Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_02816
- Subject:
- XM_006716538.3
- Aligned Length:
- 1416
- Identities:
- 1396
- Gaps:
- 18
Alignment
Query 1 ATGGG----CTGGA--------------TCACAGAAGATCTTATTAGACGGAATGCTGAACACAACGACTGTGT 56
|||.| .|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTGTGTAATGGATGAGACACCACATGTCACAGAAGATCTTATTAGACGGAATGCTGAACACAACGACTGTGT 74
Query 57 CATTTTTTCCCTGGAGGAACTCTCGTTGCATCAGCAAGAAATAGAAAGACTAGAACACATTGATAAATGGTGCC 130
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CATTTTTTCCCTGGAGGAACTCTCGTTGCATCAGCAAGAAATAGAAAGACTAGAACACATTGATAAATGGTGCC 148
Query 131 GGGATTTAAAAATTCTCTATCTTCAAAATAATCTTATTGGGAAAATTGAAAATGTTAGCAAACTCAAGAAACTT 204
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GGGATTTAAAAATTCTCTATCTTCAAAATAATCTTATTGGGAAAATTGAAAATGTTAGCAAACTCAAGAAACTT 222
Query 205 GAATATTTGAATTTAGCTTTAAACAACATTGAAAAAATAGAAAACTTGGAAGGATGTGAAGAGCTGGCAAAACT 278
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GAATATTTGAATTTAGCTTTAAACAACATTGAAAAAATAGAAAACTTGGAAGGATGTGAAGAGCTGGCAAAACT 296
Query 279 TGACCTGACTGTGAATTTCATTGGAGAGCTGAGCAGCATTAAAAACTTGCAGCACAATATCCATCTGAAGGAGC 352
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TGACCTGACTGTGAATTTCATTGGAGAGCTGAGCAGCATTAAAAACTTGCAGCACAATATCCATCTGAAGGAGC 370
Query 353 TCTTTCTCATGGGGAACCCATGTGCTTCCTTTGACCACTATAGGGAGTTCGTGGTAGCAACTCTTCCACAATTA 426
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TCTTTCTCATGGGGAACCCATGTGCTTCCTTTGACCACTATAGGGAGTTCGTGGTAGCAACTCTTCCACAATTA 444
Query 427 AAGTGGTTGGATGGTAAAGAAATAGAGCCTTCAGAAAGGATTAAGGCATTGCAGGACTATTCAGTAATTGAACC 500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AAGTGGTTGGATGGTAAAGAAATAGAGCCTTCAGAAAGGATTAAGGCATTGCAGGACTATTCAGTAATTGAACC 518
Query 501 ACAAATCAGAGAGCAGGAAAAAGATCACTGTCTTAAACGAGCCAAACTCAAGGAAGAGGCTCAGAGGAAACACC 574
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 ACAAATCAGAGAGCAGGAAAAAGATCACTGTCTTAAACGAGCCAAACTCAAGGAAGAGGCTCAGAGGAAACACC 592
Query 575 AAGAAGAGGATAAAAATGAAGACAAGAGAAGTAACGCAGGCTTTGATGGACGTTGGTACACAGACATCAATGCT 648
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AAGAAGAGGATAAAAATGAAGACAAGAGAAGTAACGCAGGCTTTGATGGACGTTGGTACACAGACATCAATGCT 666
Query 649 ACTCTTTCCTCTTTAGAGAGCAAAGACCACCTACAGGCACCAGACACAGAGGAACACAACACAAAGAAATTAGA 722
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 ACTCTTTCCTCTTTAGAGAGCAAAGACCACCTACAGGCACCAGACACAGAGGAACACAACACAAAGAAATTAGA 740
Query 723 CAACAGTGAAGATGACTTGGAATTCTGGAATAAGCCCTGTTTGTTTACTCCTGAATCAAGATTGGAAACTCTTA 796
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CAACAGTGAAGATGACTTGGAATTCTGGAATAAGCCCTGTTTGTTTACTCCTGAATCAAGATTGGAAACTCTTA 814
Query 797 GACACATGGAAAAACAACGGAAGAAACAGGAAAAATTAAGTGAAAAAAAGAAGAAAGTGAAACCACCCAGGACT 870
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GACACATGGAAAAACAACGGAAGAAACAGGAAAAATTAAGTGAAAAAAAGAAGAAAGTGAAACCACCCAGGACT 888
Query 871 TTGATCACTGAAGATGGGAAAGCCCTAAATGTGAATGAGCCCAAAATTGACTTCTCTTTGAAAGATAACGAAAA 944
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TTGATCACTGAAGATGGGAAAGCCCTAAATGTGAATGAGCCCAAAATTGACTTCTCTTTGAAAGATAACGAAAA 962
Query 945 GCAGATCATCCTGGACCTTGCTGTCTATAGGTATATGGATACCTCTTTAATCGATGTTGATGTGCAACCAACTT 1018
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GCAGATCATCCTGGACCTTGCTGTCTATAGGTATATGGATACCTCTTTAATCGATGTTGATGTGCAACCAACTT 1036
Query 1019 ACGTGCGAGTAATGATCAAAGGAAAGCCATTTCAGCTTGTCCTTCCTGCAGAAGTGAAACCCGATAGTAGTTCT 1092
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 ACGTGCGAGTAATGATCAAAGGAAAGCCATTTCAGCTTGTCCTTCCTGCAGAAGTGAAACCCGATAGTAGTTCT 1110
Query 1093 GCTAAAAGATCTCAGACAACGGGTCATTTGGTCATCTGCATGCCCAAGGTAGGAGAAGTAATCACAGGTGGTCA 1166
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GCTAAAAGATCTCAGACAACGGGTCATTTGGTCATCTGCATGCCCAAGGTAGGAGAAGTAATCACAGGTGGTCA 1184
Query 1167 GCGAGCATTCAAATCTATGAAAACTACCTCGGACAGGAGCAGAGAACAAACAAATACAAGAAGCAAGCACATGG 1240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GCGAGCATTCAAATCTATGAAAACTACCTCGGACAGGAGCAGAGAACAAACAAATACAAGAAGCAAGCACATGG 1258
Query 1241 AGAAACTAGAAGTAGACCCTAGCAAGCACTCATTCCCTGATGTGACTAACATAGTTCAAGAGAAAAAACACACA 1314
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AGAAACTAGAAGTAGACCCTAGCAAGCACTCATTCCCTGATGTGACTAACATAGTTCAAGAGAAAAAACACACA 1332
Query 1315 CCCAGAAGACGACCTGAACCCAAAATTATACCAAGTGAGGAAGACCCAACCTTTGAAGACAACCCTGAAGTGCC 1388
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CCCAGAAGACGACCTGAACCCAAAATTATACCAAGTGAGGAAGACCCAACCTTTGAAGACAACCCTGAAGTGCC 1406
Query 1389 TCCGCTGATT 1398
||||||||||
Sbjct 1407 TCCGCTGATT 1416