Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02790
• Subject: XM_006521579.3
• Aligned Length: 1358
• Identities: 1001
• Gaps: 253

Alignment

Query    1  -------------------------------------------------------------------ATGGAGA  7
                                                                               |||||..
Sbjct    1  ATGTCATCAGATTCCATGGACCAGCCCAGGAACCCCTGCGAGAACGAGCCACTGACCCCGGGTTATCATGGATT  74

Query    8  AAAAGAAA---ATGGTAACTCAGGGTAACCAGGAGCCGACAACAACTCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTTTACT  78
            ...||.||   ||||    .|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCCAGCAAGGGATGG----CCAGGGTAACCAGGAGCCAACAACAACTCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTTTACT  144

Query   79  ACCATCCCATTTCCACCACCTCCGCAGAATGGAATTCCCACAGAGTATGGGGTGCCACACACTCAAGACTATGC  152
            ||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct  145  ACCATCCCGTTCCCACCACCTCCACAAAATGGAATTCCCACAGAATATGGAGTGCCACACACTCAGGACTATGC  218

Query  153  CGGCCAGACCGGTGAGCATAACCTGACACTCTACGGAAGTACGCAAGCC-CACGGGGAGCAGAGCAGCAACTCA  225
            ||||||||||.||||.|||||||||||.||||||||.||||||| |||| ||.||.||.|||||.|||||.|||
Sbjct  219  CGGCCAGACCAGTGAACATAACCTGACCCTCTACGGGAGTACGC-AGCCTCATGGAGAACAGAGTAGCAATTCA  291

Query  226  CCCAGCACACAAAATGGATCTCTTACGACAGAAGGTGGAGCACAGACAGACGGCCAGCAGTCACAGACACAAAG  299
            |||||||..||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct  292  CCCAGCAACCAGAATGGATCTCTCACGACAGAAGGTGGAGCACAGACAGACGGACAACAGTCACAGACACAAAG  365

Query  300  TAGTGAAAATTCAGAGAGTAAATCTACCCCGAAACGGCTGCATGTCTCTAATATTCCTTTCCGCTTCCGGGACC  373
            |||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct  366  TAGTGAAAATTCAGAGAGTAAATCTACGCCCAAGCGACTACATGTCTCTAATATTCCCTTCCGCTTCCGAGACC  439

Query  374  CTGACCTCCGGCAGATGTTTGGGCAGTTTGGCAAAATCCTAGATGTAGAAATAATCTTTAATGAACGTGGCTCT  447
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.
Sbjct  440  CTGACCTCCGGCAGATGTTTGGGCAGTTTGGCAAAATCCTAGATGTGGAAATAATCTTTAATGAGCGCGGCTCC  513

Query  448  AAGGGATTCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAGACAGGGCCAGGGAGAAATTACACGGCACCGT  521
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  514  AAGGGATTCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAGACAGGGCCAGGGAGAAATTGCACGGCACCGT  587

Query  522  GGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCTACAGCACGTGTAATGACCAATAAGAAGATGGTCACACCAT  595
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct  588  GGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCAACAGCACGGGTCATGACCAACAAGAAGATGGTCACGCCAT  661

Query  596  ATGCAAATGGTTGGAAATTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTATATGGTCCGGAGTTATATGCAGCATCCAGCTTT  669
            ||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  662  ATGCAAATGGCTGGAAGTTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTGTATGGTCCTGAGTTATATGCAGCATCCAGCTTT  735

Query  670  CAAGCAGATGTGTCCCTAGGCAATGATGCAGCAGTGCCCCTATCAGGAAGAGGGGGTATCAACACTTACATTCC  743
            |||||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||.|.|||||||||||.||.||||||||||||||.||
Sbjct  736  CAAGCTGATGTGTCCCTAGGCAATGAGGCGGCTGTGCCCTTGTCAGGAAGAGGAGGCATCAACACTTACATCCC  809

Query  744  TTTAATCAGTCTCCCTTTAGTTCCTGGCTTCCCTTACCCTACTGCAGCCACCACGGCAGCCGCTTTCAGAGGAG  817
            |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||.||||||
Sbjct  810  TCTAATCAGTCTCCCTTTAGTTCCTGGCTTCCCTTACCCAACTGCAGCCACCACGGCAGCTGCTTTCCGAGGAG  883

Query  818  CCCATTTGAGGGGCAGAGGGCGGACAGTATATGGTGCAGTCCGAGCGGTACCTCCAACAGCCATCCCCGCCTAT  891
            |||||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  884  CCCATCTGAGGGGCAGAGGGCGGACAGTGTATGGTGCAGTCCGAGCGGTACCTCCAACAGCCATCCCCGCCTAT  957

Query  892  CCAGGTGTGGTTTACCAGGACGGATTTTACGGTGCTGACCTCTAT---GGTG--GATATG---------CAGCC  951
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |.||  ||.|||         ||..|
Sbjct  958  CCAGGTGTGGTTTACCAGGACGGATTTTACGGTGCTGACCTCTATTCAGCTGAAGAAATGTTAACATCTCACTC  1031

Query  952  TA------------------------------CAGATATGCACAGCCT--GCTACTGC--------------AA  979
            ||                              |.||||| .|||| .|  |.||||||              ||
Sbjct 1032  TAAATCTCTCAGTGGAGTCTCTGTTCCCTTCTCTGATAT-AACAG-ATGGGTTACTGCTTGTTATAATTATTAA  1103

Query  980  CCGCA-----------GCCACCGCTGCTGCAGCCGCTGCAGCCGC-----TTAC------------------AG  1019
               ||           ||||..|||       |.|.||    .||     ||||                  ||
Sbjct 1104  ---CATTGTGGTATGGGCCAGGGCT-------CGGGTG----GGCAAGATTTACTCCTCCTTTGGGCTGGGGAG  1163

Query 1020  TGAC----GGTTATGGCAGGG--TGT--ACACA---GCCGAC---------CC---CTACCATGCCCTTGCCCC  1070
            .|||    .||||.||.|.||  |||  ||.||   |..|||         ||   .|||||.|.|.|||...|
Sbjct 1164  GGACCAGTTGTTAGGGTATGGAATGTTAACTCAAGTGGTGACTGACTGTTTCCGTAATACCAGGTCGTTGTGGC  1237

Query 1071  TGC-CGCTAGCTATGGAGTTGGCGCTGTGGCGAGTTTA---TACCGAG---GTGGCTACAG-----------CC  1126
            ||| ||||  ||| |.|.|||..||||||       ||   .||||||   |||| ||.||           ||
Sbjct 1238  TGCACGCT--CTA-GTAATTGAGGCTGTG-------TACTTCACCGAGCTTGTGG-TAGAGCCTAGGGCAAACC  1300

Query 1127  GATTTGCCCCCTAC------------  1140
            |.|.|   |||.|.            
Sbjct 1301  GCTGT---CCCAAGAGAATGCTGGGA  1323