Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_02790
- Subject:
- XM_017316810.1
- Aligned Length:
- 1328
- Identities:
- 1004
- Gaps:
- 223
Alignment
Query 1 ATGGAGAAAA----------------------------------AGAAA---ATGGTAACTCAGGGTAACCAGG 37
|||.||||.| ||.|| |||| .|||||||||||||
Sbjct 1 ATGAAGAAGAACGAGCCACTGACCCCGGGTTATCATGGATTCCCAGCAAGGGATGG----CCAGGGTAACCAGG 70
Query 38 AGCCGACAACAACTCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTTTACTACCATCCCATTTCCACCACCTCCGCAGAATGGA 111
||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||||||
Sbjct 71 AGCCAACAACAACTCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTTTACTACCATCCCGTTCCCACCACCTCCACAAAATGGA 144
Query 112 ATTCCCACAGAGTATGGGGTGCCACACACTCAAGACTATGCCGGCCAGACCGGTGAGCATAACCTGACACTCTA 185
|||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 145 ATTCCCACAGAATATGGAGTGCCACACACTCAGGACTATGCCGGCCAGACCAGTGAACATAACCTGACCCTCTA 218
Query 186 CGGAAGTACGCAAGCC-CACGGGGAGCAGAGCAGCAACTCACCCAGCACACAAAATGGATCTCTTAC---GACA 255
|||.||||||| |||| ||.||.||.|||||.|||||.||||||||||..||.|||||||||||.|| ||||
Sbjct 219 CGGGAGTACGC-AGCCTCATGGAGAACAGAGTAGCAATTCACCCAGCAACCAGAATGGATCTCTCACGCAGACA 291
Query 256 GAAGGTGGAGCACAGACAGACGGCCAGCAGTCACAGACACAAAGTAGTGAAAATTCAGAGAGTAAATCTACCCC 329
|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 292 GAAGGTGGAGCACAGACAGACGGACAACAGTCACAGACACAAAGTAGTGAAAATTCAGAGAGTAAATCTACGCC 365
Query 330 GAAACGGCTGCATGTCTCTAATATTCCTTTCCGCTTCCGGGACCCTGACCTCCGGCAGATGTTTGGGCAGTTTG 403
.||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 366 CAAGCGACTACATGTCTCTAATATTCCCTTCCGCTTCCGAGACCCTGACCTCCGGCAGATGTTTGGGCAGTTTG 439
Query 404 GCAAAATCCTAGATGTAGAAATAATCTTTAATGAACGTGGCTCTAAGGGATTCGGGTTCGTAACTTTCGAGAAT 477
||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 440 GCAAAATCCTAGATGTGGAAATAATCTTTAATGAGCGCGGCTCCAAGGGATTCGGGTTCGTAACTTTCGAGAAT 513
Query 478 AGTGCTGATGCAGACAGGGCCAGGGAGAAATTACACGGCACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTGAATAA 551
||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 514 AGTGCTGATGCAGACAGGGCCAGGGAGAAATTGCACGGCACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTGAATAA 587
Query 552 TGCTACAGCACGTGTAATGACCAATAAGAAGATGGTCACACCATATGCAAATGGTTGGAAATTAAGCCCAGTAG 625
|||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 588 TGCAACAGCACGGGTCATGACCAACAAGAAGATGGTCACGCCATATGCAAATGGCTGGAAGTTAAGCCCAGTAG 661
Query 626 TTGGAGCTGTATATGGTCCGGAGTTATATGCAGCATCCAGCTTTCAAGCAGATGTGTCCCTAGGCAATGATGCA 699
||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 662 TTGGAGCTGTGTATGGTCCTGAGTTATATGCAGCATCCAGCTTTCAAGCTGATGTGTCCCTAGGCAATGAGGCG 735
Query 700 GCAGTGCCCCTATCAGGAAGAGGGGGTATCAACACTTACATTCCTTTAATCAGTCTCCCTTTAGTTCCTGGCTT 773
||.||||||.|.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 736 GCTGTGCCCTTGTCAGGAAGAGGAGGCATCAACACTTACATCCCTCTAATCAGTCTCCCTTTAGTTCCTGGCTT 809
Query 774 CCCTTACCCTACTGCAGCCACCACGGCAGCCGCTTTCAGAGGAGCCCATTTGAGGGGCAGAGGGCGGACAGTAT 847
|||||||||.||||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 810 CCCTTACCCAACTGCAGCCACCACGGCAGCTGCTTTCCGAGGAGCCCATCTGAGGGGCAGAGGGCGGACAGTGT 883
Query 848 ATGGTGCAGTCCGAGCGGTACCTCCAACAGCCATCCCCGCCTATCCAGGTGTGGTTTACCAGGACGGATTTTAC 921
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 884 ATGGTGCAGTCCGAGCGGTACCTCCAACAGCCATCCCCGCCTATCCAGGTGTGGTTTACCAGGACGGATTTTAC 957
Query 922 GGTGCTGACCTCTAT---GGTG--GATATG---------CAGCCTA---------------------------- 953
||||||||||||||| |.|| ||.||| ||..|||
Sbjct 958 GGTGCTGACCTCTATTCAGCTGAAGAAATGTTAACATCTCACTCTAAATCTCTCAGTGGAGTCTCTGTTCCCTT 1031
Query 954 --CAGATATGCACAGCCT--GCTACTGC--------------AACCGCA-----------GCCACCGCTGCTGC 998
|.||||| .|||| .| |.|||||| || || ||||..|||
Sbjct 1032 CTCTGATAT-AACAG-ATGGGTTACTGCTTGTTATAATTATTAA---CATTGTGGTATGGGCCAGGGCT----- 1095
Query 999 AGCCGCTGCAGCCGC-----TTAC------------------AGTGAC----GGTTATGGCAGGG--TGT--AC 1041
|.|.|| .|| |||| ||.||| .||||.||.|.|| ||| ||
Sbjct 1096 --CGGGTG----GGCAAGATTTACTCCTCCTTTGGGCTGGGGAGGGACCAGTTGTTAGGGTATGGAATGTTAAC 1163
Query 1042 ACA---GCCGAC---------CC---CTACCATGCCCTTGCCCCTGC-CGCTAGCTATGGAGTTGGCGCTGTGG 1099
.|| |..||| || .|||||.|.|.|||...|||| |||| ||| |.|.|||..||||||
Sbjct 1164 TCAAGTGGTGACTGACTGTTTCCGTAATACCAGGTCGTTGTGGCTGCACGCT--CTA-GTAATTGAGGCTGTG- 1233
Query 1100 CGAGTTTA---TACCGAG---GTGGCTACAG-----------CCGATTTGCCCCCTAC------------ 1140
|| .|||||| |||| ||.|| |||.|.| |||.|.
Sbjct 1234 ------TACTTCACCGAGCTTGTGG-TAGAGCCTAGGGCAAACCGCTGT---CCCAAGAGAATGCTGGGA 1293