Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02891
• Subject: XM_017003771.1
• Aligned Length: 1189
• Identities: 935
• Gaps: 227

Alignment

Query    1  ATGGCTTGGC-----------------------AGGGCTG-------------GCCCGCGGCGTGGCAGTGGG-  37
            |||||  |||                       |||||.|             |||||||.|.|  |.|.||| 
Sbjct    1  ATGGC--GGCGGTGGTAGCTGCTACGGCGCTGAAGGGCCGGGGGGCGAGAAATGCCCGCGTCCT--CCGGGGGA  70

Query   38  ---TCGCCGG-----CTGCT-----GGCTCCTC----CTCGTCCTTGTCCTCGTCCTACTTGTGAGCCC-----  89
               ||||.||     |.|||     ||||.|||    |..|.||                  .|.||||     
Sbjct   71  TTCTCGCAGGAGCCACAGCTAACAAGGCTTCTCATAACAGGACC------------------CGGGCCCTGCAA  126

Query   90  --CCGCGGCTGCC--GAGCGC--GGCGGGGCC----------TCCGCGGTCTGCT------CAT----------  131
              ||.|.|||.||  |||.||  ||.||..||          |||.|||  .|||      |||          
Sbjct  127  AGCCACAGCTCCCCAGAGGGCAAGGAGGAACCTGAACCCCTATCCCCGG--AGCTGGAATACATTCCCAGAAAG  198

Query  132  -GGCGCACAG----CCA----------GCGGCTGCTCTTCCGAATCGGGTACAGCCTGTACACCCGCACCTGGC  190
             ||.||| ||    |||          |.|.|||..||         |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  199  AGGGGCA-AGAACCCCATGAAAGCTGTGGGACTGGCCT---------GGTACAGCCTGTACACCCGCACCTGGC  262

Query  191  TCGGGTACCTCTTCTACCGACAGCAGCTGCGCAGGGCTCGGAATCGCTACCCTAAAGGCCACTCGAAAACCCAG  264
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  263  TCGGGTACCTCTTCTACCGACAGCAGCTGCGCAGGGCTCGGAATCGCTACCCTAAAGGCCACTCGAAAACCCAG  336

Query  265  CCCCGCCTCTTCAATGGAGTGAAGGTGCTTCCCATCCCTGTCCTCTCGGACAACTACAGCTACCTCATCATCGA  338
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  337  CCCCGCCTCTTCAATGGAGTGAAGGTGCTTCCCATCCCTGTCCTCTCGGACAACTACAGCTACCTCATCATCGA  410

Query  339  CACCCAGGCCCAGCTGGCTGTGGCTGTGGACCCTTCAGACCCTCGGGCTGTGCAGGCTTCCATTGAAAAGGAAG  412
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  411  CACCCAGGCCCAGCTGGCTGTGGCTGTGGACCCTTCAGACCCTCGGGCTGTGCAGGCTTCCATTGAAAAGGAAG  484

Query  413  GGGTCACCTTGGTCGCCATTCTGTGTACTCACAAGCACTGGGACCACAGTGGAGGGAACCGTGACCTCAGCCGG  486
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  485  GGGTCACCTTGGTCGCCATTCTGTGTACTCACAAGCACTGGGACCACAGTGGAGGGAACCGTGACCTCAGCCGG  558

Query  487  CGGCACCGGGACTGTCGGGTGTACGGGAGCCCTCAGGACGGCATCCCCTACCTCACCCATCCCCTGTGTCATCA  560
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  559  CGGCACCGGGACTGTCGGGTGTACGGGAGCCCTCAGGACGGCATCCCCTACCTCACCCATCCCCTGTGTCATCA  632

Query  561  AGATGTGGTCAGCGTGGGACGGCTTCAGATCCGGGCCCTGGCTACACCTGGCCACACACAAGGCCATCTGGTCT  634
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  633  AGATGTGGTCAGCGTGGGACGGCTTCAGATCCGGGCCCTGGCTACACCTGGCCACACACAAGGCCATCTGGTCT  706

Query  635  ACCTACTGGATGGGGAGCCCTACAAGGGTCCCTCCTGCCTCTTCTCAGGGGACCTGCTCTTCCTCTCTGGCTGT  708
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct  707  ACCTACTGGATGGGGAGCCCTACAAGGGTCCCTCCTGCCTCTTCTCAGGGGACCTGCTCTTCCTCTCTGGCTG-  779

Query  709  GGGCGGACCTTTGAGGGCAATGCAGAGACCATGCTGAGCTCACTGGACACTGTGCTGGGGCTAGGGGATGACAC  782
                                                                                      
Sbjct  780  --------------------------------------------------------------------------  779

Query  783  CCTTCTGTGGCCTGGTCATGAGTATGCAGAGGAGAACCTGGGCTTTGCAGGTGTGGTGGAGCCCGAGAACCTGG  856
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  780  ------------TGGTCATGAGTATGCAGAGGAGAACCTGGGCTTTGCAGGTGTGGTGGAGCCCGAGAACCTGG  841

Query  857  CCCGGGAGAGGAAGATGCAGTGGGTGCAGCGGCAGCGGCTGGAGCGCAAGGGCACGTGCCCATCTACCCTGGGA  930
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  842  CCCGGGAGAGGAAGATGCAGTGGGTGCAGCGGCAGCGGCTGGAGCGCAAGGGCACGTGCCCATCTACCCTGGGA  915

Query  931  GAGGAGCGCTCCTACAACCCGTTCCTGAGAACCCACTGCCTGGCGCTACAGGAGGCTCTGGGGCCGGGGCCGGG  1004
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  916  GAGGAGCGCTCCTACAACCCGTTCCTGAGAACCCACTGCCTGGCGCTACAGGAGGCTCTGGGGCCGGGGCCGGG  989

Query 1005  CCCCACTGGGGATGATGACTACTCCCGGGCCCAGCTCCTGGAAGAGCTCCGCCGGCTGAAGGATATGCACAAGA  1078
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  990  CCCCACTGGGGATGATGACTACTCCCGGGCCCAGCTCCTGGAAGAGCTCCGCCGGCTGAAGGATATGCACAAGA  1063

Query 1079  GCAAG  1083
            |||||
Sbjct 1064  GCAAG  1068