Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02790
• Subject: XM_017316810.1
• Aligned Length: 1328
• Identities: 1004
• Gaps: 223

Alignment

Query    1  ATGGAGAAAA----------------------------------AGAAA---ATGGTAACTCAGGGTAACCAGG  37
            |||.||||.|                                  ||.||   ||||    .|||||||||||||
Sbjct    1  ATGAAGAAGAACGAGCCACTGACCCCGGGTTATCATGGATTCCCAGCAAGGGATGG----CCAGGGTAACCAGG  70

Query   38  AGCCGACAACAACTCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTTTACTACCATCCCATTTCCACCACCTCCGCAGAATGGA  111
            ||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||||||
Sbjct   71  AGCCAACAACAACTCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTTTACTACCATCCCGTTCCCACCACCTCCACAAAATGGA  144

Query  112  ATTCCCACAGAGTATGGGGTGCCACACACTCAAGACTATGCCGGCCAGACCGGTGAGCATAACCTGACACTCTA  185
            |||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||.|||||||||||.|||||
Sbjct  145  ATTCCCACAGAATATGGAGTGCCACACACTCAGGACTATGCCGGCCAGACCAGTGAACATAACCTGACCCTCTA  218

Query  186  CGGAAGTACGCAAGCC-CACGGGGAGCAGAGCAGCAACTCACCCAGCACACAAAATGGATCTCTTAC---GACA  255
            |||.||||||| |||| ||.||.||.|||||.|||||.||||||||||..||.|||||||||||.||   ||||
Sbjct  219  CGGGAGTACGC-AGCCTCATGGAGAACAGAGTAGCAATTCACCCAGCAACCAGAATGGATCTCTCACGCAGACA  291

Query  256  GAAGGTGGAGCACAGACAGACGGCCAGCAGTCACAGACACAAAGTAGTGAAAATTCAGAGAGTAAATCTACCCC  329
            |||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  292  GAAGGTGGAGCACAGACAGACGGACAACAGTCACAGACACAAAGTAGTGAAAATTCAGAGAGTAAATCTACGCC  365

Query  330  GAAACGGCTGCATGTCTCTAATATTCCTTTCCGCTTCCGGGACCCTGACCTCCGGCAGATGTTTGGGCAGTTTG  403
            .||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  366  CAAGCGACTACATGTCTCTAATATTCCCTTCCGCTTCCGAGACCCTGACCTCCGGCAGATGTTTGGGCAGTTTG  439

Query  404  GCAAAATCCTAGATGTAGAAATAATCTTTAATGAACGTGGCTCTAAGGGATTCGGGTTCGTAACTTTCGAGAAT  477
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  440  GCAAAATCCTAGATGTGGAAATAATCTTTAATGAGCGCGGCTCCAAGGGATTCGGGTTCGTAACTTTCGAGAAT  513

Query  478  AGTGCTGATGCAGACAGGGCCAGGGAGAAATTACACGGCACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTGAATAA  551
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  514  AGTGCTGATGCAGACAGGGCCAGGGAGAAATTGCACGGCACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTGAATAA  587

Query  552  TGCTACAGCACGTGTAATGACCAATAAGAAGATGGTCACACCATATGCAAATGGTTGGAAATTAAGCCCAGTAG  625
            |||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct  588  TGCAACAGCACGGGTCATGACCAACAAGAAGATGGTCACGCCATATGCAAATGGCTGGAAGTTAAGCCCAGTAG  661

Query  626  TTGGAGCTGTATATGGTCCGGAGTTATATGCAGCATCCAGCTTTCAAGCAGATGTGTCCCTAGGCAATGATGCA  699
            ||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.
Sbjct  662  TTGGAGCTGTGTATGGTCCTGAGTTATATGCAGCATCCAGCTTTCAAGCTGATGTGTCCCTAGGCAATGAGGCG  735

Query  700  GCAGTGCCCCTATCAGGAAGAGGGGGTATCAACACTTACATTCCTTTAATCAGTCTCCCTTTAGTTCCTGGCTT  773
            ||.||||||.|.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  736  GCTGTGCCCTTGTCAGGAAGAGGAGGCATCAACACTTACATCCCTCTAATCAGTCTCCCTTTAGTTCCTGGCTT  809

Query  774  CCCTTACCCTACTGCAGCCACCACGGCAGCCGCTTTCAGAGGAGCCCATTTGAGGGGCAGAGGGCGGACAGTAT  847
            |||||||||.||||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  810  CCCTTACCCAACTGCAGCCACCACGGCAGCTGCTTTCCGAGGAGCCCATCTGAGGGGCAGAGGGCGGACAGTGT  883

Query  848  ATGGTGCAGTCCGAGCGGTACCTCCAACAGCCATCCCCGCCTATCCAGGTGTGGTTTACCAGGACGGATTTTAC  921
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  884  ATGGTGCAGTCCGAGCGGTACCTCCAACAGCCATCCCCGCCTATCCAGGTGTGGTTTACCAGGACGGATTTTAC  957

Query  922  GGTGCTGACCTCTAT---GGTG--GATATG---------CAGCCTA----------------------------  953
            |||||||||||||||   |.||  ||.|||         ||..|||                            
Sbjct  958  GGTGCTGACCTCTATTCAGCTGAAGAAATGTTAACATCTCACTCTAAATCTCTCAGTGGAGTCTCTGTTCCCTT  1031

Query  954  --CAGATATGCACAGCCT--GCTACTGC--------------AACCGCA-----------GCCACCGCTGCTGC  998
              |.||||| .|||| .|  |.||||||              ||   ||           ||||..|||     
Sbjct 1032  CTCTGATAT-AACAG-ATGGGTTACTGCTTGTTATAATTATTAA---CATTGTGGTATGGGCCAGGGCT-----  1095

Query  999  AGCCGCTGCAGCCGC-----TTAC------------------AGTGAC----GGTTATGGCAGGG--TGT--AC  1041
              |.|.||    .||     ||||                  ||.|||    .||||.||.|.||  |||  ||
Sbjct 1096  --CGGGTG----GGCAAGATTTACTCCTCCTTTGGGCTGGGGAGGGACCAGTTGTTAGGGTATGGAATGTTAAC  1163

Query 1042  ACA---GCCGAC---------CC---CTACCATGCCCTTGCCCCTGC-CGCTAGCTATGGAGTTGGCGCTGTGG  1099
            .||   |..|||         ||   .|||||.|.|.|||...|||| ||||  ||| |.|.|||..|||||| 
Sbjct 1164  TCAAGTGGTGACTGACTGTTTCCGTAATACCAGGTCGTTGTGGCTGCACGCT--CTA-GTAATTGAGGCTGTG-  1233

Query 1100  CGAGTTTA---TACCGAG---GTGGCTACAG-----------CCGATTTGCCCCCTAC------------  1140
                  ||   .||||||   |||| ||.||           |||.|.|   |||.|.            
Sbjct 1234  ------TACTTCACCGAGCTTGTGG-TAGAGCCTAGGGCAAACCGCTGT---CCCAAGAGAATGCTGGGA  1293