Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_02790
- Subject:
- XM_006521582.3
- Aligned Length:
- 1316
- Identities:
- 999
- Gaps:
- 214
Alignment
Query 1 ------------------ATGGAGAAAAAGAAAATGGTAAC-------TCAGGGTAACCAGGAGCCGACAACAA 49
|||||..|..| |||.| .|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1 ATGTATGGTGTATATTGCATGGATTATCA-------GTATCCTCTTGTCCAGGGTAACCAGGAGCCAACAACAA 67
Query 50 CTCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTTTACTACCATCCCATTTCCACCACCTCCGCAGAATGGAATTCCCACAGAG 123
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.
Sbjct 68 CTCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTTTACTACCATCCCGTTCCCACCACCTCCACAAAATGGAATTCCCACAGAA 141
Query 124 TATGGGGTGCCACACACTCAAGACTATGCCGGCCAGACCGGTGAGCATAACCTGACACTCTACGGAAGTACGCA 197
|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||.|||||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct 142 TATGGAGTGCCACACACTCAGGACTATGCCGGCCAGACCAGTGAACATAACCTGACCCTCTACGGGAGTACGC- 214
Query 198 AGCC-CACGGGGAGCAGAGCAGCAACTCACCCAGCACACAAAATGGATCTCTTAC---GACAGAAGGTGGAGCA 267
|||| ||.||.||.|||||.|||||.||||||||||..||.|||||||||||.|| ||||||||||||||||
Sbjct 215 AGCCTCATGGAGAACAGAGTAGCAATTCACCCAGCAACCAGAATGGATCTCTCACGCAGACAGAAGGTGGAGCA 288
Query 268 CAGACAGACGGCCAGCAGTCACAGACACAAAGTAGTGAAAATTCAGAGAGTAAATCTACCCCGAAACGGCTGCA 341
|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||.||
Sbjct 289 CAGACAGACGGACAACAGTCACAGACACAAAGTAGTGAAAATTCAGAGAGTAAATCTACGCCCAAGCGACTACA 362
Query 342 TGTCTCTAATATTCCTTTCCGCTTCCGGGACCCTGACCTCCGGCAGATGTTTGGGCAGTTTGGCAAAATCCTAG 415
|||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 363 TGTCTCTAATATTCCCTTCCGCTTCCGAGACCCTGACCTCCGGCAGATGTTTGGGCAGTTTGGCAAAATCCTAG 436
Query 416 ATGTAGAAATAATCTTTAATGAACGTGGCTCTAAGGGATTCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCA 489
||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 437 ATGTGGAAATAATCTTTAATGAGCGCGGCTCCAAGGGATTCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCA 510
Query 490 GACAGGGCCAGGGAGAAATTACACGGCACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCTACAGCACG 563
||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 511 GACAGGGCCAGGGAGAAATTGCACGGCACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCAACAGCACG 584
Query 564 TGTAATGACCAATAAGAAGATGGTCACACCATATGCAAATGGTTGGAAATTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTAT 637
.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 585 GGTCATGACCAACAAGAAGATGGTCACGCCATATGCAAATGGCTGGAAGTTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTGT 658
Query 638 ATGGTCCGGAGTTATATGCAGCATCCAGCTTTCAAGCAGATGTGTCCCTAGGCAATGATGCAGCAGTGCCCCTA 711
|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||.|.
Sbjct 659 ATGGTCCTGAGTTATATGCAGCATCCAGCTTTCAAGCTGATGTGTCCCTAGGCAATGAGGCGGCTGTGCCCTTG 732
Query 712 TCAGGAAGAGGGGGTATCAACACTTACATTCCTTTAATCAGTCTCCCTTTAGTTCCTGGCTTCCCTTACCCTAC 785
|||||||||||.||.||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 733 TCAGGAAGAGGAGGCATCAACACTTACATCCCTCTAATCAGTCTCCCTTTAGTTCCTGGCTTCCCTTACCCAAC 806
Query 786 TGCAGCCACCACGGCAGCCGCTTTCAGAGGAGCCCATTTGAGGGGCAGAGGGCGGACAGTATATGGTGCAGTCC 859
||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 807 TGCAGCCACCACGGCAGCTGCTTTCCGAGGAGCCCATCTGAGGGGCAGAGGGCGGACAGTGTATGGTGCAGTCC 880
Query 860 GAGCGGTACCTCCAACAGCCATCCCCGCCTATCCAGGTGTGGTTTACCAGGACGGATTTTACGGTGCTGACCTC 933
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 881 GAGCGGTACCTCCAACAGCCATCCCCGCCTATCCAGGTGTGGTTTACCAGGACGGATTTTACGGTGCTGACCTC 954
Query 934 TAT---GGTG--GATATG---------CAGCCTA------------------------------CAGATATGCA 963
||| |.|| ||.||| ||..||| |.||||| .|
Sbjct 955 TATTCAGCTGAAGAAATGTTAACATCTCACTCTAAATCTCTCAGTGGAGTCTCTGTTCCCTTCTCTGATAT-AA 1027
Query 964 CAGCCT--GCTACTGC--------------AACCGCA-----------GCCACCGCTGCTGCAGCCGCTGCAGC 1010
||| .| |.|||||| || || ||||..||| |.|.||
Sbjct 1028 CAG-ATGGGTTACTGCTTGTTATAATTATTAA---CATTGTGGTATGGGCCAGGGCT-------CGGGTG---- 1086
Query 1011 CGC-----TTAC------------------AGTGAC----GGTTATGGCAGGG--TGT--ACACA---GCCGAC 1050
.|| |||| ||.||| .||||.||.|.|| ||| ||.|| |..|||
Sbjct 1087 GGCAAGATTTACTCCTCCTTTGGGCTGGGGAGGGACCAGTTGTTAGGGTATGGAATGTTAACTCAAGTGGTGAC 1160
Query 1051 ---------CC---CTACCATGCCCTTGCCCCTGC-CGCTAGCTATGGAGTTGGCGCTGTGGCGAGTTTA---T 1108
|| .|||||.|.|.|||...|||| |||| ||| |.|.|||..|||||| || .
Sbjct 1161 TGACTGTTTCCGTAATACCAGGTCGTTGTGGCTGCACGCT--CTA-GTAATTGAGGCTGTG-------TACTTC 1224
Query 1109 ACCGAG---GTGGCTACAG-----------CCGATTTGCCCCCTAC------------ 1140
|||||| |||| ||.|| |||.|.| |||.|.
Sbjct 1225 ACCGAGCTTGTGG-TAGAGCCTAGGGCAAACCGCTGT---CCCAAGAGAATGCTGGGA 1278