Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02903
• Subject: XM_017319142.1
• Aligned Length: 1772
• Identities: 1364
• Gaps: 259

Alignment

Query    1  ATGGGCGCCGCCGCCTCCAGGAGGAGGGCGCTGAGGAGCGAGGCCATGTCCTCGGTGGCGGCCAAAGTGCGAGC  74
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||..||||
Sbjct    1  ATGGGTGCCGCCGCCTCCAGGAGGAGGGCGCTGAGGAGCGAGGCCATGTCCTCGGTAGCGGCCAAAGTAAGAGC  74

Query   75  AGCCCGAGCGTTTGGAGAGTACCTGTCCCAGAGTCACCCTGAGAACCGCAACGGCGCAGATCACCTGCTGGCTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct   75  AGCCCGAGCGTTTGGAGAGTACCTGTCCCAGAGTCACCCTGAGAACCGCAACGGTGCAGACCACCTGCTGGCTG  148

Query  149  ATGCCTACTCTGGCCACGACGGGTCCCCCGAGATGCAGCCGGCCCCCCAGAACAAGCGCCGCCTGTCCCTCGTC  222
            |.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  149  ACGCCTACTCTGGCCACGACGGGTCCCCAGAGATGCAACCTGCACCCCAGAACAAGCGCCGCCTCTCCCTCGTC  222

Query  223  TCCAACGGCTGCTACGAGGGCAGCCTCTCAGAGGAGCC---CAGCATTAGGAAGCCCGCAGGC----GAGGGCC  289
            |||||.|||.|.||.|||||||||.|||||||.|||.|   ||||   .|||||||    |||    |||||||
Sbjct  223  TCCAATGGCCGATATGAGGGCAGCATCTCAGATGAGGCAGTCAGC---GGGAAGCC----GGCTATAGAGGGCC  289

Query  290  CTCAGCCTCGAGTGTACACCATCTCTGGGGAGCCTGCCCTGCTGCCCAGCCCTGAGGCGGAGGCCATTGAGCTG  363
            |.|||||.|..|||||||||||||||.|.|||||.||||||||.||..||.||||.||.||.|||||||||||.
Sbjct  290  CCCAGCCCCACGTGTACACCATCTCTAGAGAGCCCGCCCTGCTACCTGGCTCTGAAGCTGAAGCCATTGAGCTA  363

Query  364  GCGGTGGTGAAGGGG------CGGCGGCAGCGGCACCCTCACCATCACAGCCAGCCCCTGCGCGCCAGCCCTGG  431
            ||.|||||.||.|||      |.||||.|.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct  364  GCAGTGGTAAAAGGGAGGAGACAGCGGGAACGGCACCCTCACCACCACAGCCAGCCCCTGCGTGCCAGCCCAGG  437

Query  432  TGGCAGCCGGGAGGACGTCAGCAGGCCCTGCCAGAGCTGGGCGGGCAGCCGCCAGGGCTCCAAGGAGTGCCCCG  505
            ..||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct  438  CAGCAGCCGGGAGGACATCAGCAGGCCCTGCCAAAGCTGGGCAGGAAGCCGCCAGGGCTCCAAAGAGTGCCCAG  511

Query  506  GATGTGCCCAGCTGGCTCCTGGCCCCACCCCTCGGGCCTTTGGGCTGGACCAGCCACCTCTGCCTGAGACCTCC  579
            |||||||||||||||..|||||.|||.|..|||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||| .||||
Sbjct  512  GATGTGCCCAGCTGGTCCCTGGTCCCTCTTCTCGGGCCTTTGGGCTGGAGCAGCCACCTCTACCTGAG-GCTCC  584

Query  580  -GGTCGCCGCAAGAAGCTGGAGAGGATGTACAGCGTTGACCGTGTGTCTGACGACATCCCTATTCGTACCTGGT  652
             ||.||||.||||||||||||.||||||||.||||||||..|.||||||||.||..||||.||.||||||||||
Sbjct  585  TGGCCGCCACAAGAAGCTGGAAAGGATGTATAGCGTTGATGGAGTGTCTGATGATGTCCCCATCCGTACCTGGT  658

Query  653  TCCCCAAGGAAAATCTTTTCAGCTTCCAGACAGCAACCACAACTATGCAAGCGGTGTTCAGGGGCTACGCGGAG  726
            |||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||                      
Sbjct  659  TCCCCAAGGAAAACCTTTTCAGCTTCCAGACGGCAACCACAACTATGCAAGC----------------------  710

Query  727  AGGAAGCGCCGGAAACGGGAGAATGATTCCGCGTCTGTAATCCAGAGGAACTTCCGCAAACACCTGCGCATGGT  800
                                           |.|||          .|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  711  -------------------------------CATCT----------CGAACTTCCGCAAACACCTGCGCATGGT  743

Query  801  CGGCAGCCGGAGGGTGAAGGCCCAGACGTTCGCTGAGCGGCGCGAGCGGAGCTTCAGCCGGTCCTGGAGCGACC  874
            .|||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  744  TGGCAGTCGGCGGGTGAAGGCCCAGACGTTCGCTGAGCGTCGCGAACGGAGCTTCAGCCGGTCCTGGAGCGACC  817

Query  875  CCACCCCCATGAAAGCCGACACTTCCCACGACTCCCGAGACAGCAGTGACCTGCAGAGCTCCCACTGCACGCTG  948
            |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||
Sbjct  818  CCACCCCTATGAAAGCCGACACTTCCCACGACTCCCGAGACAGCAGTGACCTACAGAGCTCACACTGCACCCTG  891

Query  949  GACGAGGCCTTCGAGGACCTGGACTGGGACACTGAGAAGGGCCTGGAGGCTGTGGCCTGCGACACCGAAGGCTT  1022
            ||.|||||.|..||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||..||||||||.|||||||.|||||
Sbjct  892  GATGAGGCTTGTGAGGACCTGGACTGGGACACAGAGAAAGGTCTGGAGGCCATGGCCTGCAACACCGAGGGCTT  965

Query 1023  CGTGCCACCAAAGGTCATGCTCATTTCCTCCAAGGTGCCCAAGGCTGAGTACATCCCCACTATCATCCGCCGGG  1096
            |.|||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||.|.|
Sbjct  966  CTTGCCACCCAAGGTCATGCTCATCTCCTCCAAGGTGCCAAAGGCCGAGTATATCCCTACTATCATCCGCAGAG  1039

Query 1097  ATGACCCCTCCATCATCCCCATCCTCTACGACCATGAGCACGCAACCTTCGAGGACATCCTTGAGGAGATAGAG  1170
            |||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 1040  ATGACCCGTCCATCATTCCCATCCTCTACGACCACGAGCATGCAACCTTCGAGGACATCCTGGAGGAAATAGAG  1113

Query 1171  AGGAAGCTGAACGTCTACCACAAGGGAGCCAAGATCTGGAAAATGCTGATTTTCTGC-----------------  1227
            |.|||..|||||.||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||                 
Sbjct 1114  AAGAAATTGAACATCTATCACAAGGGGGCCAAGATCTGGAAGATGCTGATTTTCTGCCAGGTAGAAGCAGCCTT  1187

Query 1228  --------------------------------------------------------------------------  1227
                                                                                      
Sbjct 1188  TCCTTTCCTCCCCAGGAAAAGAGGGCAGTGTGGTATGGGTAGGGCCCCAAGATCTTACTCAGTGTGGGCGTGTC  1261

Query 1228  --------------------------------------------------------------------------  1227
                                                                                      
Sbjct 1262  CATGTGGTACATTTGTGGACGACATGCACACGCCTCATCCTAGCCTCCCCCTAGCACTCCTGAGGCCTGACCGT  1335

Query 1228  ---------CAGGGAGGTCCTGGACACCTCTATCTCCTCAAGAACAAGGTGGCCACCTTTGCCAAAGTGGAGAA  1292
                     |||||.||.|||||||||||.|||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1336  GACCTCTTTCAGGGCGGCCCTGGACACCTTTATTTGCTCAAGAACAAGGTGGCCACCTTTGCCAAAGTGGAGAA  1409

Query 1293  GGAAGAGGACATGATTCACTTCTGGAAGCGGCTGAGCCGCCTGATGAGCAAAGTGAACCCAGAGCCGAACGTCA  1366
            |||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||
Sbjct 1410  GGAAGAGGACATGATCCACTTCTGGAAGAGGCTGAGCCGCCTGATGAGCAAGGTGAACCCCGAGCCGAATGTCA  1483

Query 1367  TCCACATCATGGGCTGCTACATTCTGGGGAACCCCAATGGAGAGAAGCTGTTCCAGAACCTCAGGACCCTCATG  1440
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1484  TCCACATCATGGGCTGCTACATTCTGGGGAACCCTAACGGGGAGAAGCTATTCCAGAACCTCAGGACCCTCATG  1557

Query 1441  ACTCCTTATAGGGTCACCTTCGAGTCACCCCTGGAGCTCTCAGCCCAAGGGAAGCAGATGATCGAGACGTACTT  1514
            ||.|||||.|.|||.|||||.|||||.||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1558  ACCCCTTACAAGGTTACCTTTGAGTCGCCTCTCGAGCTGTCTGCCCAAGGGAAGCAGATGATTGAGACCTACTT  1631

Query 1515  TGACTTCCGGTTGTATCGCCTGTGGAAGAGCCGCCAGCACTCGAAGCTGCTGGACTTTGACGACGTCCTG  1584
            ||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1632  TGACTTCCGGCTGTACCGCCTGTGGAAGAGCCGCCAGCACTCAAAGCTGCTGGACTTTGATGACGTCCTG  1701