Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02880
• Subject: NM_173749.4
• Aligned Length: 2212
• Identities: 1864
• Gaps: 53

Alignment

Query    1  ATGGAGCTGGGTTGCTGGACGCAGTTGGGGCTCACTTTTCTTCAGCTCCTTCTCATCTCGTCCTTGCCAAGAGA  74
            ||||||||.|...|.|||.|||||||||||||....||.||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGCTAGACAGATGGGCGCAGTTGGGGCTGGTGTTCCTGCAGCTCCTTCTCATCTCATCGTTGCCAAGAGA  74

Query   75  GTACACAGTCATTAATGAAGCCTGCCCTGGAGCAGAGTGGAATATCATGTGTCGGGAGTGCTGTGAATATGATC  148
            ||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||.|.||.||.|||||||||||||
Sbjct   75  GTACACGGTCATTAATGAAGCCTGTCCCGGAGCTGAGTGGAACATCATGTGTAGAGAATGTTGTGAATATGATC  148

Query  149  AGATTGAGTGCGTCTGCCCCGGAAAGAGGGAAGTCGTGGGTTATACCATCCCTTGCTGCAGGAATGAGGAGAAT  222
            |||||||.|||.|||||||.|||||||.||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct  149  AGATTGAATGCCTCTGCCCAGGAAAGAAGGAAGTGGTGGGTTACACCATCCCATGCTGCAGGAATGAGGATAAT  222

Query  223  GAGTGTGACTCCTGCCTGATCCACCCAGGTTGTACCATCTTTGAAAACTGCAAGAGCTGCCGAAATGGCTCATG  296
            ||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct  223  GAATGTGACTCCTGTCTAATTCACCCAGGTTGTACCATCTTTGAAAACTGCAAGAGCTGCCGCAATGGCTCCTG  296

Query  297  GGGGGGTACCTTGGATGACTTCTATGTGAAGGGGTTCTACTGTGCAGAGTGCCGAGCAGGCTGGTACGGAGGAG  370
            |||.||.||..|||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||.|.|||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGGCGGAACTCTGGATGACTTCTACGTGAAGGGATTCTACTGCGCAGAGTGCAGGGCAGGCTGGTACGGAGGAG  370

Query  371  ACTGCATGCGATGTGGCCAGGTTCTGCGAGCCCCAAAGGGTCAGATTTTGTTGGAAAGCTATCCCCTAAATGCT  444
            |||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||||.||||||||.|||||||||.||||.|||
Sbjct  371  ACTGCATGCGATGTGGCCAGGTTCTTCGAGCCTCAAAGGGTCAGATCTTGTTGGAGAGCTATCCCTTAAACGCT  444

Query  445  CACTGTGAATGGACCATTCATGCTAAACCTGGGTTTGTCATCCAACTAAGATTTGTCATGTTGAGCCTGGAGTT  518
            ||||||||||||||.||||||||.|.||||||||||.|||||||..|.||.||||..|||.|||||||.|||||
Sbjct  445  CACTGTGAATGGACTATTCATGCCAGACCTGGGTTTATCATCCAGTTGAGGTTTGGTATGCTGAGCCTAGAGTT  518

Query  519  TGACTACATGTGCCAGTATGACTATGTTGAGGTTCGTGATGGAGACAACCGCGATGGCCAGATCATCAAGCGTG  592
            |||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||.||..|.||..|||..||||||||||||.
Sbjct  519  TGACTACATGTGCCAATATGACTATGTGGAGGTCCGCGATGGGGATAATAGTGACAGCCCTATCATCAAGCGTT  592

Query  593  TCTGTGGCAACGAGCGGCCAGCTCCTATCCAGAGCATAGGATCCTCACTCCACGTCCTCTTCCACTCCGATGGC  666
            ||||||||||||||.||||||||||.|||..|||||..||.||.||||||||.|||||.|||||.||.||||||
Sbjct  593  TCTGTGGCAACGAGAGGCCAGCTCCCATCAGGAGCACTGGCTCTTCACTCCATGTCCTTTTCCATTCTGATGGC  666

Query  667  TCCAAGAATTTTGACGGTTTCCATGCCATTTATGAGGAGATCACAGCATGCTCCTCATCCCCTTGTTTCCATGA  740
            ||||||||.||.||.||.|||||.||..|.|.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TCCAAGAACTTCGATGGCTTCCACGCTGTCTTTGAGGAGATCACAGCGTGCTCCTCATCCCCTTGTTTCCATGA  740

Query  741  CGGCACGTGCGTCCTTGACAAGGCTGGATCTTACAAGTGTGCCTGCTTGGCAGGCTATACTGGGCAGCGCTGTG  814
            .|||||.|||.|||||||||...||||.||||.|||||||||||||.||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct  741  TGGCACATGCCTCCTTGACACCACTGGGTCTTTCAAGTGTGCCTGCCTGGCTGGCTACACTGGGCAGCGCTGTG  814

Query  815  AAAATCTTCTGGAGGCTGGGAAGTCCAAGATCAAGGCGTCAGAAGATTCATTGTCTGTCCTTGAAGAAAGAAAC  888
            ||||||                                                   |.|||||||||||||||
Sbjct  815  AAAATC---------------------------------------------------TACTTGAAGAAAGAAAC  837

Query  889  TGCTCAGACCCTGGGGGCCCAGTCAATGGGTACCAGAAAATAACAGGGGGCCCTGGGCTTATCAACGGACGCCA  962
            ||||||||||.||||||.|||||||||||||||.|||||||.||||..||.|||||.|||.||||.|..|||||
Sbjct  838  TGCTCAGACCTTGGGGGGCCAGTCAATGGGTACAAGAAAATCACAGAAGGTCCTGGACTTCTCAATGAGCGCCA  911

Query  963  TGCTAAAATTGGCACCGTGGTGTCTTTCTTTTGTAACAACTCCTATGTTCTTAGTGGCAATGAGAAAAGAACTT  1036
            ||..|||||||||||.||.||||||||||||||||||..|||.||.|||||.|||||||||||||||.||||||
Sbjct  912  TGTAAAAATTGGCACGGTTGTGTCTTTCTTTTGTAACGGCTCATACGTTCTGAGTGGCAATGAGAAACGAACTT  985

Query 1037  GCCAGCAGAATGGAGAGTGGTCAGGGAAACAGCCCATCTGCATAAAAGCCTGCCGAGAACCAAAGATTTCAGAC  1110
            |||||||||||||||||||||||||.||.||.||..|||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||
Sbjct  986  GCCAGCAGAATGGAGAGTGGTCAGGAAAGCAACCTGTCTGCATGAAAGCCTGCCGGGAACCGAAGATCTCAGAC  1059

Query 1111  CTGGTGAGAAGGAGAGTTCTTCCGATGCAGGTTCAGTCAAGGGAGACACCATTACACCAGCTATACTCAGCGGC  1184
            |||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||..||||
Sbjct 1060  CTGGTGAGAAGGAGAGTCCTTTCGATGCAGGTTCAGTCAAGGGAGACACCATTACATCAGCTTTATTCCACGGC  1133

Query 1185  CTTCAGCAAGCAGAAACTGCAGAGTGCCCCTACCAAGAAGCCAGCCCTTCCCTTTGGAGATCTGCCCATGGGAT  1258
            .|||||||||||||||.|||||..||||.|||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||...||||
Sbjct 1134  TTTCAGCAAGCAGAAATTGCAGGATGCCTCTACCAAAAAGCCAGCCCTTCCATTTGGAGACCTGCCCCCTGGAT  1207

Query 1259  ACCAACATCTGCATACCCAGCTCCAGTATGAGTGCATCTCACCCTTCTACCGCCGCCTGGGCAGCAGCAGGAGG  1332
            |||||||||||||.|||||..|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1208  ACCAACATCTGCACACCCAAGTCCAGTATGAGTGCATCTCGCCCTTCTACCGCCGCCTGGGAAGCAGCAGGAGG  1281

Query 1333  ACATGTCTGAGGACTGGGAAGTGGAGTGGGCGGGCACCATCCTGCATCCCTATCTGCGGGAAAATTGAGAACA-  1405
            |||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||.|||||.||||.|| 
Sbjct 1282  ACATGCCTGAGAACTGGGAAGTGGAGTGGGCGGGCCCCGTCCTGTATCCCAATCTGTGGAAAAATCGAGAGCAC  1355

Query 1406  TCACTGCTCCAAAGACCCAAGGGTTGCGCTGGCCGTGGCAGGCAGCCATCTACAGGAGGACCAGCGGGGTGCAT  1479
            || ||.||||||||||||||||....||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||.||.||.||.
Sbjct 1356  TC-CTTCTCCAAAGACCCAAGGCACCCGCTGGCCATGGCAGGCAGCCATCTACCGGAGGACCAGTGGTGTACAC  1428

Query 1480  GACGGCAGCCTACACAAGGGAGCGTGGTTCCTAGTCTGCAGCGGTGCCCTGGTGAATGAGCGCACTGTGGTGGT  1553
            ||.||..|.||.|||||.||.||.||||||.|.||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.||
Sbjct 1429  GATGGTGGTCTGCACAAAGGTGCATGGTTCTTGGTCTGCAGTGGTGCCCTGGTGAATGAACGGACTGTGGTTGT  1502

Query 1554  GGCTGCCCACTGTGTTACTGACCTGGGGAAGGTCACCATGATCAAGACAGCAGACCTGAAAGTTGTTTTGGGGA  1627
            |||||||||||||||.|||||.||||||||||.||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.|||||.|
Sbjct 1503  GGCTGCCCACTGTGTGACTGAGCTGGGGAAGGCCACCATCATCAAGACAGCAGACCTCAAGGTTGTCTTGGGAA  1576

Query 1628  AATTCTACCGGGATGATGACCGGGATGAGAAGACCATCCAGAGCCTACAGATTTCTGCTATCATTCTGCATCCC  1701
            ||||||||.||||.|||||.|||||||||||||.||||||||...|||.|.|||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1577  AATTCTACAGGGACGATGATCGGGATGAGAAGAGCATCCAGAATTTACGGGTTTCTGCTATCATTCTGCACCCC  1650

Query 1702  AACTATGACCCCATCCTGCTTGATGCTGACATCGCCATCCTGAAGCTCCTAGACAAGGCCCGTATCAGCACCCG  1775
            |||||||||||.|||||||||||..||||||||||..|.|||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||
Sbjct 1651  AACTATGACCCTATCCTGCTTGACACTGACATCGCTGTTCTGAAGCTCCTAGACAAAGCTCGCATCAGTACCCG  1724

Query 1776  AGTCCAGCCCATCTGCCTCGCTGCCAGTCGGGATCTCAGCACTTCCTTCCAGGAGTCCCACATCACTGTGGCTG  1849
            .|||||.|||||||||||.|||.|||.||||||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1725  TGTCCAACCCATCTGCCTGGCTACCACTCGGGACCTCAGCACCTCTTTCCAGGAATCCCACATCACTGTGGCTG  1798

Query 1850  GCTGGAATGTCCTGGCAGACGTGAGGAGCCCTGGCTTCAAGAACGACACACTGCGCTCTGGGGTGGTCAGTGTG  1923
            |||||||..||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||..|.|..|.|||..|||||||.|||
Sbjct 1799  GCTGGAACATCCTGGCAGATGTGAGGAGCCCTGGCTTTAAGAATGATACCTTACATTATGGAATGGTCAGAGTG  1872

Query 1924  GTGGACTCGCTGCTGTGTGAGGAGCAGCATGAGGACCATGGCATCCCAGTGAGTGTCACTGATAACATGTTCTG  1997
            ||.|||.|..||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1873  GTAGACCCAATGCTTTGTGAGGAACAGCATGAAGACCATGGCATTCCAGTTAGTGTCACTGACAACATGTTCTG  1946

Query 1998  TGCCAGCTGGGAACCCACTGCCCCTTCTGATATCTGCACTGCAGAGACAGGAGGCATCGCGGCTGTGTCCTTCC  2071
            |||||||...||.||||.|.||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||.|||||||||
Sbjct 1947  TGCCAGCAAAGATCCCAGTACCCCTTCTGACATCTGCACTGCAGAGACAGGGGGCATCGCTGCTTTGTCCTTCC  2020

Query 2072  CGGGACGAGCATCTCCTGAGCCACGCTGGCATCTGATGGGACTGGTCAGCTGGAGCTATGATAAAACATGCAGC  2145
            |.||.||||||||.||.|||||||||||||||.||.||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.|||
Sbjct 2021  CAGGCCGAGCATCCCCCGAGCCACGCTGGCATTTGGTGGGGCTGGTCAGCTGGAGCTATGACAAGACATGTAGC  2094

Query 2146  CACAGGCTCTCCACTGCCTTCACCAAGGTGCTGCCTTTTAAAGACTGGATTGAAAGAAATATGAAA  2211
            .|..|.||.|||||.||||||||.||||||.||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 2095  AATGGCCTATCCACAGCCTTCACAAAGGTGTTGCCGTTCAAAGACTGGATTGAGAGAAACATGAAA  2160