGGAGAAAAAGAAA--  15
                                                                     |||||.....||.||  
Sbjct  149  GCACAGAGGAGGCGGCCGACGGCGGGATGCAGAACGAGCCACTGACCCCGGGTTATCATGGATTCCCAGCAAGG  222

Query   16  -ATGGTAACTCAGGGTAACCAGGAGCCGACAACAACTCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTTTACTACCATCCCAT  88
             ||||    .|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  223  GATGG----CCAGGGTAACCAGGAGCCAACAACAACTCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTTTACTACCATCCCGT  292

Query   89  TTCCACCACCTCCGCAGAATGGAATTCCCACAGAGTATGGGGTGCCACACACTCAAGACTATGCCGGCCAGACC  162
            |.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  293  TCCCACCACCTCCACAAAATGGAATTCCCACAGAATATGGAGTGCCACACACTCAGGACTATGCCGGCCAGACC  366

Query  163  GGTGAGCATAACCTGACACTCTACGGAAGTACGCAAGCC-CACGGGGAGCAGAGCAGCAACTCACCCAGCACAC  235
            .||||.|||||||||||.||||||||.||||||| |||| ||.||.||.|||||.|||||.||||||||||..|
Sbjct  367  AGTGAACATAACCTGACCCTCTACGGGAGTACGC-AGCCTCATGGAGAACAGAGTAGCAATTCACCCAGCAACC  439

Query  236  AAAATGGATCTCTTAC---GACAGAAGGTGGAGCACAGACAGACGGCCAGCAGTCACAGACACAAAGTAGTGAA  306
            |.|||||||||||.||   |||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  440  AGAATGGATCTCTCACGCAGACAGAAGGTGGAGCACAGACAGACGGACAACAGTCACAGACACAAAGTAGTGAA  513

Query  307  AATTCAGAGAGTAAATCTACCCCGAAACGGCTGCATGTCTCTAATATTCCTTTCCGCTTCCGGGACCCTGACCT  380
            ||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct  514  AATTCAGAGAGTAAATCTACGCCCAAGCGACTACATGTCTCTAATATTCCCTTCCGCTTCCGAGACCCTGACCT  587

Query  381  CCGGCAGATGTTTGGGCAGTTTGGCAAAATCCTAGATGTAGAAATAATCTTTAATGAACGTGGCTCTAAGGGAT  454
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.|||||||
Sbjct  588  CCGGCAGATGTTTGGGCAGTTTGGCAAAATCCTAGATGTGGAAATAATCTTTAATGAGCGCGGCTCCAAGGGAT  661

Query  455  TCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAGACAGGGCCAGGGAGAAATTACACGGCACCGTGGTAGAG  528
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  662  TCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAGACAGGGCCAGGGAGAAATTGCACGGCACCGTGGTAGAG  735

Query  529  GGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCTACAGCACGTGTAATGACCAATAAGAAGATGGTCACACCATATGCAAA  602
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  736  GGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCAACAGCACGGGTCATGACCAACAAGAAGATGGTCACGCCATATGCAAA  809

Query  603  TGGTTGGAAATTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTATATGGTCCGGAGTTATATGCAGCATCCAGCTTTCAAGCAG  676
            |||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  810  TGGCTGGAAGTTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTGTATGGTCCTGAGTTATATGCAGCATCCAGCTTTCAAGCTG  883

Query  677  ATGTGTCCCTAGGCAATGATGCAGCAGTGCCCCTATCAGGAAGAGGGGGTATCAACACTTACATTCCTTTAATC  750
            |||||||||||||||||||.||.||.||||||.|.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||.|||||
Sbjct  884  ATGTGTCCCTAGGCAATGAGGCGGCTGTGCCCTTGTCAGGAAGAGGAGGCATCAACACTTACATCCCTCTAATC  957

Query  751  AGTCTCCCTTTAGTTCCTGGCTTCCCTTACCCTACTGCAGCCACCACGGCAGCCGCTTTCAGAGGAGCCCATTT  824
            |            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||.|
Sbjct  958  A------------TTCCTGGCTTCCCTTACCCAACTGCAGCCACCACGGCAGCTGCTTTCCGAGGAGCCCATCT  1019

Query  825  GAGGGGCAGAGGGCGGACAGTATATGGTGCAGTCCGAGCGGTACCTCCAACAGCCATCCCCGCCTATCCAGGTG  898
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..
Sbjct 1020  GAGGGGCAGAGGGCGGACAGTGTATGGTGCAGTCCGAGCGGTACCTCCAACAGCCATCCCCGCCTATCCAGGAA  1093

Query  899  TGGT-TTACCAGGACGGATT--TTACGGTGCT----GACCTCTATGGTGGATATGCAGCCTACAGATATGCACA  965
            |.|| ||| |||||...|.|  |||  |.|||    .||||| |.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1094  TAGTGTTA-CAGGAACCAATCATTA--GCGCTAAAATACCTC-AGGGTGGATATGCAGCCTACAGATATGCACA  1163

Query  966  GCCTGCTACTGCAACCGCAGCCACCGCTGCTGCAGCCGCTGCAGCCGCTTACAGTGACGGTTATGGCAGGGTGT  1039
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct 1164  GCCTGCTACTGCAACCGCAGCCACAGCTGCTGCAGCCGCTGCAGCCGCTTACAGCGACGGTTACGGCAGGGTGT  1237

Query 1040  ACACAGCCGACCCCTACCATGCCCTTGCCCCTGCCGCTAGCTATGGAGTTGGCGCTGTGGCGAGTTTATACCGA  1113
            |||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1238  ACACAGCTGACCCCTACCATGCCCTCGCCCCTGCCGCCAGCTATGGAGTTGGCGCTGTGGCGAGTTTGTACCGA  1311

Query 1114  GGTGGCTACAGCCGATTTGCCCCCTAC  1140
            |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1312  GGTGGCTACAGCCGATTTGCCCCCTAC  1338