Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_02872
- Subject:
- XM_006511513.3
- Aligned Length:
- 1864
- Identities:
- 1056
- Gaps:
- 719
Alignment
Query 1 ------------------------------AT------------GGAAGTAACAGCTAGCAGTCGCCACTATGT 32
|| |||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGTGCCTGTTGGAGACCCCAATCCGCATGAGCGTCCTCTCGGAGGTAACAGCTAGCAGTCGCCACTATGT 74
Query 33 TGACAGGCTATTTGACCCTGATCCCCAGAAAGTTCTACAAGGTGTCATAGACATGAAAAATGCTGTAATTGGAA 106
||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TGACAGGCTATTTGACCCTGATCCCCAGAAAGTTCTCCAAGGTGTCATAGACATGAAAAATGCTGTAATTGGAA 148
Query 107 ACAACAAGCAGAAAGCCAATCTCATTGTTTTAGGAGCTGTTCCAAGATTGTTGTACTTGCTTCAGCAAGAAACC 180
||||.||.|||||||||||.|||||.|||.|||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 149 ACAATAAACAGAAAGCCAACCTCATCGTTCTAGGAGCGGTTCCAAGATTGTTGTATTTGCTTCAACAAGAAACC 222
Query 181 TCAAGCACAGAGCTGAAAACTGAATGTGCAGTGGTGTTGGGAAGTCTTGCTATGGGTACTGAAAACAATGTCAA 254
|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||
Sbjct 223 TCAAGTACAGAGCTGAAAACTGAATGTGCAGTGGTGTTAGGGAGTCTTGCGATGGGCACAGAAAACAATGTCAA 296
Query 255 GTCTCTACTGGACTGCCATATTATCCCTGCCTTATTGCAAGGACTACTGTCCCCAGACCTGAAGTTTATTGAAG 328
|||||||||.||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 297 GTCTCTACTAGACTGCCATATTATCCCTGCCTTACTACAAGGACTACTGTCCCCAGACCTGAAGTTCATTGAAG 370
Query 329 CTTGCCTCCGATGCCTGCGTACCATCTTCACCAGTCCTGTCACTCCAGAGGAGCTACTGTATACAGATGCCACA 402
||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 371 CTTGCCTCCGATGCCTCCGGACAATCTTCACCAGCCCTGTCACTCCAGAGGAGCTACTGTATACAGATGCTACG 444
Query 403 GTGATACCACACCTCATGGCACTGCTTAGCAGGTCCCGCTATACCCAGGAGTACATCTGTCAGATCTTCTCACA 476
||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct 445 GTGATACCACACCTCATGGCACTGCTGAGCAGGTCCCGCTACACCCAGGAGTATATCTGCCAGATCTTCTCACA 518
Query 477 CTGCTGTAAAGGGCCAGATCATCAAACAATTTTATTTAACCACGGTGCAGTTCAGAATATTGCTCACCTACTAA 550
|||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||.||||||||.||.||||
Sbjct 519 CTGTTGCAAAGGGCCAGATCATCAAACAATTTTGTTTAACCATGGGGCAGTGCAGAACATTGCTCATCTCCTAA 592
Query 551 CCTCACTGTCCTACAAAGTTCGAATGCAAGCACTGAAATGTTTCTCAGTTTTAGCTTTTGAAAACCCCCAGGTA 624
||||||..||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||.|||||.|||
Sbjct 593 CCTCACCCTCTTACAAAGTTCGAATGCAAGCACTGAAATGCTTCTCTGTTTTAGCCTTTGAGAATCCCCAAGTA 666
Query 625 TCGATGACCCTGGTAAATGTTTTGGTTGATGGAGAATTGTTACCACAGATTTTTGTGAAGATGTTACAGAGGGA 698
|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TCGATGACCCTGGTAAACGTTTTGGTTGATGGGGAGTTGTTACCACAGATATTTGTGAAGATGTTACAGAGGGA 740
Query 699 TAAGCCTATTGAGATGCAGCTCACATCAGCAAAATGTTTAACTTACATGTGTAGAGCTGGAGCAATTCGGACAG 772
||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 741 TAAGCCTATTGAGATGCAGCTCACGTCAGCAAAATGTTTAACTTACATGTGCAGAGCTGGAGCAATTCGCACAG 814
Query 773 ATGATAACTGTATTGTATTAAAGACATTACCTTGTTTGGTTCGAATGTGCAGTAAGGAGAGATTACTAGAGGAG 846
||||.|.|||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 815 ATGACAGCTGTATTGTATTAAAAACTTTGCCTTGTTTGGTTCGAATGTGCAGTAAGGAGAGGTTACTAGAGGAG 888
Query 847 AGAGTTGAAGGAGCTGAGACACTTGCCTATCTGATTGAACCAGATGTTGAGCTACAGAGAATCGCTAGCATAAC 920
||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AGAGTTGAAGGAGCTGAGACCCTCGCCTATCTGATTGAGCCAGATGTTGAGCTGCAGAGAATCGCTAGCATAAC 962
Query 921 TGATCACCTCATTGCCATGCTTGCTGATTATTTCAAGTATCCCAGCTCAGTGAGTGCCATCACTGATATTAAAA 994
.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct 963 CGACCACCTCATTGCCATGCTGGCTGACTATTTCAAGTATCCCAGCTCAGTGAGCGCCATCACTGACATTAAAA 1036
Query 995 GGCTTGATCATGATTTAAAACATGCTCACGAACTCCGCCAGGCTGCATTCAAGCTCTATGCCTCTCTTGGAGCA 1068
|||||||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GGCTTGATCATGACTTAAAACATGCCCATGAGCTCCGCCAGGCTGCGTTCAAGCTCTATGCCTCTCTTGGAGCA 1110
Query 1069 AATGATGAAGACATCCGGAAGAAGGT--------------------------GAGTCTGGGAGAGGGGCGTCCC 1116
|||||||||||||||||||||||||| .||| ||..||.||..
Sbjct 1111 AATGATGAAGACATCCGGAAGAAGGTTTTACAAAATGCACCCGATGAAATCCTAGT-------AGTAGCATCTT 1177
Query 1117 CCA-GTCCTG------------------------------ACAGCC---------AGCAGG------------- 1137
||| ||..|| |.|||| |.||||
Sbjct 1178 CCATGTTATGTAACCTTCTTCTTGAATTTTCTCCAAGTAAAGAGCCAATTTTGGAATCAGGAGCTGTCGAGCTG 1251
Query 1138 -------------CAGGGAGTGACGTCAACC------------------------------------------- 1155
||..|||||| .||||
Sbjct 1252 CTCTGTGGGTTGACACAGAGTGA---AAACCCTGCTCTACGAGTGAATGGGATTTGGGCTTTAATGAATATGGC 1322
Query 1156 -------------------------------------------------------------------------- 1155
Sbjct 1323 ATTTCAGGCGGAACAAAAAATAAAAGCAGATATTTTACGAAGTCTGAGTACTGAACAGTTATTCCGGTTATTGT 1396
Query 1156 -------------------------------------------------------------------------- 1155
Sbjct 1397 CAGATTCTGATATGAATGTGCTGATGAAGACATTGGGGCTTCTTAGAAATCTCCTCTCCACTCGGCCTCATATA 1470
Query 1156 -------------------------------------------------------------------------- 1155
Sbjct 1471 GATAAAATCATGAGTACTCATGGGAAGCAGATTATGCAAGCTGTCACTCTGATACTGGAAGGGGAGCATAGCAT 1544
Query 1156 -------------------------------------------------------------------------- 1155
Sbjct 1545 TGAAGTCAAAGAGCAGACCCTGTGCATCCTAGCCAACATTGCAGATGGGACAACAGCAAAAGAGCTTATTATGA 1618
Query 1156 -------------------------------------------------------------------------- 1155
Sbjct 1619 CCAATGATGACATCCTGCAGAAAATCAAATATTACATGGGTCATTCACATGTCAAACTGCAGCTTGCTGCCATG 1692
Query 1156 -------------------------------------------------------------------------- 1155
Sbjct 1693 TTTTGTATATCAAACCTCATATGGAACGAAGAGGAAGGTTCACAGGAACGCCAGGATAAATTACGAGACATGGG 1766
Query 1156 -------------------------------------------------------------------------- 1155
Sbjct 1767 GATTGTAGATATTCTACACAAACTGAGTCAGTCGGCAGACTCAAACCTCTGTGACAAGGCAAAGACGGCGCTGC 1840
Query 1156 -------------- 1155
Sbjct 1841 AGCAGTACCTGGCG 1854
