Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_02936
- Subject:
- XM_017010728.1
- Aligned Length:
- 1863
- Identities:
- 1137
- Gaps:
- 726
Alignment
Query 1 ATGTCACCGGTCTTTCCCATGTTAACAGTTCTGACCATGTTTTATTATATATGCCTTCGGCGCCGAGCCAGGAC 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 AGCTACAAGAGGAGAAATGATGAACACCCATAGAGCTATAGAATCAAACAGCCAGACTTCCCCTCTCAATGCAG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 AGGTAGTCCAGTATGCCAAAGAAGTAGTGGATTTCAGTTCCCATTATGGAAGTGAGAATAGTATGTCCTATACT 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 ATGTGGAATTTGGCTGGTGTACCAAATGTATTCCCAAGTTCTGGTGACTTTACTCAGACAGCTGTGTTTCGAAC 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 TTATGGGACATGGTGGGATCAGTGTCCTAGTGCTTCCTTGCCATTCAAGAGGACGCCACCTAATTTTCAGAGCC 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 AGGACTATGTGGAACTTACTTTTGAACAACAGGTGTATCCTACAGCTGTACATGTTCTAGAAACCTATCATCCC 444
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 445 GGAGCAGTCATTAGAATTCTCGCTTGTTCTGCAAATCCTTATTCCCCAAATCCACCAGCTGAAGTAAGATGGGA 518
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 519 GATTCTTTGGTCAGAGAGACCTACGAAGGTGAATGCTTCCCAAGCTCGCCAGTTTAAACCTTGTATTAAGCAGA 592
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 593 TAAATTTCCCCACAAATCTTATACGACTGGAAGTAAATAGTTCTCTTCTGGAATATTACACTGAATTAGATGCA 666
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 667 GTTGTGCTACATGGTGTGAAGGACAAGCCAGTGCTTTCTCTCAAGACTTCACTTATTGACATGAATGATATAGA 740
||||||||||||||
Sbjct 1 ------------------------------------------------------------ATGAATGATATAGA 14
Query 741 AGATGATGCCTATGCAGAAAAGGATGGTTGTGGAATGGACAGTCTTAACAAAAAGTTTAGCAGTGCTGTCCTCG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 15 AGATGATGCCTATGCAGAAAAGGATGGTTGTGGAATGGACAGTCTTAACAAAAAGTTTAGCAGTGCTGTCCTCG 88
Query 815 GGGAAGGGCCAAATAATGGGTATTTTGATAAACTACCTTATGAGCTTATTCAGCTGATTCTGAATCATCTTACA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 89 GGGAAGGGCCAAATAATGGGTATTTTGATAAACTACCTTATGAGCTTATTCAGCTGATTCTGAATCATCTTACA 162
Query 889 CTACCAGACCTGTGTAGATTAGCACAGACTTGCAAACTACTGAGCCAGCATTGCTGTGATCCTCTGCAATACAT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 163 CTACCAGACCTGTGTAGATTAGCACAGACTTGCAAACTACTGAGCCAGCATTGCTGTGATCCTCTGCAATACAT 236
Query 963 CCACCTCAATCTGCAACCATACTGGGCAAAACTAGATGACACTTCTCTGGAATTTCTACAGTCTCGCTGCACTC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 237 CCACCTCAATCTGCAACCATACTGGGCAAAACTAGATGACACTTCTCTGGAATTTCTACAGTCTCGCTGCACTC 310
Query 1037 TTGTCCAGTGGCTTAATTTATCTTGGACTGGCAATAGAGGCTTCATCTCTGTTGCAGGATTTAGCAGGTTTCTG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 311 TTGTCCAGTGGCTTAATTTATCTTGGACTGGCAATAGAGGCTTCATCTCTGTTGCAGGATTTAGCAGGTTTCTG 384
Query 1111 AAGGTTTGTGGATCCGAATTAGTACGCCTTGAATTGTCTTGCAGCCACTTTCTTAATGAAACTTGCTTAGAAGT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 385 AAGGTTTGTGGATCCGAATTAGTACGCCTTGAATTGTCTTGCAGCCACTTTCTTAATGAAACTTGCTTAGAAGT 458
Query 1185 TATTTCTGAGATGTGTCCAAATCTACAGGCCTTAAATCTCTCCTCCTGTGATAAGCTACCACCTCAAGCTTTCA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 459 TATTTCTGAGATGTGTCCAAATCTACAGGCCTTAAATCTCTCCTCCTGTGATAAGCTACCACCTCAAGCTTTCA 532
Query 1259 ACCACATTGCCAAGTTATGCAGCCTTAAACGACTTGTTCTCTATCGAACAAAAGTAGAGCAAACAGCACTGCTC 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 533 ACCACATTGCCAAGTTATGCAGCCTTAAACGACTTGTTCTCTATCGAACAAAAGTAGAGCAAACAGCACTGCTC 606
Query 1333 AGCATTTTGAACTTCTGTTCAGAGCTTCAGCACCTCAGTTTAGGCAGTTGTGTCATGATTGAAGACTATGATGT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 607 AGCATTTTGAACTTCTGTTCAGAGCTTCAGCACCTCAGTTTAGGCAGTTGTGTCATGATTGAAGACTATGATGT 680
Query 1407 GATAGCTAGCATGATAGGAGCCAAGTGTAAAAAACTCCGGACCCTGGATCTGTGGAGATGTAAGAATATTACTG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 681 GATAGCTAGCATGATAGGAGCCAAGTGTAAAAAACTCCGGACCCTGGATCTGTGGAGATGTAAGAATATTACTG 754
Query 1481 AGAATGGAATAGCAGAACTGGCTTCTGGGTGTCCACTACTGGAGGAGCTTGACCTTGGCTGGTGCCCAACTCTG 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 755 AGAATGGAATAGCAGAACTGGCTTCTGGGTGTCCACTACTGGAGGAGCTTGACCTTGGCTGGTGCCCAACTCTG 828
Query 1555 CAGAGCAGCACCGGGTGCTTCACCAGACTGGCACACCAGCTCCCAAACTTGCAAAAACTCTTTCTTACAGCTAA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 829 CAGAGCAGCACCGGGTGCTTCACCAGACTGGCACACCAGCTCCCAAACTTGCAAAAACTCTTTCTTACAGCTAA 902
Query 1629 TAGATCTGTGTGTGACACAGACATTGATGAATTGGCATGTAATTGTACCAGGTTACAGCAGCTGGACATATTAG 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 903 TAGATCTGTGTGTGACACAGACATTGATGAATTGGCATGTAATTGTACCAGGTTACAGCAGCTGGACATATTAG 976
Query 1703 GAACAAGAATGGTAAGTCCGGCATCCTTAAGAAAACTCCTGGAATCTTGTAAAGATCTTTCTTTACTTGATGTG 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 977 GAACAAGAATGGTAAGTCCGGCATCCTTAAGAAAACTCCTGGAATCTTGTAAAGATCTTTCTTTACTTGATGTG 1050
Query 1777 TCCTTCTGTTCGCAGATTGATAACAGAGCTGTGCTAGAACTGAATGCAAGCTTTCCAAAAGTGTTCATAAAAAA 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1051 TCCTTCTGTTCGCAGATTGATAACAGAGCTGTGCTAGAACTGAATGCAAGCTTTCCAAAAGTGTTCATAAAAAA 1124
Query 1851 GAGCTTTACTCAG 1863
|||||||||||||
Sbjct 1125 GAGCTTTACTCAG 1137
