Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_02790
- Subject:
- XM_006521580.2
- Aligned Length:
- 1362
- Identities:
- 1022
- Gaps:
- 267
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGCGGAAGGCGGCCAGGCGCAGCAGCAGCCGCCTCAGCTCGGGCCCGGCGCTGCCGCCCGGGGCATGAAGCG 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 GGAGTCGGAGGTGGAGTTGCCGGTGCCCGGAGCGGGGGCAGACGGACCCGAGCCCGGCCTGAGCAAGCGGCCAC 148
Query 1 ---------------------------------------------------------ATGGAGAAAAAGAAA-- 15
|||||.....||.||
Sbjct 149 GCACAGAGGAGGCGGCCGACGGCGGGATGCAGAACGAGCCACTGACCCCGGGTTATCATGGATTCCCAGCAAGG 222
Query 16 -ATGGTAACTCAGGGTAACCAGGAGCCGACAACAACTCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTTTACTACCATCCCAT 88
|||| .|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 223 GATGG----CCAGGGTAACCAGGAGCCAACAACAACTCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTTTACTACCATCCCGT 292
Query 89 TTCCACCACCTCCGCAGAATGGAATTCCCACAGAGTATGGGGTGCCACACACTCAAGACTATGCCGGCCAGACC 162
|.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 293 TCCCACCACCTCCACAAAATGGAATTCCCACAGAATATGGAGTGCCACACACTCAGGACTATGCCGGCCAGACC 366
Query 163 GGTGAGCATAACCTGACACTCTACGGAAGTACGCAAGCC-CACGGGGAGCAGAGCAGCAACTCACCCAGCACAC 235
.||||.|||||||||||.||||||||.||||||| |||| ||.||.||.|||||.|||||.||||||||||..|
Sbjct 367 AGTGAACATAACCTGACCCTCTACGGGAGTACGC-AGCCTCATGGAGAACAGAGTAGCAATTCACCCAGCAACC 439
Query 236 AAAATGGATCTCTTAC---GACAGAAGGTGGAGCACAGACAGACGGCCAGCAGTCACAGACACAAAGTAGTGAA 306
|.|||||||||||.|| |||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 440 AGAATGGATCTCTCACGCAGACAGAAGGTGGAGCACAGACAGACGGACAACAGTCACAGACACAAAGTAGTGAA 513
Query 307 AATTCAGAGAGTAAATCTACCCCGAAACGGCTGCATGTCTCTAATATTCCTTTCCGCTTCCGGGACCCTGACCT 380
||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 514 AATTCAGAGAGTAAATCTACGCCCAAGCGACTACATGTCTCTAATATTCCCTTCCGCTTCCGAGACCCTGACCT 587
Query 381 CCGGCAGATGTTTGGGCAGTTTGGCAAAATCCTAGATGTAGAAATAATCTTTAATGAACGTGGCTCTAAGGGAT 454
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.|||||||
Sbjct 588 CCGGCAGATGTTTGGGCAGTTTGGCAAAATCCTAGATGTGGAAATAATCTTTAATGAGCGCGGCTCCAAGGGAT 661
Query 455 TCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAGACAGGGCCAGGGAGAAATTACACGGCACCGTGGTAGAG 528
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 662 TCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAGACAGGGCCAGGGAGAAATTGCACGGCACCGTGGTAGAG 735
Query 529 GGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCTACAGCACGTGTAATGACCAATAAGAAGATGGTCACACCATATGCAAA 602
||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 736 GGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCAACAGCACGGGTCATGACCAACAAGAAGATGGTCACGCCATATGCAAA 809
Query 603 TGGTTGGAAATTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTATATGGTCCGGAGTTATATGCAGCATCCAGCTTTCAAGCAG 676
|||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 810 TGGCTGGAAGTTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTGTATGGTCCTGAGTTATATGCAGCATCCAGCTTTCAAGCTG 883
Query 677 ATGTGTCCCTAGGCAATGATGCAGCAGTGCCCCTATCAGGAAGAGGGGGTATCAACACTTACATTCCTTTAATC 750
|||||||||||||||||||.||.||.||||||.|.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||.|||||
Sbjct 884 ATGTGTCCCTAGGCAATGAGGCGGCTGTGCCCTTGTCAGGAAGAGGAGGCATCAACACTTACATCCCTCTAATC 957
Query 751 AGTCTCCCTTTAGTTCCTGGCTTCCCTTACCCTACTGCAGCCACCACGGCAGCCGCTTTCAGAGGAGCCCATTT 824
||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||.|
Sbjct 958 AGTCTCCCTTTAGTTCCTGGCTTCCCTTACCCAACTGCAGCCACCACGGCAGCTGCTTTCCGAGGAGCCCATCT 1031
Query 825 GAGGGGCAGAGGGCGGACAGTATATGGTGCAGTCCGAGCGGTACCTCCAACAGCCATCCCCGCCTATCCAGGTG 898
|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1032 GAGGGGCAGAGGGCGGACAGTGTATGGTGCAGTCCGAGCGGTACCTCCAACAGCCATCCCCGCCTATCCAGG-- 1103
Query 899 TGGTTTACCAGGACGGATTTTACGGTGCTGACCTCTATGGTGGATATGCAGCCTACAGATATGCACAGCCTGCT 972
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1104 --------------------------------------GGTGGATATGCAGCCTACAGATATGCACAGCCTGCT 1139
Query 973 ACTGCAACCGCAGCCACCGCTGCTGCAGCCGCTGCAGCCGCTTACAGTGACGGTTATGGCAGGGTGTACACAGC 1046
|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1140 ACTGCAACCGCAGCCACAGCTGCTGCAGCCGCTGCAGCCGCTTACAGCGACGGTTACGGCAGGGTGTACACAGC 1213
Query 1047 CGACCCCTACCATGCCCTTGCCCCTGCCGCTAGCTATGGAGTTGGCGCTGTGGCGAGTTTATACCGAGGTGGCT 1120
.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1214 TGACCCCTACCATGCCCTCGCCCCTGCCGCCAGCTATGGAGTTGGCGCTGTGGCGAGTTTGTACCGAGGTGGCT 1287
Query 1121 ACAGCCGATTTGCCCCCTAC---------- 1140
||||||||||||||||||||
Sbjct 1288 ACAGCCGATTTGCCCCCTACTGAAGTGACG 1317